TAXONOMÍA BACTERIANA

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DEL ESTADO DE MÉXICOFACULTAD DE QUÍMICA

UNIDAD DE APRENDIZAJE: BACTERIOLOGÍA CLÍNICA BÁSICATAXONOMÍA BACTERIANA

MSP SERGIO H. PAVÓN ROMEROFEBRERO 2013

TAXONOMÍA: CIENCIA DE LA CLASIFICACIÓN BIOLÓGICA.

CLASIFICAR: Ordenar o disponer en clases. Del latín classificare. Dividir o disponer en clases o categorias. Determinar la clase a la que pertenece algo.

TAXONOMÍA:

taxis: ESTRUCTURA U ORDEN.nomos: LEYnemein: DISTRIBUIR O GOBERNAR.

CLASIFICACIÓN NOMENCLATURA

IDENTIFICACIÓN

IDENTIFICACIÓN: PROCESO QUE DETERMINA QUE UN AISLAMIENTO PERTENECE A UN TAXÓN ESPECÍFICO.

En biología, un taxón del griego (ταξις) taxis, «ordenamiento» es un grupo de organismos emparentados, que en una clasificación dada han sido agrupados asignándole un nombre en latín.

CLASFICACIÓN: ESTRUCTURACIÓN DE LOS ORGANISMOS EN GRUPOS O TAXONES CONSIDERANDO SUS SEMEJANZAS Ó PARENTEZCO EVOLUTIVO.

IDENTIFICACIÓN: ASIGNAR NOMBRES CONFORME A NORMAS A GRUPOS TAXONÓMICOS.

Escherichia coli

IMPORTANCIA

AGRUPA A LOS MICROORGANISMOS CON NOMBRES PRECISOS QUE PERMITE UNA COMUNICACIÓN

EFICIENTE ENTRE MICROBIÓLOGOS.

IMPORTANCIA

PERMITE LA IDENTIFICACIÓN EXACTA DE LOS MICROORGANISMOS

Familia Pseudomonadaceae. Bacilos Gram-negativos, con flagelos polares.Producen citocromo oxidasa.Género: Pseudomonas: P. aeruginosa

TAXONOMÍA BACTERINA

TAXONOMÍA SISTEMÁTICA

ESTUDIO CIENTÍFICO DE LOS MICROORGANISMOS CUYOOBJETIVO FINAL ES CARACTERIZARLOS Y AGRUPARLOS EN FORMA ORDENADA.

DISCIPLINAS QUE ABORDA:

MORFOLOGÍAECOLOGÍA

EPIDEMIOLOGÍA

BIOQUÍMICA

BIOLOGÍA MOLECULAR

FISIOLOGÍA

EVOLUCIÓN Y DIVERSIDAD MICROBIANA

ESTROMATOLITOS (CIANOBACTERIAS)

BACTERIAS FÓSILES3500-3800 MILLONESDE AÑOS,

KARL WOOSEÁRBOLFILOGENÉTICO

EUBACTERIAS

EUCARIOTAS

ARQUEOBACTERIAS

(RNAr)

RANGOS TAXONÓMICOS

DOMINIO

SECCIÓN

FAMILIA

GENERO

ESPECIE

CONCEPTOS:

CEPA: POBLACIÓN QUE DESCIENDE DE UNA SOLA BACTERIAO DE UN CULTIVO PURO.

CEPA TIPO: PRIMERAS CEPAS ESTUDIADAS Y ESTÁ MASCARACTERIZADA QUE OTRAS.

TAXONOMÍABACTERIANA

GÉNERO: GRUPO BIEN DEFINIDO DE UNA O MÁS ESPECIES

ESPECIE: CEPAS QUE COMPARTEN PROPIEDADES ESTABLESY QUE DIFIEREN EN FORMA SIGNIFICATIVA DE OTROS GRUPOS DE CEPAS.

TAXONOMÍA BACTERIANA.

SISTEMA BINOMIAL

LINNEONOMBRE LATINIZADO Y LETRA CURSIVA

Escherichia coli, Bacillus subtilis, …

(1980) International JournalOf Systematic Bacteriology LISTA DE NOMBRES

APROBADOS

BERGEY´S MANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY

BERGEY´S MANUAL OF DETERMINATIVE BACTERIOLOGY

SISTEMAS DE CLASIFICACIÓN

CLASIFICACIÓN NATURALDE LINNEO

TAXONOMÍA NUMÉRICA

CLASIFICACIÓNFILOGENÉTICA

CLASIFICACIÓN NATURAL

CARACTERÍSTICAS ANATÓMICAS(MEDIADOS DEL SIGLO XVIII)

