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INDICADORES Y VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA PARA MITIGAR EL TERCER REBROTE #DATATON2021 Categoría Nueva Normalidad Código del Equipo: LT

INDICADORES PARA VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA PARA …

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INDICADORES Y VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA PARA

MITIGAR EL TERCER REBROTE#DATATON2021

Categoría Nueva NormalidadCódigo del Equipo: LT

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Equipo

• Dr. Manuel Adrian Acuña Zegarra

• Dr. Jorge X. Velasco Hernández

• Dr. Mario Santana Cibrian

• M. en C. Ruth Corona Moreno

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Planeación de actividades y evaluación del estado de la

epidemiaDescripción de indicadores

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ℛ = 2.0, casos nuevos, generación 10 = 1024

ℛ = 1.5, casos nuevos, generación 10 = 57.6

ℛ = 1.1, casos nuevos, generación 10 = 2.5

ℛ = 0.8, casos nuevos, generación 10 = 0.1

ℛ = 2

ℛ número reproductivoNúmero de contagios producido por un enfermo

durante su periodo infeccioso.

Fuerza de la transmisión

¿Cómo podemos medir la rapidez a la que se generan estos contagios?

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𝐶𝐶𝑡𝑡 riesgo de contagio al día tProbabilidad de encontrarse con 1 o más enfermos enuna reunion con 𝑁𝑁 individuos en un día determinado

Casos activos al día de hoy: número total de enfermos desde hoy hasta 14 días atrás

Casos activos 3 Casos activos 10 𝑝𝑝 𝑡𝑡 frecuencia de casos activos en una region (estado, municipio, alcaldía) =

casos activos/población total del estado, región o municipio𝑝𝑝 𝑡𝑡 =3

30= 1/10 𝑝𝑝 𝑡𝑡 =

1030

= 1/3

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𝑁𝑁 significa aproximadamente:

• 50: salón de clases, transporte urbano(autobuses, troles), fiesta casera.

• 100: sala de cine, supermercado

• 200: reuniones multitudinarias (bodas, misas etc.)

• ≥ 500: estadios, aeropuertos, terminalesde autobús, fiestas patronales, expos, etc.

𝑁𝑁: grupos de riesgo

Page 7: INDICADORES PARA VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA PARA …

• 𝑝𝑝 = 0.01, 1 − 𝑝𝑝 = 0.99,𝑁𝑁 = 200,𝐶𝐶𝑡𝑡 = 86%• 𝑝𝑝 = 0.01, 1 − 𝑝𝑝 = 0.99,𝑁𝑁 = 100,𝐶𝐶𝑡𝑡 = 63%• 𝑝𝑝 = 0.01, 1 − 𝑝𝑝 = 0.99,𝑁𝑁 = 50,𝐶𝐶𝑡𝑡 = 39%

C𝒕𝒕 = 1 − 1 − 𝑝𝑝(𝑡𝑡) 𝑁𝑁 × 100.

Probabilidad de NO encontrarse con una persona enferma en un grupo de tamaño N

Probabilidad de SÍ encontrarse con al menos una persona enferma en un grupo de tamaño N

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Número reproductivo

Ries

go

ℛ = 1

ℛ < 1𝐶𝐶𝑡𝑡 > 50%

ℛ > 1𝐶𝐶𝑡𝑡 > 50%

50%

ℛ > 1𝐶𝐶𝑡𝑡 < 50%

ℛ < 1𝐶𝐶𝑡𝑡 < 50%

Page 9: INDICADORES PARA VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA PARA …

Ejemplo:

Incidencia

Mortalidad

Número reproductivo

Tumbes

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Comportamiento nacional (riesgo de contagio, aforo 50 personas)

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Evolución de la epidemia

Comportamiento nacional

Tendencia incipiente

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Marco regionalIdentificación de problemática

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Situación

La República del Perú bajo elembate de la pandemia global deSARS-CoV-2• Alta mortalidad y alta

morbilidad.• Crisis sistema médico,

hospitalario, de salud pública.• Crisis sectores productivos del

país.

Page 14: INDICADORES PARA VIGILANCIA EPIDEMIOLOGICA PARA …

• A la fecha, la curva epidémica está en unpunto de baja prevalencia.

• El último brote se inició a principios del año ydesde finales de abril se encuentra endescenso.

