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Edicin: Lic. Daisy Bello lvarezDiseo interior y cubierta, emplane e ilustracin: D.I. Jos Manuel Oubia Gonzlez
Lidia Cardell Rosales, 2007 Sobre la presente edicin: Editorial Ciencias Mdicas, 2007
Editorial Ciencias MdicasCalle I No 202 esquina a Lnea, El VedadoCiudad de La Habana10400, CubaCorreo electrnico:[email protected]: 832 5338, 838 3375
Cardell Rosales, Lidia. Bioqumica humana/Lidia CardellRosales y colaboradores. La Habana:Editorial Ciencias Mdicas, 2007. XIV., 332 p.: il., tab.
Bibliografa al final del libro.ISBN 959-212-238-3
QU 4
1. BIOQUIMICA/educacin
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AutoresDra. Lidia Cardell Rosales
Doctora en Ciencias Biolgicas. Profesora de Mrito.Especialista de II Grado en Bioqumica Clnica. Profesora TitularConsultante del Departamento de Bioqumica de la EscuelaLatinoamericana de Medicina de La Habana (ELAM).
Dr. Rolando Hernndez FernndezEspecialista de II Grado en Bioqumica Clnica. Profesor Titulardel departamento de Bioqumica del Instituto de Ciencias BsicasVictoria de Girn, ISCM-H.
Dra. Celia Upmann Ponce de LenDoctora en Ciencias Mdicas. Especialista de I Grado en BioqumicaClnica. Profesora Titular Consultante del departamento de Bioqumicadel Instituto de Ciencias Bsicas Victoria de Girn, ISCM-H.
Dr. Agustn Vicedo TomeyDoctor en Ciencias Mdicas. Especialista de II Grado en BioqumicaClnica. Profesor Titular del departamento de Bioqumica del Instituto deCiencias Bsicas Victoria de Girn, ISCM-H.
Dr. Simn Sierra FigueredoMSc. Educacin Mdica Superior. Especialista de II Grado enBioqumica Clnica. Profesor Titular de la Vicerrectora de desarrollo delISCM-H.
Dra. Estrella Rubio BernalEspecialista de II Grado en Bioqumica Clnica. Profesora Auxiliar deldepartamento de Bioqumica de la Escuela Latinoamericanade Medicina de La Habana (ELAM).
Dr. Ral Fernndez RegaladoDoctor en Ciencias Mdicas. Especialista de II Grado en BioqumicaClnica. Profesor Titular del Instituto de Ciencias Bsicas Victoria de Girn.
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. . . yo s que la palabra Bioqumica produce determinados reflejos
condicionados en nuestros estudiantes. Y cuando los vemos
traumatizados por la Bioqumica, horrorizados por la Bioqumica,
decimos: Cmo es posible, siendo tan interesante, tan maravillosa y
tan til la Bioqumica?
Fidel Castro Ruz
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ndice
La ciencia bioqumicay la disciplina Bioqumica/ 1
Objeto de estudio de la bioqumica/ 1La disciplina Bioqumica en el plan de estudio dellicenciado en enfermera/ 2Categoras, principios y conceptos generales/ 2
Categoras/ 2Principios/ 3Conceptos generales/ 4
Habilidades intelectuales/ 4Mtodo de estudio de la bioqumica/ 6Resumen/ 7Ejercicios/ 7
Agrupaciones derivadas/ 13Hemiacetales/ 13Acetales/ 14steres/ 14ter/ 15Tioster/ 15Amida/ 15
Anhdrido de cido/15Isomera/ 16Isomera estructural/ 16Isomera espacial/ 17Series estricas D y L/ 19Conformaciones distintas de las molculas/ 20Agua como disolvente en los organismos vivos/ 21cidos y bases/ 21Resumen/ 24Ejercicios/ 24
Introduccin al estudiode las biomolculas/ 9
Caractersticas generales de las biomolculas / 9Enlaces qumicos/ 10
Enlace inico/ 10Enlace covalente/ 10
Interacciones dbiles/ 10Puente de hidrgeno/ 11Interacciones hidrofbicas/ 11Interacciones electrostticas/ 11Fuerzas de Van der Waals/ 11Grupos funcionales presentes en las biomolculas/ 11Grupo hidroxilo / 12Grupo carbonilo/ 12Grupo carboxilo/ 12Grupo sulfidrilo/ 13Grupo amino/ 13Amidas/ 13
Estructura y funcin de los precursoresde macromolculas/ 27
Aminocidos/ 27Funciones de los aminocidos/ 30Clasificacin de los aminocidos/ 30Propiedades elctricas de los aminocidos/ 31Interacciones entre grupos de las cadenaslaterales(R) de los aminocidos/ 32Enlace peptdico/ 32
Monosacridos/ 33
Funciones de los monosacridos/ 36Formacin del enlace glicosdico/ 36
Nucletidos/ 37Clasificacin de los nucletidos/ 38Funcin de los nucletidos/ 38
Nomenclatura de los nucletidos/ 39Formacin del enlace fosfodister/ 39
Resumen/ 40Ejercicios/ 41
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Estructura y funcinde los lpidos/ 43
Clasificacin de los lpidos/ 43cidos grasos/ 44
Ceras/ 46Acilgliceroles/ 46Fosftidos de glicerina/ 47Esfingolpidos/ 48Terpenos/ 49Esteroides/ 49
Funciones de los lpidos/ 50Membranas biolgicas/ 51
Componentes de las membranas biolgicas/ 51Mecanismos de transporte/ 52
Resumen/ 54Ejercicios/ 55
Efecto del pH/ 85Efecto de la temperatura/ 85
Inhibicin enzimtica/ 85Efecto de los inhibidores/ 85
Regulacin enzimtica/ 87Regulacin alostrica/ 88Modificacin covalente/ 89Isoenzimas/ 90
Organizacin de las enzimas/ 91Cofactores enzimticos/ 92
Coenzimas y vitaminas/ 92Resumen/ 97Ejercicios/ 98
Protenas/ 57
Pptidos y protenas/ 57Estructura de los pptidos/ 58
Importancia biomdica/ 58Estructura de las protenas/ 59
Nivel primario/ 59Nivel secundario/ 59Nivel terciario/ 61Nivel cuaternario / 63
Relacin estructura-funcin/ 63Propiedades de las protenas/ 67
Desnaturalizacin/ 67Propiedades fsico-qumicas/ 68
Resumen/ 69Ejercicios/ 70
Biocatalizadores/ 71
Reacciones qumicas y catalizadores/ 71
Sistemas biocatalticos/ 75Mecanismo bsico de accin de las enzimas/ 75Centro activo/ 76
Clasificacin y nomenclatura de las enzimas/ 78Clasificacin/ 78
Nomenclatura/ 79Cintica de las reacciones enzimticas/ 81
Efecto de la concentracin de la enzima/ 82Efecto de la concentracin de sustrato/ 82Efecto de la concentracin de cofactores/ 84
Respiracin celular/ 99
Las necesidades energticas del organismo/ 99Fuentes de energa/ 100
Reacciones de oxidacin-reduccin/ 101Energa asociada a las reacciones redox/ 102
La hidrlisis de las macromolculas/ 103Formacin de los metabolitos comunes/ 103Va degradativa final comn: la respiracin celular/ 104Introduccin al metabolismo celular/ 104
Vertientes del metabolismo/ 104Vas metablicas/ 105Aspectos generales de la regulacin del metabolis-mo: Regulacin de una va metablica/ 107
La mitocondria/ 108Estudio de los procesos metablicos/ 108
Ciclo de Krebs/ 109La cadena respiratoria/ 116Cadena transportadora de electrones/ 116
Complejos de la cadena transportadora de electro-nes/ 119Aspectos generales de la regulacin de la velocidaddel transporte de electrones/ 121
La fosforilacin oxidativa/ 123La estructura del complejo de la ATP sintetasa/ 124La teora quimioosmtica/ 125Mecanismo de la fosforilacin oxidativa/ 125Factores que controlan la respiracin celular/ 126
Resumen/ 127
Ejercicios/ 131
Metabolismode los glcidos/ 133
Homeostasis de la glucemia/ 133Digestin y absorcin de los glcidos de la dieta/ 133
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Entrada de la glucosa a los tejidos y su fosforilacininicial/ 136
Glucognesis/ 137Glucogenlisis/ 141Gluclisis/ 143Gluconeognesis/ 149
Incorporacin de otras hexosas a la va glucoltica/ 153Incorporacin de la manosa a la va glucoltica/ 154
Incorporacin de la galactosa a la va glucoltica/ 154Incorporacin de la fructosa a la va glucoltica/ 155Ciclo de las pentosas/ 156Especificidades hsticas en el metabolismo de losglcidos/ 157
Alteraciones del metabolismo de los glcidos/ 158Glucogenosis/ 158
Resumen/ 161Ejercicios/ 163
Metabolismo de compuestosnitrogenados de bajo peso
molecular/ 199
Protenas de la dieta comn/ 200Necesidades cuantitativas y cualitativas de prote-nas/ 200Digestin de las protenas/ 200Digestibilidad de las protenas/ 203Absorcin intestinal de los aminocidos/ 203Reacciones metablicas generales de losaminocidos/ 208
Encefalopata heptica/ 216Sndrome ictrico/ 217
Formacin y metabolismo de la bilirrubina/ 217Causas de la ictericia/ 219Clasificacin de las ictericias/ 220
Metabolismo de la ictericia / 220Resumen/ 221Ejercicios/ 222
Integracin y regulacindel metabolismo/ 223
La regulacin del metabolismo/ 223La integracin del metabolismo/ 224
La integracin y regulacin metablica en el
organismo/ 227Tipos de comunicacin intercelular/ 228Hormonas/ 228
Resumen/ 237Ejercicios/ 237
El metabolismoen situaciones especficas/ 239
Cerebro/ 240
Msculo esqueltico/ 240Corazn/ 242Tejido adiposo/ 242Hgado/ 243Rin/ 244
Adaptaciones metablicas en el ayuno/ 244Adaptaciones metablicas en el ejercicio fsico/ 247Adaptaciones metablicas en la diabetes mellitus/ 251
Resumen/ 256Ejercicios/ 257
Metabolismode los lpidos/ 165
Digestin y absorcin de los lpidos de la dieta.Papel de las sales biliares en la digestin de loslpidos/ 165
Digestin/ 165Absorcin/ 168Liplisis/ 169Oxidacin de los cidos grasos/ 169Transporte de cidos grasos a la mitocondria/ 170
Cuerpos cetnicos/ 174Cetognesis/ 175Cetlisis/ 177
Lipognesis/ 178Biosntesis de los cidos grasos/ 178Regulacin de la sntesis de cidos grasos enmamferos/ 182
Formacin de los triacilgliceroles/ 184El colesterol. Su importancia y fuentes para elorganismo humano/ 185
Biosntesis del colesterol/ 185Regulacin de la sntesis de colesterol/ 187
Las lipoprotenas/ 188Clasificacin de las lipoprotenas/ 188
Receptores de las lipoprotenas/ 189Sistemas enzimticos que participan en el metabo-lismo de las lipoprotenas/ 189Metabolismo de las lipoprotenas/ 189Metabolismo de las lipoprotenas y ateroesclerosis/ 191
La obesidad. Tipos de obesidad y sus consecuencias/ 192Causas de obesidad/ 193Prevencin y tratamiento/ 194
Resumen/ 195Ejercicios / 197
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cidos nucleicos/ 259
cidos ribonucleicos/ 259cidos ribonucleicos de transferencia (ARNt)/ 260cidos desoxiribonucleicos (ADN)/ 261
Genes eucariontes/ 263Expresin de la informacin gentica/ 268Regulacin de la expresin de la informacingentica/ 273Conservacin de la informacin gentica/ 275
Las mutaciones/ 275Las enfermedades moleculares/ 276Resumen/ 279
Ejercicios/ 280
Control del pH sanguneo/ 281
Mecanismos reguladores del pH sanguneo/ 281
Sistemas amortiguadores/ 281
Mecanismos respiratorios/ 283
Mecanismos renales/ 283
Alteraciones del equilibrio cido-bsico/ 284
Clasificacin/ 284Medidas teraputicas bsicas/ 285
Resumen/ 285
Ejercicios/ 286Nutricin/ 287
Dieta, alimentos nutrientes. Funciones de losnutrientes/ 287Requerimientos energticos en el ser humano/ 288Valor calrico de los nutrientes. Factores Atwater/ 292
Las protenas en la dieta humana/ 292Los glcidos en la dieta humana/ 297Los lpidos en la dieta humana/ 298Vitaminas en la dieta humana/ 298Los minerales en la dieta humana/ 301
Recomendaciones dietticas/ 305Alteraciones nutricionales/ 306
Kwashiorkor/ 306Marasmo nutricional/ 307
Resumen/ 307Ejercicios/ 308Bibliografa/ 309
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Prlogo
L a Enfermera, que fuera calificada por nuestro apstol Jos Mart, comola ms noble de las ocupaciones, es adems una de las profesionesms antiguas del mundo. La preparacin organizada de este personal se inicia
en Cuba en los finales del siglo XIXcon el propsito de mejorar la calificacin
de los enfermeros.
