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Universidad Nacional Autónoma de México Facultad de Estudios Superiores Zaragoza Practica 5: “Identificación de aminoácidos constituyentes de la colágena” Integrantes: Carranza Alfaro Brenda Adriana Jiménez Hernández Janett Anel Vargas Orozco Víctor Manuel Zuñiga Olvera Luis Sadik

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Page 1: bioquimica

Universidad Nacional Autónoma de México

Facultad de Estudios Superiores Zaragoza

Practica 5:

“Identificación de aminoácidos constituyentes de la colágena”

Integrantes:

Carranza Alfaro Brenda Adriana

Jiménez Hernández Janett Anel

Vargas Orozco Víctor Manuel

Zuñiga Olvera Luis Sadik

Grupo:

3152

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MARCO TEÓRICO

Existen 20 aminoácidos distintos, cada uno de los cuales viene caracterizado por su radical: Valina, Alanina, Leucina, Isoleucina, Prolina, Metionina, Fenilalanina, Triptófano, Glicina, Serina, Treonina, Cisteina, Asparragina, Glutamina, Tirosina, Ácido aspártico, Ácido glutámico, Lisina, Arganina, Histidina.

Las proteínas se clasifican en dos clases principales atendiendo a su composición. Las proteínas simples u holoproteínas son las que están compuestas exclusivamente por aminoácidos. Las proteínas conjugadas o heteroproteínas son las que están compuestas por aminoácidos y otra sustancia de naturaleza no proteica que recibe el nombre de grupo prostético. Las proteínas conjugadas pueden a su vez clasificarse en función de la naturaleza de su grupo prostético. Así, se habla de glucoproteínas, cuando el grupo prostético es un glúcido, lipoproteínas cuando es un lípido, metaloproteínas cuando es un ion metálico, fosfoproteínas cuando es un grupo fosfato, etc.

Otro criterio de clasificación de las proteínas es la forma tridimensional de su molécula. Las proteínas fibrosas son de forma alargada, generalmente son insolubles en agua y suelen tener una función estructural, mientras que las proteínas globulares forman arrollamientos compactos de forma globular y suelen t Las proteínas son las macromoléculas más versátiles de cuantas existen en la materia viva: desempeñan un elevado número de funciones biológicas diferentes. Cada proteína está especializada en llevar a cabo una determinada función.

Entre las funciones de las proteínas cabe destacar las siguientes: catalíticas, estructurales, de transporte, nutrientes y de reserva, contráctiles o mótiles, de defensa, reguladoras del metabolismo, y otras muchas que determinadas proteínas desempeñan en organismos concretos.ener funciones de naturaleza dinámica (catalíticas, de transporte, etc).

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OBJETIVO

Identificar algunos aminoácidos que constituyen a la colágena, destacando las funciones que esta cumple en cavidad bucal, para la mejor comprensión de su composición y sitios de la cavidad bucal donde se presenta.

MATERIAL POR EQUIPO.

1. Lamina para cromatografía (cromatografía)2. 1 Regla (deberá traerla el equipo)3. Soluciones de aminoácidos4. Solución problema5. Cámara de cromatografía6. Solvente7. Ninhidrina8. Estufa

DESARROLLO.

Con un lápiz marcar a una distancia de 2 cm del borde de la placa, una línea, muy suavemente y sin tocar con los dedos u otra material.Dividir dicha línea en 6 puntos equidistantes.Colocar 1 gota de aminoácido en cada punto incluyendo también el problema, con distribución al zar, anotando al sitio en que adiciona cada aminoácido en un cuaderno. Dejar secar la gota adicionada y repetir nuevamente hasta completar 3 gotas en cada punto, dejando secar entre cada una. Una vez terminando el procedimiento anterior, introducir los cromatogramas (placas) en las cámaras de impregnación, por lo que deberán de ser marcadas por cada equipo para distinguirlas al retirarlas de la cámara.Sellar la cámara y dejar humedecer las placas (fase móvil), por lo menos hasta que cubran las 2/3 partes de la placa (1 hora).Transcurrido el tiempo y/o distancia, extraer la placa y marcar hasta donde haya llegado el disolvente.Proceder a secar la placa en estufa.

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Colocar la placa en una cámara de extracción o en una zona bien ventilada, para adicionar la nihidrina, rociando toda la placa.Secar nuevamente la placa en la estufa.Aparecerán unas manchas, debe circularlas, marcar el centro de cada una, identificar el color y anotarlo, además de medir el centro de la mancha hasta el punto en donde coloco inicialmente los aminoácidos y el problema, anotado el resultado en mm.Calcular el Rf de cada mancha, anotando el nombre del aminoácido correspondiente, en el caso del problema puede aparecer más de una mancha, por lo que deberá de anotar los aminoácidos reconocidos mediante este método.

