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2 DETECCIÓN DE GRÁNULOS DE POLIHIDROXIALCANOATOS EN LA CEPA USBA 355 Tistlia consotensis. KARINA BLANCO MARIN PONTIFCIA UNIVERSIDAD JAVERIANA FACULTAD DE CIENCIAS MICROBIOLOGIA INDUSTRIAL DICIEMBRE DE 2010

Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

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Page 1: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

2

DETECCIÓN DE GRÁNULOS DE POLIHIDROXIALCANOATOS

EN LA CEPA USBA 355 Tistlia consotensis .

KARINA BLANCO MARIN

PONTIFCIA UNIVERSIDAD JAVERIANA

FACULTAD DE CIENCIAS

MICROBIOLOGIA INDUSTRIAL

DICIEMBRE DE 2010

Page 2: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

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DETECCION DE GRÁNULOS DE POLIHIDROXIALCANOATOS

EN LA CEPA USBA 355 Tistlia consotensis .

KARINA BLANCO MARIN

TRABAJO DE GRADO

Presentado como requisito parcial Para optar el titulo de

MICROBIOLOGA INDUSTRIAL

BOGOTA D.C.

DICIEMBRE DE 2010

Page 3: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

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DETECCION DE DE GRÁNULOS DE POLIHIDROXIALCANOATOS

EN LA CEPA USBA 355 Tistlia consotensis .

KARINA BLANCO MARIN

APROBADO

Page 4: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

__________________________________

DETECCION DE

EN LA CEPA

5

__________________________________

Ingrid Schuler Garcia, Ph D. Decana Académica

Facultad de Ciencias

DETECCION DE DE GRÁNULOS DE POLIHIDROXIALCANOATOS

EN LA CEPA USBA 355 Tistlia consotensis .

KARINA BLANCO MARIN

APROBADO

OLIHIDROXIALCANOATOS

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6

AGRADECIMIENTOS

A Dios por permitirme llegar hasta aquí y por brindarme todos los días la seguridad de

su compañía en todas las acciones realizadas.

A la Unidad de Saneamiento y Biotecnología Ambiental (USBA), de la Pontificia

Universidad Javeriana, que permitió el desarrollo de este trabajo.

A la Doctora Sandra Baena por su colaboración, conocimientos aportados y su por

infinita paciencia y dedicación que día a día hacia posible este proceso de

investigación.

A mis compañeros de USBA: Carolina Rubiano, Javier Gómez, Luisa Fernanda Bernal,

Ángela Mantilla, Estefanía Sánchez y Laura Poveda por su apoyo, acompañamiento,

colaboración y aporte incondicional en este proyecto.

A Tuti por darme su mano y estar ahí para todo lo que necesitaba, por el aporte, por su

confianza, por su inmensa amistad y su don de hacerme reír.

A Andrés Felipe y su familia por acogerme como un integrante más y brindarme todo

su apoyo y confianza.

Y finalmente a papá y mamá quien con su infinito amor lograron engrandecer mi

espíritu con sus consejos para darme la fuerza y el acompañamiento necesario para

lograr este trabajo.

Page 6: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

7

RESUMEN

Un microorganismo identificado como nuevo género y nueva especie Tistlia consotensis (Díaz

Cárdenas et al. 2010) presenta inclusiones citoplasmáticas que podrían sugerir la presencia de

gránulos de polihidroxialcanoatos (PHA). Los PHAs son poliésteres sintetizados por bacterias

en forma de inclusiones citoplasmáticas, como reserva de materia orgánica y energía,

principalmente cuando las células se encuentran en condiciones desequilibradas en los

suministros de nutrientes. Sus propiedades son similares a los termoplásticos, como el

polipropileno y el polietileno, y el gran número de mezclas de co-polímeros hace posible

obtener polímeros con las propiedades deseadas para un amplio rango de posibilidades. El

objetivo general del estudio fue detectar los gránulos de PHAs que se almacenan como

reserva, en la cepa USBA 355 Tistlia consotensis. Alterando las concentraciones de la fuente

de carbono, la fuente de nitrógeno y la concentración de sal, optimas de crecimiento para la

cepa T. consotensis, promoviendo las condiciones de stress para la producción del polímero.

La consecuente producción de gránulos es detectada mediante coloración con Negro Sudan,

Este trabajo de grado pretende demostrar que un microorganismo aislado de condiciones

salinas con limitaciones o excesos nutricionales tienen la capacidad de producir de forma

natural acumulados de polihidroxialcanoatos, que contribuyen como mecanismo de

almacenamiento de energía para la célula en condiciones de stress.

Para evaluar la influencia de los factores (condiciones nutricionales manipuladas) que

intervienen en la producción de PHAs se desarrolló un diseño factorial de 3x3x2 para analizar

todas las posibles combinaciones de los niveles de los factores en cada réplica del

experimento. La detección de los gránulos por la técnica de Negro Sudán arrojó resultados

positivos en la influencia de la fuente de carbono y la fuente de nitrógeno.

Page 7: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

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TABLA DE CONTENIDO

Pág.

1. Introducción………………………………………………………………...... 1

2. Formulación del problema y Justificación del estudio………………….. 2

3. Marco Teórico………………………………………………………………... 3

3.1. Definición Polihidroxialcanoatos…………………………………………… 3

3.2. Características físicas y químicas…………………………………………. 4

3.2.1. Figura 1. Estructura general de los polihidroxialcanoatos…………… 4

3.3. Clasificación Polihidroxialcanoatos………………………………………... 4

3.4. Síntesis de PHA en procariotas………………………………………….... 5

3.4.1. Figura 2. Vías metabólicas microbianas para la síntesis de PhaA: 3-

cetotiolasa; PhaB: (R)-reductasa 3-cetoacil-CoA reductasa, PhaC:

PHA sintasa o de la polimerasa; PhaG, (R)-3-hidroxiacil ACP:

transacilasa CoA; PhaJ, (R hidratasa enoil-CoA) específico. ………..

7

3.4.2. PHAs sintasas y Especies Representativas…………………………… 7

3.5. Formacion de los gránulos de PHAs………………………………………… 9

3.6. Detección y cuantificación de PHAs….……………………………………… 10

3.6.1. Detección………………………………………………………………... 10

3.6.2. Cuantificación………………………………………………………….... 10

4. Objetivos……………………………………………………………………… 10

4.1. Objetivo General…………………………………………………………...... 10

4.2. Objetivos Específicos…………………………………………………….... 10

5. Metodología………………………………………………………………….. 11

5.1. Microorganismo……………………………………………………………… 11

5.2. Medios de cultivo y condiciones de crecimiento………………………… 11

5.3. Detección de la presencia de gránulos de PHAs…………………………... 11

5.3.1. Tabla 1. Medición de producción de gránulos de PHAs……………… 12

5.4. Factores para síntesis de gránulos de PHA’s en Tistlia consotensis …… 12

5.4.1. Fuente de carbono……………………………………………………... 12

5.4.2. Fuente de nitrógeno…………………………………………………..... 12

5.4.3. Concentración de sal…………………………………………………... 12

Page 8: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

9

5.5. Diseño Factorial…………………………………………………………….. 12

5.5.1. Tabla 2. Diseño estadístico de 3x3x2 para evaluar diferentes

concentraciones de nutrientes para poner a prueba la capacidad de

producción de PHAs del microorganismo USBA 355………………….