En 1976 comenz en Ciudad de La Habana el primer curso de Licenciatura
en Enfermera, que permiti elevar el nivel cientfico tcnico de estos profesio-
nales al poner al alcance de los mismos el nivel universitario de enseanza.
Actualmente esta carrera se cursa en todas las facultades de Ciencias Mdi-
cas del pas.
Cuando la Enfermera pas a convertirse en profesin universitaria, se incluy
la disciplina Bioqumica como parte del plan de estudio de esta especialidad,aunque en esos momentos los cursantes no disponan de un texto especial-
mente preparado para este perfil y deban emplear los que fueron elaborados
para otras carreras, con los inconvenientes de su falta de especificidad.
El presente libro ha sido elaborado teniendo en cuenta las necesidades parti-
culares de la especialidad de Licenciatura en Enfermera, tomando como base
el programa vigente de la disciplina Bioqumica para esta carrera universitaria
y con el propsito explcito de brindar al estudiante la posibilidad de apropiar-
se de los conocimientos de esta disciplina de una forma orientada y aplicada,en correspondencia con los objetivos declarados en el programa. Si estos
propsitos se logran nos sentiremos plenamente satisfechos.
Los autores
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La ciencia bioqumica
y la disciplina Bioqumica
a bioqumica es la ciencia que estudia las bases moleculares de la vida; por loque se ocupa de la composicin qumica de la materia viva, la relacin
estructura-funcin de las molculas caractersticas de los seres vivos
(biomolculas), as como de las transformaciones qumicas que se llevan a
cabo en dichos organismos (metabolismo) y los mecanismos moleculares que
intervienen en la regulacin de tales transformaciones.
La bioqumica es una ciencia relativamente nueva, ya que se reconoce
como tal a inicios del siglo XXy de hecho el trmino bioqumica se emple por
vez primera en el ao 1903. La bioqumica ha contribuido al desarrollo de
otras especialidades biolgicas, particularmente las biomdicas.
Numerosos aportes de la bioqumica han desempeado un papel destaca-
do en los logros experimentados en las ciencias mdicas, entre estos la cabal
comprensin de las causas moleculares de numerosas enfermedades, el desa-rrollo de variadas tcnicas para el diagnstico, as como el fundamento para
la elaboracin de ciertos medicamentos en el tratamiento de determinadas afec-
ciones son ejemplos de la aplicacin directa de la bioqumica a la medicina.
De ah la importancia de su estudio para los profesionales de las ciencias
mdicas.
Objeto de estudio de la bioqumica
La bioqumica y en especial la bioqumica humana se ocupa del estudio de:
1. La relacin estructura-funcin de las biomolculas.
2. Las organizaciones supramacromoleculares que constituyen la base de lasestructuras celulares, los tejidos y el organismo.
3. Los mecanismos de accin de los biocatalizadores.
4. Las bases moleculares de la conservacin, transferencia y expresin de la
informacin gentica.
5. Los procesos metablicos celulares, su especificidad hstica y los meca-
nismos reguladores de los mismos.
6. Las alteraciones bioqumicas que son causas, complicaciones o acompa-
an diversas enfermedades.
L
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2 Bioqumica Humana
La disciplina Bioqumica en el plan de estudio
del licenciado en enfermera
La ciencia bioqumica es muy amplia, la disciplina Bioqumica constituye la parte
de la ciencia bioqumica que se imparte en una especialidad o carrera especfica. La
disciplina Bioqumica, para la Licenciatura en Enfermera, tiene el propsito de proveer
a los alumnos de los contenidos bsicos generales de esta ciencia aplicables al ser hu-mano, y en lo posible debe estar dirigida hacia los intereses de su perfil profesional, as
como contribuir a la concepcin cientfica del mundo, a la consolidacin de los valores
ticos y morales de la sociedad, con un profundo sentido humanista y acorde con el
desarrollo de un pensamiento cientfico. Para elaborar los planes y programas de esta
disciplina se tiene en cuenta:
a) Prestar atencin preferencial a los aspectos ms generales de esta especialidad, con
el propsito de brindar al estudiante en el menor contenido posible, una visin ac-
tualizada y lograr que se apropien de los mtodos y procedimientos que lo faculten
para el anlisis y la interpretacin de los fenmenos bioqumicos.
b) Promover un aprendizaje activo, aplicando mtodos que contribuyan a formar un
pensamiento creador en los alumnos, que los prepare para incorporar nuevos cono-
cimientos de forma independiente.
c) Abordar de forma integral el estudio de los procesos celulares, concibiendo a la
clula como unidad funcional de los seres vivos.
d) Hacer un nfasis especial en la importancia biolgica de los fenmenos bioqumicos,
dedicando especial atencin a su relacin con los aspectos clnicos, preventivos y de
promocin de salud.
e) Utilizar las posibilidades que brinda esta ciencia, para contribuir a la concepcin
materialista del mundo y a la formacin de valores morales en los estudiantes en
consonancia con los intereses de nuestra sociedad.
Categoras, principios y conceptos generales
La disciplina Bioqumica, como toda ciencia, implica un sistema de conocimientos.
Este sistema incluye conceptos y leyes de variados grados de generalizacin, desde los
ms particulares que se aplican solamente a aspectos especficos de la especialidad, hasta
los ms generales que son de aplicacin a una gran parte o a toda la disciplina. En los
conocimientos de mayor grado de generalizacin que se aplican a toda la disciplina se
incluyen las categoras, los conceptos generales y los principios.
Categoras
Son conceptos centrales que abarcan a toda la ciencia. Las categoras en la disciplina
Bioqumica son:
Las biomolculas: Son formas de organizacin de las diversas molculas especficas
de la materia viva. Reflejan el carcter material de los constituyentes de los seres vivos.
La biocatlisis:Refleja las caractersticas de todas y cada una de las transformacio-
nes catalizadas por enzimas que ocurren en los organismos vivos: Incluye su fundamento
energtico, la eficiencia y especificidad, as como su regulacin.
La biotransduccin:Refleja los mltiples procesos biolgicos que implican la con-
versin de un tipo de energa en otra, as como los mecanismos ntimos mediante los
cuales se producen.
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Captulo 1.La ciencia bioqumica y la disciplina Bioqumica
La bioinformacin: Refleja la propiedad de los seres vivos de mantener, reproducir y
expresar, mediante mecanismos diversos, las caractersticas propias de su especie, funda-
mento de un atributo esencial de los organismos vivos, la autoperpetuacin.
Las biotransformaciones: Incluyen el conjunto de reacciones qumicas biocatalizadas
mediante las cuales se realiza el intercambio de sustancia, energa e informacin de los
seres vivos con el medio, es decir, el metabolismo, atributo esencial de la vida.
PrincipiosLos principios son leyes de carcter universal que se cumplen para toda la
bioqumica:
Del recambio continuo: El intercambio continuo de sustancia, energa e informacin
con el medio circundante es una condicin indispensable para la existencia de la vida.
De la organizacin de las macromolculas: Conforman este principio todas las ca-
ractersticas que son comunes a las macromolculas, como su condicin de polmeros de
precursores sencillos, la unin estable de tipo covalente entre estas, la relacin estructura-
funcin, el carcter informacional, entre otras.
De la multiplicidad de utilizacin: Se refiere a que cada biomolcula desempea,
como regla, diversas funciones. Esta diversidad de funciones disminuye a medida queaumenta la complejidad de dichas biomolculas.
De la mxima eficiencia: Los procesos que se llevan a cabo en los organismos vivos
son reacciones catalizadas por enzimas las cuales son muy especficas y eficientes, ello
condiciona que se formen el mayor nmero posible de molculas del producto sin que se
formen otros productos colaterales.
De la mxima economa:Se refiere ala existencia de eficientes mecanismos de regu-
lacin los cuales garantizan que los distintos procesos se lleven a cabo en la medida en que
los productos que se forman son requeridos y, utilizando su ptimo aprovechamiento por
el organismo.
