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CLAUDIASERRANO,M.D.,MSCMédica Gineco-obstetra ygenetistaDirectora médicaycientífica
Genética,confiableeinnovadora
Microarreglos:una formadeentender elfeto
Cariotipo
FISH- q-PCR
Enfermedadesmonogenicas
HGC-a
MicroarreglosSNP´s
NGS
Exoma fetal
Tamizaje
Ultrasonido
Prenat Diagn 2010;30:674–681
Dificultad diagnóstica
15 -20% de malformaciones son cromosómicas
30-40%Enfermedades monogénicas/del-dup
Expresión variable
Fenotipos incompletos
Heterogeneidad genetica yalélica
Prenat Diagn 2010;30:674–681
Comoresuleve elproblema……
• Noes necesario tener undiagnóstico clínico exacto
• Evalúa varias regiones cromosómicas y/oADNde
formasimultánea
• Costos aceptables
• Oportunidad
Genética,confiableeinnovadora
QuéesunMICROARREGLOounARRAY?
Genética,confiableeinnovadora
QuéesunMICROARREGLOounARRAY?
Microarreglo oHibridación Genómica Comparada
Genética,confiableeinnovadora
CómosehaceHGC-a?
Genética,confiableeinnovadora
Cómosehacemicroarreglo+SNP?
Cómosehacemicroarreglo+SNP?
Contaminación materna delamuestraUPDMosaicismoTriploidía
Tipos demicroarreglos
Tipos demicroarreglos
Resolución
Prenatal
Altaresolución
SNP ADN/ARN
ADN
ARN
Genética,confiableeinnovadoraGenética,confiableeinnovadora
HIBRIDACIONGENOMICA
COMPRADAPORARRAYS
MICROARREGLOS:CuentaconSNP´squepermiteneldiagnósticodepérdidadeheterozigosidad(LOH),disomíauniparental(UPD)ycontaminaciónmateraenlas
pruebasprenatales
CARACTERISTICAS CGH-a aCGH OPTIMA CytoScan 750K CytoScan HD
Resolución 160K 160K 750K 2.67MillonesK
MarcadoresSNPs 150.000 148,450 750,436 6,876,796
MarcadoresNoPolimórficos 18.000 18,018 550,000 1,953,246
Resoluciónperdidadelaheterozigosidad (LOH)
NoAplica 5Mb 1Mb 1Mb
Mosaicismo Apartirdel30% Apartirdel30% Apartirdel20% Apartirdel15%
UPD No Si Si Si
ResoluciónDeleciones 1Mb 1Mb 1Mb 10Kb
ResoluciónDuplicaciones 2Mb 2Mb 2Mb 25Kb
PRENATAL 396genes 396genes NoserecomiendaparaDxprenatal
NoserecomiendaparaDxprenatal
Tiempodeentrega 20-30díascalendario 20-30díascalendario 30-45díascalendario 30-45díascalendario
Genética,confiableeinnovadoraGenética,confiableeinnovadora
HIBRIDACIONGENOMICA
COMPRADAPORARRAYS
MICROARREGLOS:CuentaconSNP´squepermiteneldiagnósticodepérdidadeheterozigosidad(LOH),disomíauniparental(UPD)ycontaminaciónmateraenlas
pruebasprenatales
CARACTERISTICAS CGH-a aCGH OPTIMA CytoScan 750K CytoScan HD
Resolución 160K 160K 750K 2.67MillonesK
MarcadoresSNPs 150.000 148,450 750,436 6,876,796
MarcadoresNoPolimórficos 18.000 18,018 550,000 1,953,246
Resoluciónperdidadelaheterozigosidad (LOH)
NoAplica 5Mb 1Mb 1Mb
Mosaicismo Apartirdel30% Apartirdel30% Apartirdel20% Apartirdel15%
UPD No Si Si Si
ResoluciónDeleciones 1Mb 1Mb 1Mb 10Kb
ResoluciónDuplicaciones 2Mb 2Mb 2Mb 25Kb
PRENATAL 396genes 396genes NoserecomiendaparaDxprenatal
NoserecomiendaparaDxprenatal
