Simulación de crecimiento celular en tumores

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Autora: Vanessa Garca GarcaDirector: R. Javier Prncipe RubioEspecialidad: Biomdica

Simulacin de crecimiento celular

en tumores

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Tumor

Simulacin de crecimiento celular en tumores

Simulacin

Modelo

3TFG

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Tumor


4TFG

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Tumor


benigno maligno

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Tumor


glioma sarcoma carcinoma linfoma/mieloma

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regulacin de seales

reparacin ADN

apoptosis

Mecanismos supresores

7 Inhibicin mecanismos supresores

Anaplasia

Angiognesis

Metstasis

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Caractersticas

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Simulacin

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In vitro

In silico

Entrada de

parmetros

Validacin de

resultados

In silico: de computadora

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CA (autmata celular ) dinmicodiscretolocal

ABM (modelo basado en agentes)comportamiento yobjetivos propios

local + globalToma de decisiones

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Requisitos

Anlisis

DiseoImplementacin

Prueba

Evaluacin

prototipo#01

prototipo#02

prototipo#03

Modelo espiral + prototipo

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Requisitos

Condiciones mitosis

Mecanismos supresores

Vecindad

Herencia

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Requisitos

Anlisis

DiseoImplementacin

Prueba

Evaluacin

prototipo#01

prototipo#02

prototipo#03

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M1 ausencia sigGo

M2 ignora inhibidores

M3 evasin apoptosis

M4 inmortalidad telmero

M5 inestabilidad gentica

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Simulacin de crecimiento celular en tumoresSimulacin de crecimiento celular en tumores

Marcadores genticos

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Apoptosis (fallo reparacin ADN) = 1/1.000 Largo telmero = 100 Mutacin = 1/100.000

Evasin apoptosis = 1/10 Ignorar inhibidores sigGo = 1/10 Inestabilidad gentica = 1/100

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Datos iniciales

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Requisitos

Anlisis

DiseoImplementacin

Prueba

Evaluacin

prototipo#01

prototipo#02

prototipo#03

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Diagrama del modelo

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Requisitos

Anlisis

DiseoImplementacin

Prueba

Evaluacin

prototipo#01

prototipo#02

prototipo#03

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MatLab (www.mathworks.com)

GNU Octave (www.iprium.com)

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Modelo

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Requisitos

Anlisis

DiseoImplementacin

Prueba

Evaluacin

prototipo#01

prototipo#02

prototipo#03

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Rejilla de 25x251 clula sana inicial40 ciclos

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Rejilla de 50x503 clulas sanas (amarillo)2 clulas mutadas (azul)40 ciclos

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Rejilla de 50x501 clula mutada40 ciclos

Can clulas mutadasAzul oscuro clulas muertas

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Rejilla de 50x501 clula mutada75 ciclos

Can clulas mutadasAzul oscuro clulas muertas

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Can clulas mutadasAzul oscuro clulas muertasNaranja clulas sanas

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Tiempo transcurrido Nmero de ciclos efectuados Estado de las clulas en cada intervalo Condiciones mitosis Posicin de la clula progenitora e hija Motivo apoptosis Herencia

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Salida de resultados

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Requisitos

Anlisis

DiseoImplementacin

Prueba

Evaluacin

prototipo#01

prototipo#02

prototipo#03

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Rejilla de 25x251 clula sana250 cicloss-1

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Rejilla de 25x251 clula mutada250 cicloss-1

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Rejilla de 50x502 clulas sanas 3 clulas mutadas 25 ciclos

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Conclusiones

El crecimiento celular es de tipo Gompertz, tal y como se ha demostrado en otros estudios

El ritmo de proliferacin de las clulas tumorales es mayor al de las clulas sanas, as como su tasa de mortalidad

Las clulas tumorales tienen una capacidad de carga mucho mayor que las clulas sanas


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Concepto Uds Precio

Programadora junior

365 h 2.555

Software Octave MatLab

Licencia GNU/GPL Licencia estudiante (sin complementos)

0

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PC (laptop) CPU P8700 @ 2'53GHz x 24GB DDR3-1066 MHzNVIDIA GeForce G 105M

599

otros 21,75

TOTAL 3210,75


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Implementar en Pandora/GPL (en curso) Aadir protenas sintetizadas y rutas metablicas Simular seales del medio extracelular Distinguir diferentes regiones dentro del tumor Aadir capacidad angiognesis y metstasis

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Mejoras


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GRACIAS POR VUESTRA ATENCIN

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