CUESTIONARIO

1. ¿Cuáles son las funciones de la colágena en el organismo?

R= Su principal función es brindarle al organismo fuerza de tensión, siendo además responsable por la firmeza, elasticidad e integridad de las estructuras e hidratación del cuerpo; por la transmisión de fuerza en los tendones y ligamentos; por la transmisión de luz en la córnea; por la distribución de fluidos en los vasos sanguíneos y conductos glandulares, etc. La elasticidad y la flexibilidad común en los jóvenes, se debe al alto contenido de colágeno que ellos poseen.

2. ¿Cuáles otros tipos de cromatografía existen?

R= 1. Cromatografía de adsorción: La fase estacionaria es un sólido en el que los componentes de la muestra son adsorbidos. La fase móvil puede ser un líquido (cromatografía líquido-sólido) o un gas (cromatografía gas-sólido); los componentes se distribuyen entre dos fases a través de la combinación de los procesos de adsorción y desorción. La cromatografía de capa fina (TLC) es un ejemplo especial de cromatografía por adsorción en la cual la fase estacionaria es un plano, en la forma de un soporte sólido en un plato inerte.

2. Cromatografía de partición: La fase estacionaria de la cromatografía de partición es un líquido soportado en un sólido inerte. Otra vez, la

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fase móvil puede ser un líquido (cromatografía de partición líquido-líquido) o un gas (cromatografía de partición gas-líquido, GLC). La cromatografía en papel es un tipo de cromatografía de partición en la cual la fase estacionaria es una capa de agua adsorbida en una hoja de papel.

3. Cromatografía de intercambio iónico: La separación en la cromatografía de intercambio iónico depende la adsorción reversible de moléculas de soluto cargadas, a una resina con grupos iónicos de carga opuesta. El mecanismo de separación se basa en un equilibrio de intercambio iónico. Muchos de los experimento de intercambio iónico se llevan a cabo en cinco etapas.

4. Cromatografía de exclusión por tamaño: En la cromatografía de exclusión puede separarse moléculas solvatadas de acuerdo a su tamaño y habilidad a penetrar en una estructura tamiz (la fase estacionaria).

3. ¿En qué parte de la cavidad bucal existe colágeno?

R= Ligamento periodontal y Epitelio, membrana basal, lámina basal, sintetizada por el epitelio y lámina reticular sintetizada por el tejido conectivo. A su vez la lámina basal: consta de dos estratos: lámina lúcida y lámina densa. Ambas forman una estructura a manera de red tridimensional siendo más tupida la lámina densa. En la lámina lúcida encontramos laminina, entacticna o nidogeno, colágeno tipo XVII, unceina y ladinina. En la lámina densa se encuentra colágeno tipo IV, heparan sulfato y fibronectina. Dentina, cemento y hueso.

4. Escriba 3 tipos de colágeno y su localización

R= • Tipo I: Está presente sobre todo en los huesos, en la piel, en la córnea y en los tendones. Tiene un tamaño de aproximadamente la millonésima parte de un milímetro y se presenta en forma de fibra con estrías. Éstas, se agrupan y forman cadenas cuyas principales funciones son el dotar a un organismo de capacidad de estiramiento y resistencia.

• Tipo II: Se encuentra fundamentalmente en los cartílagos, aunque también en determinadas estructuras de los embriones. Sus dimensiones son similares a las del colágeno de Tipo I, así como su forma, también alargada. Sus principales funciones son las de otorgar resistencia a estos tejidos, así como la de realizar presión de forma intermitente.

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• Tipo III: Es propio de los tejidos de los músculos, así como de las venas, la piel y varias glándulas del cuerpo. Mide aproximadamente dos veces más que el colágeno de tipo I y II y su principal función es la de sujetar a varios órganos del cuerpo

5. ¿Cuáles son las funciones de la colágena en los tejidos dentarios?

R= Soporte mecánico primario de los tejidos, acelerar el proceso de mineralización y elasticidad.

6. Cuál es la diferencia entre hidrólisis y desnaturalización?

R= HIDRÓLISIS En química orgánica, la hidrólisis se presenta como la reacción opuesta a la condensación. En este contexto una molécula orgánica y el agua reaccionan rompiendo un enlace covalente para formar dos moléculas orgánicas con grupos funcionales que incluyen los átomos de la molécula de agua. En general se requiere añadir ácidos o bases fuertes para catalizar la hidrólisis

DESNATURALIZACIÓN En bioquímica, la desnaturalización es un cambio estructural de las proteínas o ácidos nucleicos, donde pierden su estructura nativa, y de esta forma su óptimo funcionamiento y a veces también cambian sus propiedades físico-químicas

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CONCLUSIONES

En esta práctica analizamos la importancia de los aminoácidos como estructuras de las proteínas las cuales están unidas por enlaces pepiticos. Las proteínas son biomoleculas, con diversas funciones que van desde la conformación de las membranas celulares a la enzimática. En cavidad bucal existen 106 tipos de proteínas, en esta práctica se enfatizo a la importancia de algunos tipos de colágena que se encuentran en cavidad bucal como el IV y VII los cuales forman hueso, ligamento periodontal, cemento, membrana basal, los cuales provocan sostén y mineralización.