13

5.6. Detección de gránulos de polihidroxialcanoatos………………………... 14

5.6.1. Técnica de tinción Negro Sudan……………………………………... 14

6. Resultados y Discusión…………………………………………………...... 14

6.1. Detección de gránulos de PHA por tinción negro sudan……………….. 14

6.1.1. Figura 5. Detección de gránulos de PHA, por coloración con Negro

Sudan en control positivo (Ralstonia Picketti)………………………….

15

6.2. Detección de gránulos de PHAs con respecto al tiempo de

crecimiento…………………………………………………………………....

15

6.2.1. Figura 6. Cinética de crecimiento (Densidad óptica λ= 580nm ) de

la cepa Tistlia consotensis y producción de gránulos de PHA con

respecto al tiempo de crecimiento, por 24 horas de muestreo, en

condiciones físicas y nutricionales optimas de

crecimiento……...……………………………………………………..

16

6.3. Anova para seleccion de modelo factorial………………………………….. 17

6.3.1. Tabla 3. Análisis de varianza…………………………………..……..... 17

6.3.2. Tabla 4. Resultados estadísticos análisis de varianza……………... 18

6.3.3. Efecto de la fuente de carbono, fuente de nitrógeno y concentración

de sal evaluados, sobre la producción de gránulos de

polihidroxialcanoatos………………………………………………………

19

6.3.3.1. Figura 7. Interacción entre el factor A: fuente de carbono (glucosa)

y el factor B (cloruro de amonio)…………………………………………

20

6.3.3.2. Figura 8. Interacción entre el factor A: fuente de carbono (glucosa)

y el factor C: concentración de sal………………………

21

6.3.3.3. Figura 9. Interacción entre el factor B: fuente de nitrógeno (cloruro

de amonio) y el factor C: concentración de sal…………….

23

7. Conclusiones………………………………………………………………… 24

8. Recomendaciones…………………………………………………………... 24

9. Referencias Bibliográficas………………………………………………… 25

Page 9: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

10

1. INTRODUCCIÓN

La problemática generada por el uso indiscriminado de plásticos sintéticos y su persistencia en

el ambiente ha estimulado la investigación para el desarrollo de nuevos materiales y métodos

de producción que permitan generar plásticos o materias primas que presenten las mismas

propiedades pero que tengan un periodo de degradación más corto. La palabra plástico se

refiere a ciertos tipos de materiales sintéticos obtenidos mediante fenómenos de polimerización

o multiplicación artificial de los átomos de carbono en largas cadenas moleculares de

compuestos orgánicos. En general, son derivados del petróleo, aunque algunos se pueden

obtener a partir de otras sustancias naturales (Segura et.al.2007).

Desde que Maurice Lemoigne descubrió en 1926 que la bacteria Bacillus megaterium produce

Polihidroxialcanoatos (PHA), denominado polihidroxibutirato (PHB), se han reportado más de

300 bacterias capaces de producir PHA. Los PHA’s no son más que precursores de polímeros

naturales producidos por bacterias, que constituyen una familia de poliésteres, acumulados

intracelularmente, en forma de gránulos, compuestos de ácidos R-3 hidroxialcanoicos. Se

producen partir de sustratos orgánicos, como carbohidratos (glucosa, sacarosa), aceites,

alcoholes, ácidos orgánicos, hidrocarburos, y los acumulan en grandes cantidades dentro de la

célula bacteriana en forma de gránulos, llegando a constituir hasta 90% de la biomasa. A nivel

biológico la acumulación de este polímero se puede considerar como una estrategia

desarrollada por las bacterias para su supervivencia en ambientes cambiantes. Además de

servirle a la célula como fuente de carbono, también sirve como fuente de energía en el

proceso de enquistamiento, como en el caso de Azotobacter sp. y de esporulación (Bacillus),

así como barrera del oxigeno para la protección del complejo nitrogenasa, ya que actúa como

compuesto oxidable y también es constituyente de la membrana citoplasmática de las bacterias

(Castillo Franco, 2008).

Por sus propiedades físicas semejantes a las de los plásticos derivados del petróleo (ya que

estos polímeros presentan propiedades que van desde plásticos rígidos y quebradizos, hasta

los semejantes al hule) y por ser producidos a partir de recursos renovables, los PHA han sido

ampliamente estudiados presentándose como una alternativa biotecnológica para la producción

de plásticos biodegradables (Segura et.al.2007).

La cantidad de polímero producido y acumulado depende de la especie bacteriana y de las

condiciones en las que se cultiva. Como ya se ha mencionado, los PHAs se acumulan de

manera un tanto similar a la acumulación de grasas de reserva en los animales, bajo ciertas

condiciones nutricionales. En general, condiciones de desbalance nutricional en el medio

utilizados para el cultivo bacteriano, que favorezcan una alta producción. Para producir PHA

Page 10: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

11

son especialmente favorables condiciones de cultivo en las que hay una concentración alta de

fuente de carbono (que la bacteria utilizará como materia prima para sintetizar el PHA), por

ejemplo sacarosa, pero además existe una limitación para el crecimiento, como niveles de

oxígeno bajos o escasez de otros nutrientes (Kim, 2008; Segura et.al.2007).

Existen varios factores que deben ser considerados en la selección de microorganismos para la

producción industrial de PHA, tales como la capacidad de la célula para utilizar una fuente de

carbono de bajo costo, la velocidad de crecimiento, la velocidad de síntesis y la capacidad de

acumulación del polímero de una cepa en particular sobre la base del sustrato (Martínez et al.

2004). Motivo por el que rrecientemente, se ha estado explorando estrategias de cultivo con el

fin de obtener una producción de PHAs con el mejor rendimiento, estas estrategias no se

logran sobre el cálculo en papel, si no con ensayo y error lo que permite evidenciar bajo un

estudio organizado y estadísticamente probado, que el efecto de diferentes nutrientes,

concentraciones y condiciones de cultivo proveen la información necesaria para determinar el

medio de producción adecuado.

El objetivo de este trabajo de grado, se trató principalmente en demostrar la presencia de

gránulos de polihidroxialcanoatos en la cepa Tistlia consotensis USBA 355, acumulados en

forma de inclusiones citoplasmáticas y además determinar las variaciones nutricionales que

podrían influir en la detección de gránulos de PHAs.

2. FORMULACIÓN DEL PROBLEMA Y JUSTIFICACIÔN DEL PRO BLEMA

En trabajos de investigación previos, realizados en la Unidad de Saneamiento y Biotecnología

Ambiental (USBA) de la Pontificia Universidad Javeriana, sobre la diversidad microbiana, se

encontró un microorganismo la cepa USBA 355 identificado como nuevo género y nueva

especie, Tistlia consotensis (Díaz Cárdenas et al. 2010), que por medio de microscopia

electrónica sugirió la presencia de inclusiones citoplasmáticas que podrían tratase de gránulos

de PHA. Con base en esta evidencia, este estudio comprobó la presencia de dichos gránulos

de almacenamiento de carbono y energía mediante la combinación de variables nutricionales

para la determinación cualitativa de polihidroxialcanoatos.

Teniendo en cuenta que los Polihidroxialcanoatos representa un precursor importante en la

producción de plásticos biodebradables. La importancia de este trabajo se basó principalmente

en la descripción de una cualidad con aplicación biotecnológica en la cepa USBA 355 Tistlia

consotensis aislada de un manantial salino, Salado de Consotá, ubicado en el departamento de

Risaralda (Colombia), que representa una alternativa biodegradable. Ya que los plásticos de

origen químico constituyen una parte de los desechos sólidos. Debido a su baja densidad no es

apreciable el porcentaje en masa con el que contribuyen a los desechos totales, pero el

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12

porcentaje en volumen es grande, y conociéndose que el consumo destacado de estos

materiales en la sociedad moderna se incrementa día a día. Razon por la cual la problemática

de los plásticos en el medio ambiente es de gran relevancia y pretende ser disminuida (Rozsal,

et al. 2004).

