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BASES DE DATOS BASES DE DATOS
BIBLIOGRÁFICAS: BIBLIOGRÁFICAS:
PUBMEDPUBMED
diciembre 2011
ÍNDICEÍNDICE
1.- Introducción
2.- Iniciando una búsqueda
3.- Formatos de referencias
5.- Archivar los resultados
6.- Limitar los resultados
4.- Sugerencias para la
búsqueda
¿Qué es una ¿Qué es una
base de base de
datos?datos?
¿Referencias? ¿Números?¿Estadísticas?
DEFINICIÓNDEFINICIÓN
campos(fields)
Conjunto de información información
homogéneahomogénea organizadaorganizada de una
forma determinada y legible por
ordenadorordenadorregistros(records)
IntroducciónIntroducción
11
¿Qué es ¿Qué es
MEDLINE-MEDLINE-
PubMed?PubMed?
- Una base de datos de la National Library of Medicine
- Especializada en ciencias de la salud
- Integrada por más de 20 millones de referencias
- Con información bibliográfica desde 1865
- Y accesible desde http://www.pubmed.com
¿Qué me ¿Qué me
encuentro encuentro
en PubMed?en PubMed?
Bases de
datos
Formulario
de consulta
Herramientas
y recursos
Información
Para comenzar, debe
asegurarse...
...que la base de datos
seleccionada es PubMed
...en el menú desplegable
del comando Search.
Puede consultar otras
bases de datos
disponibles, además de
PubMed...
Iniciando una Iniciando una
búsquedabúsqueda
22
¿Cómo ¿Cómo
comenzar a comenzar a
buscar?buscar?
¿Fibromialgia?
Por ejemplo: fibromyalgia
1
Debe escribirse el término
de la búsqueda en inglés
Para ayudarle en la
escritura del término, se
despliega un menú...
...con términos similares
al que se pretende
consultar
Activar el comando “Search”
2
Al consultar “fibromyalgia”...
...las primeras de
las cuales
pueden
visualizarse en la
misma pantalla
3
...resultan 6.618 referencias...
¿Puedo ¿Puedo
combinar combinar
términos?términos?
¿Fibromialgia
Y ejercicio?
OPCIÓN “A PRIORI”OPCIÓN “A PRIORI”
• Para combinar los términos
deben utilizarse los operadores
booleanos: ANDbooleanos: AND, OR OR y NOTNOT
• Éstos deben escribirse en
mayúsculasmayúsculas y separadosseparados de los
términos
Se escribe el primer
término
(fibromyalgia)...
...luego el operador
AND...
...y después el
segundo término
(exercise)
Recuperándose en total 598
referencias
fibromyalgia AND
exercise
OPCIÓN “A POSTERIORI”OPCIÓN “A POSTERIORI”
• Consiste en buscar
independientemente independientemente cada
término•Utilizar luego la función
“History”“History”•Y, por último, combinar los
términos seleccionando los
booleanos con el ratóncon el ratón
Se busca el primer
término
(fibromyalgia)...
Recuperándose 6.618
referencias relacionadas con
este término
A continuación se
busca el segundo
término (“exercise”)
Recuperándose 232.582
referencias relacionadas con
este otro término
Por último, se
accede desde la
función “Advanced”
(Búsqueda
avanzada)...
...a la función “History”...
...para consultar los resultados
de ambas búsquedas...
Ahora, puede construirse
también la estrategia de
búsqueda de otra forma...
...pinchando sobre el número
previo al primer término
…se despliega un menú,
donde debe seleccionarse la
primera opción (AND)...
...para que se inserte en el
formulario el número del primer
elemento de la estrategia
Después, es necesario
pinchar sobre el número
del segundo término...
Y en el menú,
seleccionar de nuevo el
operador AND...
...para que el segundo
término se incorpore al
formulario de consulta
(“PubMed Advanced
Search Builder”)
Por último, al activar el
comando “Search” se
ejecuta la búsqueda
Recuperándose, igualmente, 598
referencias
¿Cómo ¿Cómo
seleccionar seleccionar
una una
referencia?referencia?
la referencia
Me interesa
nº 4
Puede seleccionarse una
determinada referencia (o más de
una)...
...marcando con el ratón el cuadro en
blanco...
...situado delante del número
de la referencia.
¿Por qué veo ¿Por qué veo
sólo 20 sólo 20
referencias?referencias?
20 referencias, 100 páginas
Por defecto, no pueden verse en
pantalla todas las referencias (598,
en este caso) de una sola vez...
…sino sólo las
20 primeras...