SISTEMA FENÉTICO

TAXONOMÍA NUMÉRICAORDENADORESCÓMPUTO

ORDENAMIENTO POR MÉTODOS NUMÉRICOSDE UNIDADES TAXONÓMICAS EN TAXONES.(ANÁLISIS NUMÉRICO)

TAXONOMÍA NUMÉRICA:

REQUIERE COMPARAR DECENAS O CENTENAS DE CARACTERES PARA REALIZAR UNA CLASIFICACIÓN PRECISA Y CONFIABLE.(MORFOLÓGICOS, BIOQUÍMICOS, FISIOLÓGICOS,ETC)

DETERMINACIÓN DE LA CONCORDANCIA

COEFICIENTE DE EMPAREJAMIENTOSIMPLE (Ssm)

COEFICIENTE DE JACCARD(Sj)

MATRÍZ DE SEMEJANZA

FENONES

DENDROGRAMAS

TAXONOMÍA NUMÉRICA

ESTUDIO DE LA FILOGENIEBACTERIANA

CRONÓMETROS MOLECULARES

ARBOLES FILOGENÉTICOS

DISTANCIA EVOLUTIVA

SECUENCIA DEOLIGONUCLEÓTIDOSFIRMA

CARACTERÍSTICAS APLICADAS EN LATAXONOMÍA

CLÁSICAS

MORFOLÓGICAS

FISIOLÓGICAS

BIOQUÍMICAS

ECOLÓGICAS

MOLECULARES

. PROTEÍNAS

. ÁCIDOS NUCLÉICOS:COMPOSICIÓNTEMP. DE FUSIÓNHIBRIDACIÓNSECUENCIACIÓN

HISTORIA DEL MANUAL DE BERGEY.

1923 PRIMERA EDICIÓN (1925,1930,1934,1939,1948,1957,1966)1974 OCTAVA EDICIÓN.1977 EDICIÓN ABREVIADA.1981 Suplemento al Index Bergeyana (1966)

1984 Primera edición-Bergey´s Manual of Systematic BacteriologyVolumenes I-IV.Reino: Procariotae ( Divisiones: Gracilicutes, Firmicutes,Tenericutes y Mendosicutes)

1994 Bergey´s Manual of Determinative Bacteriology (Novena Edición)

BERGEY´S MANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY.

REINO: PROCARYOTAE

DIVISION: GRACILICUTESDIVISIÓN: FIRMICUTESDIVISIÓN: TENERICUTESDIVISIÓN: MENDOSICUTES

TAXONOMÍA BACTERIANA.

CLASES INCLUIDAS EN LAS DIVISIONES DEL REINO PROCARYOTAE

DIVISIÓN I. GRACILICUTESCLASE I: ScotobacteriaCLASE II. AnoxyphotobacteriaCLASE III. Oxyphotobacteria

DIVISIÓN II. FIRMICUTESCLASE I: FirmibacteriaCLASE II: Thallobacteria

DIVISIÓN III. TENERICUTESCLASE I: Mollicutes

DIVISIÓN IV. MENDOSICUTESCLASE I: Archeobacterias.

BERGEY´S MANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY

SECCIONES

FAMILIA

GÉNERO

ESPECIES

SECCIONES:

1. THE SPIROCHETES1. ORDEN: SPIROCHAETALES

FAMILIA I: SPIROCHAETACEAEGÉNERO: Spirochaeta

FAMILIA II: LEPTOSPIRACEAEGÉNERO: Leptospira

SECCIÓN 2. AEROBIC/MICROAEROPHILIC, MOTILE, HELICAL VIBRIOID GRAM NEGATIVE BACTERIA.

FAMILIA: SPIRILLACEAE

GÉNEROS: ENTRE OTROS– Campylobacter y Vibrio.

SECCIÓN 3. NONMOTILE (O RARELY MOTILE), GRAM NEGATIVE CURVED BACTERIA.

FAMILIA: SPIROSOMACEAE

(APARENTEMENTE NO INCLUYE GÉNEROS PATÓGENOS PARA EL HOMBRE)

SECCIÓN 4. GRAM NEGATIVE AEROBIC RODS AND COCCI.

FAMILIAS: Entre otras: PSEUDOMONADACEAELEGIONELLACEAENEISSERIACEAE

SECCIÓN 5. FACULTATIVELY ANAEROBIC GRAM NEGATIVE RODS.

FAMILIAS: I. ENTEROBACTERIACEAE II. VIBRIONACEAE III. PASTEURELLACEAE

SECCIÓN 6. ANAEROBIC GRAM NEGATIVE STRAIGHT, CURVED AND HELICAL RODS.

FAMILIA I. BACTEROIDACEAE

SECCIÓN 7. DISSIMILATORY SULFATE OR SULFUR REDUCING BACTERIA.

