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PRUEBAS DIAGNÓSTICAS EN VIH/SIDA- parte 3
CARLOS ALVAREZ. MD.DTMH
Otras pruebas…
• Saliva: • OraSure:
– S: 99.24%– E: 99.89%
• Orina– Calypte– S: 99% – E: 94%
GUIA PARA EL MANEJO DE VIH / SIDABasada en la Evidencia
COLOMBIA
2006
•Diagnóstico en embarazo:– Ofrecimiento y realización de la prueba
recomendada con consentimiento para aceptación o rechazo.
– Indicaciones de repetición en tercer trimestre.– Uso de pruebas rápidas– Recomendaciones de interpretación
GUIA PARA EL MANEJO DE VIH / SIDABasada en la Evidencia
COLOMBIA
2006
•Detección en el Hijo de Mujer Infectada :– Indicaciones de carga viral.– Flujograma de diagnóstico con pruebas de
detección de ácidos nucleicos e interpretación.
GUIA PARA EL MANEJO DE VIH / SIDARecomendaciones Prueba de genotipificación
• No ordene pruebas de genotipificación en pacientes con problemas activos de incumplimiento, intolerancia, o inconsistencia en la toma de medicamentos (III A).
• Siempre confirme fracaso virológico y carga viral mayor a 1000 copias antes de ordenar una prueba de genotipificación (II A).
• La prueba de genotipificación debe realizarse en pacientes que se presentan con un segundo o tercer fracaso terapéutico previa autorización de experto en enfermedades infecciosas o VIH-SIDA (I B).
GUIA PARA EL MANEJO DE VIH / SIDARecomendaciones Prueba de genotipificación
• La prueba de genotipificación debe interpretarse con la participación de un experto en enfermedades infecciosas o en VIH-SIDA (I B).
• La conducta que se derive de la información de las pruebas de genotipificacion debe ser siempre supervisada por un experto en enfermedades infecciosas o en VIH-SIDA (IIIA).
• El paciente debe estar consumiendo el régimen que fracasa en el momento en que se le toma la muestra para la prueba de genotipificación o dentro de las dos a cuatro semanas posteriores a su suspensión (II B).
Mutaciones relacionadas con la resistencia a las drogas antiretrovirales
L10I K20M D30N M36I M46I G48V I54V V82A I84V N88D L90M
Saquinavir
Indinavir
Nelfinavir
Ritonavir
Amprenavir
Mutaciones primarias Mutaciones secundarias Polimorfismos
Inhibidores de la Proteasa
www.hiv-web.lanl.gov
Genotipo: predicción de resistencia
1 6 11 16 21 26 31 36 41 46 51 56 61 66 71 76
SI
NOTodos los virus con L90Mdeberían tener resistenciauniforme a saquinavir M
agn
itu
d d
e re
sist
enci
a a
dro
gas
HIV obtenidos de 78 pacientes
Fenotipo: medida directa de resistencia
1 6 11 16 21 26 31 36 41 46 51 56 61 66 71 76
HIV obtenidos de 78 pacientes
Mag
nit
ud
de
resi
sten
cia
a d
rog
as
1,000
100
10
1
0
Fenotipo: medida directa de resistencia
1 6 11 16 21 26 31 36 41 46 51 56 61 66 71 76
HIV obtenidos de 78 pacientes
Mag
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1,000
100
10
1
0
Punto de cortede sensibilidad
40% de virus con L90M permanecen
sensibles a saquinavir
Ensayo Fenotípico: ANTIVIROGRAM
PACIENTE
PLASMA(> 200 µl)
RNA cDNAPR/RT GENES
(amplicones)
Aislamiento del gen PR/RT
extración RT PCR
Plásmido con genoma VIH (excep PR/RT)
Virus WT
PRORT
Delección PRO& RTgenes
Clon proviral deleccionado
Susceptibilidad del ensayo
Transfección del gen (Electropor)
(MT4)
VR
SUSCEPTIBILIDAD
Sensible: IC50 4< Cepa Ref
Parc.Res:IC50 4-10 > Cep.Ref
Resistente: IC50 +10> Cep.Ref
MÉTODOS GENOTÍPICOS: Secuenciación
Plasma Extracción RNA viral
RT-PCR
cDNA
Amplicones
Cebador marcado para replicación
Cadena a secuenciar
4 mezclas de reacción que incluye cada uno de los diferentes ddNTP
que paran la replicación
Productos de la reacción de replicación
Separación de productos por electroforesis
Electroferograma
Algoritmos
• Trugene HIV-1 Report Generator (Visible Genetics).• Retrogram Software v 1.2 (Viroloy Networks) • ANRS AC11 v 2.000 • Detroit Medical Center, Grupo de Aconselhamento Virológico, CHL
V3.2, Rega v 5.0 (estos 5 accesibles a través de la empresa Advanced Biological Laboratories, SA)
• Resistance Collaborative Group, Stanford University HIV Database (estos 2 accesibles a través de Beta Test HIV Algorithm Comparison, Stanford University)
• ADRA (Los Alamos Resistance Database)• Geno2phenosense(Arevir, Analyse Von Resistenzmutatione bei HIV).
VirtualPhenotype® - Cómo funciona
Informacióngenotípica
Informaciónfenotípica
Información de VirtualPhenotype (media del fenotipo)
> 85.000 > 45.000
>35.000 muestras comprobadas
Secuencia(pregunta a la base de
datos)
RESISTANCE ANALYSIS
vircoTYPE REPORT
vircoTYPE page 1
Page 2: Details
Informe deInforme de Virtual VirtualPhenotypePhenotype®®
Fármaco
Nombre comercial Nombre genérico
Pares en base de datos
Proporción de muestras iguales:
En rango normal de susceptibilidad 2
Por encima de rango normal de susceptibilidad 2
Por encima de rango normal de susceptibilidad, pero por debajo de valor clínico de corte 2, 3, 4
Zidovudina
Lamivudina
Didanosina
Zalcitabina
Estavudina
Abacavir
Tenofovir DF
Nevirapina
Delavirdina
Efavirenz
Un componente de Kaletra®
Veces de cambio en la IC50
(corte para el rango normal de susceptibilidad)
¿Qué es mejor?¿Qué es mejor?
FFenotipo realenotipo real:: - Prueba real- Prueba real- Alta variabilidad intraprueba- Alta variabilidad intrapruebaCosto !!Costo !!
GenotipoGenotipo:: - Interpretación compleja- Interpretación compleja
Fenotipo virtualFenotipo virtual:: - Medida de probabilidad estadística- Medida de probabilidad estadística- Mayor precisión- Mayor precisión- Problema en la definición de veces - Problema en la definición de veces significativas: biológicos y clínicos significativas: biológicos y clínicos
Mutaciones relacionadas con la resistencia a las drogas antiretrovirales
www.iasusa.org
www.iasusa.org
www.iasusa.org
www.iasusa.org