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[S] 0 100 200 300 400 v 0 2 4 6 8 10 12 Cooperatividad

Cooperatividad

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Cooperatividad. Pos. Neg. Modelo de Hill. E + n S  ES n. Cuando v = 0,5 Vmax. Dificultades del modelo de Hill. No se puede obtener el número de sitios de unión No considera que los distintos sitios van siendo ocupados de uno en uno - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: Cooperatividad

[S]

0 100 200 300 400

v

0

2

4

6

8

10

12

Cooperatividad

Page 2: Cooperatividad
Page 3: Cooperatividad

[S]

0 200 400 600 800

v

0

2

4

6

8

10

12

Page 4: Cooperatividad

1/[S]

0.00 0.05 0.10 0.15 0.20

1/v

0

1

2

3

4

Pos

Neg

Page 5: Cooperatividad

E + n S ESn

[ES]

[E].[S]K

n´S

]ES[]E[

]ES[YS

Modelo de Hill

´S

n

K]S].[E[

]ES[

n´S

n

S ]S[K]S[

Y

Page 6: Cooperatividad

Mmax K]S[]S[

Vv

K]S[]S[

Vv

n

n

max

Page 7: Cooperatividad

n´S

n

S ]S[K]S[

Y

]ES[]E[]ES[

YS

maxp

pS V

v]ES[]E[k

]ES[kY

Page 8: Cooperatividad

´S

n

S

S

KS

Y1Y

´S

S

S Klog]Slog[.nY1

Ylog

0.5max

logSn.log[S]vV

vlog

´s

max

logKn.log[S]vV

vlog

Page 9: Cooperatividad
Page 10: Cooperatividad

[S]

0 100 200 300 400

v

0

2

4

6

8

10

12

Page 11: Cooperatividad

n5,0

n5,0

´S ]S[]S[5,0K5,0

Cuando v = 0,5 Vmax

´S

n

n

max K]S[]S[

Vv

´S

n

n

K]S[]S[

5,0

n5,0

´S ]S[K

n ´S5,0 K]S[

Page 12: Cooperatividad

Dificultades del modelo de Hill

• No se puede obtener el número de sitios de unión

• No considera que los distintos sitios van siendo ocupados de uno en uno

• Es como si la ocupación de 1 sitio variara la afinidad de los demás tan abruptamente que la enzima inmediatamente se satura

Page 13: Cooperatividad

• Adair reformuló lo postulado por Hill en el sentido que el primer S “abre la puerta” para el ingreso de los siguientes y asiste (coopera) para que los demás ingresen a los demás sitios.

• Se observó que algunos compuestos distintos del S modificaban la respuesta sigmoide, surgen los términos efector heretrotrópico (y homotrópico) y alosterismo

• Alosterismo (allos: otro; stereos: sólido o lugar): sustancias que se unen en un sitio diferente al sitio activo y modifican el comportamiento de la enzima

Page 14: Cooperatividad

Secuencial

Concertado

Los modelos propuestos para explicar la cooperatividad son dos

Page 15: Cooperatividad

El modelo concertado o de simetría de Monod, Wyman y Changeux (MWC)

1. NO permite la existencia de diferentes estados conformacionales para las distintas SU de una misma macromolécula

2. El sustrato no influye en la conformación de la enzima, sólo se une a la forma de más afinidad

Page 16: Cooperatividad

CONDICIONES para que se cumpla el modelo

1. Las proteínas cooperativas son oligómeros de SU (protómeros) idénticos que ocupan lugares equivalentes

2. El protómero es la menor unidad funcional y tiene un sitio de unión para L

3. El oligómero puede presentarse en 2 conformaciones diferentes que se encuentran en equilibrio. No hay estados intermedios.

4. La conformación de un protómero depende de la de los otros. Si un L induce un cambio en uno, los demás cambian también.

5. La afinidad de un protómero depende de su estado conformacional.

6. En ausencia de ligando el equil. favorece a la forma T

Page 17: Cooperatividad

El modelo concertado o de simetría de Mond, Wyman y Changeux (MWC)

Page 18: Cooperatividad
Page 19: Cooperatividad

Kts

Kts

Kts

Kts

Krs

Krs

Krs

Krs

L

L1

L2

L3

L4

T0

TS1

TS2

TS3

TS4

R0

RS1

RS2

RS3

RS4

L: cte. de equil. P.ej: T0/Ro

Kts y Kr

s: ctes. intrínsecas de disoc.

Krs / Kt

s= c, coefic. no excluyente de unión

Page 20: Cooperatividad

Si L > 1, c < 1 hay sigmoidicidad.

Si L es > 1 hay + T0

Si hay mucha diferencia de afinidades, c va a ser chico

Page 21: Cooperatividad

n

S

n

SS

KS

L

KS

KS

Vv

1

11

nn

nn

cL

cLcy

11

11 11

Page 22: Cooperatividad

El modelo secuencial de Koshland, Nemethy y Filmer(KNF):

1. permite la existencia de diferentes estados conformacionales para las distintas SU de una

misma macromolécula

2. Tiene fuerte anclaje en la teoría del ajuste inducido: la unión del S cambia la conformación de la SU.

Sólo las SU que unen S cambian de conformación-

Page 23: Cooperatividad

Estados posibles para un tetrámero según KNF

Page 24: Cooperatividad

Estados permitidos por el modelo secuencial de KNF

Page 25: Cooperatividad

Si la conform. de las SU está relacionada, se puede tener una conformación de la SU adyacente alterada

SU ocupada

Hay coop (+) si las afinidades son:

Hay coop (-) si las afinidades son:

Modelo secuencial de KNF

Page 26: Cooperatividad

P + E SE SES

El modelo secuencial de Koshland, Nemethy y Filmer(KNF): caso de un dímero

E + S ES E + P kpKs

+S

kpKs

+S

KsKs

SE + PES + P2kp

Page 27: Cooperatividad

P + E SE SES

E + S ES E + P kpKs

+S

kpKs

+S

KsKs

SE + PES + P2kp

Page 28: Cooperatividad

2S

2

S

2S

2

s

KS

KS2

1

KS

KS

Vv

Page 29: Cooperatividad

V= kp [ES1] + 2kp [ES2] + 3kp [ES3] + 4kp [ES4]

423

4

32

3

2

2

423

4

32

3

2

2

4641

33

SSSS

SSSs

KS

KS

KS

KS

KS

KS

KS

KS

Vv

Page 30: Cooperatividad

4

4

4

4

423

4

423

4

11SK

S

KSKS

KSK

S

Vv

´S

´S

´S

S

S

Cuando la cooperatividad es alta el modelo se reduce a la ecuación de Hill

Page 31: Cooperatividad

Diferencias entre ambos modelos

Secuencial Concertado o Simetría

No todas las SU en la misma conformación

Todas las SU en la misma conformación

El S induce el cambio de conformación

El S se une a la forma de > afinidad y desplaza el equilibrio

Page 32: Cooperatividad

¿Para que sirve la cooperatividad?

Positiva: mayor sensibilidad al cambio de concentración

Page 33: Cooperatividad

[S]0 50 100 150 200 250

v

0

2

4

6

8

10

12

Velocidad

[S] n = 1 n = 4 n = 0.5

50 3.33 0.59 4.14

100 5 5 5

150 6 8.35 5.51

Diferencia en v entre 150-50 (veces)

1.8 14.5 1.33