BIBLIOGRAFÍA

Bioquimica. Bohinski. Quinta edición. Pearson Bioquimica. Edwin T. Mertz.

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Universidad Nacional Autónoma de México

Facultad de Estudios Superiores Zaragoza

Practica 4:

“ACTIVIDAD DE LA AMILASA SALIVAL”

Integrantes:

Carranza Alfaro Brenda Adriana

Jiménez Hernández Janett Anel

Vargas Orozco Víctor Manuel

Zuñiga Olvera Luis Sadik

Grupo:

3152

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MARCO TEÓRICO

Las proteínas son biomoléculas formadas básicamente por carbono, hidrógeno, oxígeno y nitrógeno. Pueden además contener azufre y en algunos tipos de proteínas, fósforo, hierro, magnesio y cobre entre otros elementos.

Pueden considerarse polímeros de unas pequeñas moléculas que reciben el nombre de aminoácidos y serían, por tanto, los monómeros unidad. Los aminoácidos están unidos mediante enlaces peptídicos. La unión de un bajo número de aminoácidos da lugar a un péptido; si el número de aminoácidos que forma la molécula no es mayor de 10, se denomina oligopéptido, si es superior a 10 se llama polipéptido y si el número es superior a 50 aminoácidos se habla ya de proteína.

Por tanto, las proteínas son cadenas de aminoácidos que se pliegan adquiriendo una estructura tridimensional que les permite llevar a cabo miles de funciones. Las proteínas están codificadas en el material genético de cada organismo, donde se especifica su secuencia de aminoácidos, y luego son sintetizadas por los ribosomas.

Las proteínas desempeñan un papel fundamental en los seres vivos y son las biomoléculas más versátiles y más diversas. Realizan una enorme cantidad de funciones diferentes, entre ellas funciones estructurales, enzimáticas, transportadora.

Todas las proteínas poseen una misma estructura química central, que consiste en una cadena lineal de aminoácidos. Lo que hace distinta a una proteína de otra es la secuencia de aminoácidos de que está hecha, a tal secuencia se conoce como estructura primaria de la proteína. La estructura primaria de una proteína es determinante en la función que cumplirá después, así las proteínas estructurales (como aquellas que forman los tendones y cartílagos) poseen mayor cantidad de aminoácidos rígidos y que establezcan enlaces químicos fuertes unos con otros para dar dureza a la estructura que forman.

Enzimas

Son las moléculas proteícas más abundantes. Se encuentran en todo tipo de células y catalizan las reacciones químicas de los seres vivos

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(biocatalizadores).Un catalizador es una sustancia que aumenta la rapidez o velocidad de una reacción química, sin verse alterada ella misma en el proceso global. Son por tanto, las responsables del metabolismo celular. Son específicas de las reacciones que catalizan y de los sustratos que intervienen.

Los enzimas son catalizadores muy potentes y eficaces (aumentan la velocidad de las reacciones entre 103 y 109 veces). No llevan a cabo reacciones que sean energéticamente desfavorables, no modifican el sentido de los equilibrios químicos, sino que aceleran su consecución.

Químicamente son proteínas simples de estructura terciaria o cuaternaria (globulares) o proteínas conjugadas; en éste último caso, la parte proteíca se denomina apoenzima (inactiva, carece de los componentes químicos apropiados para la actividad que debe realizar) y necesitan de un cofactor, que puede ser un ión metálico o una molécula orgánica. La molécula orgánica si se une fuertemente a la apoenzima recibe el nombre de grupo prostético, si se une débilmente se llama coenzima. Al conjunto de apoenzima y cofactor se le denomina holoenzima.

Las coenzimas actúan como un sustrato más y participan en la reacción modificándose químicamente con ella; sin embargo, al considerar la secuencia de reacciones globales, el coenzima se recupera en los pasos siguientes. La mayor parte de los coenzimas son vitaminas, o las vitaminas forman parte de ellas, particularmente las del grupo B. No son específicas de un solo tipo de apoenzimas, dándose casos de algunas que pueden unirse a más de 100 apoenzimas diferentes.

