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Consejo Nacional de Ciencia y TecnologíaCentro de Investigación en Matemáticas, A.C.
Estimaciones de la Tasa de Reproducción EfectivaRt de COVID-19 para los Estados y Zonas
Metropolitanas de México
16 de Septiembre de 2020
Reporte realizado por:Dra. Graciela González FaríasM.en C. Domingo Iván Rodríguez González
CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA
CENTRO DE INVESTIGACIÓN EN MATEMÁTICAS, A.C.
16 de Septiembre de 2020
Tabla de Contenidos
1 Estimaciones de Rt en Orden Ascendente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.1 Estimaciones de Rt por Estado en Orden Ascendente 5
1.2 Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana en Orden Ascendente 6
2 Estimaciones de Rt por Estado . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
2.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Estado 19
3 Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Zona Metropolitana 30
4 Metodología de Estimación de Rt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
4.1 Metodología para la Estimación del Rt. 324.1.1 Datos de entrada para la estimación . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 324.1.2 Estimación de la tasa de reproducción efectiva Rt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
1. Estimaciones de Rt en Orden Ascendente
1.1 Estimaciones de Rt por Estado en Orden Ascendente 5
1.1 Estimaciones de Rt por Estado en Orden Ascendente
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día16 de Septiembre de 2020
La figura 1.1 muestra las estimaciones del Rt para los 32 estados de México, ordenados demanera ascendente. Se tomaron los datos de nuevos casos hasta el día 10 de Septiembre de 2020. Enverde se muestran los estados para los que el Rt estimado es menor a 1. Se incluyen los intervalosde máxima densidad del 50 % y 90 %.
SAN
LUIS
POT
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BAJA
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BAJA
CAL
IFOR
NIA
SUR
JALI
SCO
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0.5
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
3.0
R t
Rt más reciente por EstadoRt>1Rt<=1
50%50%
90%90%
Fig. 1.1: Valor de Rt más reciente para los 32 estados de México.
6 Capítulo 1. Estimaciones de Rt en Orden Ascendente
1.2 Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana en Orden Ascendente
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día16 de Septiembre de 2020
La figura 1.2 muestra las estimaciones del Rt para las 25 Zonas Metropolitanas con mayornúmero de casos confirmados de COVID-19, ordenadas de manera ascendente. Se tomaron losdatos de nuevos casos hasta el día 10 de Septiembre de 2020. En verde se muestran las zonasmetropolitanas para las que el Rt estimado es menor a 1. Se incluyen los intervalos de máximadensidad del 50 % y 90 %.
San
Luis
Poto
sí
Mex
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León
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os
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Acap
ulco
Tolu
ca
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cán
Agua
scal
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cruz
Villa
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Quer
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o
Mér
ida
Guad
alaj
ara
La P
az
0.5
0.0
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
3.0
R t
Rt más reciente por Zona MetropolitanaRt>1Rt<=1
50%50%
90%90%
Fig. 1.2: Valor de Rt más reciente para las 25 Zonas Metropolitanas con mayor número de casos.
2. Estimaciones de Rt por Estado
8 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día16 de Septiembre de 2020
A contiuación se muestran las gráficas del comportamiento de la tasa Rt a lo largo del tiempopara los 32 estados de México. La fecha inicial se toma a partir de la cual existen datos suficientespara hacer la estimación, mientras que la fecha final corresponde al 10 de Septiembre de 2020, esdecir, 7 días anteriores de la fecha de elaboración de este reporte.