De los cambios graduales: Los procesos bioqumicos que se llevan a cabo en los
organismos vivos se producen por pequeos cambios estructurales de los sustratos inicia-
dores y variaciones energticas discretas en cada etapa, aunque al final del proceso el
producto puede ser marcadamente diferente del sustrato inicial.
De la interrelacin:Cada uno de los componentes del organismo, cada reaccin o
proceso metablico que ocurre en el organismo se encuentra estrechamente vinculado con
el resto de forma directa o indirecta, de modo que todos los procesos metablicos estn
relacionados entre s.
Del acoplamiento:Los productos formados en una determinada reaccin o ruta
metablica y la energa liberada suelen ser utilizados para el funcionamiento de otra que
depende de este suministro para lo cual pueda llevarse a cabo.
De la reciprocidad de las transformaciones:En las transformaciones bioqumicas se
constata como una regularidad, que si a partir de un sustrato determinado se forma un
cierto producto, la reaccin inversa, generalmente, es tambin posible. Ocurre por
reversibilidad de una reaccin y a veces por la participacin de reacciones diferentes
catalizadas por otras enzimas.
De la transferencia de informacin: La transmisin de las caractersticas estructura-
les y funcionales de las biomolculas, necesaria para el mantenimiento de la especie, se
produce por la capacidad de ciertas macromolculas de presentar carcter informacional
capaz de garantizar la copia exacta de dichas biomolculas mediante complejos proce-
sos genticos.
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4 Bioqumica Humana
Conceptos generales
Son elementos de conocimientos o nociones generales que se aplican a gran parte o a
la totalidad de la disciplina, aunque no alcanzan el nivel de categoras. Los conceptos
generales de la bioqumica constituyen pares dialcticos los cuales resultan inseparables
para su interpretacin y comprensin; estos son:
Estructura-funcin: Este concepto refleja la relacin entre dos aspectos esenciales de
los componentes constituyentes de los seres vivos, es decir, que a la organizacin estruc-tural de cada componente corresponde una funcin,lo cual es vlido desde el nivel molecular
hasta el de organismo.
Conformacin-transconformacin: Refleja la propiedad que tienen ciertas bio-
molculas de presentar varios estados conformacionales interconvertibles, relacio-
nados con actividades diferentes y que ocurren en respuesta a ciertas condiciones del
entorno.
Sustrato-producto: Lastransformaciones que ocurren en los organismos vivos con-
sisten, en esencia, en la conversin cataltica de sustancias conocidas como sustratos en
productos; en una va metablica formada por varias reacciones ordenadas, ocurre que el
producto de una reaccin deviene en sustrato de la siguiente.
Inhibicin-activacin:Las transformaciones bioqumicas que ocurren en los or-
ganismos se pueden encontrar activadas o inhibidas, ello responde a condiciones es-
pecficas del medio. Como regla, la activacin o inhibicin se provoca por el efecto de
mecanismos de regulacin sobre, al menos, alguna enzima que interviene en la va
metablica.
Anabolismo-catabolismo:Constituyen las dos grandes vertientes del metabolis-
mo. El anabolismo representa los procesos biosintticos responsabilizados con la for-
macin de los componentes del organismo y requieren energa. El catabolismo, por el
contrario, representa los procesos degradativos de los cuales se obtiene energa
metablicamente til. Aunque son procesos contrarios ambos funcionan coordinada y
armnicamente as; los productos formados en el catabolismo son frecuentemente
precursores de vas anablicas y la energa liberada en el primero son utilizadas para
suplir los requerimientos del segundo.
Medio-bioelemento:El trmino bioelemento se refiere a todo ente biolgico, desde
una biomolcula a un organismo completo y el de medio, a todo lo que, no siendo el
bioelemento en cuestin, se relaciona directa o indirectamente con este.
A medida que se avance en el estudio de la disciplina bioqumica, el lector puede
comprender mejor tanto las categoras como los principios y conceptos generales, ya que
se aplica y van poniendo de manifiesto.
Habilidades intelectuales
En el proceso enseanza-aprendizaje resulta esencial el dominio de las habilida-
des lgico-intelectuales. El sistema de operaciones lgicas para el logro de las habili-
dades necesarias para el estudio de la bioqumica se presenta de forma resumida a
continuacin:
Definir:
a) Precisar las caractersticas necesarias y suficientes del objeto o fenmeno.
b) Considerar las relaciones de subordinacin.
c) Distinguir lo especfico de la clase o subclase.
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Captulo 1.La ciencia bioqumica y la disciplina Bioqumica
Identificar:
a) Analizar las caractersticas del objeto o fenmeno.
b) Determinar lo esencial.
c) Verificar si el objeto o fenmeno posee todas las caractersticas necesarias y suficientes.
Describir:
a) Identificar.
b) Relacionar los rasgos identificados con los conocimientos que se tienen.c) Destacar las caractersticas fundamentales.
Comparar:
a) Definir e identificar.
b) Seleccionar los elementos que tipifican al objeto, fenmeno o proceso.
c) Establecer sus nexos o relaciones.
d) Destacar lo comn y lo diferente en los objetos, fenmenos o procesos a comparar.
Clasificar:
a) Definir e identificar los objetos, fenmenos o procesos.
b) Seleccionar los elementos que los tipifican.c) Seleccionar los criterios de clasificacin.
d) Agrupar los elementos segn el criterio de seleccin.
Explicar:
a) Identificar, clasificar, determinar las caractersticas esenciales y relacionarlas entre
s con la situacin analizada.
b) Debe responder a las preguntas: para qu?, cundo?, cmo?, dnde? por qu?
y debe destacarse la relacin causa-efecto.
Fundamentar:
a) Dar razones que apoyen un planteamiento (en sentido positivo, lo contrario sera
refutar).b) Defender un punto de vista con argumentos que lo justifiquen.
c) Incluye las habilidades: definir, comparar, identificar.
Analizar:
a) Definir el objeto, fenmeno o proceso que se ha de analizar.
b) Identificar los componentes estructurales del sistema (objeto, fenmeno o proceso).
c) Identificar las propiedades y funciones correspondientes a cada uno de los compo-
nentes estructurales.
d) Establecer las relaciones entre la estructura, propiedades y funciones de cada uno
de los componentes.
e) Describir la forma en que se relacionan los diferentes componentes del sistema.f) Determinar la manera en que la estructura, la funcin y la forma de relacin de los
componentes contribuyen a la estructura y funcin del sistema (objeto, fenmeno o
proceso).
Interpretar:
a) Descomponer el todo en sus partes.
b) Determinar nexos o relaciones esenciales atribuyndoles significados.
c) Determinar las relaciones entre objeto-fenmeno y/o proceso
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6 Bioqumica Humana
Mtodo de estudio de la bioqumica
En toda disciplina existen distintos niveles para la adquisicin de un conocimiento:
el de reconocimiento, el reproductivo, el aplicativo y el creador. En la disciplina Bioqumica
para estudiantes universitarios se deben alcanzar al menos los tres primeros niveles, es
decir, el reconocimiento, el reproductivo y el aplicativo.
Es conveniente aclarar que el trmino reproductivo no se refiere a una reproduccin
mecnica y memorstica sino a la capacidad del estudiante de exponer, como resultado
del anlisis individual y de la sntesis, los aspectos esenciales de un fenmeno estudiado.
Para lograr alcanzar las etapas reproductiva y aplicativa en los distintos contenidos de la
bioqumica debe emplearse el mtodo de estudio apropiado de esta disciplina.
Algunas reglas generales de este mtodo son:
a) El primer requisito para apropiarse de un conocimiento, es tener la certeza de que
se ha logrado su cabal comprensin, para ello debe realizarse el anlisis de todos
los factores involucrados y tener en cuenta el orden y jerarquizacin de estos;
cuando corresponda, se establece la relacin con otros conocimientos ya adquiri-
dos y si fuera posible se intenta realizar una comparacin entre todos, destacando
lo que presenten en comn y lo que los diferencia. Seguidamente se procede a
representar con frmulas qumicas o con el auxilio de esquemas, modelos, tablas
o grficos, de acuerdo con el caso, las nociones fundamentales de cada aspecto
estudiado. Ello le permite apropiarse del conocimiento sin necesidad de realizar
un esfuerzo memorstico y el conocimiento as adquirido tiene una mayor calidad
y durabilidad.
b) A continuacin se intenta definir cada uno de los conceptos involucrados en el
asunto estudiado, reproduciendo de forma independiente: esquemas, modelos, fr-
mulas, etc., de acuerdo a la temtica de la cual se trate.
c) Al estudiar estructuras qumicas debe lograr distinguir las caractersticas comunes
a todas y las que son privativas de cada una, realizando una comparacin siempre
que sea pertinente.
d) Cuando se trate de un proceso bioqumico, debe precisarse su funcin, su impor-
tancia biolgica y analizar la transformacin que se lleva a cabo en cada reaccin,
lo que le permite apropiarse del conocimiento ntegro a partir de los compuestos
iniciales. En cada proceso estudiado, se debe ser capaz de explicar su: significacin
biolgica segn el tejido, localizacin celular y, en el organismo, interrelacin con
otros procesos, as como sus enzimas reguladoras principales y sus mecanismos de
regulacin
e) Deben conocerse los objetivos de cada actividad docente, sea evaluativa o no, lo
que indica la habilidad que debe alcanzar.
f) Ha de seguirse atentamente las orientaciones para el estudio independiente que hace
el profesor y realizar los ejercicios del texto relacionados con el tema estudiado.g) Conviene efectuar una autoevaluacin o una confrontacin entre distintos estudian-
tes de los contenidos estudiados, para determinar lo realmente aprendido y dejar
claro lo que an no se domina suficientemente, as como puntualizar los aspectos
que necesitan ser aclarados con su profesor en la consulta docente.
h) En Bioqumica, para la comprensin y asimilacin de un tema se requiere, el domi-
nio de los precedentes ya que guardan una relacin ms o menos directa. De lo que
se infiere la necesidad del estudio diario de esta disciplina.
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Captulo 1.La ciencia bioqumica y la disciplina Bioqumica
Resumen
La disciplina Bioqumica en los planes y programas de estudio de los profesionales
de las ciencias mdicas debe plantear el estudio de los aspectos bsicos de esta cien-
cia, aplicados al ser humano y vinculados a los aspectos mdicos.
Los niveles de reconocimiento, reproductivos y aplicativos deben ser alcanzados para
los contenidos de la disciplina Bioqumica de pregrado. En los elementos de conoci-mientos ms generales de la bioqumica se incluyen las categoras, los principios y
conceptos generales que abarcan a toda la disciplina.
El dominio de las habilidades intelectuales es un requisito fundamental para el co-
rrecto aprendizaje de la disciplina Bioqumica.
