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SÍNTESIS DE PROTEÍNAS • Dirigida por un molde de mRNA • Tres fases: iniciación, elongación de la cadena y terminación • Fase preliminar: formación de un precursor activado Aminoacil tRNA • Maquinaria de síntesis compleja: ribosomas y factores secundarios
RIBOSOMAS RNA ribosomal Proteínas
Importancia del RNA ribosomal • Se pueden omitir algunas proteínas durante la reconstitución in vitro de la subunidad 30S, lo que provoca disminución de la actividad pero no pérdida total de funcionalidad • Una secuencia del rRNA de 16S selecciona el lugar de iniciación en el mRNA • Una base del tRNA está apareada con una base del rRNA de 16S en una secuencia de 14 nucleótidos idéntica en todos los rRNAs secuenciados (mas de 1000) • El extremo aceptor 3’ del tRNA interacciona con una región conservada del rRNA de 23S • Ribosomas casi desprovistos de proteínas aun pueden catalizar la formación de enlaces peptídicos • La mayoría de antibióticos que interfieren en la síntesis de proteínas lo hacen por interacción específica con el rRNA y no con las proteínas
La síntesis de proteínas transcurre desde el extremo amino al carboxilo
H2N-CH-COOH + H2N-CH-COOH H2N-CH-CO-HN-CH-COOH | | | | R1 R2 R1 R2 H2N-aa1-aa2-aa3……….aan-COOH
Proteína ya sintetizada antes de añadir el aa
radiactivo
Proteína sintetizada después de añadir el aa radiactivo
Formación del complejo de iniciación de la síntesis de
proteínas procariótica
Factor ¿Une GTP? Función IF1 No Promueve la disociación del ribosoma de 70S IF2 Si Ayuda a la unión del tRNA iniciador IF3 No Similar a IF1
5’ ...AGGAGGU...mRNA 3’... UCCUCCA... rRNA 16S Interacción entre el mRNA y el rRNA
Secuencia de Shine-Dalgarno
EF-Tu transporta los aminoacil-tRNAs al sitio A del ribosoma EF-Tu protege de la hidrólisis al aminoacil-tRNA Sólo hidroliza su GTP si el apareamiento codon-anticodon es correcto: fidelidad en la síntesis No reconoce fMet-tRNAf pero sí todos los demás
Factores de elongación: EF-Tu
Factores de elongación: EF-Ts
EF-Ts participa en el reciclado de EF-Tu, cargándolo nuevamente con GTP
Elongación de la cadena proteica: formación del enlace peptídico
Centro peptidiltransferasa Proteínas L2 L3 L4 L15 L16 rRNA de 23S
Mimetismo Molecular
Elongación de la cadena proteica: translocación
EF-G participa en la translocación
Formación del complejo de iniciación en eucarióticos
Síndrome X frágil (trastorno mental hereditario) Cáncer de próstata y otros tumores
Elongación y terminación en eucarióticos
Nombre Equival. Función Procar. EF1α EF-Tu Con GTP unido coloca los aa-tRNAs en el sitioA EF1β EF-Ts Recicla EF1a sustituyendo GDP por GTP EF2 EF-G Translocación eRF1 RF1 Reconoce codones de terminación RF2
Estructuras de algunos antibióticos inhibidores de
la síntesis de proteínas
Tetraciclina: Inhibe la unión de los aminoacil tRNAs al ribosoma bloqueando así la traducción
Estreptomicina: Interfiere con el aparea-miento normal de los aminoacil tRNAs con los codones del mRNA, causando errores en la lectura y, por tanto proteínas abe-rrantes
Eritromicina: Se une a un sitio específico del rRNA de 23S y bloquea la elongación interfiriendo en la fase de translocación
Estructuras de algunos antibióticos inhibidores de
la síntesis de proteínas
Cloranfenicol: Bloquea la elongación, actuando como un inhibidor competitivo de la actividad peptidiltransferasa. El enlace amida (en azul) imita un enlace peptídico
Semejanza entre la puromicina y un aminoacil-tRNA
Puromicina: Causa terminación prematura de la síntesis, ya que se parece al extremo 3’ de los aminoacil-tRNAs. Por tanto, entrará en el sitio A y se le transferirá la cadena polipeptídica en crecimiento, pero su débil unión al ribosoma causará su liberación prematura
Tranferencia del oligosacárido desde el dolicolfosfato a la cadena lateral de asparagina
Asn-X-Ser Asn-S-Thr
Señales de destino de algunas proteínas De retención en RE: Lis-Asp-Glu-Leu-COOH (de devolución de Golgi a RE) De tránsito a los cloroplastos: similares a las de las Mitocondrias. Varios compartimentos: varias señales Peroxisomas: Ser-Lis-Fen-COOH Nucleares: Lis-Lis-Lis-Arg-Lis (hay otras)
Chaperonas
Familia Hsp60 GroEL (en el citosol bacteriano) Hsp60 (en la matriz mitocondrial) Proteína que se une a Rubisco (en cloroplastos) Proteínas Hsp70 Hsp70 (en el citosol de mamíferos) BiP (en el RE de eucariotas) Grp75 (en mitocondrias) DnaK (en el citosol bacteriano) Proteínas Hsp90 Hsp83 (en el citosol de eucariotas) Grp94 (en el RE de mamíferos) HtpG (en el citosol bacteriano) Otras Proteína isomerasa de puentes disulfuro Peptidil-prolil-isomerasa (PPI)