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.92Rt más reciente
AGUASCALIENTES
6495 casos totales514 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio452.73 casos por 100mil habitantes0.95 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.59Rt más reciente
BAJA CALIFORNIA
18386 casos totales3374 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio505.82 casos por 100mil habitantes2.70 % de casos a nivel nacional
9
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.14Rt más reciente
BAJA CALIFORNIA SUR
9147 casos totales425 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio1136.69 casos por 100mil habitantes1.34 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.84Rt más reciente
CAMPECHE
5834 casos totales784 defunciones totales
2020-03-08 fecha de inicio583.04 casos por 100mil habitantes0.86 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.79Rt más reciente
COAHUILA
24435 casos totales1669 defunciones totales
2020-02-28 fecha de inicio759.15 casos por 100mil habitantes3.59 % de casos a nivel nacional
10 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.04Rt más reciente
COLIMA
4279 casos totales469 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio544.99 casos por 100mil habitantes0.63 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.78
Rt más reciente
CHIAPAS
6411 casos totales1081 defunciones totales
2020-02-29 fecha de inicio111.88 casos por 100mil habitantes0.94 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.64Rt más reciente
CHIHUAHUA
9223 casos totales1263 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio242.62 casos por 100mil habitantes1.35 % de casos a nivel nacional
11
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.83Rt más reciente
CIUDAD DE MÉXICO
114268 casos totales9087 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio1267.02 casos por 100mil habitantes16.78 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.07Rt más reciente
DURANGO
7887 casos totales536 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio421.99 casos por 100mil habitantes1.16 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.00Rt más reciente
GUANAJUATO
37541 casos totales2664 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio602.76 casos por 100mil habitantes5.51 % de casos a nivel nacional
12 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.71Rt más reciente
GUERRERO
16854 casos totales1842 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio460.86 casos por 100mil habitantes2.48 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.98
Rt más reciente
HIDALGO
11662 casos totales1794 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio377.85 casos por 100mil habitantes1.71 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.18Rt más reciente
JALISCO
23743 casos totales2868 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio282.33 casos por 100mil habitantes3.49 % de casos a nivel nacional
13
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.80Rt más reciente
MÉXICO
75412 casos totales10999 defunciones totales
2020-02-28 fecha de inicio432.71 casos por 100mil habitantes11.07 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.71Rt más reciente
MICHOACÁN
18194 casos totales1473 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio377.05 casos por 100mil habitantes2.67 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.95Rt más reciente
MORELOS
5602 casos totales1042 defunciones totales
2020-03-09 fecha de inicio274.06 casos por 100mil habitantes0.82 % de casos a nivel nacional
14 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.00Rt más reciente
NAYARIT
5547 casos totales686 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio430.48 casos por 100mil habitantes0.81 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.91
Rt más reciente
NUEVO LEÓN
34760 casos totales2699 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio619.59 casos por 100mil habitantes5.10 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.72Rt más reciente
OAXACA
15030 casos totales1374 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio362.73 casos por 100mil habitantes2.21 % de casos a nivel nacional
15
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.90Rt más reciente
PUEBLA
29524 casos totales3808 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio447.03 casos por 100mil habitantes4.34 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.06Rt más reciente
QUERÉTARO
7929 casos totales852 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio347.82 casos por 100mil habitantes1.16 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.83Rt más reciente
QUINTANA ROO
11189 casos totales1556 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio649.29 casos por 100mil habitantes1.64 % de casos a nivel nacional
16 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.57Rt más reciente
SAN LUIS POTOSÍ
21114 casos totales1456 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio736.67 casos por 100mil habitantes3.10 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.73
Rt más reciente
SINALOA
17498 casos totales3005 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio554.32 casos por 100mil habitantes2.57 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.62Rt más reciente
SONORA
23445 casos totales2779 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio762.50 casos por 100mil habitantes3.44 % de casos a nivel nacional
17
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.00Rt más reciente
TABASCO
30397 casos totales2673 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio1181.71 casos por 100mil habitantes4.46 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.73Rt más reciente
TAMAULIPAS
27299 casos totales1970 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio747.79 casos por 100mil habitantes4.01 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.75Rt más reciente
TLAXCALA
7035 casos totales1058 defunciones totales
2020-03-23 fecha de inicio509.78 casos por 100mil habitantes1.03 % de casos a nivel nacional
18 Capítulo 2. Estimaciones de Rt por Estado
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.80Rt más reciente
VERACRUZ
31370 casos totales4087 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio367.34 casos por 100mil habitantes4.61 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.23Rt más reciente
YUCATÁN
16894 casos totales1469 defunciones totales
2020-03-12 fecha de inicio747.82 casos por 100mil habitantes2.48 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.09Rt más reciente
ZACATECAS
6527 casos totales622 defunciones totales
2020-03-16 fecha de inicio391.68 casos por 100mil habitantes0.96 % de casos a nivel nacional
2.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Estado 19
2.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Estado
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día16 de Septiembre de 2020
La figura 2.1 muestra la tasa de crecimiento (Rt ∗ I) a lo largo del tiempo, es decir, los casosnuevos esperados por día para la tasa Rt estimada y el número de casos nuevos registrados ese día(I). Se muestra la comparación con la curva nacional (obtenida a partir de los datos por Estado)para observar la contribución de cada uno de los Estados a la tasa de crecimiento nacional.