La asimilacin de la Bioqumica requiere de un mtodo apropiado en el que la cabal
comprensin del asunto que se ha de estudiar, el anlisis, la comparacin, la genera-
lizacin y la integracin desempean un papel determinante. Por la estrecha vincu-
lacin existente entre los distintos temas de cada asignatura, el estudio sistemtico es
una necesidad insoslayable.
Ejercicios
1. Explique la diferencia existente entre la ciencia y la disciplina Bioqumica.
2. Fundamente la necesidad de la inclusin de la disciplina Bioqumica en los planes de
estudio de la Licenciatura en Enfermera.
3. Enuncie el concepto de categora y principio para la disciplina Bioqumica y mencio-
ne, al menos, 3 categoras y 3 principios de dicha disciplina.
4. Enuncie 4 reglas necesarias que se han de tener en cuenta para el correcto estudio y
aprendizaje en la disciplina Bioqumica.
5. Fundamente por qu es imprescindible el estudio sistemtico de esta disciplina.
6. Cite los distintos niveles para la adquisicin de un conocimiento y mencione los que seexigen en el aprendizaje de la bioqumica en pregrado.
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Introduccin al estudio
de las biomolculas
Las biomolculas son las molculas especficas de los seres vivos. Aunque for-mando parte de los seres vivos se encuentran, tambin, sustancias de natura-leza inorgnica.
A pesar de estar constituidas fundamentalmente por un grupo pequeo detomos: carbono (C), nitrgeno (N), oxgeno (O), hidrgeno (H), y en menorcantidad, fsforo (P) y azufre (S) las biomolculas presentan una gran diver-sidad estructural la cual est relacionada con su funcin.
En el presente captulo se revisan, someramente, algunos aspectos rela-cionados con los principales grupos funcionales, enlaces e interacciones pre-sentes en las biomolculas ya que su conocimiento previo resulta fundamentalpara la cabal comprensin de la estructura y propiedades de las biomolculas.Tambin se tratan las propiedades del agua, que le confieren su capacidad de
solvente universal en los organismos vivos, as como las caractersticas decidos y bases, y de las soluciones tampones o amortiguadoras del pH.
Caractersticas generales de las biomolculasLas biomolculas estn formadas principalmente por: carbono, hidrge-
no, oxgeno y nitrgeno unidos por enlaces covalentes. Adems, algunas con-tienen azufre y fsforo, entre otros elementos y existen en un grado variable
de complejidad.Las biomolculas se pueden agrupar de acuerdo con su tamao y compleji-
dad en: molculas sencillas, de relativo bajo peso molecular, como los aminocidos,
los monosacridos, los cidos grasos, los nucletidos, y en molculas de alto pesomolecular, macromolculas, formadas por la polimerizacin de algn tipo demolcula sencilla: de este modo las protenas son polmeros de aminocidos; lospolisacridos, lo son de monosacridos y los cidos nucleicos, de nucletidos. La
mayora de los lpidos, aunque no constituyen macromolculas, presentan estruc-turas complejas integradas por la asociacin de molculas sencillas diversas. Pararealizar el estudio de las biomolculas es necesario comprender previamente losenlaces principales que mantienen unidos a los tomos que la forman, los princi-
pales grupos funcionales y las agrupaciones moleculares presentes.
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10 Bioqumica Humana
Enlaces qumicosLos enlaces qumicos que constituyen las fuerzas interatmicas que permiten la
formacin de molculas pueden ser inicos o covalentes.
Enlace inico
Es un enlace de tipo electrosttico, que se forma por la transferencia de unelectrn desde un tomo de baja energa de ionizacin hasta uno de alta afinidad
electrosttica. Los iones as formados son atrados electrostticamente y de esta
forma se establece el enlace en la molcula. Las molculas que presentan este tipo
de enlace forman cristales inicos, son slidos, buenos conductores de la electrici-
dad, solubles en agua o solventes polares y poseen elevados puntos de fusin y
ebullicin.
Por ejemplo: El tomo de sodio (Na) posee baja energa de ionizacin, su
tendencia es a perder un electrn de su ltima capa y forma el ion Na+. Por el
contrario el cloro (Cl) posee alta afinidad electrosttica y su tendencia es a captar
un electrn y completar 8 electrones en su ltima capa (regla del octeto), y forma
el ion Cl-
, el Na+
y el Cl-
, se atraen electrostticamente formando el cloruro desodio Na+Cl-, liberndose gran cantidad de energa.
Enlace covalenteEl enlace covalente se produce por el compartimiento de electrones entre to-
mos. Los electrones compartidos forman el orbital molecular y se produce cuando
interactan electrones no pareados con spin opuestos. El enlace covalente puedeser apolar si los electrones comparten igualmente entre s los electrones: pero si unode los tomos posee mayor electroafinidad y atrae con ms fuerza hacia s los
electrones compartidos, el enlace es covalente polar.Ejemplo: Es apolar en el caso del tomo de hidrgeno (H
2), pues cada H atrae
con igual intensidad los electrones y es apolar en la molcula de agua (H2O) dondeel oxgeno atrae ms hacia s los electrones, ello explica que la molcula de agua
constituya un dipolo (Fig. 2.1).Fig. 2.1. Representacin del modelo de lamolcula de H
2O como dipolo.
Interacciones dbilesAdems de los enlaces inicos o covalentes, entre los tomos pueden estable-
cerse otras fuerzas intermoleculares dbiles que tienen importancia en el manteni-
miento de las estructuras espaciales de las macromolculas. Entre las interaccionesdbiles de importancia en las biomolculas estn los puentes de hidrgeno, lasuniones salinas, las interacciones hidrofbicas y las fuerzas de Van der Waals.
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Captulo 2. Introduccin al estudio de las biomolculas 1
Puente de hidrgenoLos puentes de hidrgeno se establecen entre un tomo de hidrgeno que est unido a
un elemento muy electronegativo y con radio inico pequeo (como el oxgeno y el nitr-geno) y que es atrado por un segundo elemento con caractersticas similares, de maneraque el hidrgeno queda compartido entre los dos tomos electronegativos. En estas condi-ciones el tomo de H se encuentra casi desposedo de su electrn y se comporta como un
H
+
. El puente de hidrgeno puede formarse entre molculas diferentes y entre molculasiguales. Entre las interacciones dbiles el puente de hidrgeno es una de las ms fuertes.Estas interacciones son fundamentales en el mantenimiento de los niveles estructuralessuperiores de protenas y cidos nucleicos. Un ejemplo se puede apreciar en el H
2O y
tambin entre grupos OH y NH2en algunas molculas.
Interacciones hidrofbicasLas interacciones hidrofbicas se producen cuando grupos qumicos o molculas
apolares se encuentran en un medio acuoso; en esas condiciones estos grupos tienden aasociarse entre s para ofrecer la menor superficie de contacto posible al medio polar. Esta
atraccin de las cadenas apolares, como las hidrocarbonadas de los aminocidos apolares
son de gran importancia en el mantenimiento de la estructura espacial de las protenas.
Interacciones electrostticasConocidas como uniones salinas, se establece entre iones cuando estos se encuentran
en disolucin. De este modo, si dos iones poseen carga opuesta, se atraen y tienden a
acercarse, mientras que si poseen carga igual se repelen y, por tanto, tienden a alejarse.
Entre grupos bsicos con carga positiva y grupos cidos con carga negativa se presenta
una fuerza de atraccin electrosttica. Este tipo de interaccin contribuye al mantenimien-
to de la estructura espacial de las protenas.
Fuerzas de Van der WaalsSon fuerzas electrostticas transitorias que se establecen entre los electrones de la
envoltura de unos tomos y los ncleos de otros, lo que provoca deformacin momentnea
de las nubes electrnicas y la aparicin de un dipolo de carcter transitorio. Estos dipolos
originan fuerzas de atraccin entre los grupos o molculas vecinas.Las fuerzas de Van der Waals son importantes en el mantenimiento de la estructura
tridimensional de las protenas y los cidos nucleicos.
Grupos funcionales presentes en las biomolculasEn las biomolculas se encuentran diversos grupos funcionales entre los que se pue-
den citar: el hidroxilo (OH), el carbonilo (CO), el carboxilo (COOH), el amino (NH2), el
sulfidrilo (SH), entre otros.
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12 Bioqumica Humana
Grupo hidroxiloLos compuestos que poseen este grupo se conocen como alcoholes. Estos se clasifi-
can en primarios, secundarios o terciarios en dependencia del tipo de tomo de carbonoal que se encuentran unidos. En forma abreviada se representan R-OH. Se nombran al
aadir el sufijo olal nombre del hidrocarburo correspondiente. Un ejemplo de alcoholes el etanol.
El grupo hidroxilo puede reaccionar con diferentes compuestos y formar diversas
agrupaciones derivadas. El grupo hidroxilo (OH) se encuentra en varios tipos debiomolculas, como en azcares y algunos aminocidos, entre otras.
Grupo carboniloLa funcin carbonilo (CO) puede existir en dos formas: aldehdo si esta funcin se
encuentra en un carbono primario, y cetona, si est en un carbono secundarioLos aldehdos se nombran por la adicin del sufijo al al nombre del hidrocarburo
correspondiente y si se trata de una cetona se le adiciona el sufijo ona.
Los monosacridos y sus derivados son biomolculas que poseen en su estructura ungrupo aldehdo o cetona.
Grupo carboxiloEl grupo carboxilo caracteriza a los cidos orgnicos. Su estructura se representa de
manera abreviada como COOH. Su nomenclatura sistmica se obtiene por la adicin delsufijo oicoal nombre del hidrocarburo correspondiente, aunque frecuentemente al com-
puesto que posee este grupo se les conoce por su nombre trivial.El grupo carboxilo est compuesto por un grupo carbonilo y un hidroxilo
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Captulo 2. Introduccin al estudio de las biomolculas 1
El grupo carboxilo se encuentra en los aminocidos y en los cidos grasos, entre otras
biomolculas y les confiere carcter cido a compuestos que lo poseen. Interviene ennumerosas reacciones y en la formacin de diversos enlaces e interacciones .
Grupo sulfidriloEl grupo sulfidrilo (SH), conocido tambin como mercaptn o tiol se encuentra en
varias biomolculas como aminocidos y vitaminas, entre otras.
Grupo aminoEl grupo amino se encuentra ampliamente distribudo en la naturaleza formando parte
de diversas biomolculas, como en los aminocidos, cidos nucleicos, aminoazcares,entre otras.