Tiempodeentrega 20-30díascalendario 20-30díascalendario 30-45díascalendario 30-45díascalendario
Numéricas
Deleciones/duplicaciones
Disomíasuniparentales
Mosaicos
Perdidadeheterocigocidad
Alteraciones cromosómicas
Casoclínico- 66754
27años - G2P1A0Amenaza deabortoExposición aalcoholmoderadoRCIUdesde lasemana 27Ecografías:CIV
66754
Genética,confiableeinnovadora
66754
66754
Casoclínico- 66023
29años - G2P1A0SN:9,5mmHueso nasalhipoplásicoRegurgitación tricuspideaPieequivo-varo bilateralAcortamiento mesomélico extremidadesHidrops fetal
Genética,confiableeinnovadora
66947 45,XY,t(14;22)(q32;q11.2),-22
66947 45,XY,t(14;22)(q32;q11.2),-22
66947 45,XY,t(14;22)(q32;q11.2),-22
Casoclínico- 65422
42años– G1P1A046,XX,t(4;8)(q35;q22)Embarazo de26semanas:RCIU,tetralogía deFallotNIPT:negativo
Tamizar?Dx Invasivo?
NIPT?Seguimiento ecográfico?
Nada?
65422
Madreconcariotipo 46,XX,t(4;8)(q35;q22)
65422 Madreconcariotipo 46,XX,t(4;8)(q35;q22)
63483
Primigestante de 34 años con embarazo de 26 semanas con cardiopatía conotruncal, estenosis pulmonar.
65748
arr(hg18)2p12p11.2(76,865,584-89,129,064)x2-3
64858
Pérdida deheterocigocidad
Mayores a10Mb- Genesrecesivos
65358 Contaminaciónmaterna
TasadedeteccióndeCNV´s segúnlasmalformacionescongénitashalladas
Alteración Deteccióndeanomalías Observaciones Publicaciones
Diagnósticoprenatal 6%
12.000 análisis prenatales5,5%cariotiponormal72%alteraciones<10Mb1,4%alteraciónadicionalalahalladaenelcariotipo1,1%VOUS
Shaffer etal,2012Wou etal.2016
SN >3,5mm 12%(5-20%)6% sinotrasanomalíasestructurales13-20%otrasanomalíasUS2%hallazgossignificadoindeterminado
Leung etal2011Donelly etal2014
Deseomaterno0,3-0,5%1,5%fetossanos
PosiblementeeselRx enlapoblacióngeneraldeRM
Armengoletal2010Wou etal2016
Padresportadoresdealteracionescongénitas 35% Rearreglos balanceados Breman etal2012
Obito fetal 8,2% Liu etal2011
Abortos 40%PRG Sugiura etal2012
Retardo psicomotor,autismoymalformacionespostnatales
20% Camaro etal2010Calou etal2017
• Análisis delainformación prenatalpuede serdispendiosa yhallazgos conimplicacionesdesconocidas• VOUS
• Algunas alteraciones deben ser confirmadas conotras técnicas
• Costos
Limitaciones
Interpretación deresultadosUSanormal
Anormal Normal
Array
Anormal
Cariotipo padres
Normal
NGS- exoma fetal
VOUS
Arraypadres
LOH
Enf recesivas
FISH– q-PCR
Indicaciones
J.Suelaetal./Med Clin (Barc).2017;xxx(xx):xxx.e1–xxx.e8
Indicaciones
1. CUANDOELCARIOTIPOESNORMAL.Cardiopatías,defectosfosaposterior,SNaumentada,múltiplesmalformaciones,labioypaladarhendido,D.E.
2. Cromosomasmarcadores3. Translocaciones“balanceadas”4. Translocacionesnobalanceadas5.Óbitofetalconmalformaciones
Genética,confiableeinnovadora
Microarreglos:una formadeentender elfeto.Familia:asesoramiento genéticoVentajas - LimitacionesConfirmar conotras pruebas
