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Marcadores moleculares usados en el mapeo genómico
Dos clases de mapeo genómico: Mapeo genético
– Técnicas genéticas, cruces o pedigrees – Calculo de la distancia basada en la frecuencia de
recombinación.
Mapeo Físico • Evaluación directa de la posición relativa de una
secuencia característica • El mapa físico es la secuencia de DNA del genoma
completo
• Marcadores para el mapeo genético • Fenotípico (morfológico) basados en el
polimorfismo físico: color , forma de la hoja en plantas
• Marcadores citológicos basados en la estructura cromosómica: depleción duplicación inversión translocación
• Marcadores bioquímicos – Macromoléculas – Isoenzimas
• Marcadores Moleculares: • Basados en la hibridación DNA-DNA
– RFLP VNTR
• Basados en PCR – Random primers RAPD – Usando primers específicos STR
• Basados en PCR y cortes por enzimas de restricción – AFLP
• Basados en puntos de mutación en el DNA – SNP detectados por SSCP, DASH, DNA chip,
secuenciamiento
• Marcadores moleculares
• Uni locus (buenos porque son estáticos se mapea un gen en una posición sobre el cromosoma) versus Multilocus (buenos para el análisis completo del genoma y análisis filogenético)
• Principales métodos de detección: Hibridación, PCR
Cinco condiciones que caracterizan a un adecuado marcador molecular. •Debe ser polimórfico •De herencia codominante •Distribuidos al azar y frecuentemente por todo el genoma •De fácil y económico análisis •Reproducible
STR and VNTR Typing: PCR Amplification of Repeat Loci
Molecular Biology of the Cell, 4th Edition, pg511
STR and VNTR Typing: Mendelian Inheritance of Repeat Loci
Progeny
Parents
Repeats
Typing a Forensic Sample
Molecular Biology of the Cell, 4th Edition, pg511
Forensic STR Profile Comparison: How Many Loci are Needed?
Nine Repeat Loci and Sex
What is a probability match and what does it mean?
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