3. MARCO TEORICO

3.1. DEFINICION DE POLIHIDROXIALCANOATOS

Los polihidroxialcanoatos son macromoléculas de origen microbiológico que se acumula en

forma de gránulos discretos a altos niveles de rendimiento en peso seco. Gran variedad de

procariotas tiene la capacidad de acumular PHAs como inclusiones citoplasmáticas insolubles

en agua, que representan compuestos de almacenamiento de carbono y energía los cuales son

sintetizados bajo condiciones desbalanceadas de crecimiento, principalmente cuando la fuente

de carbono se encuentra en exceso y cualquier otro nutriente se encuentra en condiciones

limitadas al mismo tiempo (Pötter & Steinbûchel, 2006).

Los PHAs constituyen una familia de polímeros biodegradables son una clase de poliéster

microbiano con un gran potencial en la aplicación de plásticos convencionales. Una vez que se

extraen los PHAs de la célula bacteriana, estas moléculas muestran propiedades similares a

algunos plásticos es conveniente para las bacterias almacenar el exceso de nutrientes dentro

de la célula, en especial cuando su forma física en general no se ve afectada. Los PHAs

contribuyen al desarrollo sostenible al ser originados por recursos renovables y por su

capacidad de biodegradación, son llamados “polímeros doblemente verdes” (Rozsal, et al.

2004), El poli (3 – hidroxialcanoatos) (PHAs) Como comunes, como el polipropileno. Además

de ser biodegradables, los PHAs son reciclables como los termoplásticos petroquímicos (Lara

& Gjalt. 1999).

3.2. CARACTERISTICAS QUIMICAS Y FISICAS

Diversos PHAs que han sido identificados son principalmente poliésteres lineales de principio a

fin compuestos de monómeros de ácidos grasos 3-hidroxi. En estos polímeros el grupo

carboxilo de un monómero forma un enlace éster con el grupo hidroxilo del monómero vecino.

Page 12: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

13

3.2.1. Figura 1. Estructura general de los polihidroxialcanoatos. (Imagen: Ojumo et al 2003)

Hasta el momento se han identificado más de 150 ácidos hidroxialcanoicos, saturados e

insaturados, halógenos, aromáticos, etc, los cuales son incorporados a la cadena lateral del

PHA y a su vez cambian sus propiedades físicas, esta variabilidad depende del tipo del

sustrato que se suministra, y de su especificidad (Madison & Huisman, 1999).

3.3. CLASIFICACIÓN DE LOS POLIHIDROXIALCANOATOS

La clasificación de los polihidroxialcanoatos depende de una amplia variedad de PHA que han

sido estudiados en diversas bacterias, hasta la fecha, alrededor de 150 componentes

diferentes de los PHA han sido identificados (Steinbüchel y Valentín, 1995). Los PHAs pueden

dividirse en dos grandes grupos, dependiendo del número de átomos de carbono en la cadena

polimérica. Estos pueden ser de cadena corta o de cadena media, los polihidroxialcanoatos

tienen una longitud de cadena corta de 3-5 átomos de carbono. En cuanto a los

polihidroxialcanoatos con una longitud de cadena media, generalmente tienen de 6 -14 átomos

de carbono. Otra clasificación conocida, se basa en la composición del polímero dado que ésta

varía en función de los sustratos utilizados (Pötter & Steinbuchel, 2007).

La masa molecular de los PHAs es del orden de 50 kilo-Dalton hasta 100 kilo-Dalton esto

depende de la naturaleza del polímero, intracelularmente se puede llegar a encontrar en estado

liquido y amorfos, que después de la extracción con solventes orgánicos, este pasa a un

estado cristalino confiriéndole características rígidas pero a su vez quebradizo. En cuanto al

punto de fusión es relativamente alto (180ºC) pero cerca al punto de degradación térmica

(200ºC) (Castillo Franco, 2008)

Page 13: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

14

3.4. SINTESIS DE PHA EN PROCARIOTAS

Como se ha descrito anteriormente, los PHAs son acumulados si la fuente de carbono se

encuentra en exceso y si al mismo tiempo el crecimiento se ve limitado por otro nutriente como

el hierro, el magnesio, el nitrógeno, el azufre, el fosfato o el potasio (Pötter y Steinbüchel 2006)

ademas también se describen dos formas de clasificación de los PHAs de cadena corta y de

cadena larga, cuya formación metabólica difiere de acuerdo a los sustratos.

Las vías metabólicas de síntesis de los polihidroxialcanoatos de cadena corta y de cadena

media han sido ampliamente estudiadas (Steinbuchel & Eversloh, 2003). El principal

intermediario para la biosíntesis de polihidroxialcanoatos de cadena corta (PHASCL) es el acetil

– CoA, proveniente principalmente principalmente de la oxidación de diferentes fuentes de

carbono como carbohidratos, ácidos orgánicos y alcoholes; la producción de PHAs a partir de

carbohidratos (sacarosa, glucosa y fructosa) está compuesta por tres enzimas clave. (Volova et

al. 2004)

La primera enzima perteneciente a la vía biosintética de los polihidroxialcanoatos es la β

cetotiolasa, la cual cataliza la condensación de dos moléculas de acetil – CoA para formar

acetoacetil – CoA, esta enzima es codificada por el gen phaA.

El siguiente paso es la reducción del acetoacetil-CoA a (R) – 3 – Hidroxibutiril – CoA, catalizada

por la acetoacetil - CoA reductasa dependiente de NADPH. La expresión de esta enzima es

codificada por el gen phaB (Volova et al. 2004, Suriyamogkot et al. 2004).

La principal enzima señalada en la síntesis de PHA es denominada PHA sintasa, responsable

por la polimerización de unidades de (R)–3–hidroxiacil-CoA, formando el polihidroxialcanoato.

Esta enzima es absolutamente estereoespecifica para los esteroisomeros (R), y su

especificidad por el sustrato definirá la naturaleza del polímero final. Esta enzima puede ser

encontrada en los gránulos de PHA durante la acumulación, en donde la moléculas de

hidroxiacil-CoA servirán de sustrato para esta enzima, codificada por el gen phaC (Rehm,

2003)

La incorporación de diferentes monómeros depende principalmente del microorganismo y de la

fuente de carbono utilizada. Diferentes vías metabólicas, presentes en los microorganismos

son los responsables por la formación de diferentes moléculas de hidroxiacil – CoA. Por lo que

existen dos grupo de sustratos utilizados en la biosíntesis de estos polímeros: los sustratos

relacionados y los sustratos no relacionados (Steinbuchel, 1996). La síntesis a partir de

sustratos relacionados se denomina de esta forma ya que la composición del polímero

Page 14: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

15

producido refleja el sustrato proporcionado; este tipo de síntesis es la que permite la

incorporación de mas diversidad de monómeros al polímero. (Cortes, 2008)

En la síntesis a partir de sustrato no relacionados, cuando son cultivados en presencia de

glucosa, fructosa, glicolato, acetato, glicerol, etc., producen un polímero conteniendo 3 –

hidroxidecanoato (3HD) como principal constituyente, además del 3 – hidroxioctanato (3HO), 3

– hidroxihexanoato (3HHx), 3 – hidroxidodecanoato, entre otros como constituyentes

secundarios. La síntesis de PHAs de cadena media (PHAMCL), a partir de sustratos

relacionados y sustratos no relacionados, pueden ser diferenciadas por las vías metabolicas

que proporcionan los intermediarios. Mientras que en la síntesis a partir de sustratos

relacionados, la β oxidación de ácidos grasos es la principal via para suministrar intermediarios.