En dependencia del nmero de sustituciones de los H del grupo amino, se est enpresencia de una amina primaria, secundaria o terciaria:
El grupo amino se comporta como una base debido a que el tomo de nitrgeno poseeun orbital bielectrnico no compartido por el que puede coordinarse con un H+y formarun amonio cuaternario; este ltimo grupo en disolucin se comporta como un cido dbil.
Por deshidrogenacin de las aminas primarias se forman las iminas, las que poseen undoble enlace entre el C y el N.
Agrupaciones derivadasLos grupos funcionales presentes en las biomolculas son capaces de reaccionar entre
s y originar nuevas agrupaciones moleculares, las cuales poseen mayor complejidad ypresentan caractersticas propias.
HemiacetalesLos hemiacetales se forman al reaccionar un grupo carbonilo (aldehdo o cetona) con
un alcohol. En la formacin de este enlace no se pierde ningn tomo, solo se produce una
AmidasCuando el grupo OH de los cidos carboxlicos es reemplazado por un grupo amino
se origina una amida
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reorganizacin de estos ; como aspecto a resaltar est el cambio de un doble enlace C=O
a un enlace simple C-O. Esta agrupacin es muy importante en los monosacridos en losque al formarse un hemiacetal interno las molculas forman un ciclo.
AcetalesLos acetales se forman al reaccionar un hemiacetal con un grupo OH. En la forma-
cin de este enlace se pierde una molcula de agua.El enlace acetal es el que se encuentra en ciertos azcares derivados y es tambin el
tipo de enlace que une los monosacridos para originar oligosacridos y polisacridos; enestos ltimos casos se le conoce como enlace glicosdico.
steresLos enlaces de tipo steres se forman al reaccionar un cido con un alcohol con
prdida de una molcula de agua. Estos enlaces se pueden formar entre cidos y alcoholesdistintos, dando lugar a la formacin de steres con algunas caractersticas diferentes. Porsu importancia en la constitucin de las biomolculas se analizan dos tipos de steres: loscarboxlicos y los fosfricos.
steres carboxlicosSe forman entre un grupo COOH y un alcohol. Los steres carboxlicos pueden en-
contrarse en distintos tipos de biomolculas como los acilgliceroles y otros tipos de lpidos.
steres fosfricos
Se forman al reaccionar un cido fosfrico y un alcohol con prdida de una molcula
de agua.Los monosacridos reaccionan con el cido fosfrico formando diversos steres
fosfricos, que tienen gran importancia en el destino metablico de este tipo debiomolcula.
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Captulo 2. Introduccin al estudio de las biomolculas 1
Es posible que un ster fosfrico ya formado reaccione con otro grupo OH y forme un
enlace fosfodister o dister fosfrico, enlace que es el que une a los nucletidos paraformar los cidos nuclicos.
terEste enlace se forma al reaccionar dos grupos alcoholes con prdida de una molcula
de agua. Se encuentra en un tipo de lpidos: los plasmalgenos.
TiosterLos enlaces tiosteres, enlaces de alto contenido energtico (liberan gran cantidad
de energa libre al ser hidrolizados) se forman cuando reacciona un grupo carboxilo conun grupo SH, con prdida de una molcula de agua.
Los derivados tiosteres de los cidos orgnicos y particularmente de los cidos grasos
son compuestos fundamentales de diversas vas metablicas.
AmidaLas amidas se forman al reaccionar un grupo carboxilo con uno amino con prdida de
una molcula de agua. El enlace de tipo amida sustituida es el que une a los aminocidospara formar los pptidos y las protenas, en ese caso se le conoce como enlace peptdico y
sus caractersticas y propiedades son objeto de estudio con mayor detalle en el captulo deprecursores de macromolculas.
Anhdrido de cidoEl anhdrido de cido se forma cuando reaccionan dos cidos, que pueden ser iguales
o diferentes, con prdida de una molcula de agua, como ejemplo, el caso de la reaccin dedos cidos fosfricos.
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16 Bioqumica Humana
Estos enlaces son enlaces de alto contenido energtico, se encuentran en los nucletidos
y su hidrlisis est ligada a la liberacin de energa til para la clula. En otras ocasiones se
forman anhdridos mixtos, en los que intervienen dos grupos cidos diferentes; tambin
los anhdridos mixtos constituyen enlaces de alto contenido energtico.
No debe confundirse el enlace anhdrido de cido fosfrico con el enlace ster
fosfrico ni con el fosfodister.
Es frecuente que en las mismas biomolculas se encuentren ms de un grupo
funcional, tal es el caso de los monosacridos que contienen un grupo carbonilo y
varios hidroxilos o de los aminocidos en los que existen, al menos, un grupo amino y
un carboxilo. Por otra parte tambin es frecuente encontrar diversas agrupaciones
derivadas en una misma biomolcula, un ejemplo de ello son algunos tipos de lpidos
(fosftidos de glicerina) en los que se encuentran enlaces de tipo ster carboxlico yster fosfrico; o un nucletido con enlaces N-glicosdicos, enlace ster fosfrico y
del tipo de anhdrido de cido. Todo ello contribuye a la inmensa diversidad de las
biomolculas.
La diversidad de estas molculas tambin se incrementa por el hecho de pueden
existir en distintas formas isomricas.
IsomeraSon ismeros los compuestos que poseen la misma frmula global, pero presentan
propiedades distintas. La isomera se debe a que la distribucin de los tomos y el tipo de
enlace que se establece determina las propiedades de las molculas y estas no puedeninferirse de su frmula global; los ismeros se diferencian en su estructura o en su confi-guracin, o en ambas caractersticas, es por ello que la isomera se clasifica en estructuralo plana y la espacial o estereoisomera. A continuacin se revisan las principales caracte-rsticas de cada tipo.
Isomera estructuralSe debe a diferencias en la estructura de los distintos ismeros y puede ser de 3 tipos:
de cadena, de posicin y de funcin.
Isomera de cadena
Este tipo de isomera estructural se debe a la disposicin distinta que pueden adoptarlos tomos de carbono en las cadenas carbonadas.
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Captulo 2. Introduccin al estudio de las biomolculas 1
Isomera de posicin
Esta variante de isomera estructural se debe a la existencia de compuestos cuya
nica diferencia consiste en la posicin que ocupa un determinado grupo funcional en lacadena.
Isomera de funcin
Son ismeros de funcin los que poseen grupos funcionales diferentes a pesar depresentar una misma frmula qumica. Un ejemplo lo constituyen el alcohol etlico y el
ter metlico, ambos con C2H
6O como frmula.
Isomera espacialEste tipo de isomera la presentan aquellos compuestos que se diferencian en su con-
figuracin espacial. Esta isomera comprende dos grupos principales: isomera geomtricae isomera ptica.
Isomera geomtrica
Ocurre cuando en una molcula estn presentes dobles enlaces o anillos, los tomosinvolucrados en estas estructuras tienen ciertas restricciones en los giros, la rotacin delos tomos de carbono est limitada y debido a esto la posicin de los grupos sustituyentes
unidos a ellos queda fijada en el espacio, a uno u otro lado del anillo o doble enlace. Deesta manera el buteno-2 puede existir en dos configuraciones geomtricas.
Como puede apreciarse la disposicin de los grupos sustituyentes unidos a los tomosde carbono en el ismero cis se disponen hacia el mismo lado del doble enlace y hacialados distintos en el ismero trans. Ambos tipos de ismeros se pueden encontrar en lasbiomolculas.
Isomera ptica
La isomera ptica se presenta en los compuestos que poseen algn centro de asimetray se manifiesta por la capacidad que tienen estos ismeros de desviar el plano de vibracin
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de la luz polarizada, hacia la derecha o hacia la izquierda. La actividad ptica se determina
experimentalmente por medio de un equipo conocido como polarmetro (Fig. 2.2).
Fig. 2.2. Esquema de las partes de unpolarmetro.: prismas polarizadores, pris-mas analizadores, ocular, escala angular,fuente de luz monocromtica y tubo paracolocar la muestra a analizar.
Fig. 2.3. Frmulas espaciales de D y Lcido lctico, donde se evidencia queambas estructuras carecen de plano desimetra y no pueden superponerse.
El centro de asimetra que es causa de la actividad ptica se explica debido a que lasmolculas carecen de planos o centros de simetra y su configuracin es tal que no pueden
superponerse.
La causa ms frecuente de asimetra en las biomolculas es la presencia de los carbo-nos quirales o carbonos asimtricos, es decir, los carbonos cuyas cuatro valencias estnsustituidas por grupos diferentes. La cantidad de ismeros pticos de una molcula sepuede calcular segn 2n, donde n es igual al nmero de carbonos asimtricos presentes.
Como ejemplo se tiene el caso del monosacrido de 4 tomos de carbono cuya estruc-tura es la siguiente:
Esta molcula posee 2 carbonos asimtricos que son los marcados en negrita, aplican-do la frmula, se puede deducir que existiran 22= 4 ismeros pticos y son los siguientes:
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Captulo 2. Introduccin al estudio de las biomolculas 1
Las 4 especies (a, b, c y d), son todos ismeros pticos, es decir, son estereoi-smeros entre s; adems, la a) con respecto a la b) y la c) con respecto a la d) sonenantimeros (o antpodas pticos), por ser una la imagen ante el espejo de la otra; la
(a en relacin con la c) y la d) y en general cada especie en relacin con las que no sonsus enantimeros, son diastereoismeros. Los ismeros pticos que solo se diferen-cian en la disposicin de un grupo y son idnticas con respecto a todos los otros, se
conocen como epmeros. Para el caso que se analiza, las formas a) y b) son epmeroscon respecto a la c) y a la d); y la c) y d) lo son con respecto a la a) y b).
Los enantimeros no difieren en sus propiedades fsicas ni qumicas, con excepcinde su actividad ptica; pero sus propiedades biolgicas pueden variar grandemente. Los
diastereoismeros se diferencian, adems de su actividad ptica, en la mayora de suspropiedades fsicas y biolgicas y en determinadas propiedades qumicas.
La mezcla equimolecular de los enantimeros se denomina mezcla racmica yno presenta actividad ptica.
Series estricas D y LUtilizando al gliceraldehdo como molcula de referencia se han establecido las
series estricas D y L. Para ello se representa al gliceraldehdo con el grupo aldehdohacia arriba y el OH del gliceraldehdo dextrgiro hacia la derecha y se le asigna la serie
D y el OH del gliceraldehdo levgiro hacia la izquierda y se le asigna la serie L.
