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Laboratorio de Química Física II Prácticas de Química Computacional Práctica 3- Estudio de Sistemas Electrónicos con El Método de Hückel Práctica 4- Modelización Molecular: Estructura y Reactividad

Presentación de PowerPoint - uv.es · HÖ TÖ e TÖ N VÖ eN V ... * Los electrones y ocupan distintas regiones del espacio H Ö ... • La estructura del punto silla corresponde

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Laboratorio de Química Física II

Prácticas de Química Computacional

Práctica 3- Estudio de Sistemas Electrónicos con El Método de Hückel

Práctica 4- Modelización Molecular: Estructura y Reactividad

Introducción General

ˆ H (r, R) E(r, R)

NNeeeNNe VVVTTH

Conoce la estructura molecular implica resolver la ecuación de

Schrödinger:

Aproximación de Born-Oppenheimer:

)R()R;r()R,r( e

Tratamiento de núcleos y e- por separado debido a su diferente masa (mN >> me)

Introducción General

N

1i

N

ij ij

N

1i

S

1A iA

A2

i eeeNee

r

1)

r

Z

2

1(- VVTH

NNNe VTH H

Ecuación de Schrödinger electrónica:

)R;r(E)R;r(H eeee

Introducción

Para la obtención de la energía potencial de la molécula:

V (R)E V(R) NNe

S

1A

S

AB AB

BA

eR

ZZ (R)E V(R)

Práctica de Hückel: Estructura electrónica y distribución de carga

Superficies de Energía Potencial: Geometría molecular

1. Método de Hückel

Hückel: Fundamentos Teóricos

Planteamiento problema: Estudio de una molécula de etileno

C2H4: 6 núcleos y 16 electrones

ˆ H (r, R) E(r, R)

H T n V n

H eˆ H e ( 1

2i

2

ZA

riAA1

S

i1

N

)1

rijj i

N

i 1

N

r (electrones) R (núcleos) = 22 partículas

Hückel: Fundamentos Teóricos

1.- Aproximación Born-Oppenheimer

mN >> me

(r, R) R (r)(R) H eR(r) EeR(r)

Energía Potencial de la Molécula

N

1A

N

AB AB

BAene )(V

R

ZZEVE R

16 partículas

H T n V n

H e0 cte

Hückel: Fundamentos Teóricos

2.- Aproximación electrónica

ˆ H e ˆ H

ˆ H ˆ H

* Estamos interesados en los electrones

* Los electrones y ocupan distintas regiones del espacio

H e (1, ... , N) H (1, ..., k) H (k 1, ... , N)

R (1, 2, ..., N) (1, ..., k) (k 1, ..., N)

H (k 1, ..., N) (k1, ..., N) E(k 1, ..., N)

Puede incluir

implicitamente

interacción con

e-

2 partículas

Hückel: Fundamentos Teóricos

3.- Aproximación Orbital (OM)

H (1, 2, ..., N ) h (1) h (2) .... h (N )

(1, 2, ... , N ) i(1)j (2) .... l (N )

h (1)i(1) ii(1)

Problema de 1partícula !!E i j .... l

Hückel: Fundamentos Teóricos

4.- Aproximación OM-CLOA (Orb. Molecular como Combinación Lineal

de Orbitales Atómicos)

i cai

a 1

K

a

Ejemplo: El orbital del etileno se construye por C. L.

de los orbitales 2pz de los carbonos

2211 cc

Hückel: Fundamentos Teóricos

5.- Cálculo de la Energía: Aproximación Variacional

2211 cc

2

21221

2

1

22

2

2122111

2

1

22112211

22112211

2

2

cSccc

HcHccHc

cccc

cchcch

1

ˆ

aaaa

babaab

babaab

S

SS

HhH

22

2

2122111

2

1

2

21221

2

1 HcHcc2HccScc2c

Hückel: Fundamentos Teóricos

5.- Cálculo de la Energía: Aproximación Variacional

22

2

2122111

2

1

2

21221

2

1 HcHcc2HccScc2c

1c

122111

1

2

2

1

1221122

1

2

11 Hc2Hc2c

cc

Scc2Sc2c

cc2

0 0 0

0cSHcH 21212111

0HSH

SHH

221212

121211

2c

0cHcSH 22211212

Ec. 2º grado que da dos

soluciones de la energía

(2 C.L. distintas de los orbitales 2pz)

