CESGA: Curso Básico SVG

CESGA, GALICIA SUPERCOMPUTING CENTER

Curso Básico SVGJavier Cacheiro Lópezjlopez@cesga.es

Contenido

Acceso al sistema Uso del sistema Documentación Soporte

Acceso

Acceso al Sistema

Paso 1: Abrir la VPN usando FortiSSL https://www.cesga.es/es/soporte_usuarios/usr-

servicio-computacion/conexion_remota

Paso 2: Acceder a través de SSH svg.cesga.es

Uso del Sistema

Sesiones interactivas

Sesiones Interactivas: compute

Sesiones interactivas con entorno gráfico

Usando X11 forwarding ssh -X svg.cesga.es compute Aplicación: gedit, gnome-terminal, etc.

VNC a través de Web

http://10.112.6.23:5801 (baja resolución)

http://10.112.6.23:5802 (alta resolución)

Envío de un trabajo

qsub -l <recursos> job.sh

Solicitar 1 core AMD Opteron durante 10 horas, 2GB de memoria y 20GB de disco:

arch=amd,num_proc=1,s_rt=10:00:00,s_vmem=2G,h_fsize=20G

Solicitar 1 core Intel Xeon Sandy Bridge durante 10 horas, 2GB de memoria y 20GB de disco:

arch=sandy,num_proc=1,s_rt=10:00:00,s_vmem=2G,h_fsize=20G

Ver los trabajos en Cola

Los trabajos en cola pueden verse con el comando qstat

Ficheros de salida de los trabajos

Salida standard: job.sh.o<job-ID> Salida de error: job.sh.e<job-ID>

Alerta por email en caso de fallo

Añadir las siguientes opciones al qsub -M jlopez@cesga.es -m bea

Al principio del trabajo: b Al final del trabajo: e Cuando falla o es reencolado: a

Indicar la prioridad de un trabajo

Especificar la prioridad del trabajo

-p [-1023:1024]

El valor por defecto es 0

Almacenamiento

HOME: Protegido con backup Mejor rendimiento

Store: Almacenamiento masivo $HOME/mnt/store

Scratch: $TMPDIR Almacenamiento local Sólo existe mientras se ejecuta el trabajo

Aplicaciones pre-instaladas

www.cesga.es → Soporte usuarios → Aplicaciones → SVG

module available R/2.15.2 R/3.0.1 Python/2.7.3 Perl5.10.1 (sistema)

Utilizar una aplicación pre-instalada

module load R/3.0.1 module help R/3.0.1

Estado de los sistemas

https://www.cesga.es/es/soporte_usuarios/usr-servicio-computacion/estado-sistemas

Estado de los sistemas: Trabajos en ejecución

http://193.144.35.79/beta/SVGqueueR.html

Documentación

Identificarse en la web del CESGA www.cesga.es → Soporte usuarios →

Computación

En la sección "Mis tickets" podrá abrir nuevas consultas o incidentes de los diversos servicios existentes, así como hacer un seguimiento de aquellas consultas en curso, o verificar aquellas que ya han sido resueltas.

En la sección "Formación" podrá consultar la oferta formativa de CESGA u otras convocatorias y/o cursos que puedan ser de interés en el ámbito de actuación del CESGA. También se facilitan materiales de interés y localizar materiales de interés.

En la sección "Formularios de solicitud" encontrará un acceso rápido para la solicitud de cualquier servicio de CESGA, así como otros formularios de interés como pueden ser el de visitas al centro, solicitud de acceso al CPD para intervenciones, etc. Aquí también podrá localizar la información relativa a las políticas de uso aceptables relativas a la Red de Ciencia y Tecnología de Galicia (RECETGA) así como a los servicios de computación u otros provistos.

Soporte

Teléfono: 981569810

Email: sistemas@cesga.es/aplicaciones@cesga.es

Tickets abiertos:

https://www.cesga.es/es/soporte_usuarios/mis-tickets

¿Preguntas?