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Composición de las poblaciones de campo de Globodera pallida del Reino Unido y sus implicaciones de manejo de la resistencia Vivian C. Blok and Ulrike Gartner

Composición de las poblaciones de campo de · introducciones de Sudamérica basado en el gen CytB y microsatélites IV c V c I c III c II c Plantard et al 2008 Molecular Ecology

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Page 1: Composición de las poblaciones de campo de · introducciones de Sudamérica basado en el gen CytB y microsatélites IV c V c I c III c II c Plantard et al 2008 Molecular Ecology

Composición de las poblaciones de campo de Globodera pallida del Reino Unido y sus

implicaciones de manejo de la resistencia

Vivian C. Blok and Ulrike Gartner

Page 2: Composición de las poblaciones de campo de · introducciones de Sudamérica basado en el gen CytB y microsatélites IV c V c I c III c II c Plantard et al 2008 Molecular Ecology

En UK, Globodera pallida está compuesta de al menos 3 introducciones de Sudamérica basado en el gen CytB y

microsatélites

IVc

Vc

Ic

IIIc

IIc

Plantard et al 2008 Molecular Ecology

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C: Escocia, Irlanda del Norte

A) Francia, RU, UcraniaHolanda, Suiza, Portugal

100 km

B) Escocia, Francia, Holanda

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Hockland et al 2012 Nematology

Árbol filogenético del gen CytBde las poblaciones de

G. pallida de Europa, Sur y Norteamérica

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En Escocia las 3 introducciones de G. pallida están muyextendidas

• Los 3 tipos están extendidos• Muchas parcelas tienen 1 tipo de cytB

1/5 de las parcelas contienen mezclas• <3% contienen los tres tipos• 1 parcela contiene un 4o tipo Eves van den Akker et al 2015 Molecular Ecology

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El “paisaje patogénico” en una parcela en Luffness, Escocia

Eves van den Akker et al 2015 Molecular Ecology

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Si los campos del R. U. están formadas por múltiplesintroducciones de G. pallida, ¿pueden ser también

mezclas de fenotipos?

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Muestreo en Luffness donde las 3 “introducciones” de

G. pallida fueron localizadas

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Líneas provenientes de un único quiste de G. pallida

• Desirée• Maris Piper (H1)• P55/7 (H2)• Vales Everest (H3)• 62.33.3 (Gpa5)• Innovator (Gpa5)

Test de multiplicación sobre:

Año 1 Año 2/3 Año 3/4

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Fenotipado de líneas provenientes de un único quiste de Luffness

Sin

gle

cyst

lin

es

Pob

laci

on

es“P

ato

tip

o”

Page 11: Composición de las poblaciones de campo de · introducciones de Sudamérica basado en el gen CytB y microsatélites IV c V c I c III c II c Plantard et al 2008 Molecular Ecology

GBS (Genotipado porsecuenciación) de 41 poblaciones y

líneas procedentes de un únicoquiste de G. pallida

(árbol sin raíz de 3274 SNPs usandofreebayes)

A

C

B

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Mitotipado de G. pallida con T-RFLP

AB C

A

B

C

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Fenotipado de líneas provenientes de un único quiste de Luffness

Lín

eas

de

qu

iste

ún

ico

Pob

laci

on

es“P

ato

tip

o”

Page 14: Composición de las poblaciones de campo de · introducciones de Sudamérica basado en el gen CytB y microsatélites IV c V c I c III c II c Plantard et al 2008 Molecular Ecology

Fenotipado de líneas provenientes de un único quiste de Inglaterra

Pob

laci

on

es“P

ato

tip

o”

Sin

gle

cyst

lin

es

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Multiplication rates

0.0

5.0

10.0

15.0

20.0

25.0

30.0

35.0

40.0

Desiree Russett

Burbank

P55/7 Morag Iledher Innovator 12380 Vales

Everest

Pf/

Pi

(fie

ld e

qu

ivale

nt)

Pa1 (B)

Rookmaker

Luffness

Lindley (E)

Idaho

P4A

Bedale

Chavornay

indicates Pf/Pi = 1

+

Combinación de resistencias a G. pallida

Gpa4 (H3) Gpa5

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34.98

70.11

51.87 52.79

7.90

17.6715.92

20.83

3.166.24 6.83 8.10

1.25 2.52 1.59 3.23

-10.00

0.00

10.00

20.00

30.00

40.00

50.00

60.00

70.00

80.00

90.00

Lindley Luffness Farcet Newton

No Qtl

Gpa4

Gpa5

Gpa4 + Gpa5

Rigney et al 2016 Plant Pathology 66: 1031-1040

Efectos aditivos de la combinación de Gpa4 (H3) y Gpa5

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0

2

4

6

8

10

12

14

0 2 4 6 8 10 12 14 16

SQRT de conteos de hembras 2016

SQR

T d

e c

on

teo

sd

e h

em

bra

s2

01

5

5 50

Conteos de hembras 5

Conteos de hembras 50

Diagrama de dispersión de SQRT de conteos de hembras de G. pallida en 231 clones

(progenie de los cruzamientos de Gpa5 y H3 JHL)

Page 18: Composición de las poblaciones de campo de · introducciones de Sudamérica basado en el gen CytB y microsatélites IV c V c I c III c II c Plantard et al 2008 Molecular Ecology

Crianza de papa para resistencia

para resistencia

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Agradecimientos:

Seb Eves van den Akker

Benjamin Mimee and Pierre-Yves Veronneau

Gaynor McKenzie, Chen Xinwei, Drummond Todd and Vanessa Young

Brian Rigney and Dan Milbourne

Allan Stevenson

Juan Emilio Palomares Rius

Louise-Marie Dandurand

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