I. BACTERIAS CAPACES DE OXIDAR ACETATO HASTA CO2

GÉNERO: Desulfuromonas

II. BACTERIAS REDUCTORAS DE SULFATO, SULFITO, TIO-SULFATO U OTROS COMPUESTOS OXIDADOS DEAZUFRE.

GENEROS: Desulfovibrios, Desulfomonas, Desulfococcus, Desulfobacter, Desulfobulbus, Desulfotomaculum, Desulfosarcina, Desulfonema

SECCIÓN 8. ANAEROBIC GRAM NEGATIVE COCCI.

FAMILIA I. VEILLONELLACEAEGENERO I. Veillonella (7)

II. Acidaminococcus (1) III. Megasphera (1)

SECCIÓN 9. THE RICKETTSIAS AND CHLAMYDIA

SECCIÓN 10. THE MYCOPLASMAS

SECCIÓN 11. ENDOSYMBIONTES (Simbiosis con Protozooarios)

VOLUMEN 2.

SECCIÓN 12. GRAM POSITIVE COCCI.

FAMILIA I. MICROCOCCACEAEGENEROS I. Micrococcus

II. Stomatococcus III. Planococcus IV. Staphylococcus

FAMILIA II. DEINOCOCCACEAEGENERO I: Deinococcus

OTROS GENEROS: Streptococcus,Leuconostoc, Pediococcus Aerococcus, Gemella, Peptococcus, Pepto- streptococcus, Ruminococcus, Coproco- ccus, Sarcina.

SECCIÓN 13. ENDOSPORE FORMING GRAM POSITIVE RODS AND COCCI.

GENEROS: Bacillus, Clostridium, (+4)

SECCIÓN 14. REGULAR NON SPORING GRAM POSITIVE RODS.

GENEROS: Lactobacillus, Listeria, (+5)

SECCIÓN 15. IRREGULAR NON-SPORING GRAM POSITIVE RODS

GENEROS: Corynebacterium, Gardnerella, Propionibacterium Eubacterium, Actinomyces, Bifidobacterim, (+15)

TAXONOMIA BACTERIANA

SECCIÓN 16. THE MYCOBACTERIA

FAMILIA. MYCOBACTERIACEAEGENERO: Mycobacterium (49 )

SECCIÓN 17. NOCARDIOFORMS

GENEROS: Nocardia (+8)

VOLUMEN 3.

SECCIÓN 18. ANOXYGENIC PHOTOTROPHIC BACTERIA

( Purple non sulfur bacteria, Green sulfur bacteria, otros)

SECCIÓN 19. OXYGENIC PHOTOSYNTHETIC BACTERIA

(Cyanobacterias, otras…..)

SECCIÓN 20. AEROBIC CHEMOLITHOTROPHIC BACTERIA AND ASSOCIATED ORGANISMS.

( Bacterias nitrificantes, bacterias sulfurosas incoloras, Bacterias quimiolitotróficas obligadas(H2), Bacterias oxidantes de Hierro y Manganeso)

SECCIÓN 21. BUDDING AND/OR APPENDAGED BACTERIA.

SECCIÓN 22. SHEATHED BACTERIA.

SECCIÓN 23. NONPHOTOSYNTHETIC, NONFRUITING GLIDING BACTERIA.

SECCIÓN 24. FRUITING, GLIDING BACTERIA: THE MYXOBACTERIA

SECCIÓN 25. ARCHAEOBACTERIAS

VOLUMEN 4. THE ACTINOMYCETES

SECCIÓN 26. NOCARDIOFORM ACTINOMYCETES

SECCIÓN 27. ACTINOMYCETES WITH MULTILOCULAR SPORANGIA

SECCIÓN 28. ACTINOPLANETES

SECCIÓN 29. STREPTOMYCETES AND RELATED GENERA

SECCIÓN 30. MADUROMYCETES

SECCIÓN 31. THERMOMONOSPORA

SECCIÓN 32. THERMOACTINOMYCETES

SECCIÓN 33. OTROS GENEROS

2001 BERGEY´S MAMANUAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY2ND. EDITION. VOLUMES I-V.

VOL. I. The Archea, Cyanobacteria, Phototrophos, and deeplybranching genera.(Secciones I-XIV)

VOL. II. The Proteobacteria (Secciones XV-XIX)(Subdivisiones alfa, beta, gamma, delta y épsilon)

VOL. III. The Low G+C Gram Positives (Secciones XX-XXII)VOL. IV. The High G+C Gram Positives (Sección XXIII)VOL. V. The Planctonmycetes, Spirochaetes, Fibrobacteres,

Bacteroides y Fusobacteria (Secciones XXIV-XXXI)

TAXONOMÍA BACTERIANA

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