NACIONAL
CIUDAD DE MÉXICOJALISCO
●
●●0
2500
5000
7500
10000
Feb 27 Mar 19 Apr 10 May 02 May 24 Jun 14 Jul 06 Jul 28 Aug 19 Sep 10Fecha
Cas
os N
uevo
s E
sper
ados
(R
t*I)
Estado
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
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●
NACIONAL
CIUDAD DE MÉXICO
JALISCO
GUANAJUATO
NUEVO LEÓN
YUCATÁN
TABASCO
MÉXICO
BAJA CALIFORNIA SUR
ZACATECAS
QUERÉTARO
PUEBLA
HIDALGO
COAHUILA
DURANGO
VERACRUZ
TAMAULIPAS
COLIMA
NAYARIT
MICHOACÁN
QUINTANA ROO
SINALOA
MORELOS
GUERRERO
SAN LUIS POTOSÍ
AGUASCALIENTES
CAMPECHE
OAXACA
TLAXCALA
BAJA CALIFORNIA
SONORA
CHIAPAS
CHIHUAHUA
Tasas de Crecimiento por Estado (Rt*I)
Fig. 2.1: Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Estado.
3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
21
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día16 de Septiembre de 2020
A contiuación se muestran las gráficas del comportamiento de la tasa Rt a lo largo del tiempopara las 25 Zonas Metropolitanas con mayor número de casos de COVID-19. La fecha inicial setoma a partir de la cual existen datos suficientes para hacer la estimación, mientras que la fechafinal corresponde al 10 de Septiembre de 2020, es decir, 7 días anteriores de la fecha de elaboraciónde este reporte.
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.78Rt más reciente
Valle de México
172692 casos totales17751 defunciones totales
2020-02-27 fecha de inicio787.01 casos por 100mil habitantes25.36 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.93Rt más reciente
Monterrey
31871 casos totales2618 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio620.79 casos por 100mil habitantes4.68 % de casos a nivel nacional
22 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.93Rt más reciente
Puebla
24108 casos totales2843 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio758.31 casos por 100mil habitantes3.54 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)1.06
Rt más reciente
Villahermosa
16823 casos totales1311 defunciones totales
2020-03-18 fecha de inicio1892.63 casos por 100mil habitantes2.47 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.17Rt más reciente
Guadalajara
16370 casos totales1985 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio312.22 casos por 100mil habitantes2.40 % de casos a nivel nacional
23
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.78Rt más reciente
León
15039 casos totales1357 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio799.68 casos por 100mil habitantes2.21 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.88Rt más reciente
Toluca
11859 casos totales1689 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio498.73 casos por 100mil habitantes1.74 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.66Rt más reciente
San Luis Potosí
11709 casos totales817 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio954.52 casos por 100mil habitantes1.72 % de casos a nivel nacional
24 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.17Rt más reciente
Mérida
10891 casos totales1010 defunciones totales
2020-03-12 fecha de inicio879.94 casos por 100mil habitantes1.60 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.73
Rt más reciente
Hermosillo
10020 casos totales919 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio1059.14 casos por 100mil habitantes1.47 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.95Rt más reciente
La Laguna
10009 casos totales687 defunciones totales
2020-02-28 fecha de inicio684.26 casos por 100mil habitantes1.47 % de casos a nivel nacional
25
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.80Rt más reciente
Tampico
8911 casos totales474 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio908.86 casos por 100mil habitantes1.31 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.67Rt más reciente
Mexicali
8790 casos totales1537 defunciones totales
2020-03-11 fecha de inicio808.29 casos por 100mil habitantes1.29 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.98Rt más reciente
Veracruz
8525 casos totales1092 defunciones totales
2020-03-15 fecha de inicio891.30 casos por 100mil habitantes1.25 % de casos a nivel nacional
26 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.79Rt más reciente
Oaxaca
8322 casos totales520 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio1190.88 casos por 100mil habitantes1.22 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.87
