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Isolation(culture)Agarplate/coloniesLiquidmediatesttubebulk

Identification&taxonomyFamilyGenusSpeciesTypeStrain

Biochemical(physiological)testsMoleculartests

DNADNAhomology16SrRNAsequencingChemicalprofiling

NonculturebaseddetectionPolymerasechainreaction(PCR)Agglutination(antigendetection)StainSerology(antibodydetection)

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Familia:grupodegnerosrelacionados. Gnero:grupodeespeciesrelacionadas. Especies:grupodecepasrelacionadas. Tipo:grupodecepasdentrodeunaespecie(e.g.biotipos,

serotipos).

Cepa:unorganismoaisladodentrodeunaespecieenparticular.

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Relacinentrecaractersticafisiolgicayfuncincelular Relacinentrelasactividadesquellevanacaboensu

ambientenatural

Relacinconlostrayectosmetablicosmicrobianos

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FermentacindeAzcares

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Utilizacindecompuestosorgnicoscomofuentedecarbonoyenerga

Catabolismooxidacindemolculasorgnicasparaproducirenerga

Fermentacin Respiracin

Anabolismoutilizacindeenergaparasintetizarmaterialcelular

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Bacteriasoxidativas

Molculadeazcarserompecompletamente

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Oxidacinparcialdeuncompuestoorgnicoutilizandointermediariosorgnicoscomodonantesyaceptadoresdeelectrones

TodoelATPesproducidoporfosforilacina

niveldesustrato

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Homolctica Lactobacillus,LactococcusylamayoradelosStreptococcus

Mixta MayormenteEnterobacteriaceae Produccindecidolctico,actico,frmico,succinatoyetanol

Butanediol Klebsiella,Enterobacter

cidobutrico Clostridia cidoactico,CO2yH2

Butanolacetona Clostridiumacetobutylicum

cidoproponico PropionibacteriumandBifidobacterium

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Glucosa Lactosa Manitol Inositol Sorbitol Ramnosa Melibiosa

Amigdalina Adonitol Arabinosa Dulcitol

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Importanteenlaidentificacindebactericasentricas

comolasEnterobactericeae

Fermentadorasdelactosa:Escherichia,Klebsiella,Enterobacter

Nofermentadoras:Salmonella,ProteusyShigella

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Aerbicosyfacultativosanaerbicos Gramnegativo Noformadoresdeesporas Formadebacilo Fermentanlactosa,conproduccindecidoygasdentro

de48hra35oC

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ProduccindecidosrojofenolcomoindicadordepH

TuboDurhamproduccindegas Pruebasdefermentacinen:

glucosa,lactosaymanitol

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Tresazcares:glucosa,lactosaysucrosa

RojofenolcomoindicadordepH

ContienehierropermitedetectarlaproduccindeH2Sapartirdeamino

cidos

Puededetectarseproduccindegas

A.Salmonellasp.

B.EscherichiacoliC.Unknown

D.Proteusmirabilis

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Deteccindeactividadesenzimticasbacterianas ONPGsustratoartificialanlogodelalactosa Ureacompuestonitrogenadosencillo Casenaprotenaprincipaldelaleche Gelatinaprotenaderivadadelcolgenoanimal Almidnpolisacridodeorigenvegetal Lpidosograsas

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Produccindegalactosayonitrofenol

Amarilloencondicionesalcalinas

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UreasaatacaenlaceentrecarbonoynitrgenoprociendoCO2,aguayamonaco

Rojofenol

Urea

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PruebatilparadistinguirProteusdeotrasbacteriasentricasGram

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Protenapredominanteenlaleche Protenamuygrandeparapasarporlamembranapero

algunasbacteriasliberancaseinasaquedegradala

protenaeincorporanlosaminocidosqueseliberan

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Bacteriaspuedenproducirlaexoenzimagelatinasa,querompelaestructuradelagelatinaylalica

Lacapacidaddeunabacteriadeproducirgelatinasasepuedecorrelacionarconelgradodepatogenicidadovirulencia,yaquelaenzimapermitemoverseatravsdeltejidoconectivoenelcuerpo.

Unapruebagelatinaseevalaobservandolaconsistenciaenfro

SeutilizaparadiferenciarentreS.aureusyS.epidermidis

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Algunasbacteriaspuedenproduciramilasa,produciendodextrinas,glucosaymaltosa

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Produccindelipasasparaproducircidosgrasosyglicerol

PruebasellevaacaboenagarSpiritBluequetieneunindicadordepH.LahidrlisisbajaelpHocurriendouncambiodecoloraazulintenso

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ParalosbacilosGramnegativos Indol Rojometilo(MR) VogesProskauer(VP) Citrato(C)

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Hidrlisisdetriptfanoproduciendoindol,cidopirvicoyamonaco

Elindolseacumulaenelmedioporquenoestilalabacteria

SeaadereactivodeKovacquereaccionaconelindolproduciendouncompuestorojizorosado

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Pruebaparalafermentacinmixtapresenciadecidosacticos,lactico,frmicoysuccnico

Laadicinderojodemetilo,quedistinguegradosdeacidez:amarilloapH8,incoloroapH7yrojoapHde4

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Produccindealcoholy2,3butanodiolenlugardecidosapartirdeunazcar