El apoenzima presenta una región llamada centro activo en la que se acopla el sustrato y suele tener forma de hendidura o bolsillo, rodeada por cadenas laterales de aminoácidos que facilitan la unión del sustrato y por otras cadenas laterales que intervienen en la catálisis. La compleja estructura terciaria de las enzimas hace posible que en este bolsillo se ajuste el sustrato de manera muy estrecha lo que explica la extraordinaria especificidad de la catálisis enzimática. Los aminoácidos que constituyen el centro activo pertenecen a zonas muy distantes de la cadena y representan una pequeña fracción del número total de aminoácidos de la proteína. El resto de la molécula es necesaria para mantener la molécula en posición correcta y para suministrar lugares de unión adicionales con función reguladora (centros reguladores).

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OBJETIVO

Al terminar de la practica los alumnos, deberán de relacionar la actividad enzimática con los cambios del pH, asi como también deberán relacionar la actividad de la amilasa con el inicio de la digestión química de los alimentos.

INTRODUCCIÓN

Las enzimas son catalizadores proteicos que aceleran la velocidad de las reacciones metabólicas que ocurren tanto a nivel celular como fuera de ellas, sin sufrir ellas cambios en su estructura y/o función.En los humanos la digestión empieza en la cavidad oral, donde los alimentos son masticados y degradados por enzimas contenidas en la secreción de la saliva, está es secretada en la boca en grandes cantidades por las glándulas salivares, las principales son las parótidas, las submandibulares y las sublinguales; además, hay muchas glándulas salivales pequeñas.Las enzimas presentes en la cavidad oral y de las cuales estudiaremos son: la amilasa salival que hidroliza al almidón, la lisozima que desinfecta las posibles bacterias infecciosas y también la lipasa lingual que se activa en el medio acido del estomago que actúa sobre los triglicéridos.

MATERIAL POR EQUIPO.

2 placas de porcelana

8 tubos de ensaye 20x150

1 gradilla

1 pipeta pasteur

2 pipetas de 5 ml

1 parrilla

1 vaso de precipitado de 500 ml

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REACTIVOS:

Solución de alimón al 0.9%

Reactivo de lugol

Solución buffer de pH 3,5,6, 6.5, 7, 8 y 10

Muestra de saliva diluida 1:5 y 1.10

PROCEDIMIENTO

1. Dos integrantes de cada equipo adicionaran 1 ml de saliva en 1 tubo de ensaye cada uno, el primero debe diluir su saliva adicionando 4 ml mas de agua destilada, etiquetando el tubo (1:5) y mantendrá su temperatura aproximadamente en 37° C, sea en su mano o el baño maría.

2. El segundo deberá diluir su saliva adicionando al ml del otro tubo de ensaye 9 ml de agua destilada, etiquetando dicha dilución (1:10), manteniendo la temperatura de aproximadamente 37° C en baño maría o calor corporal.

3. Mientras otro integrante etiquetara los tubos de ensaye con los pH correspondientes de 3, 5, 6, 6.5, 7, 8 y 10 a los que adicionara 3.0 ml de cada solución buffer.

4. A cada tubo de solución buffer se le adicionan 2 ml de solución de almidón al 0.9%.

5. Se deben mantener los tubos a la temperatura de 37° C aproximadamente, sea en baño maría o calor corporal.

6. Preparar una placa de porcelana para cada saliva, adicionando 2 gotas de reactivo lugol.

7. Adicionar 1 ml de la saliva diluida a la solución buffer a medir, inmediatamente se mezcla con la pipeta Pasteur y se adicionan 2 gotas en una de las cavidades de la placa de porcelana, tomándose como tiempo inicial (0), se adicionara con intervalos de 30° a cada cavidad de la placa en orden secuencial, hasta llegar al punto acromico, anotando el tiempo total para cada solución.

8. Los pH de 5, 6, 6.5 y 7 se realizaran cada 30’’ y los 3,8 y 10 cada 3 minutos.

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CONCLUSIONES

En esta práctica analizamos la importancia de las enzimas con los cambios de pH en cavidad bucal, las cuales ayudan a mantener el Ph siempre entre 6.3 a 6.8 lo cual sabemos que si el ph desciende aumenta el riesgo de caries dental, y si aumenta produce una enfermedad periodontal.

La importancia de la amilasa salival en cavidad bucal es comenzar con la digestión, ya que en cavidad bucal es donde se degradan los carbohidratos los cuales serán degradados por la enzima amilasa salival la cual es responsable de romper los enlaces glucosidicos en el almidón tales como, la amilasa y amelopectina hasta llegar a maltosa.

BIBLIOGRAFÍA

Bioquimica. Bohinski. Quinta edición. Pearson Bioquimica. Edwin T. Mertz.