...dispuestas en
sucesivas páginas
¿No puedo ver ¿No puedo ver
más más
referencias en referencias en
pantalla?pantalla?
¡¡TODAS!!
¡¡TODAS!!
“Display Settings”
Para ver más referencias, es
necesario activar la función
“Display Settings”
...y luego seleccionar en
“Items per page, una opción
entre 5 y 200 referencias
“Items per page”
Al elegir, en
“Items per page”,
la opción de 200...
...y activar el
botón “Apply”
...se reagrupan las 598
referencias en sólo
tres páginas
Formatos de Formatos de
referenciasreferencias
33
¿Cómo ¿Cómo
puedo ver puedo ver
los los
abstractsabstracts??
Por defecto, las referencias
se presentan en el formato
“Summary”...
Formato “Summary
”
• Formato “Summary”“Summary” (sumario): autor
título del artículo
revista y paginación
estado de la cita (ej. en proceso)
idioma (si no es inglés)
identificador PubMed (PMID)
artículos relacionados
Formato “Summary
”
AutoresTítulo (en inglés)
Idioma
Artículos relacionados
RevistaPMID
Estado
Formato “Summary
”
Para ver, por ejemplo, el
resumen de las
referencias...
...es necesario activar en la
función “Display Settings”...
... el formato “Abstract”
...en su versión HTML
(“Abstract”)
Resumen
...o en su versión texto
(“Abstract Text”)
Resumen
• Formato “Abstract”“Abstract” (resumen):
autor y lugar de trabajo
título del artículo
revista y descripción física
estado de la cita
idioma (si no es inglés)
resumen y PMID
Formato “Summary
”
Título (en inglés)Revista
Idioma
AutoresLugar de trabajo
Resumen
PMID Estado
¿Y un formato ¿Y un formato
para ver las para ver las
materias?materias?
¿Cómo puedo ver
los MeSH?
Desde el formato “Abstract”...
...seleccionando el botón +
de la sección Publication
Types, MeSH Terms...
...se despliegan
automáticamente...
...primero, el “tipo de
artículo”...
...y luego los “términos
MeSH”.
¿Cómo están ¿Cómo están
ordenadas ordenadas
las las
referencias?referencias?
¿1, 2, 3, 4, 5, 6, etc.?
Por defecto, las referencias
se ordenan
cronológicamente ...
...según se han incorporado a la
base de datos (“Sorted by
Recently Added”)
Al principio, las recién
incorporadas...
...y, al final, las más
antiguas
¿Puedo elegir ¿Puedo elegir
otras otras
ordenaciones?ordenaciones?
¿Por ejemplo,
por arevista?
“Display Settings”
Para seleccionar otras
formas de ordenar, es
necesario activar la función
“Display Settings”
...y luego seleccionar una de
las opciones en “Sort by”
“Sort by”
...fecha de
publicación
(“Sorted by Pub
Date”)
...primer autor
(“Sorted by First
Author”)
...Revista
(“Sorted by
Journal”)
...o por Título del artículo
(“Sorted by Title”)
Sugerencias a la Sugerencias a la
búsquedabúsqueda
44
¿Para qué ¿Para qué
sirve toda la sirve toda la
información a información a
la derecha?la derecha?
¿Free?¿Review?
¿PubMed sssCentral?
En cada búsqueda, PubMed
muestra, en su margen
derecho,...
...una serie de sugerencias o
complementos
Filtrar los resultados
- artículos de acceso libre al texto completo
- o artículos de revisión
A
Otros términos sugeridos
(“Related searches”) para
perfilar y reelaborar la
búsqueda
B
Artículos que incluyen en su título
los términos de la búsquedaC
Artículos de acceso libre al texto
completo desde PubMed CentralD
Archivar los Archivar los
resultadosresultados
55
¿Cómo ¿Cómo
puedo puedo
guardar las guardar las
referencias?referencias?
¿Las tengo que aprender todas sssde memoria?
Comando “Send to”
El comando “Send to” permite
guardar las referencias de
diferentes formas
La opción “Send to”
+ “ File”...
...permite guardar las referencias
(“Create File”) en un archivo...
…pudiendo indicar previamente...
...el formato
(“Format”)...
... y la ordenación
(“Sort by”) de las
referencias...
Al pulsar el botón “Create File”
(Crear archivo)...
…aparece una nueva
ventana con el nombre del
archivo creado
Por defecto:
“pubmed_result.txt”
Al pulsar “Guardar”...
...se archiva el
resultado de la
búsqueda
La opción “Send
to” + “E-mail”...
...permite enviar las referencias
mediante un correo electrónico...
…pudiendo indicar previamente...