En la síntesis a partir de sustratos no relacionados la biosíntesis de ácidos grasos suple los

intermediarios (Cortes, 2008).

El metabolismo de ácidos grasos representa una de las vías metabolicas mas comunes para

suplir monómeros de hidroxialcanoato (HA) a la síntesis de PHAs. Los intermediarios

generados mediante la degradación de ácidos grasos via β oxidación pueden proveer

hidroxialcanoil – CoA (HA-CoA) como sustrato para PHAsMCL (Cortes, 2008).

Una segunda ruta para la síntesis de PHAMCL en bacterias es a través del uso de intermediarios

de la biosíntesis de ácidos grasos de novo, la cual provee monómeros de 3 – hidroxiacil – CoA

que generalmente es metabolizada a acetil – CoA, como carbohidratos, acetatol o etanol. El

gen phaG codifica la enzima que enlaza la biosíntesis de ácidos grasos de novo y la síntesis de

PHA (Hoffmann et al. 2000). El producto de este gen cataliza la conversión de (R) – 3

hidroxiacil – ACP intermediario de la via de biosíntesis de ácidos grasos a su correspondiente

derivado CoA (Cortes, 2008).

Page 15: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

16

(Imagen: http://openwetware.org/wiki/Work_Area)

3.4.1. Figura 2. Vías metabólicas microbianas para la síntesis de PhaA: 3-cetotiolasa; PhaB:

(R)-reductasa 3-cetoacil-CoA reductasa, PhaC: PHA sintasa o de la polimerasa; PhaG,

(R)-3-hidroxiacil ACP: transacilasa CoA; PhaJ, (R hidratasa enoil-CoA) específico.

Por otra parte la síntesis de PHA’s de cadena media se ve directamente influenciado por la

enzima PHA sintasa de grupo II, esta enzima tiene mayor afinidad por sustratos a partir de

metabolismo de carbohidratos, donde se produce moléculas de acetil coA, las cuales vía

malonil coA, son incorporadas a la síntesis de Novo de ácidos grasos, donde es generado el 3-

hidroxiacil, el cual es transportado de la ACP (Acil Carrier Protein) para la coenzima A (CoA)

donde es polimerizado por la acción de la PHA sintasa. (REHM et al. 1999; Castillo, 2008 y

Volova et al. 2004)

3.4.2. PHAs SINTASAS Y ESPECIES REPRESENTATIVAS

Algunas PHAs sintasas han sido clonadas y caracterizadas a nivel bioquímico o molecular.

Cuatro diferentes clases de PHA sintasas son diferenciadas. PHA sintasas Clase I, que son

representadas por la enzima de Ralstonia eutropha; estas enzimas tienen preferencia al

aceptar tioesteres de tipo CoA de ácidos hidroxialanoicos de cadena corta, como sustratos y

consiste de solo un tipo de subunidad (PhaCSCL). Este tipo de PHA sintasa actúa

principalmente en bacterias acumuladoras de PHA de cadena corta. (PHASCL) (Pöter &

Steinbuchel, 2006).

Page 16: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

17

3.4.2.1. FIGURA 3. Clases de PHA sintasa (Imagen: actualizado Pötter & Steinbüchel de 2006)

Los PHAs de Clase II son representados por la enzima de Pseudomona oleovorans estas

aceptan tioesteres CoA de ácidos hidroxialcanoicos de cadena media, como sustrato y

contiene un solo tipo de subunidad (PhaCMCL) (Pöter & Steinbuchel, 2006). Los PHA sintasa

Clase III, son representadas por la enzima de Allochromatium vinosum, esta sintasa contiene

dos diferentes tipos de subunidades (Pha C y PhaE) y acepta tioesteres CoA de ácidos

hidroxialcanoicos de cadena corta como sustrato y en algunos casos ácidos hidroxialcanoicos

de cadena larga. Por último los PHA sintasas Clase IV, que están representados por la enzima

extraida de Bacillus megaterium y Bacillus sp., estos también constan de dos diferentes tipos

de subunidades (PhaC y PhaR) y presentan afinidad por sustratos del rango aceptado por PHA

sintasas de Clase III) (Pöter & Steinbuchel, 2006).

Page 17: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

18

3.4.2.2. Figura 4. Ejemplo de la acción de los genes en la producción enzimática y la acción de

cada una de estas sobre el sustrato. (Imagen: Kim, 2008)

3.5. FORMACIÓN DE LOS GRÁNULOS DE PHAs.

Los PHAs son acumulados intracelularmente (como polímeros amorfos o móviles) en gránulos

de diferentes tamaños, ellos están rodeados por una monocapa fosfolipidica, que contiene

PHAsinas PhaF y PhaI, polimerasas, despolimerasas y proteínas citosólicas no especificas

ligadas al gránulo. La PhaI participa en la formación y estabilización de los gránulos, mientras

que la Pha F está involucrada en la estabilización de los gránulos y actúa como regulador

(Cortes, 2008).

La función de la monocapa fosfolipídica aun no ha sido bien establecida (Pötter & Steinbüchel

de 2006), aunque se cree que es necesaria por el contacto de los PHAs con el agua,

previniendo la transición del poliéster del estado liquido amorfo a una forma cristalina más

estable, y también se cree que desempeña un papel como barrera protectora evitando daño

celular causado por la interacción de los PHAs con las estructuras internas celulares o con las

proteínas citosólicas. En caso tal en que la monocapa fosfolipidica sea en realidad requerida

para proteger las células desde el comienzo de la formación del gránulo, puede ser asumido

que esta envoltura puede ser extendida alrededor del polimero, tan larga como se incremente

el tamaño del mismo. Por ello deben existir enzimas específicamente involucradas en la

síntesis de la monocapa fosfolipidica asociadas con el poliéster (Cortes, 2008).

Page 18: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

19

3.6. DETECCIÓN Y CUANTIFICACIÓN DE PHA’s

Se han empleado diferentes técnicas para la detección gránulos del polímero intracelular. Los

colorantes lipofílicos Negro Sudan, Azul de Nilo A y Rojo de Nilo, son ampliamente utilizados

(Burdón, 1946).

3.6.1. DETECCIÓN

Después de Hartman, quien primero sugirió el uso de negro Sudán B, en lugar de Rojo Sudán,

como una tinción de grasa bacteriana (Hartman, 1940), la coloración con Negro Sudan en

solución alcohólica se confirmó como la técnica de mayor valor, dado que el procedimiento

demuestra el contenido graso intracelular de las bacterias, por medio de la preparación de

suspensiones de los organismos, formándose una película bacteriana y generando el contraste

de observación con safranina, la cual permite visualizar la presencia o ausencia de polímero de

naturaleza lipídica neutra en forma de gránulos intracelulares. (Burdón, 1946; Erazo et al.

2009).

3.6.2. CUANTIFICACIÓN

El método cuantitativo de detección de los polihidroxialcanoatos es mediante cromatografía de

gases, utilizando como patrón interno, acido benzoico, el cual establece tiempo de retención

determinados para cada uno de los tipos de estructuras y cantidad de carbonos presente en

ellas, esta cuantificación depende de la extracción previa de los gránulos de PHA del interior de

las células y adicionalmente se debe despolimerizar por métodos como metanólisis para formar

metil – esteres propanolisis para formar propil – ester (Castillo, 2008).