Sistema de ec. seculares

Hückel: Fundamentos Teóricos

6.- Aproximaciones del método Hückel

Hab

dhhH a

*

aaaaa

Integral de Coulomb:

energía de un electrón descrito por el orbital a en el campo de la molécula

Todas iguales Haa=Hbb=

dhhH b

*

abaab

Integral de Resonancia:

energía de solapamiento entre orbitales a y

Hab=- si a y b son átomos directamente enlazados

Hab=0 si a y b no están directamente enlazados

Hückel: Fundamentos Teóricos

6.- Aproximaciones del método Hückel

Sab

ababS

= 1 si a=b (orbital normalizado)

= 0 si a≠b (despreciamos solapamiento)

Determinante de Hückel

0

x

0x1

1x

0HSH

SHH

221212

121211

Integral de solapamiento

Hückel: Fundamentos Teóricos

Soluciones del método Hückel: Energías

x

0x1

1x x2 -1 = 0 x = 1

x = +1

x = -1

= +

= - -

+

Energía molécula = 2 (-)

Hückel: Fundamentos Teóricos

Soluciones del método Hückel: Orbitales

0cSHcH 21212111

0cHcSH 22211212

Ecuaciones Seculares

0cc 21

21 cc

1ª solución = - 0cc 21

0cc 21

21 cc

21 cc

Otra ecuación → Normalización 1cc 2

2

2

1

2

1cc 21

Hückel: Fundamentos Teóricos

Soluciones del método Hückel: Orbitales

1ª solución = -

2

1cc 21

212

1

2

1

2ª solución = +

2

1cc 21

212

1

2

1

Hückel: Fundamentos Teóricos

Construcción Determinante Hückel: Generalización

1,3-Butadieno (C4H6) Ciclobutadieno(C4H4)

1 2 3 4

1 2

43

1 2 3 4

1

2

3

4

x 1 0 0

1 x 1 0

0 1 x 1

0 0 1 x

1 2 3 4

1

2

3

4

x 1 1 0

1 x 0 1

1 0 x 1

0 1 1 x

Hückel: Fundamentos Teóricos

Cálculo de Propiedades Moleculares

Energía Electrónica (sistema )

OMs

i

iinE1

ni número ocupación del orbital i (0,1,2)

Densidad electrónica sobre un átomo

OMs

i

aiia Cnq1

2 Carga neta Q = 1-qa

Orden de Enlace entre átomos a y b

OMs

i

biaiiab CCn1

Orden total = 1+ab

Hückel: Fundamentos Teóricos

Extensión a Sistemas con Heteroátomos

Para heteroátomos X e Y en moléculas conjugadas planas

X = +hX

XY = kXY

http://www.chem.ucalgary.ca/SHMO/index.html

Programa a usar:

2. Superficies de Energía

Potencial

Superficie de energía potencial

• Energía de una molécula (E).

H E

H

T N

T e

V ee

V Ne

V NN

• Aproximación de Born-Oppenheimer.

)(r;)(E);r()(H eeee RRRR

Neeeee VVTH

• Energía potencial es la energía de una molécula para una posición relativa

dada (fija) de los núcleos (R son las coordenadas de los átomos).

)(V)(E)(V NNe RRR

No se puede resolver exactamente

La superficie de energía potencial es el

conjunto de valores de la energía potencial

para todas posiciones relativas de todos los

átomos y corresponde a la función V(R).

Coordenadas internas.

• Hacen uso de variables como:

Ejemplo: H2ON.

Orden

Tipo Ref distancia Ref ángulo

1 O

2 H 1 0.942

3 H 1 0.942 2 103.7HH

r31

or21

312

3 2

1

- distancia entre dos átomos.

- ángulo formado por tres átomos

- ángulo diedro formado por cuatro átomos

Molécula de H2O

HH

r1

or2

La energía potencial dependerá de

tres coordenadas

El ángulo diedro formado por cuatro átomos i-j-k-n se define como el ángulo

entre dos planos, uno conteniendo los átomos i,j,k y el otro los átomos j,k,n.

1

2 3

4 = 60º = 120º = 180º = 0º

4

1

5

2

3

Orden Tipo Ref distancia Ref ángulo Ref diedro

1 C

2 O 1 1.336

3 H 2 0.972 1 106.10

4 O 1 1.206 2 124.68 3 90.00

5 H 1 1.113 2 110.46 3 -90.0

Ejemplo: HCOOH

• ¿Cuantas coordenadas internas son necesarias para definir

una molécula de N átomos?

En general 3N-6 (El HCOOH tiene 5 átomos, necesitamos 3*5-6=9)

Muchas veces solo una o dos coordenadas internas son importantes o tienen

variaciones significativas en el proceso que se estudia. En estos casos se puede

representar V(R) frente a esas pocas coordenadas obteniéndose una superficie

de potencial reducida.