...y la dirección a
donde enviarlo
...el formato
(“Format”)...
...la ordenación
(“Sort by”)
...el número de
referencias a
enviar (“Number
to send”)
...una vez
cumplimentado el
formulario...
...y activado el botón “e-mail”
El resultado de la búsqueda es enviado...
La opción “Send
to” +
“Clipboard”...
...permite enviar las referencias a
un archivo virtual (“Add to
Clipboard”)...
...con una capacidad
máxima de 500
referencias (luego, en
este caso, 98 se
quedarían fuera)
...y al que se accede desde el
icono y la función “Clipboard”...
...para consultar las referencias
guardadas provisionalmente (un
máximo de 500)...
...eliminar aquellas que no
nos interesan (“Remove from
clipboard”)...
...guardar las restantes
aplicando la función
“Send to”...
...o eliminarlas todas a la
vez (“Remove all items”)
Una última opción ers
archivar la propia
estrategia de búsqueda
(“fibromyalgia AND
exercise”) para
aprovecharla en un futuro
Para ello basta con
activar la función “Save
search”
PubMed le solicitará
entonces una clave y
contraseña personales
Si no las tiene puede
obtenerlas registrándose
de forma individual
(“Register for an
account”)
Al introducir su clave y
contraseña personales,
PubMed le permite
guardar la estrategia.
Para ello…
…primero debe
darle un nombre
…y luego activar el
botón “Save”
Puede defnir el
envío de alertas
periódicas a su
correo electrónico
O no, si no es
partidario de que le
“bombardeen”
periódicamente con
dichas alertas
Finalmente, debe
pulsar la función
“Save” para que su
estrategia quede
guardada.
En su página
personal en PubMed
¿Cómo ¿Cómo
recuperar la recuperar la
estrategia estrategia
guardada?guardada?
Sí, pero, ¿y dónde se ha quedado?
Para recuperar la
estrategia guardada,
basta con ir a My
NCBI…
…activar la clave y
contraseña
personales…
…buscar la
estrategia en la
sección “Search
Save”…
…y pinchar sobre el
título de la misma
para que
automáticamente se
ejecute en PubMed
Limitar los Limitar los
resultadosresultados
66
¿Qué puedo ¿Qué puedo
hacer si hacer si
obtengo obtengo
muchos muchos
resultados?resultados?
¡¡No puedo leerme138.521
referencias!!
Desde la página principal, en la
columna de la izquierda,
tenemos las opciones para
limitar la búsqueda
…para reducir el número de resultados de la búsqueda
…pueden activarse diversos
filtros..
1.- Tipo de artículo
Hacienco clic sobre “more”, visualizamos todos los tipos
de documento
2.- Disponibilidad del texto
2.- Fecha de publicación
Se puede personalizar el rango
3. Sujetos de la investigación
Al hacer clic con el ratón sobre
una o varias de las opciones,
quedan marcadas
Aquí también visualizamos los filtros activados…
Y si seleccionamos: Mostrar filtros adicionales…
… obtenemos más filtros para incluir en la búsqueda
Se pueden marcar uno o varios…
… y visualizarlos en la página principal
Así, una búsqueda como la de
“fibromyalgia AND exercise”...
...acotada en función de diferentes
filtros
… recupera 74 referencias,
reduciendo el número inicial
BASES DE DATOS BASES DE DATOS
BIBLIOGRÁFICAS: BIBLIOGRÁFICAS:
PUBMEDPUBMED- Búsquedas sencillasBúsquedas sencillas
- Formatos referenciasFormatos referencias
- Guardar referenciasGuardar referencias
- Limitar resultadosLimitar resultados
CRÉDITOSCRÉDITOSEste tutorial ha sido realizado por el Grupo de Investigación del Proyecto ETS PI07/90103: Investigador principal: José Manuel Estrada Lorenzo (Agencia Laín Entralgo) Investigadores: Concepción Campos Asensio (Hospital Universitario de Getafe) Isabel Martínez Hervás (Hospital Severo Ochoa) Juan Medino Muñoz (Hospital Universitario de Fuenlabrada) Concepción Muñoz Tinoco (Hospital Universitario Ramón y Cajal) Olga Reillo Sánchez (Agencia Laín Entralgo) María José Toledano (Hospital Infanta Cristina) Teresa de la Torre Aragonés (Hospital Infanta Leonor)
Asesores: Ana Barderas Manchado (Instituto de Salud Carlos III) Blanca Novella (Agencia Laín Entralgo) Ilustraciones: Eduardo Estrada Lorenzo Financiación: Fondo de Investigaciones Sanitarias
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