Al comparar la disposicin de determinados grupos funcionales unidos a carbonos
asimtricos de los ismeros pticos de diversos compuestos, con la del OH de cada
gliceraldehdo, se establece la serie L o D de dicho compuesto. As para el caso de los
aminocidos el grupo a comparar es el a amino, cuando el aminocido se representa con
su grupocarboxilo hacia arriba, coincidiendo con el grupo aldehdo del gliceraldehdo.
El aminocido representado en a) es un D aminocido ya que su grupoamino se dispone
hacia el mismo lado del OH del D gliceraldehdo, en tanto que el aminocido representado
en b) es un L aminocido pues su grupoamino est ubicado hacia el mismo lado que el
OH en el L gliceraldehdo.
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20 Bioqumica Humana
En el caso de los monosacridos, las series se establecen por la comparacin de la
disposicin del OH unido al carbono quiral ms alejado del grupo carbonilo con la del OHdel D y L gliceraldehdo .
El poder rotatorio real de un compuesto determinado por el polarmetro no tiene quecorresponder con la serie D o L a que pertenezca. De esta forma el aminocido L glutmicoes dextrgiro, mientras que la L leucina es levgira; la D glucosa es dextrgira y la D
fructosa es levgira. Recurdese que la rotacin especfica se determina experimental-mente en un polarmetro en tanto que la serie se determina por la comparacin del com-puesto en cuestin con una molcula de referencia, el gliceraldehdo.
Conformaciones distintas de las molculasA las distintas disposiciones que pueden adoptar los tomos en una molcula como
consecuencia de rotaciones de uno o ms enlaces simples, se conoce como conformacio-nes y no debe confundirse con los ismeros.
Las rotaciones que pueden efectuarse en un enlace simple estn restringidas por eltamao y carga elctrica de los tomos unidos al carbono. Un ejemplo de las distintasconformaciones se aprecian en el caso del etano, molcula que puede existir en dosconformaciones (escalonada o eclipsada), aunque la primera es la ms estable. Las
diferentes conformaciones de una molcula representan simplemente posiciones queadoptan los tomos al rotar sobre un enlace simple y debido a que las barreras energ-ticas son muy bajas, no constituyen sustancias diferentes que puedan ser aislables.
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Captulo 2. Introduccin al estudio de las biomolculas 2
Agua como disolvente en los organismos vivosEl agua es la sustancia ms abundante en los organismos vivos, tanto en el interior de las
clulas como en los lquidos extracelulares y en general en todos los fluidos biolgicos, yaque constituye el disolvente principal de las biomolculas. Las propiedades fsicas y qumi-cas del agua posibilitan esta importante funcin: su elevado punto de ebullicin, su bajopunto de fusin, su alta constante dielctrica y su gran capacidad calrica.
El agua es una molcula dipolar y puede establecer numerosos puentes de hidrgenoentre s; cada molcula de agua puede asociarse a otras tres o cuatro por medio de lospuentes de hidrgeno lo que le confiere propiedades caractersticas.
La ionizacin del agua cumple la siguiente ecuacin:
2 H2O H
3O++ OH-
o simplificadamente:
H2O H++ OH-
La constante de disociacin del H2O es igual a:
Ka = [OH- ] [H+] / [H2O] 1)
De donde se puede despejar:
Ka [H2O] = [OH-] [H+] 2)
Ka[H2O]es el producto inico del agua y su valor es de 1 x 10-14
La aplicacin del logaritmo negativo a la ecuacin 2) dara:
- log (1 x 10-14) = - log [H+] + (- log [OH-])
pero pH = - log [H+] y
pOH = - log [OH-]
efectuando, y sustituyendo, se tiene:
pH + pOH = 14 3)
El pH mide el ndice de acidez de una disolucin y el pOH el ndice de basicidad.El agua pura tiene un pH de 7 (neutro), condicin en que la concentracin de H +y de
OH-es igual, es decir, [H+] = [OH-]; si en una disolucin existe un predominio de [H+] conrelacin a la de [OH-] el valor de pH es menor que 7 (cido); por el contrario, si la concen-tracin mayor es la de OH-, el valor del pH es superior a 7 y el medio es alcalino o bsico. El
pH del agua se modifica, si se le adiciona una sustancia cida o alcalina.
cidos y basesBronsted y Lowrydefinieron a los cidos como las sustancias que ceden protones, y
bases a las que los captan; la especie cida forma un par con su base conjugada, comopuede apreciarse seguidamente:
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22 Bioqumica Humana
Para esta reaccin se puede definir su constante de disociacin (Ki), que consiste en la
reaccin de disociacin cida que es Ka , por tanto:
Como es fcil inferir de esta relacin: a mayor valor de la [Ka] mayor es [H+] y
significa que la especie es un cido ms fuerte; por el contrario, valores bajos de Ka
corresponden a [AH] mayores, en ese caso la especie es un cido ms dbil o una
base ms fuerte. A un cido ms fuerte le corresponde una base conjugada dbil y
viceversa.
Despejando [H+] en la ecuacin 1) y reordenando, se tiene:
y aplicando logaritmo a ambos miembros de la ecuacin:
Cambiando el signo a ambos lados de la ecuacin:
Pero :
Por definicin:
- log Ka = pKa y - log de [ H+] = pH, sustituyendo en 2):
donde A-corresponde a la forma disociada del grupo, y AH a la no disociada. Es obvio que
dada la definicin de pK, a menor pK ms fuerte ser el cido y viceversa.La ecuacin 3) conocida como de Henderson Hasselbach, constituye tam-
bin la ecuacin de las soluciones buffer o tampn, la funcin de estas soluciones
es la preservacin del pH del medio y por su trascendencia se tratan someramente
aqu.
Un buffer (o tampn o amortiguador del pH) est constituido por una mezcla de un
electrlito fuerte con uno dbil, por ejemplo un cido dbil con su sal, como en el caso del
buffer acetato, entonces:
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Captulo 2. Introduccin al estudio de las biomolculas 2
La mezcla as formada del cido y su sal y donde el ion comn es CH3- COO-, es
decir, el ion acetato, constituye el buffer acetato. En este caso el electrlito dbil es el
cido, que se disocia poco y, por tanto, predomina en la forma no disociada (CH3- COOH);en tanto que su sal, el acetato de socio es el electrlito fuerte y est prcticamente toda
en su forma disociada, es decir, en forma de ion acetato: CH3- COO-. Por ello, el
CH3- COOH ser la reserva cida y proteger el pH contra la adicin de bases, mien-
tras que el CH3- COO- es la reserva alcalina y protege al pH contra la adicin de cidos.
La ecuacin de Henderson Hasselbachse conoce tambin como la ecuacin de los
buffers y para estos casos suele escribirse as:
donde el pK corresponde al pK del cido y el pH del buffer depende de la relacin de las
concentraciones de la sal y el cido. Un buffer es ms eficiente, si las concentraciones de
la reserva cida y la alcalina son similares, y ello se cumple con valores de pH cercanos al
valor del pK del cido. Para fines prcticos se acepta que un buffer es eficiente con
valores de
pH = pK del cido 1
Utilizando el buffer acetato como ejemplo, se analiza la respuesta ante adiciones de
un cido como el HCl. La reserva alcalina reacciona:
CH3-COO-+ H+(Cl) CH
3- COOH
con lo que el pH del medio no cambia
Si por el contrario se aade un lcali como el hidrxido de sodio, NaOH, reacciona la
reserva cida:
CH3- COOH + OH-(Na) H
2O + Na+CH
3- COO-
y de esta forma el pH tampoco cambia.
Un solo grupo disociable puede actuar como un buffer, para lo cual intervienensu forma disociada y no disociada, es decir, el cido y su base conjugada. De hecho
es as como funcionan los grupos disociables de las protenas en su funcin
amortiguadora del pH.
En la sangre y en otros fluidos biolgicos y en general en todas las clulas vivas es
fundamental el mantenimiento del pH dentro de ciertos lmites, que permitan el normal
desarrollo de las reacciones del metabolismo y ello se garantiza por la existencia de diver-
sos sistemas buffers.
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24 Bioqumica Humana
ResumenLas biomolculas son las molculas especficas de los seres vivos; en su estructurapredominan los tomos de C, H, O y N, y en menor medida el P y el S, entre otros.Los grupos funcionales ms frecuentes en las biomolculas son el hidroxilo (OH),primario, secundario o terciario; el carbonilo (CO), que puede ser aldehdo o cetona;el carboxilo (COOH), grupo que confiere carcter cido a las biomolculas que loposeen; el grupo amino (NH2), bsico, que puede formar aminas primarias, secunda-
rias o terciarias; y el grupo sulfidrilo (SH). Estos grupos al reaccionar entre s for-man agrupaciones derivadas las cuales son tambin de gran importancia en lasbiomolculas. De este modo al reaccionar los cidos con los alcoholes originan lossteres; los carbonilos con los alcoholes pueden originar hemiacetales o acetales. Loscarboxilos con los aminos forman el enlace amida; un grupo sulfidrilo y un cidocarboxlico dan lugar a los tiosteres y, si los que reaccionan son dos grupos cidos seforman los anhdridos de cido. Es frecuente encontrar en una misma biomolculavarios grupos funcionales distintos, as como diferentes agrupaciones derivadas.
A la gran diversidad que presentan las biomolculas contribuye tambin la existenciade ismeros diferentes. Los ismeros son compuestos que presentan la misma frmulaqumica global, pero poseen propiedades diferentes, ya que pueden presentar estruc-tura distinta (isomera estructural) o diferente configuracin espacial (estereoisomera).
La isomera estructural, a su vez, puede ser de cadena, de posicin o de funcin, y laestereoisomera puede ser geomtrica u ptica. La isomera ptica se debe a la presen-cia de carbonos quirales o asimtricos y las molculas pueden ser dextrgiras o levgirasen dependencia de que desven el plano de luz polarizada a la derecha o a la izquierda.Los ismeros pticos pueden pertenecer a la series estricas D o L, para ello se compa-ra, la disposicin de determinado grupo funcional con el OH del D gliceraldehdo ydel L gliceraldehdo; y en consecuencia se determina su serie D o L
El agua es el disolvente universal en la materia viva y ello se debe a las propiedades deesta molcula que por constituir un dipolo, resulta un magnfico disolvente para lamayora de las biomolculas. El agua pura tiene un pH neutro y en estas condicioneslas concentraciones del ion H+es igual a la del ion OH-; si predomina la [ H+] el pH escido y si la que predomina es la [ OH -] el pH es alcalino. Un cido es una sustanciacapaz de ceder protones y una base es la que los capta; aunque frecuentemente el
comportamiento cido o bsico de una sustancia depende del pH del medio en que seencuentre. Las mezclas de un cido o una base con su sal originan los buffer o tampo-nes, cuya funcin es preservar el pH del medio; la reserva alcalina defiende al mediocontra la adicin de cidos, en tanto que la reserva cida lo hace contra la de lcalis.Un mismo grupo puede funcionar como buffer, el cido y su base conjugada. La ecua-cin deHenderson-Hasselbaches la ecuacin de los buffers y de esta se desprende queun buffer es eficiente con valores de pH iguales al pK del cido 1.