4. OBJETIVOS

4.1. OBJETIVO GENERAL

Detectar la producción de gránulos de Polihidroxialcanoatos en la cepa Tistlia consotensis.

4.2. OBJETIVOS ESPECIFICOS

1. Identificar la presencia de gránulos de PHA’s de acuerdo a la fase de crecimiento de la

cepa Tistlia consotensis (USBA 355)

2. Identificar la presencia de gránulos de PHA’s de acuerdo a cambios de condiciones

nutricionales.

Page 19: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

20

5. METODOLOGIA

5.1. MICROORGANISMO

La cepa USBA 355: Tistlia consotensis se encuentra en la colección de microorganismos del

departamento de Biología de la Pontificia Universidad Javeriana. Fue aislada de un manantial

salado, situado en los andes colombianos, en el laboratorio de la Unidad de Saneamiento y

Biotecnología Ambiental. La secuencia genética del análisis de 16s rRNA la ubica dentro del

género Tistlia en la familia Rhodospirillaceae, de la clase Alphaproteobacteria, El nombre de la

especia T. consotensis, está relacionado con la ubicación geográfica la cual fue aislada por

primera vez en el manantial salino de Consotá, ubicado en el departamento de Risaralda,

Colombia. (Díaz – Cárdenas, et al. 2010)

Tistlia consotensis es una célula estrictamente aerobia, de coloración Gram negativa, miden de

0,6 – 0,7 x 3,0 – 3,5 µm, se reproduce por fisión binaria, muestra desplazamiento corporal, no

posee pilis y no forma esporas, es ligeramente curva y ligeramente halófila. Muestra

crecimiento en un rango de 20-40ºC (mesofílica) y un óptimo de 30ºC, crece en un rango de

pH entre 5.0 a 8.0 con un pH óptimo en 6,5 – 6,7. De metabolismo quimioheterótrofa, utiliza

glucosa o peptona como única fuente de carbono (Díaz – Cárdenas, et al. 2010).

5.2. MEDIOS DE CULTIVO Y CONDICIONES DE CRECIMIENTO

Los requerimientos nutricionales básicos, fueron empleado en medio aerobio con: 1g/L NH4Cl;

0.3g/L K2HPO4; 0.3g/L KH2PO4; 8g/L NaCL; 0.1g/L CaCl2; 0.1g/L KCl; 10g/L de Solución de

oligoelementos; (Balch et al. 1979) 0.05 g/L de Extracto de levadura y 5g/L NaHCO3. En

condiciones de agitación de 300 r.p.m. El pH del medio se mantuvo un óptimo entre 6.5 – 6.7.

El medio se llevo a agitación con el fin de lograr una mezcla homogénea para las sales y

demás componentes del medio. Posteriormente, alícuotas de 10mL fueron distribuidas en

tubos tapa rosca de 16x150mm y se llevaron a esterilización en autoclave por 20 minutos a 15

psi, una vez auto clavado, finalmente a los tubos con el medio básico se le adicionó 0.1mL de

Glucosa por cada tubo de 10mL para conseguir una concentración final de glucosa de 20mM

(Baena et al. 1998 y Díaz – Cárdenas. 2010).

5.3. DETECCIÓN DE LA PRESENCIA DE GRÁNULOS DE PHA

La determinación de la producción de gránulos en la cepa Tistlia consotensis, se llevó a cabo

por medio del muestreo de un cultivo liquido de crecimiento, en las condiciones de cultivo

óptimas para el crecimiento del microorganismos (6.2), cada dos hora durante 24 horas. En

cada muestreo, se montó una lámina de coloración con Negro Sudan, por triplicado y se evaluó

Page 20: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

21

la presencia de gránulos. Esto se hizo para encontrar la hora aproximada en que se empieza a

producir el polímero y de esta forma, establecer el tiempo de muestreo para la detección de

gránulos bajo las condiciones nutricionales manipuladas. Esta detección cualitativa se realizó

con base a la cantidad de gránulos observados por campo óptico (Tabla 2), para

posteriormente ser interpolados de manera cualitativa.

5.3.1. Tabla 1. Medición de producción de gránulos de PHAs

Gránulos s por campo óptico Determinación cuantitativa

0 a 20 0

20 a 60 1

60 a 100 2

Mayor a 100 3

5.4. FACTORES PARA SÍNTESIS DE GRÁNULOS DE PHAs EN Tistlia consotensis

Las concentraciones de carbono y nitrógeno fueron alteradas del medio básico utilizado, en el

cual, el microorganismo tiene las condiciones óptimas para su crecimiento. Basados en el

criterio de Pötter y Steinbügel 2006; Madison & Huiman, 1999; Martínez et al. 2004; Ojumo et

al. 2004 y Saito y Doi, 1993, la acumulación de PHAs está dada cuando la fuente de carbono

esta elevada y otros nutrientes se encuentran limitados al mismo tiempo. Para este estudio se

realizó un diseño factorial similar al aplicado por Quillaguamán y colaboradores en 2007, en el

que se aplica una combinación de variables para evaluar la producción del polímero.

5.4.1. Fuente de carbono Se evaluaron tres concentraciones diferentes de glucosa (fuente

de carbono) 30mM, 40mM y 50mM (9,008g/L),

5.4.2. Fuente de nitrógeno (NH4Cl), A partir de la concentración óptima para el crecimiento

de la cepa (1,05g/L), tres concertaciones diferentes de NH4Cl: ¼ - ½ y ¾ partes de

esta concentración, equivalentes a: 0.2625g/L – 0.525 g/L y 0.7875 g/L se evaluaron

para determinar su influencia en la producción de gránulos.

5.4.3. Concentración de sal (NaCL), Dos concentraciones diferentes de sal, 5g/L y 23g/L

fueron evaluados.

5.5. DISEÑO FACTORIAL

Dado a la presencia de tres factores, fuente de carbono; fuente de nitrógeno y concentración

de sal, con 3, 3 y 2 niveles respectivamente se diseñaron las posibles combinaciones de esos

niveles en todos los factores, (Tabla 1) lo que permitió el estudio del efecto de cada factor

sobre la variable respuesta que correspondía a una sola, la producción de gránulos de PHA.

Page 21: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

22

Este diseño arroja un total de 18 ensayos diferentes, para los cuales se tuvieron en cuenta 3

repeticiones para validar la prueba, por lo tanto la suma de ensayos fue de 54 y la cuya

evaluación se llevo a cabo de manera aleatoria. Adicionalmente se realizaron evaluaciones

para el control positivo con Ralstonia pickettii que fue mantenida en condiciones normales en

medio básico con las mismas condiciones para el mantenimiento y reproducción de T.

consotensis y control negativo Escherichia coli puesto en crecimiento en medio caldo nutritivo,

obtenidas del cepario del departamento de Microbiología de la Pontificia Universidad Javeriana.

La interpretación de datos obtenidos se realizó con software de análisis estadístico Design-

Expert versión 6.0.

5.5.1. TABLA 2. Diseño estadístico de 3x3x2 para evaluar diferentes concentraciones de

nutrientes para poner a prueba la capacidad de producción de PHAs del

microorganismo USBA 355.