Rt más reciente
Acapulco
7683 casos totales925 defunciones totales
2020-03-13 fecha de inicio835.36 casos por 100mil habitantes1.13 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.11Rt más reciente
Querétaro
6726 casos totales670 defunciones totales
2020-03-10 fecha de inicio455.01 casos por 100mil habitantes0.99 % de casos a nivel nacional
27
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.72Rt más reciente
Tijuana
6667 casos totales1481 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio331.49 casos por 100mil habitantes0.98 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.90Rt más reciente
Culiacán
6551 casos totales986 defunciones totales
2020-03-17 fecha de inicio680.36 casos por 100mil habitantes0.96 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.75Rt más reciente
Reynosa
5637 casos totales608 defunciones totales
2020-03-16 fecha de inicio687.54 casos por 100mil habitantes0.83 % de casos a nivel nacional
28 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.84Rt más reciente
Cancún
5353 casos totales1039 defunciones totales
2020-03-12 fecha de inicio616.87 casos por 100mil habitantes0.79 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0(R
t)0.91
Rt más reciente
Aguascalientes
5317 casos totales473 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio464.88 casos por 100mil habitantes0.78 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.76Rt más reciente
Juárez
4907 casos totales814 defunciones totales
2020-03-14 fecha de inicio334.96 casos por 100mil habitantes0.72 % de casos a nivel nacional
29
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
1.29Rt más reciente
La Paz
4852 casos totales190 defunciones totales
2020-03-26 fecha de inicio1606.83 casos por 100mil habitantes0.71 % de casos a nivel nacional
Mar 01 Mar 22 Apr 12 May 04 May 25 Jun 16 Jul 07 Jul 29 Aug 19 Sep 10Fecha
0.0
1.0
2.0
3.0
4.0
5.0
6.0
7.0
(Rt)
0.83Rt más reciente
Matamoros
4767 casos totales327 defunciones totales
2020-03-20 fecha de inicio872.89 casos por 100mil habitantes0.70 % de casos a nivel nacional
30 Capítulo 3. Estimaciones de Rt por Zona Metropolitana
3.1 Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Zona Metropolitana
Las estimaciones se obtuvieron a partir de los datos oficiales del Gobierno Federal al día16 de Septiembre de 2020
La figura 3.1 muestra la tasa de crecimiento (Rt ∗ I) a lo largo del tiempo para Zonas Metropo-litanas, es decir, los casos nuevos esperados por día para la tasa Rt estimada y el número de casosnuevos registrados ese día (I). Se muestra la comparación con la curva nacional (obtenida a partirde los datos por Estado) para observar la contribución de cada una de las Zonas Metropolitanas a latasa de crecimiento nacional.
NACIONAL
Valle de MéxicoMonterrey
●
●●0
2500
5000
7500
10000
Feb 27 Mar 19 Apr 10 May 02 May 24 Jun 14 Jul 06 Jul 28 Aug 19 Sep 10Fecha
Cas
os N
uevo
s E
sper
ados
(R
t*I)
ZM
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
●
NACIONAL
Valle de México
Monterrey
Guadalajara
Villahermosa
La Paz
Mérida
Querétaro
Puebla
La Laguna
Toluca
Veracruz
Culiacán
Tampico
León
San Luis Potosí
Aguascalientes
Acapulco
Matamoros
Oaxaca
Hermosillo
Cancún
Reynosa
Mexicali
Tijuana
Juárez
Tasas de Crecimiento por Zona Metropolitana (Rt*I)
Fig. 3.1: Tasa de Crecimiento (Rt ∗ I) por Zona Metropolitana.
4. Metodología de Estimación de Rt
32 Capítulo 4. Metodología de Estimación de Rt
4.1 Metodología para la Estimación del Rt.A continuación se resume la metodología utilizada para estimar el valor de la tasa de repro-
ducción Rt cada día por Estados y Zonas Metropolitanas de la República Mexicana. La cual estábasada en la propuesta del sitio Estimating COVID-19’s Rt in Real-Time [1], que estima los valoresde Rt para los Estados Unidos de América.
Esta tasa de reproducción es una medida de la rapidez con la que se trasmite la enfermedadCOVID-19, pues se refiere al número promedio de personas que son infectadas por una personainfecciosa. Si el valor de Rt es superior a 1.0, la enfermedad continúa su expansión, mientras quesi es menor a 1.0 la expansión se está deteniendo.
4.1.1 Datos de entrada para la estimaciónLos datos a partir de los cuáles se estiman los valores de Rt corresponden a la información
oficial provista por el Gobierno de México, a través de su portal de acceso abierto, respecto a loscasos confirmados de COVID-19 en el país (ver el sitio).