Ejercicios1. Mencione los principales tomos presentes en las biomolculas.2. Identifique los diferentes grupos funcionales presentes en las biomolculas siguientes:
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Captulo 2. Introduccin al estudio de las biomolculas 2
3. Identifique las agrupaciones atmicas presentes en las biomolculas siguientes:
4. Identifique el tipo de isomera que presentan los pares de biomolculas siguientes:
a) b)
c) d)
e)
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26 Bioqumica Humana
5. La ribosa es un monosacrido que presenta una funcin carbonilo en carbono primario
y 4 grupos OH y cuya estructura se presenta a continuacin, al respecto responda:
a) Identifique los C quirales en la molcula
b) Calcule el nmero de ismeros pticosc) Represente la estructura de los diferentes ismeros pticos.d) Identifique cules son enantimeros entre s.
6. Mencione los componentes de una disolucin buffer o amortiguadora del pH y refira-se a la funcin de cada componente.
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Estructura y funcin
de los precursores de macromolculas
Las macromolculas son estructuras de elevado peso molecular formadas por
la unin de molculas relativamente pequeas que constituyen monmeros o
precursores que al unirse entre s forman la estructura polimrica caracters-
tica de las macromolculas. De este modo las protenas son polmeros de
aminocidos, los polisacridos de monosacridos y los cidos nucleicos de los
nucletidos. Este captulo se dedica a los aspectos estructurales y funcionales
de los precursores de macromolculas ya que su cabal conocimiento resulta
esencial para el estudio de sus respectivos polmeros.
AminocidosLos aminocidos que forman las protenas son cidos orgnicos que pre-
sentan al menos un grupo carboxilo y un amino unidos a su carbono alfa. Por
tanto su estructura general es la siguiente.
Como puede apreciarse en la estructura se observan dos partes: una don-
de aparece lo comn a todos los aminocidos, es decir, el grupo carboxilo yamino unidos al carbono y el resto de la estructura representado por la letraR que corresponde a la cadena lateral del aminocido, que es la parte que
diferencia a un aminocido de otro por tanto es la porcin variable de la
molcula.
En las cadenas laterales R pueden aparecer cadenas hidrocarbonadas,
anillos aromticos, grupos hidroxilos, sulfidrilos, grupos carboxilos, aminos
y otros que confieren propiedades diferentes a estas biomolculas y que per-
miten su clasificacin en base a diferentes criterios.
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28 Bioqumica Humana
d) Aminocidos con un anillo aromtico en R. En este grupo se incluyen los aminocidos que
presentan el anillo benceno, el fenol y el indol.
En el cuadro 3.1, se puede observar la estructura de los 20 aminocidos que
forman parte de las protenas.
Cuadro 3.1. Estructura de los aminocidos que forman parte de las protenas.
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Captulo 3. Estructura y funcin de los precursores de macromolculas 2
e) Aminocidos con un grupo carboxilo (COOH) o amida (CONH2) en R:
f) Aminocidos con grupos bsicos:(NH2), guanidino o anillo imidazol en R:
g) Aminocidos cclicos. En este grupo se incluyen al aminocido prolina y su derivado la
hidroxiprolina:
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30 Bioqumica Humana
Funciones de los aminocidos
Los aminocidos cumplen con el principio de mltiple utilizacin, ya que desem-
pean diferentes funciones, como son:
1. Constituyen precursores de importantes neurotrasmisores,
2. Algunos son metabolitos intermediarios de vas metablicas
3. Forman parte de otras biomolculas como algunas coenzimas
4. Por descarboxilacin forman aminas bigenas, molculas con accin fisiolgica im-portante
5. Son precursores de algunas hormonas (hormonas tiroideas y adrenalina)
6. Constituyen los precursores de los pptidos y las protenas. Es la funcin ms impor-
tante de los aminocidos .
Clasificacin de los aminocidos
Pueden clasificarse en base a diferentes criterios. Si se clasifican de acuerdo al nme-
ro de grupos carboxilos o aminos presentes en la molcula, lo que determina el carcter
cido-bsico de sus disoluciones, y se establecen 3 categoras:
a) Neutros: Si poseen un nico grupo carboxilo y uno amino
b) cidos: Si poseen un nico grupo amino y dos carboxilosc) Bsicos: Si poseen un grupo carboxilo y dos grupos bsicos.
Si se observa cuidadosamente el cuadro 3.1, se puede comprobar que los aminocidos
cidos son solamente dos: el cido asprtico y el cido glutmico. Los aminocidos
bsicos, tres : la lisina (con un amino), la arginina (con el grupo bsico guanidnico) y
la histidina (que posee el anillo imidazol). El resto de los aminocidos se clasifican
como neutros.
Otro criterio importante de clasificacin para los aminocidos se basa en la polari-
dad de su cadena lateral R. De este modo los aminocidos que carecen de algn grupo
polar en R se clasifican como apolares y los que presentan algn grupo polar en su
cadena lateral son polares. Estos ltimos, a su vez, se subdividen en polares inicos si apH fisiolgico adquieren carga elctrica neta y en caso contrario se clasifican como
polares poco inicos.
Los grupos qumicos que se disocian y presentan carga elctrica apreciable a pH
fisiolgico son los carboxilos, los grupos bsicos que son: amino, guanidino y anillo
imidazol. Los grupos polares presentes en algunos aminocidos, pero que no presentan
carga elctrica apreciable a pH fisiolgico son hidroxilos, sulfidrilos, amidas y el anillo
indol presente en el triptfano. Por tanto podemos resumir que atendiendo a la polaridad
de su cadena R se establecen 3 categoras:
1. Polares inicos:
a) Dos aminocidos cidos: cido asprtico y cido glutmico
b) Tres aminocidos bsicos: lisina, arginina e histidina2. Polares poco inicos:
a) Poseen grupos OH en R: serina, treonina, tirosina e hidroxiprolina
b) Poseen SH: cistena
c) Poseen grupo CONH (amida): asparagina y glutamina.
d) Poseen el anillo indol: el triptofano.
3. Apolares:
a) Todos los dems: glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina, fenilalanina, metionina,
prolina.
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Captulo 3. Estructura y funcin de los precursores de macromolculas 3
Propiedades elctricas de los aminocidos
Los aminocidos, por poseer grupos disociables, en dependencia del pH del medio son
capaces de disociar dichos grupos y presentar especies inicas distintas con carga neta
diferente.
Como se vi en el captulo 2, el valor del pKa de un grupo determina su fortaleza
como cido. En los aminocidos los valores de pKa de sus grupos disociables se numeran
del ms cido (pk menor) al menos cido o ms bsico (pk mayor), as el pK1de la alaninacorresponde al pKa del grupo COOH y el pK
2, al pK del grupoNH
2(ver los valores
del pK de los grupos disociables de los aminocidos en la tabla 3.1).
Como se recuerda del captulo 2, a valores del pH > pK el grupo predomina en su
forma disociada. A valores de pH < pK predomina en su forma no disociada y si el valor
del pH coincide con el del pK, ambas formas coexisten en iguales cantidades.
Por ejemplo, para un aminocido neutro como la alanina, pueden presentarse 3 diferen-tes especies inicas: A valores de pH < pK1la especie inica de la alanina es la que se
representa en a) presentando la molcula carga positiva y sometida a la accin de un campo
elctrico migrara al polo negativo (ctodo); a valores del pH > pK1, predomina la especie de
c) con carga neta negativa y migrara al polo positivo (nodo); si el valor del pH = pK
entonces predomina el in bipolar representado en b) y la carga elctrica neta sera cero. El
ion bipolar es el que predomina en el punto isoelctrico que corresponde con el valor del pH
al cual la carga elctrica del aminocido es cero y si se sometiera a la accin de un campo
elctrico no migrara a ningn polo por no mostrar afinidad por ninguno de ellos.
Tabla 3.1.Valores de pK y del punto isoelctrico de los aminocidos
Aminocido pK1
pK2
pK3
PI
Grupo Valor Grupo Valor Grupo Valor
Glicina carboxilo 2,34 amino 9,60 - - 5,97
Alanina carboxilo 2,35 amino 9,69 - - 6,02
Valina carboxilo 2,32 amino 9,62 - - 5,97
Leucina carboxilo 2,36 amino 9,60 - - 5,98
Isoleucina carboxilo 2,36 amino 9,68 - - 6,02
Serina carboxilo 2,21 amino 9,15 - - 5,68
Treonina carboxilo 2,63 amino 10,43 - - 6,53
Fenilalanina carboxilo 1,83 amino 9,13 - - 5,48
Triptfano carboxilo 2,38 amino 9,39 - - 5,88
Metionina carboxilo 2,28 amino 9,21 - - 5,75
Prolina carboxilo 1,99 amino 10,60 - - 6,29
Asparagina carboxilo 2,02 amino 8,88 - - 5,45
Glutamina carboxilo 2,17 amino 9,13 - - 5,65
Tirosina carboxilo 2,20 amino 9,11 fenlico 10,07 5,65
Lisina carboxilo 2,18 amino 8,95 amino 10,53 9,74Histidina carboxilo 1,82 Imidazol 6,00 amino 9,17 7,58
Arginina carboxilo 2,17 amino 9,04 guanidino 12,48 10,76
cido asprtico carboxilo 2,09 carboxilo 3,86 amino 9,67 2,97
cido glutmico carboxilo 2,19 carboxilo 4,25 amino 9,67 3,22
Cistena carboxilo 1,71 Sulfidrilo 8,33 amino 10,78 5,02
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32 Bioqumica Humana
Para los aminocidos cidos o bsicos las especies inicas son cuatro en vez de tres
ya que habra que considerar la disociacin adicional del grupo COOH o bsico que le
confiere dicho carcter al aminocido. Para los propsitos de este texto lo que interesa
resaltar para el lector es que los aminocidos, en dependencia del pH del medio en que se
encuentren disuelto, presentan diferente especie inica y consecuentemente carga elctrica
diferente y que la disociacin de cada grupo disociable depende del valor del pH del medio
y del de su pK (Fig. 3.1).
Fig. 3.1. Especies inicas de la
alanina. En dependencia del valor del
pH medio de disolucin la alanina
presenta distintas especies inicas.