ENSAYO

VARIABLES EVALUADAS

GLUCOSA

NH4CL

NACL

Partes/ Conc. Inicial

Concentración g/L

1 30 mM ¼ 0.2625 5 g/L

2 40 mM ¼ 0.2625 5 g/L

3 50 mM ¼ 0.2625 5 g/L

4 30 mM ½ 0.525 5 g/L

5 40 mM ½ 0.525 5 g/L

6 50 mM ½ 0.525 5 g/L

7 30 mM ¾ 0.7875 5 g/L

8 40 mM ¾ 0.7875 5 g/L

9 50 mM ¾ 0.7875 5 g/L

10 30 mM ¼ 0.2625 23 g/L

11 40 mM ¼ 0.2625 23 g/L

12 50 mM ¼ 0.2625 23 g/L

13 30 mM ½ 0.525 23 g/L

14 40 mM ½ 0.525 23 g/L

15 50 mM ½ 0.525 23 g/L

16 30 mM ¾ 0.7875 23 g/L

17 40 mM ¾ 0.7875 23 g/L

18 50 mM ¾ 0.7875 23 g/L

Page 22: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

23

5.6. DETECCIÓN DE GRÁNULOS DE POLIHIDROXIALCANOATOS

5.6.1. Técnica de tinción Negro Sudan (Burdón, 1946): 1. Se lleva una gota del cultivo ya

sea con el control positivo o con el microorganismo prueba (Cepa USBA 355) 2. Se

difunde el cultivo en un portaobjetos limpio y libre de grasa que debe tener un área de

alrededor 10mm x 30mm. Poner en fuego retirado el portaobjetos permitiendo así que

se fije y se seque el frotis. 3. La fijación bacteriana en este caso se llevara a cabo por

coagulación del citoplasma. 4. Se ponen unas pocas gotas (3 – 5) de solución negro

sudan a una concentración de 0,3% p/v en etanol al 70% v/v. 5. Después de 5-10

minutos el etanol presente en el tinte se debe evaporar o se puede retirar el exceso

cuidadosamente, empleando el borde de un pedazo de papel filtro. 6. Inmediatamente

después se sumerge el portaobjetos en xileno (di-metilbenceno) por 10 segundos,

teniendo la precaución de las reglas de seguridad de este compuesto dada a su alta

volatilidad por la presencia de gases tóxicos. Esperar a que el xileno se seque. 7.

Posteriormente se debe usar un colorante de contraste como la solución de safranina.

8. Después de 10 segundos enjuagar suavemente el portaobjetos bajo una corriente de

agua, y se deja secar de nuevo. 9. Después de completamente seco el portaobjetos se

añade una gota de aceite de inmersión y se pone bajo el lente 100X de microscopio.

Los gránulos de PHA’s son detectados como incrustaciones muy oscuras dentro de las

células de color rosa (Practical Biotechnology).

6. RESULTADOS Y DISCUSIÓN

6.1. DETECCIÓN DE GRÁNULOS DE PHA POR TINCIÓN NEGR O SUDAN

La técnica de tinción, Negro Sudán, resultó ser la herramienta de estudio base para continuar

con el desarrollo de este trabajo de grado, a partir de la cual se determinó en cada tiempo de

muestreo de esta forma evaluar la única variable respuesta de interés (producción de

polihidroxialcanoatos). A partir de la microscopia electrónica realizada a T. consotensis en

estudios previos, se evidenció la presencia de inclusiones citoplasmáticas de carácter lipídico lo

cual sugería la formación de gránulos de PHAs. Esto fue confirmado con la coloración realizada

bajo condiciones nutricionales óptimas para el crecimiento de la cepa (glucosa 20mM, NH4Cl

1,05g/L y NaCl 5g/L) donde se detectó la presencia de estos gránulos. Esta evidencia fue

soportada utilizando Ralstonia picketti como control positivo (figura 5) y Escherichia coli como

control negativo.

Page 23: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

24

6.1.1. Figura 5. Detección de gránulos de PHA, por coloración con Negro Sudan en control

positivo (Ralstonia Picketti)

6.2. DETECCIÓN DE GRÁNULOS DE PHAs CON RESPECTO AL TIEMPO DE

CRECIEMIENTO.

Los PHAs se sintetizan y acumulan en el interior de las células en la mayoría de las bacterias

en una condición de crecimiento desfavorable, tales como la limitación de nitrógeno, fósforo,

oxígeno o magnesio y cuando la fuente de carbono de origen se encuentra en exceso. (Ojumu

et al. 2004) Sin embargo, la producción de los gránulos en T. consotensis se identificó sin

utilizar alguna estrategia nutricional que estimulara la producción del polímero o que llevara a la

cepa a condiciones de estrés que promoviera la acumulación de la fuente de carbono como

material de reserva y/o energía. Aunque las estrategias nutricionales mencionadas

anteriormente, son utilizadas para simular las condiciones que conducen a la producción

eficiente de PHA, se ha reportado que algunas bacterias como A. eutrophus, A. latus y la cepa

mutante de Azotobacter vinelandii tienen la capacidad de acumularlos durante su crecimiento,

como podría llegar a ser el caso de la cepa T. consotensis (Yu, 2001; Du et al. 2001; Du y Yu,

2002).

A partir de la cinética de crecimiento realizada para T. consotensis en condiciones óptimas y en

agitación, se determinó que su fase exponencial inició en la hora 8 de crecimiento hasta la hora

18, donde comenzó la fase estacionaria. Durante la cinética evaluada se realizó la tinción de

Negro Sudan cada dos horas por 24 horas de muestreo. Se observó la detección del polímero

a partir de la hora 6, al inicio de la fase exponencial (Figura 6), lo cual posiblemente indica que

la cantidad detectada está relacionada de manera directa con el aumento de la biomasa, y que

Célula de Contraste

color Rosa (Safranina) Gránulo PHA con

Negro Sudan

Page 24: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

los mecanismos involucrados en

partir de la hora 6 aproximadamente.

6.2.1. Figura 6. Cinética de crecimiento (Densidad óptica

consotensis y producción de gránulos de PHA con respecto al tiempo de crecimiento,

por 24 horas de muestreo, en condiciones físicas y nutricionales

crecimiento.

La figura 6, muestra el aumento de producción de PHAs en cada

muestras) junto al aumento de biomasa, durante 24 horas de crecimiento.

identificó el punto de partida de detección del polímero, con una

presentes por campo no mayor a 1. (Tabla 1

comenzó a aumentar la biomasa y por consigu

donde no se evidencio un aumento

de muestra. Lo que conduce a pensar que los gránulos son

fuente de energía y carbono una vez que l

medio (Heok, 2009). A partir del comportamiento observado

tiempo máximo requerido para la formación del polímero,

para evaluar la presencia de gránulos en condiciones

0,000

0,500

1,000

1,500

2,000

2,500

3,000

3,500

4,000

4,500

5,000

0 2 4

LN (

X/X

o)

Crecimiento y Produccion de gránulos de PHA's

25

los mecanismos involucrados en la producción de PHAs, probablemente generaron

aproximadamente.