• La vacunación en el país inició en el mes defebrero con una tasa baja

• Previsible dominancia de la variante Delta delSARS-CoV-2.

• Condiciones para un incremento en laincidencia con el consecuente incremento enla demanda elevada de servicios médicos yhospitalarios, igual o quizás mayor, que en elbrote de invierno.

• La vacuna muy probablemente prevendrámuertes pero no contagio.

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Necesidades

• Mantener abierta la economía es central• Población con menores recursos, la más vulnerable económicamente;

fuertemente afectada por cuarentenas y aislamiento social.• Reapertura de escuelas es apremiante.• La juventud peruana, particularmente aquella en la clase de edad de

0 a 18 años, no puede continuar sin recibir su educación de maneraeficiente y completa.

• El futuro del país es el que se vería comprometido de continuar la presente situación.

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Para coadyuvar a mitigar el impacto de un tercer rebrote, es imperativoel seguimiento informado de la evolución de la epidemia.

ObjetivoConstrucción de indicadores prácticos, interpretables, basados en los

conocimientos científicos de frontera verificables, abiertos y reproducibles usando herramientas matemáticas, estadísticas y

computacionales de frontera.

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Justificación

• Sala Situacional COVID-19 Perú, es un instrumento sumamentevalioso de seguimiento y evaluación, basado en los casos y muertesobservadas.

• Guía es insuficiente si se quiere controlar o amortiguar un rebrote demagnitud significative.

• Se requiere complementar la información basada en casos reportadoscon indicadores que den cuenta de la real dimensión de la epidemia.

• Indicadores, necesariamente basados en el conocimiento que se tienede la enfermedad en diferentes países que con criterios yfundamentos teóricos y conceptuales bien informados y verificables,puedan adaptarse a la situación peruana.

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Aspectos técnicosDescripción modelo de análisis

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InformaciónSolicitada

• Casos reportados: confirmados, sospechosos y negativos desde el inicio de la epidemia.

• Edad, sexo, departamento, provincia, distrito.

• Fechas de: inicio de síntomas, ingreso al sistema de vigilancia, hospitalización, intubación o ingreso a UCI, alta de hospital o muerte, toma de prueba, confirmación de prueba.

• Tipo de prueba y comorbilidades.• Además, el exceso de mortalidad por día

atribuible al COVID-19.

Generada

• Estimación semanal de la incidencia total• Casos activos totales.• Casos severos totales• Incidencia acumulada total en el país y en

sus diferentes departamentos. • Índice semanal de riesgo de contagio en

eventos con aforos variables. • Número reproductivo instantáneo

semanal.

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Técnicas

• Uso de modelo estadístico quecombina la evidencia detransmisión, historia natural ydiagnosis con casos y muertesreportadas para

• Ajustar casos reportados ymuertes reportadas

• Generar estimaciones deincidencia total, incidenciaacumulada total, casos severos ynúmero reproductivo.

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• Distribución de probabilidad de ser diagnosticadosi se es sintomático.

• Distribución de probabilidad de ser diagnosticadosi presenta enfermedad severa.

• Distribución de probabilidad de retraso enreportaje.

• Distribución de retraso en el diagnóstico paracasos sintomáticos y casos severos.

• Distribución de tiempo del retraso en eldiagnóstico de casos sintomáticos.

• Distribución de probabilidad de tiempo del retrasoen el diagnóstico de casos severos.

• Distribución del tiempo desde la infección hasta laaparición de síntomas.

• Distribución del tiempo desde la aparición desíntomas hasta la enfermedad severa.

• Distribución del tiempo desde la sintomatologíasevera hasta defunción.

• Distribución del retraso en el reportaje de casos.

• Distribución del retraso en el reportaje dedefunciones.

• Distribución de probabilidad de ser sintomático sise es infeccioso.

• Distribución de probabilidad de presentarenfermedad severa si se es sintomático.

• Distribución de probabilidad de fallecer si sepresenta enfermedad severa

• Distribución de probabilidad de fallecer si se essintomático.

Técnicas

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ObservacionesComentarios sobre la base de datos

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Consideraciones

Deficiencias en los datos• La base de casos hospitalizados

está incompleta (e.g., Arequipa)• Existen casos de la base de

seguimiento que no figuran en labase de positivos.

• Falta lugar de residencia de casossospechosos. Imposible asignarlosa departamentos.

• Existen casos positivos sinidentificador.

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