V depende de 3*8-6=18 variables pero sólo una es significativa

para el proceso El dihedro ClCCCl

Cl

Cl

Cl

Cl

Equilibrio Conformacional del 1,2-dicloroetano

En general la energía potencial de una molécula de N átomos será función

de 3N-6 coordenadas → Hipersuperficie de Energía Potencial

0

2

4

6

8

10

-180 -120 -60 0 60 120 180

ClCCCl (grados)

Cl

Cl

ClCl

Cl

Cl

ClCl

Puntos estacionarios de la superficie.

i

iR

VF

)(R

De la superficie de energía potencial se puede deducir las fuerzas que sienten

los átomos.

• Hay puntos (un conjunto de coordenadas determinado) en la superficie

para los que las fuerzas que sienten todos los átomos es cero

o

la derivada de V con respecto a cada una de las coordenadas es cero .

A estos puntos se les denomina puntos estacionarios.

Sobre dos dimensiones pueden ser:

* Mínimos

* Máximos

* Puntos de Silla

0

2

4

6

8

10

-180 -120 -60 0 60 120 180

ClCCCl (grados)

DEconfDE‡

Cl

Cl

ClCl

Cl

Cl

ClCl

HaHb + HcHa + HbHc

Rbc0.74 Å

Rab2.2 Å

Reactivos

Rab0.74 Å

Rbc2.2 Å

Productos

HaHb + HcHa + HbHcRab

Rbc

Rab 0.93 Å

Rbc0.93 Å

HaHb + HcHa + HbHc Camino de Reacción

2,9 Å

1,9 Å

Y C

H

HH

X-2,9 1,9

2,1 Å

2,3 Å

-

2,3 2,1 Y C

H

HH

X

1,6 Å

3,2 Å

C

H

HH

X-Y1,6 3,2

c.r.

E (Kcal/mol)

Er 6 kcal/mol

Ea 11 kcal/mol

• Los mínimos nos indican las coordenadas para las que tenemos estructuras

estables.

Importancia de los mínimos

Importancia de los puntos silla

• Para pasar de reactivos a productos hay que pasar cerca del punto silla.

• La estructura del punto silla corresponde a la del estado de transición

• La velocidad de una reacción va a depender de la diferencia de energía entre

el mínimo correspondiente a reactivos y el punto silla.

• La diferencia de energía entre el mínimo y el punto silla es la barrera de

potencial.

• Une los reactivos con los productos a través del estado de transición.

Camino de reacción:

• Camino a través de la superficie de potencial que une dos mínimos y pasa por

un punto silla.

V(R) Eele(R)VNN(R)

Cálculo de la energía potencial.

• Se puede obtener dentro de dos

metodologías generales

- Mecánica Cuántica (QM)

- Mecánica Molecular (MM)

Mecánica Cuántica (QM)

- Se resuelve la ecuación de Schrödinger

- Hay muchos métodos y se diferencian en las aproximaciones utilizadas

para resolver la ecuación de Schrödinger

- En general son mas exactos que los métodos MM.

- En general son mas costosos computacionalmente que los métodos MM

H ele(R)ele(R) Eele(R)ele(R)

Mecánica Molecular (MM)

- Calculan cuanto cambia la energía de la molécula cuando modificamos las

coordenadas de los átomos.

- Dependiendo del método los términos energéticos pueden ser diferentes, pero

en general los mas usados son:

V Venl

enlaces

Vang

ángulos

Vdie

diedros

Vele

electrostaticas

Vvdw

vdw

Venl 1

2kenl(bbenl)

2

kenl y benl son parámetros que dependen de tipo de enlace.

Por ejemplo todos los enlaces CC tendrán los mismos valores de estos

parámetros

C Cb

El enlace es como un muelle con una constante de fuerza igual a kenl

y una distancia de equilibrio de benl

Vdie 1

2kdie 1 cos n

Vang 1

2kang( ang)

2

Vele qiq j

40rij

Vvdw 4ij

ij

rij

12

ij

rij

6

0

1

2

3

4

5

6

0 60 120 180 240 300 360

Ángulo de Torsión

VtorsiónVdie

Venl 1

2kenl(bbenl)

2

Vdie 1

2kdie 1 cos n

Vang 1

2kang( ang)

2

Vele qiq j

40rij

Vvdw 4ij

ij

rij

12

ij

rij

6

Parametros Variable

kang ang (ángulo formado

por tres átomos)

kdie n (ángulo diedro

formado por 4

átomos)

qi qj rij (distancia entre

dos átomos i y j)

ij ij rij(distancia entre

dos átomos i y j)

• Es un método muy aproximado

• No se puede utilizar para estudiar reacciones químicas.

• Es un método barato computacionalmente.

• Se utiliza mucho en el estudio de proteínas.

Programa a usar:

Chem3D