Cinética de crecimiento (Densidad óptica λ= 580nm ) de la cepa

y producción de gránulos de PHA con respecto al tiempo de crecimiento,

por 24 horas de muestreo, en condiciones físicas y nutricionales

, muestra el aumento de producción de PHAs en cada tiempo

junto al aumento de biomasa, durante 24 horas de crecimiento.

el punto de partida de detección del polímero, con una cantidad de gránulos

no mayor a 1. (Tabla 1) que se mantuvo hasta la hora 8, en la cual

a aumentar la biomasa y por consiguiente la detección del polímero

donde no se evidencio un aumento tanto de biomasa como de gránulos presentes por campo

Lo que conduce a pensar que los gránulos son movilizados y metaboli

fuente de energía y carbono una vez que la limitación de nutrientes se ve disminuida en el

A partir del comportamiento observado se determinó la hora 12

para la formación del polímero, y este tiempo de crecimiento se utilizó

para evaluar la presencia de gránulos en condiciones de estrés nutricional en

y = 0,191x + 0,0381R² = 0,947

6 8 10 12 14 16 18 20 22

Tiempo (Horas)

Crecimiento y Produccion de gránulos de PHA's

Crecimiento cepa T. consotensis

Produccion granulos PHA

Lineal (Crecimiento cepa T. consotensis)

, probablemente generaron influencia a

= 580nm ) de la cepa Tistlia

y producción de gránulos de PHA con respecto al tiempo de crecimiento,

por 24 horas de muestreo, en condiciones físicas y nutricionales óptimas de

de muestreo (13

junto al aumento de biomasa, durante 24 horas de crecimiento. En la hora 6 se

cantidad de gránulos

hasta la hora 8, en la cual

iente la detección del polímero hasta la hora 14,

tanto de biomasa como de gránulos presentes por campo

movilizados y metabolizados como

ve disminuida en el

determinó la hora 12 como el

tiempo de crecimiento se utilizó

nutricional en T. consotensis.

y = 0,191x + 0,0381R² = 0,947

0

1

2

3

4

24 26

Pro

ducc

ion

gran

ulos

PH

A

Crecimiento y Produccion de gránulos de PHA's

Page 25: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

26

En conclusión es importante tener en cuenta que existen varios factores que deben ser

considerados en la producción los PHAs, frente a la evaluación con el comportamiento de

crecimiento de la cepa, tales como la capacidad de la célula para utilizar la fuente de carbono,

la tasa de crecimiento, la velocidad de síntesis del polímero y la acumulación máxima de éste,

sobre la base del sustrato (Ojumu et al. 2004). Lo que refleja que es posible que la cepa,

mejore el rendimiento en cuanto a la producción de PHAs siempre y cuando se aumente la

velocidad de crecimiento mediante el estudio en la utilización de otra fuente de carbono frente a

la producción de PHAs.

6.3. ANOVA. ANALISIS DE VARIANZA PARA EL MODELO FA CTORIAL.

En este trabajo, el efecto de los diferentes nutrientes y las condiciones de cultivo, se evaluaron

con el objetivo de observar la influencia de estos factores nutricionales en la producción de

PHAs por T. consotensis y la detección de los gránulos. Esto se realizó mediante un modelo

estadístico de diseño factorial (3x3x2), que determinó el grado de influencia de cada uno los

factores evaluados (fuente de carbono, fuente de nitrógeno y concentración de sal) y

integración de los mismos.

Los resultados obtenidos se analizaron para validar los efectos principales sobre la variable

respuesta (producción de gránulos de PHAs) y comprobar que la variación observada en los

resultados es debida a un efecto real de cada factor y no al error experimental. (Ferré, 2003)

Que para efectos del estudio el programa Design-Expert arrojó los siguientes resultados.

6.3.1. Tabla 3. Análisis de varianza.

Source Sum of

Squares

DF Mean square F Value Prob > F

Model

Significant

17.28 13 1.33 14.95 < 0.0001

A 10.11 2 5.06 56.87 < 0.0001

B 3.00 2 1.50 16.88 < 0.0001

C 1.50 1 1.50 16.88 0.0002

AB 2.22 4 0.56 6.25 0.0005

AC 0.11 2 0.056 0.62 0.5404

BC 0.33 2 0.17 1.87 0.1666

Residual 3.56 40 0.089

Lack of fit 1.56 4 0.39 7.00 0.0003

Pure Error 2.00 36 0.056

Cor Total 20.83 53

Page 26: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

27

La interpretación del ANOVA determinó que: “F-valor” de 14,95 implica que el modelo es

significativo. Determinando que existe una posibilidad de 0.01% de que el "Modelo F-valor" de

este tamaño pueda ocurrir debido al error. En síntesis el resultado del análisis demuestra que

los datos se ajustan al modelo estadístico, mediante el valor F, que evalúa dentro de un

análisis de varianza que los valores esperados de una variable cuantitativa en varios grupos

definidos previamente se diferencian entre sí. (González Ed. 2006)

Los valores de "Prob> F" menor que 0,0500 indican que los términos del modelo son

significativos. Para este caso A (fuente de Carbono), B (fuente de nitrógeno), C (Concentración

de sal) y AB (Relación fuente de carbono vs fuente de nitrógeno) son términos significativos del

análisis de varianza. Frente a la interpretación de la respuesta esperada, justifica, que los datos

obtenidos predicen que el comportamiento de estos factores deben ser altamente considerados

para la cuantificación de la variable respuesta, (producción de gránulos de PHA’s) En cuanto a

los factoeres que presentan valores superiores a 0.1000, no son significativos y no influyen en

la variable respuesta, como la relación AB (fuente de carbono y concentración de sal) y la

relación AC (fuente de nitrógeno y concentración de sal).

6.3.2. Tabla 4. Resultados estadísticos Análisis de Varianza

El análisis de varianza estadístico determinó que el comportamiento de los resultados

obtenidos (a partir de la coloración con Negro Sudán) señalo una baja dispersión de los datos y

la linealidad de los mismos es cercana a 0,9 lo que puede predecir un resultado satisfactorio

Std. Dev. 0,30

Mean 1,94

C.V. 15,33

PRESS 6,48

R – Squared 0,8293

Adj R – Squared 0,7739

Pred R – Squared 0,6890

Adeq Precision 15,370

The Model F-value of 14.95 implies the model is significant. There is only a 0.01% chance that a "Model

F-Value" this large could occur due to noise.

Values of "Prob > F" less than 0.0500 indicate model terms are significant. In this case A, B, C, AB are

significant model terms.

Values greater than 0.1000 indicate the model terms are not significant. If there are many insignificant

model terms (not counting those required to support hierarchy), model reduction may improve your

model.

The "Lack of Fit F-value" of 7.00 implies the Lack of Fit is significant. There is only a

0.03% chance that a "Lack of Fit F-value" this large could occur due to noise. Significant lack of fit is bad

-- we want the model to fit.

Page 27: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

28

muy cercano a la realidad, a la hora del análisis de los datos bajo un modelo estadístico de

diseño factorial.

6.3.3. EFÉCTO DE LA FUENTE DE CARBONO, FUENTE DE NI TROGENO Y

CONCENTRACION DE SAL EVALUADOS, SOBRE LA PRODUCCION DE

GRÁNULOS DE POLIHIDROXIALCANOATOS

La evaluación de la interacción entre los factores evaluados (fuente de carbono, fuente de

nitrógeno y concentración de sal) determino el grado de influencia de cada uno de ellos sobre

la variable respuesta (producción de gránulos de polihidroxialcanoatos), por lo tanto como ya

se ha mencionado numerosos factores afectan la producción del polímero, tales como la

concentración de sustratos, relación carbono-nitrógeno e incluyendo factores que no se tienen

bajo control en este estudio, como el pH, temperatura, agitación y tasa de aireación, de forma

similar a cualquier tipo de fermentación (Grothe et al, 1999; Du et al, 2001; Du y Yu, 2002).

La manipulación de la condiciones en la fuente de carbono y nitrógeno (siendo las más

reportadas) y la concentración de sal en el medio básico, para el crecimiento óptimo de T.

consotensis, se han utilizado en este estudio para promover la detección del polímero. Pues

como ya se mencionado en la revisión, las inclusiones intracelulares correspondientes a

gránulos de PHAs, son producidos en condiciones nutricionales no balanceadas.