Mediante estos datos se determina la serie de nuevos casos confirmados por día para cada unode los estados, tomando como fecha el día de presentación de los síntomas de cada individuo. Sedescartan los datos correspondientes a los últimos 7 días y se aplica un suavizado con promediomóvil ponderado. La siguiente gráfica muestra los nuevos casos diarios para la Ciudad de Méxicohasta el 26 de abril, a manera de ejemplo.
4.1.2 Estimación de la tasa de reproducción efectiva Rt
Se estima la probabilidad a posteriori P (Rt|k) utilizando el Teorema de Bayes, donde t es eldía y k es el número de casos nuevos de COVID-19 en ese día:
P (Rt|k) =P (k|Rt) · P (Rt)
P (k)(4.1)
4.1 Metodología para la Estimación del Rt. 33
Para la verosimilitud P (k|Rt) se propone una distribución Poisson:
P (k|Rt) =λke−λ
k!(4.2)
con parámetro λ = kt−1eγ(Rt−1), que depende del número de casos nuevos del día anterior y del
parámetro γ = 1/12, pues el invervalo serial es de 12 días.
La probabilidad a priori P (Rt) se calcula a partir de la probabilidad a priori del día anteriorP (Rt−1), asumiendo que P (Rt|Rt−1) sigue una distribución normal centrada en Rt−1, es decirN(Rt−1, σ). Para cada estado o zona metropolitana se selecciona el valor de σ que maximiza laverosimilitud de P (k|σ) para un rango de valores propuesto.
Para estimar la posterior P (Rt|k) del día t, se fija k, pues se conoce el número de nuevoscasos en el día t, y se varía Rt en un rango propuesto entre 0 y 12. Se repite el proceso de maneraiterativa para calcular la probabilidad posterior para cada día de la serie. La siguiente figura muestralas distribuciones posteriores diarias obtenidas para la Ciudad de México.
34 Capítulo 4. Metodología de Estimación de Rt
Para cada estado y zona metropolitana se seleccionó un valor de R0 inicial, a partir del cuál seinicia la estimación del Rt:
Estado R0 Zona Metropolitana R0
AGUASCALIENTES 1.5 Valle de México 6.9BAJA CALIFORNIA 4.8 Puebla 3.1BAJA CALIFORNIA SUR 1.5 Villahermosa 3.2CAMPECHE 1.8 Monterrey 2.2CHIAPAS 2.3 Guadalajara 2.3CHIHUAHUA 3.2 León 2.2CIUDAD DE MÉXICO 6.9 Veracruz 3.0COAHUILA 2.1 La Laguna 2.1COLIMA 1.5 Acapulco 2.2DURANGO 1.4 Mérida 1.8GUANAJUATO 2.2 Tijuana 4.8GUERRERO 2.2 Oaxaca 1.9HIDALGO 2.2 Culiacán 5.0JALISCO 2.3 Hermosillo 2.5MÉXICO 6.0 Cancún 2.5MICHOACÁN 1.7 Tuxtla Gutiérrez 2.3MORELOS 2.8 Juárez 3.2NAYARIT 1.9 Aguascalientes 1.5NUEVO LEÓN 2.2 Reynosa 2.4OAXACA 1.9 Tampico 2.4PUEBLA 3.1 Querétaro 1.7QUERÉTARO 1.7 Pachuca 2.2QUINTANA ROO 2.5 Cuernavaca 2.8SAN LUIS POTOSÍ 1.4 San Luis Potosí 1.4SINALOA 5.0 Tlaxcala-Apizaco 2.6SONORA 2.5TABASCO 3.2TAMAULIPAS 2.4TLAXCALA 2.6VERACRUZ 3.0YUCATÁN 1.8ZACATECAS 1.4
Tabla 4.1
Finalmente para cada día se calculan los intervalos de máxima densidad (HDI) para el 50 %y el 90 %, así como el valor de máxima verosimilitud (ML), a partir de la posterior P (Rt|k). La
4.1 Metodología para la Estimación del Rt. 35
siguiente tabla muestra los valores estimados para 5 días de la Ciudad de México, a manera deejemplo.
Referencias
[1] Systrom K. (2020). Estimating COVID-1’s Rt in Real-Time. Del sitio https://github.com/k-sys/covid-19/blob/master/Realtime%20R0.ipynb
[2] Systrom K., Vladeck T. & Krieger M. (2020). Rt Covid-19. Del sitio https://rt.live/