EspeciesdeEnterobacterySerratiayalgunasGrampositivocomoBacillus

Semideacetonaqueesunprecursorde2,3butanodiol Luegodeperododeincubacinseaadeelreactivode

Barrit:alfanaftol5%yKOH40%enalcoholabsoluto Pruebapositivaeslaformacindeuncomplejorojo

rosado

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Algunasbacteriaspuedenutilizarcitratocomonicafuentedecarbonoencondicionesaerbicas

LapermeasadecitratopermiteeltransportedecitratoalinteriordelaclulaylaenzimacitrasaconvierteelcitratoencidopirvicoyCO2

Mediocontienecitratodesodio,salesdeamonioyazulbromotimolcomoindicadordepH

ElCO2liberadosecombinaconelsodioyaguayformancarbonatodesodioqueesalcalinocambiandoelbromotimoldeverdeaazulintenso

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TSITripleSugarIronAgar SIMSulfideIndoleMotility

FermentacindeazcaresyproduccindeH2S

ProduccindeH2Symotilidad

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Remocindelgrupoaminodefenilalaninaporfenilalanasaproduciendocidofenilpirvico

Diferenciaentregnerosdeenterobacterias Seaadesolucin10%clorurofrrico

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RemocindelgrupocarboxilodelosaminocidosqueproducenaminasyCO2

Seutilizancaldosquecontienenelaminocidocorrespondiente,glucosayunindicadordepHcomobromocresolvioleta

Seaadeaceitemineralparacrearcondicionesanaerbicas Loscidosproducidosporlafermentacinactivala

decarboxilasaqueproducenaminasalcalinasqueneutralizanelmediolocualcambiaelmediodeamarillo(cido)avioleta

Pruebanegativamedioamarillo

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Pruebaquecombinadiferentesreacciones Fermentacindeazcares

Lactosa

Reaccionesdehidrlisis Casena

Lechedesnatadaal10%conlitmus(azolitmin)comoindicadordepH

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Bacteriasquimioorganoheterotrficasutilizanelnitratocomoaceptadorfinaldeelectronesduranterespiracinanaerbica

NO3+2e+2H+NO2+H2O

Relacinalciclonitrgeno Elmediodecultivocontieneextractodecarne,peptonay

nitratodepotasio(KNO3)

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Serequierelaadicindecidosulfanlico(A)ydimetilnaftilamina(B)

Sedetectalapresenciadenitrito

Pruebapositivacolorrojo

SeconfirmapruebanegativaconZn

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Detectalaproduccindeunaenzimaquecoagulalasprotenasdelasangre

Sehaceenmedioquetieneplasma

TpicadelasGrampositivo

S.aureus

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Detectapresenciadedeoxiribonucleasa

PruebatpicaparacocosGrampositivo

TpicodebacteriaspatgenasquerompenDNAenclulasdelhospedero

EltintesepegaalascargasnegativasdelDNA;ausenciadeltinte,ausenciaDNA

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DetectapresenciadecatalasaoperoxidasaquerompeelperxidoenaguayO2

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Pruebarepresentativadelosprocesosaerbicospropiosdebacteriasoxidativas

BacteriasoxidativasenergaapartirdecompuestosorgnicosutilizandooxgenoyliberandoCO2yagua

Lasoxidasassonenzimasimportantesenlacadenadetransportedeelectronesduranterespiracinaerbica

Pruebaimportanteparadistinguirciertosgruposdebacterias Pruebarequiereelusodetetrametilpfenilendiaminaque

reaccionanhaciauncolorazuloscuroalreaccionarconlacitocromacoxidada

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Lasenterobacteriassonoxidasanegativa

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API20E

EnterotubeII

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Pruebasrpidas:sistemaparalaidentificacinbioqumicadeEnterobacteriacaeyotrasbacteriasGramneg.

Consistedetirasplsticascon20uldesustratosdeshidratadosqueseutilizanparadetectarcaractersticasbioqumicas.

Lossustratossoninoculadosconcultivospurossuspendidosensalina.

Luegodeunperodode5hr24hrslas20pruebassonconvertidasaunalecturade79dgitos.

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LimitadoabacteriasGram,oxidasaneg

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ONPG(galactosidase);ADH(argininedihydrolase);LDC(lysinedecarboxylase);ODC(ornithinedecarboxylase);CIT(citrateutilization);H2S(hydrogendisulphideproduction);URE(urease);TDA(tryptophandeaminase);IND(indoleproduction);VP(VogesProskauertestforacetoin);GEL(gelatinliquefaction);thefermentationofglucose(GLU),mannitol(MAN),inositol(INO),sorbitol(SOR),rhamnose(RHA),sucrose(SAC);Melibiose(MEL),amygdalin(AMY),andarabinose(ARA);andOI(oxidase).

positive

negative

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OI0

ARA22+AMY0

MEL4+

SAC27+RHA1+

SOR4+INO05

MAN1+

GLU4+GEL04VP0

IND4+TDA04

URE0

H2S0CIT01 ODC1+

LDC4+ADH05ONPG1+

normal7digitcode5144572=E.coli

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EnterotuboIIenterobacteriasoxidasaneg EntericTek Oxi/FermGramNegativeRodsIdentificationpara

bacteriasoxidasaposyoxidasaquenofermentanglucosa

APIStaphIdentpara13especiesdeestafilococos

Biolog MicroIDenterobacteriasoxidasaneg Minitek