La relación de estos factores: A, concentración de glucosa y B, concentración de cloruro de

amonio así como los diferentes niveles evaluados (concentración de cloruro de amonio) (B1,

B2 y B3) para cada uno fue graficado por el software de análisis utilizado, (Expert – Design) y

se puede evaluar a continuación.

Page 28: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

29

6.3.3.1. Figura 7. Interacción entre el factor A: Fuente de carbono (Glucosa) y el factor B

(Cloruro de amonio)

Para la interpretación de la variable respuesta, correspondiente a la producción de gránulos de

PHA en los factores A (glucosa) y B (Cloruro de amonio) bajo tres niveles diferentes, se

evidenció que la mayor producción de gránulos está dada a un concentración de glucosa de

50mM, junto con el nivel B1 que corresponde a la menor concentración de cloruro de amonio

(0,2625g/L), la grafica también demuestra que la menor concentración de glucosa (30mM) junto

con la mayor concentración de cloruro de amonio (0,7875g/L) también influye de manera

negativa en la producción de los gránulos, lo que confirma que la relación carbono – nitrógeno

está directamente relacionada en la producción. Esto es sustentado por la teoría explicada por

diferentes autores, que cuando los suministros de nutrientes están desequilibrados, es

ventajoso para las bacterias ya que estas tienen la capacidad de almacenar el exceso de

nutrientes dentro de la célula. (Madison y Huisman, 1999; Berlanga et al. 2006; Ojumu et al.;

Du y Yu, 2002).

DESIGN-EXPERT Plot

Granulos

X = A: GlucosaY = B: Cloruro de amonio

Design Points

B1 0,2625B2 0,5250B3 0.7875

Actual FactorC: NaCl = 5

B: Cloruro de amonioInteraction Graph

A: Glucosa

Gra

nulo

s

30 40 50

1

1.56813

2.13625

2.70438

3.2725

121212666 121212

666

666 121212 333

333

121212

666

Page 29: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

30

Sólo unos pocos PHAs pueden ser sintetizados a partir de carbonos simples, tales como ácidos

grasos o la glucosa. Teniendo en cuenta que los PHA son sintetizados por polimerización de

coenzima A (CoA), podría ser posible concluir que en este caso la fuente de carbono (glucosa)

es el precursor más importante (figura 6) en la producción de acetil CoA, teniendo en cuenta

que el sustrato utilizado (glucosa) hace parte del grupo de los carbohidratos y que la síntesis de

PHAs este mediada por la consecuente producción de acetoacetil CoA, para que

posteriormente se produzca (R) – 3 – hidroxiacil CoA y finalmente el polihidroxialcanoato.

Cuyas reacciones se deben llevar a cabo por las enzimas phaA, PhaB y PhaC (Figura 1). Al

parecer podrían ser activadas ante el exceso de glucosa en limitación de cloruro de amonio, lo

que genera una condición desbalanceada.

6.3.3.2. Figura 8. Interacción entre el factor A: Fuente de carbono (Glucosa) y el factor C:

Concentración de sal.

DESIGN-EXPERT Plot

Granulos

X = A: GlucosaY = C: NaCl

Design Points

C1 5C2 23

Actual FactorB: Cloruro de amonio = 0,2625

C: NaClInteraction Graph

A: Glucosa

Gra

nulo

s

30 40 50

1

1.56813

2.13625

2.70438

3.2725

88555 888

666

55 888

666

Page 30: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

31

En cuanto a la relación entre los factores de concentración de sal y glucosa, (C y A). La

concentración de sal, no muestra participación en el proceso de producción, ya que es posible

observar en la figura 8, que tanto la menor como la mayor detección de gránulos se ve

reflejada cuando la concentración de glucosa es igual a 30 y 50mM respectivamente, mientras

que la influencia de la concentración de sal está siendo arrastrada, de acuerdo al aumento en

la concentración de glucosa.

De igual forma la relación entre la concentración de sal y el cloruro de amonio (C y B) no se

determinó como un factor fuerte en la influencia de producción del polímero dado que en el

análisis conjunto entre la figura 9 y la figura 7, es posible analizar que la mayor detección de

gránulos esta marcado, cuando la concentración de cloruro de amonio es baja (0,2625g/L) y

esta detección se ve disminuida cuando la concentración de NH4Cl aumenta. Concluyendo que

la limitación de nitrógeno en el medio de cultivo es una de las causas que favorecen la

biosíntesis de estos polímeros, ya que al producirse el desbalance nutricional y la condición de

estrés, la síntesis de proteínas y el metabolismo celular se ven impedidos y se podría pensar

que esta condición de ausencia, activa un mecanismo de defensa para lo que genera un factor

respuesta al generar reserva de energía (Castillo 2008).

Sin embargo es importante mencionar, que aunque la condición salina no representa un factor

que influya en la producción del polímero, si representa una ventaja industrial, debido a que la

extracción del gránulo por choque osmótico en células halófilas disminuye costos de

producción cercanos al 60% (Quillaguamán et al 2010). Este proceso por medio utilización de

agua en bajas concentración salina, genera la lisis celular permitiendo la liberación del gránulo.

Page 31: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

32

6.3.3.3. Figura 9. Interacción entre el factor B: Fuente de Nitrógeno (Cloruro de amonio) y el

factor C: Concentración de sal.

En el trabajo de Quillaguamán y colaboradores en el 2007, desarrollaron la optimización de

Halomonas boliviensis para la producción de polihidroxibutirato por medio de un diseño factorial

que involucraba diferentes fuentes de nitrógeno y la utilización de sacarosa como fuente de

carbono y determinaron que las altas concetraciones de este causaban una efecto positivo en

la producción del polímero debido a la condición de estrés generado y la activación de

mecanismos que permitieron la acumulación del exceso. En sintesis la fuente de carbono

marcó la pauta principal en la producción de polihidroxialcanoatos en T. consotensis, dado que,

como se ha analizó anteriormente, la mayor concentración de este, garantiza el estrés de la

célula, lo que promueve la acumulación de gránulos en el interior, mediante la vía de glucolisis

y la posible que la producción de Acetil – CoA, entendiendo que este es el principal precursor

para la síntesis de polihidroxialcanoatos. Sin embargo se recomienda que otros factores físicos

DESIGN-EXPERT Plot

Granulos

X = B: Cloruro de amonioY = C: NaCl

Design Points

C1 5C2 23

Actual FactorA: Glucosa = 30

C: NaClInteraction Graph

B: Cloruro de amonio

Gra

nulo

s

0,2625 0,5250 0.7875

0.505273

1.12895

1.75264

2.37632

3

555 333

666

55

333 666

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33

sean evaluados y controlados para determinar la influencia en la producción del polímero y

complementar una lista de factores que intervengan en el proceso.

7. CONCLUSIONES.

• La detección de los PHAs se encontró entre la hora 6 y la hora 18 de crecimiento en

condiciones optimas en la cepa Tistlia consotensis USBA 355.

• La condición de estrés con mayor influencia en la detección de gránulos de PHA se

observó con la mayor concentración de glucosa evaluada y la menor concentración de

cloruro de amonio.

8. RECOMENDACIONES.

• Para la complementación de este trabajo, es necesario hacer una cuantificación de los

gránulos de PHAs producidos en los factores evaluados que arrojaron respuestas

favorables.

• Evaluar rangos menores de salinidad a los evaluados.

• Detección de genes PHA sintasa.

Page 33: Escrito Detección de gránulos de PHAs en la cepa USBA 355 2

34

9. REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS

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