Fig. 3.2. Formacin del puente
disulfuro. Al perder H dos molcu-
las de cisterna forman el puente
disulturo, el cual puede romperse
ante la presencia de un agente reduc-
to que aada 2 H.
Interacciones entre grupos de las cadenas laterales(R)de los aminocidos
Entre diferentes grupos presentes en las cadenas laterales de los aminocidos pueden
establecerse diversas interacciones. Entre un grupo carboxilo cargado negativamente de
un aminocido cido y el grupo bsico cargado positivamente de un aminocido bsico se
forma una unin salina. Dos aminocidos apolares establecen una unin hidrofbica; un
grupo OH de un aminocido hidroxilado puede establecer un puente de hidrgeno con un
carboxilo o un grupo bsico o con otro OH de otro aminocido hidroxilado.
Un enlace covalente se forma cuando dos grupos sulfidrilos de dos aminocidos cistena
pierden hidrgeno (se oxidan) y se forma un puente disulfuro (S-S) (ver figura 3.2). Estas
diversas interacciones son fundamentales en el mantenimiento de la estructura tridimensional
de las protenas como se estudiar en el captulo 5.
Enlace peptdico
Se denomina enlace peptdico al enlace polimerizante , que une a los aminocidos y
forma los pptidos y las protenas y es de tipo amida sustituida.
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Captulo 3. Estructura y funcin de los precursores de macromolculas 3
Como puede apreciarse el grupo carboxilo de un aminocido reacciona con el grupo
amino de otro aminocido, se forma el enlace peptdico y se elimina una molcula de H2O.
En este enlace se presenta resonancia entre el O carbonlico y el N amdico y ello le
confiere carcter parcial de doble enlace . Esta condicin tiene dos consecuencias impor-
tantes para la cadena peptdica: la restriccin en el giro de este enlace y la disposicin
trans (Fig. 3.3 y Fig. 3.4).
Fig. 3.3. Representacin de la estru
tura del enlace peptdico; a) estruct
ra resonante; b) solapamiento de lorbitales p del C, el O y el N.
Fig. 3.4. Representacin de dos enlaces peptdicos contiguos. Los elementos del enlace peptdico se encuentran en un mismo
plano debido a las limitaciones en el giro del enlace C-N (carcter parcial de doble enlace). Los giros se producen a nivel de
los carbonos ; enlace C-C() y del C
- N ().
MonosacridosLos monosacridos son molculas que presentan como caracterstica comn poseer un
grupo carbonilo (que puede ser aldehdo o cetona) y varios grupos hidroxilos. Se diferencian
unos de otros en el nmero de tomos de carbono, y pueden ser : triosas, tetrosas, pentosas,
hexosas, si poseen, respectivamente, 3, 4, 5 o 6 tomos de carbono. Se diferencian en el tipo
de funcin carbonilo: se denominan aldosas, si presentan el grupo aldehdo y cetosas si el
grupo es cetnico. Los monosacridos pueden tambin pertenecer a las series estricas D o
L. La serie para estas biomolculas se establece por comparacin del OH unido al carbono
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asimtrico ms alejado del grupo carbonilo con el OH del carbono quiral del gliceraldehdo.
Las que se encuentran en la naturaleza pertenecen a la serie D. En la siguiente frmula se
representa el OH colocado hacia la derecha.
Los diferentes monosacridos de la serie D se presentan en el cuadro 3.2.
Cuadro 3.2. Monosacridos de la serie estrica D
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Captulo 3. Estructura y funcin de los precursores de macromolculas 3
Los monosacridos con 5 o ms tomos de carbono, forman hemiacetales internos
(ver captulo 2), lo que provoca la forma cclica. Se suelen representar por la frmula de
Haworth. En esta estructura los monosacridos que pertenecen a la serie D se identifican
por el grupo del carbono 6 representados por encima del anillo. Los diferentes grupos OH
se escriben hacia abajo aquellos que en la frmula lineal se disponen a la derecha, y hacia
arriba los que se disponen hacia la izquierda. Los anillos pueden ser furansicos (que se
presenta en las pentosas y predomina en las cetohexosas) o piransico (el principal en lasaldohexosas) (Fig. 3.5).
Fig. 3.5. Formas cclicas de la glucosa y la fructosa segn frmula de Haworth.
Como se observa en la figura 3.5, al formarse el anillo el carbono 1 para las aldosas
y el 2 para las cetosas, en el que se encontraba el grupo carbonilo se ha convertido ahora
en otro carbono quiral, que se reconoce con el nombre de carbono anomrico . Entonces,
existen dos posibilidades para la disposicin del OH unido a este carbono anomrico. Si el
OH se dispone hacia abajo del anillo, en la representacin plana, se denomina anmero
y si se dispone hacia arriba se conoce como anmero . De este modo podemos resumir
las fuentes de variacin en los monosacridos:
a) Nmero de tomos de carbono
b) Tipo de funcin carbonilo
c) Serie estrica
d) Tipo de anmeroe) Tipo de anillo
Los monosacridos derivados pueden formarse por:
a) Oxidacin (azcares cidos)
b) Reduccin
c) Sustitucin (aminoazcares)
d) Por unin de un grupo fosfato por enlace ster (azcares fosfatos).
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Cuadro 3.3. Estructura de las D cetosas
Funciones de los monosacridos
Los monosacridos cumplen con el principio de multiplicidad de utilizac in
ya que:
a) Forman parte de otras molculas (nucletidos, coenzimas)
b) Constituyen fuente de energa
c) Son fuente carbonada (sus carbonos pueden formar parte de otras biomolculas)
d) Son los precursores de los oligosacridos y polisacridos.
Formacin del enlace glicosdico
La unin de los monosacridos para formar oligosacridos y polisacridos es median-
te el enlace glicosdico, que es un enlace de tipo acetlico (ver captulo 2). Este enlace se
establece entre el OH del carbono anomrico de un monosacrido y un OH (que puede o
no ser anomrico) de otro monosacrido.
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Captulo 3. Estructura y funcin de los precursores de macromolculas 3
Fig. 3.6. Diferentes tipos de enlac
glicosdicos.
Como puede apreciarse en la figura 3.6, en dependencia del tipo de anmero y la
posicin de los OH que intervienen en la formacin del enlace glicosdico reciben diferen-
tes denominaciones.
Nucletidos
Son los precursores ms complejos desde el punto de vista estructural. Estn forma-
dos por una base nitrogenada, un azcar (monosacrido) y grupos fosfatos (1; 2 o 3
grupos fosfatos).
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La base nitrogenada se une a l azcar por enlace N glicosdico representado en la
estructura anterior con la letra a. La letra b es un enlace ster y la c uno anidrido de
cido.En el cuadro 3.4 pueden observarse las estructuras de las bases comunes presentes
en los nucletidos precursores de los cidos nucleicos.
Cuadro 3.4.Bases nitrogenadas presentes en los nucletidos
El monosacrido presente en los nucletidos puede ser la ribosa (aldopentosa) o su
derivado la 2 desoxirribosa.
Clasificacin de los nucletidos
Los nucletidos se clasifican por:
1. Tipo de base: Si poseen una base purina, como nucletidos purnicos y si la base quecontienen es una pirimidina son nucletidos pirimidnicos.
2. Tipo de azcar. Si el azcar es ribosa, como ribonucletido y si es desoxirribosa, el
nucletido es un desoxirribonucletido.
3. Cantidad de grupos fosfatos: sern monofosfato, difosfato, trifosfato segn posean 1;
2 o 3 grupos fosfatos, respectivamente.
Funcin de los nucletidos
Los nucletidos desempean importantes funciones:
a) Almacenan y transfieren energa metablicamente til (ATP y GTP)b) Actan como coenzimas al donar algunos grupos (fosfato, pirofosfato u otros)
c) Forman parte de otros compuestos (algunas coenzimas)d) Pueden participar como segundos mensajeros de la accin hormonal (AMPc, GMPc)
e) Participan en la activacin de precursores para la sntesis de algunas molculas(UDP-glucosa en la sntesis de glucgeno, CDP-diacilglicerol en la sntesis de
fosftidos de glicerina)
f) Constituyen los precursores de los cidos nucleicos (los ribonucletidos de los ARN
y los desoxirribonucletidos del ADN).
Se puede concluir que los nucletidos cumplen el principio de multiplicidad de utilizacin.
Bases purnicas Bases pirimidnicas
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Captulo 3. Estructura y funcin de los precursores de macromolculas 3
Formacin del enlace fosfodister
Los nucletidos se unen entre s y forman los cidos nucleicos al reaccionar el OH del
carbono 3 del azcar de un nucletido con el fosfato del carbono 5 del azcar de otro
nucletido. Como puede apreciarse en la figura, el fosfato queda unido por dos enlaces de
tipo ster fosfato, por ello este enlace recibe el nombre de enlace fosfodister 3 5 .
Tabla 3.2. Nomenclatura de los nuclesidos y nucletidos comunes
Base Nuclesido Nucletido Nucletido Nucletido
con 1 fosfato con 2 fosfatos con 3 fosfatos
Adenina Adenosina Adenosn monofosfato Adenosn difosfato Adenosn trifosfato
AMP ADP ATP
(cido adenlico)
Guanina Guanosina Guanosn monofosfato Guanosn difosfato Guanosn trifosfato
GMP GDP GTP
(cido guanidlico)
Hipoxantina Inosina Inosn monofosfato (IMP) Inosn difosfato (IDP) Inosn trifosfato (ITP)(cido inosnico)
Uracilo Uridina Uridn monofosfato Uridn difosfato Uridn trifosfato
(UMP) (UDP) (UTP)
(cido uridlico)
Citosina Citidina Citidn monofosfato Citidn difosfato Citidn trifosfato
(CMP) (CDP) (CTP)
(cido citidlico)
Timina Timidina Desoxitimidn Desoxitimidn difosfato Desoxitimidn trifosfato
monofosfato (dTDP) (dTTP)
(dTMP)(cido desoxitimidlico)
Nomenclatura de los nucletidos
En la tabla 3.2 se muestra la nomenclatura de las seis bases nitrogenadas ms comu-
nes, con la nomenclatura de los nuclesidos y nucletidos que ellas forman.
En la tabla 3.2 se asume que el azcar es la ribosa excepto para la base timina. Si el
azcar es desoxirribosa debe nombrarse acorde con el criterio empleado para el caso de la
timina, ejemplo, desoxiadenosn trifosfato (dATP).
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40 Bioqumica Humana
Resumen
Las macromolculas son polmeros de molculas ms simples, los precursores. Los
aminocidos son precursores de las protenas, los monosacridos de los polisacridos
y l