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CLADISTICA metodología de reconstrucción filogenética, basada en un tipo especial de similitud. LAS SINAPOMORFÍAS. o caracteres derivados compartidos por un grupo de organismos. es decir caracteres que se han modificado respecto de cómo los encontramos en ancestros más lejanos. - PowerPoint PPT Presentation
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CLADISTICA
metodología de reconstrucción filogenética, basada en
un tipo especial de similitudLAS SINAPOMORFÍAS
o caracteres derivados compartidos por un grupo de
organismos
es decir caracteres que se han modificado respecto de
cómo los encontramos en ancestros más lejanos
Un ejemplo: las medusas, las estrellas de mar y los humanos
¿Quiénes están más cercanamente emparentados?
¿POR QUÉ ES MEJOR AGRUPAR POR SINAPOMORFÍAS?
permite hacer clasificaciones que reflejen mejor la
historia evolutiva y tengan un mayor valor predictivo
permite hacer inferencias de cómo funciona la
evolución, al mostrar cómo un carácter se ha
modificado a lo largo de la historia
permite hacer estudios de adaptación
ALGUNAS SUPOSICIONES
1) todo grupo de organismos está relacionado por
descendencia de un ancestro común
2) existe un patrón de bifurcación en la formación de
las ramas del árbol (cladogénesis)
3) ocurren cambios en los caracteres a lo largo de la
historia evolutiva
4) los caracteres cambian de manera independiente
5) el mejor árbol es aquel que postula el menor
número de pasos para explicar los cambios en los
caracteres (criterio de parsimonia)
1) elección del INGROUP, es decir el grupo de organismos cuyas relaciones se quieren determinar
Australopithecus afarensis
Homo habilis
Homo sapiens neanderthalensis
Australopithecus africanus
Homo heidelbergensis
Homo sapiens sapiens
¿CÓMO CONSTRUÍR UN CLADOGRAMA?
2) determinación de los caracteres que se van a utilizar
Secuencias de ADN
Secuencias de proteínas
Caracteres morfológicos
Caracteres embriológicos
Caracteres comportamentales
Caracteres ecológicos
3) determinación de los estados posibles para cada carácter y codificación de los mismos
Binarios: dos estados posibles. Ej: presencia/ausencia
Multiestado: más de dos estados posibles. Ej: A, T, C, G
No ordenados: cualquier estado puede transformarsedirectamente en otro.
1 2
3 4
Ordenados: se pueden determinar los estados intermedios.
1 2 3
4)elección de un OUTGROUP o varios, que permitan dar polaridad a los caracteres al enraizar el árbol
Pan
Gorilla
H.s. sapiens
H.habilis
Gorilla
Pan A. afarensis
A. africanus
5)construcción de una matriz de caracteres
carácter 1 carácter 2 carácter 3 carácter 4A. africanus 0 1 2 1H. habilis 1 1 2 1A. afarensis 1 1 2 2H. heidelbergensis 1 1 2 2H. s. neanderthalensis 1 2 2 2H. s. sapiens 1 2 2 3Gorilla 0 1 1 1Pan 0 0 1 0
6) elección del tipo de parsimonia que se va a utilizar (criterio de “optimality”)
Parsimonia de Fitch
Parsimonia de Wagner
Parsimonia de Dollo
Parsimonia de Carmin y Sokal
Parsimonia de transversiones
Parsimonia generalizada
7) búsqueda del/los árbol/es más corto/s mediante algoritmos exactos o heurísticos
H. sapiens sapiens
H. s. neanderthalensis
H. heidelbergensis
H. habilis
A. afarensis
Gorilla
A. africanus
Pan
HOMÍNIDOS
HOMO
8) aplicación de índices y métodos de remuestreo que den soporte a los grupos establecidos por el/los árboles
Índice de consistencia
Índice de retención
Decisividad
Bremer support
Bootstrap
Jacknife
Búsqueda
de árboles
Algoritmos exactos
Métodos heurísticos
Búsquedas exhautivas
Métodos de branch-and-bound
Stepwise addition
As is
Closest
Branch swapping
NNI
SPR
TBR
Branch swapping
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