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Universidad Nacional Autónoma de México Curso de Genética y Biología Molecular Licenciatura Química Farmacéutico Biológica (1630) Química en Alimentos (0144) (Optativa) Facultad de Química Dra. Herminia Loza Tavera Profesora Titular de Carrera Departamento de Bioquímica Laboratorio 105, Edificio E 5622-5280 [email protected]

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Universidad Nacional

Autónoma de México

Curso de Genética y Biología Molecular

Licenciatura

Química Farmacéutico Biológica (1630)

Química en Alimentos (0144) (Optativa)

Facultad de Química

Dra. Herminia Loza TaveraProfesora Titular de Carrera

Departamento de BioquímicaLaboratorio 105, Edificio E

5622-5280

[email protected]

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VII. REGULACIÓN DE LA

EXPRESIÓN GENÉTICA

• Objetivo general

– El alumno identificará los diferentes mecanismos

que operan en la regulación de la expresión

genética en procariontes y eucariontes

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Objetivos particulares

El alumno... Conoci-

miento

Compren-

sión

Aplica-

ción

2. Regulación

genética en

eucariontes

2.1. Reconocerá la importancia de los eventos epigenéticos en

determinar la expresión génica y el fenotipo.X

2.2. Comprenderá los procesos de acetilación/desacetilación de

histonas como eventos que modifican la estructura de la

cromatina y la expresión génica.

X

2.3. Conocerá los efectos de la metilación del DNA sobre la

expresión génica.X

2.4. Conocerá las características de los factores de

transcripción y su papel en la regulación de la expresión

genética.

X

2.5. Conocerá el papel de las hormonas esteroides en la

regulación de la expresión genética.X

2.6. Conocerá la importancia del control post-transcripcional de

la expresión genética mediada por microRNAs.X

2.7. Reconocerá la biogénesis de los microRNAs, desde su

transcripción hasta la formación del RNA dúplex asimétricoX

2.8. Comprenderá los mecanismos de regulación post-

transcripcional mediados por microRNAsX

2.9. Aplicación técnica: Técnicas para evaluar la expresión

genética: Microarreglos, RT-PCR cuantitativo.X

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El alumno identificara los

diferentes mecanismos que

operan en la regulación de la expresión genética en eucariontes

Objetivo general

Regulación genética en eucariontes

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Development 2012 139: 397-410; doi: 10.1242/dev.065581

Desarrollo de meloncitos en relación con tejido nervioso

“Garantizar que el gen

correcto se active en la

célula correcta en el momento correcto”

Regulación genética en eucariontes

Los mecanismos de

regulación génica son los

encargados de la

diferenciación celular

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Puntos de regulación de la expresión genética en eucariontes

Remodelación de la cromatina1.

Transcripción2.

Procesamiento de RNA3.

Estabilidad del 4. mRNA

Traducción5.

Modificaciones post6. -traduccionales

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Reclutamiento de la maquinaria de transcripción en eucariontes

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

Remodeladores• de la cromatinaModificadores de •

nucleosomasFactores de •

transcripción basalesProteínas que •

estimulan el inicio y la elongación

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Alteraciones en la estructura de la cromatina inducidas por los activadores

Watson et al., (2014) Molecular Biology of te Gene, 7th edición.

La expresión genética

en eucariontes

requiere de cambios

en el estado de

condensación de la cromatina

Desacetilasas de

histonas (HDACs)

Complejos

remodeladores de cromatina(SWI/SNF)

Acetilasas de histonas (HATs)

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Código epigenético

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

Se llama la regulación epigenética a

la herencia de los patrones de

expresión génica en ausencia de una

señal de iniciación.

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Silenciamiento transcripcional: formación de heterocromatina

Watson et al., (2014) Molecular Biología of te Gene, 7th edición.

Tinción de DAPI que muestra las regiones de

heterocromatina en el genoma de Arabidopsis

El silenciamiento es un efecto de posición. Un gen es silenciado por el lugar

donde se encuentra, no en respuesta a una señal ambiental.

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Silenciamiento de un gen por metilación del DNA

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

En ocasiones un gen debe estar

completamente apagado, algunas

veces de forma permanente. Esto

se logra a través de la metilación

del DNA y modificación de los

nucleosomas locales.

5-metilcitosina

MeCP2

Estado no modificado de un gen

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Los patrones de la metilación del DNA se mantienen a través de la división celular

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

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Reclutamiento de la maquinaria de transcripción en eucariontes

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

Remodeladores• de la cromatinaModificadores de •

nucleosomasFactores de •

transcripción basalesProteínas que •

estimulan el inicio y la elongación

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Regulación de la expresión genética a nivel

TRANSCRIPCIONAL

Activadores

Factores de transcripción basal

Coactivadores

Represores

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Promotor Basal: secuencia de nucleótidos necesaria para la fijación de la

RNA polimerasa.

Secuencias reguladoras:

A) Intensificadoras (enhancers): secuencias que estimulan la transcripción

y cuya localización puede ser a miles de nts de distancia "río arriba o abajo"

del promotor

B) Silenciadoras (silencers): secuencias que inhiben la transcripción.

También pueden hallarse muy distantes del promotor.

Factores basales de transcripción: complejo proteico que interacciona con

el sitio promotor. Son esenciales para la transcripción pero no la pueden

aumentar o disminuir.

Factores específicos de la transcripción: complejo de proteínas

reguladoras que pueden ser activadoras o represoras.

A) Proteínas activadoras: interaccionan con las secuencias

intensificadoras del gen (enhancers).

B) Proteínas represoras: interaccionan con las secuencias silenciadoras

del gen (silencers).

Regulación de la expresión genética a nivel TRANSCRIPCIONAL

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Regulación de la expresión genética de la levadura al humano

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

En los organismos multicelulares hay mas secuencias reguladoras en

un gen típico que reflejan la amplia integración de señales necesarias

para regular un gen determinado.

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Los activadores son proteínas de unión a DNA

El dominio de unión a DNAy el dominio activador están separados o en polipéptidos

diferentes

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

El dominio activador es clasificado por su contenido de aminoácidos, ya que mantiene una función adhesiva

entre proteína - proteína

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Los activadores tienen dominios de activación y de unión a DNA

separables

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

Experimento de cambio de dominio

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Interacción de los dominios de unión a DNA con secuencias de DNA específicas

Los dominios de unión a DNA en eucarionte

son en su mayoría heterodímeros

Homeo-dominio Dedos de Zinc

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

La hélice de reconocimiento hace contacto con el surco mayor del DNA y reconoce pares de bases específicas. La otra hélice hace contacto con el esqueleto del DNA posicionando la hélice de reconocimiento adecuadamente y aumentando la fuerza de unión.

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Interacción de los dominios de unión a DNA con secuencias de DNA específicas

Zipper de leucina Hélice-vuelta-hélice

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

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Los aisladores bloquean la activación inespecífica de los promotores

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

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Los activadores se unen de manera sinérgica y cooperativa para inducir la transcripción

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

Unión cooperativa a través de

la interacción directa

Efecto indirecto en el que la unión de una

proteína en el DNA dentro de nucleosomas

ayuda a la unión de una segunda proteína.

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Los activadores se unen de manera combinatoria para inducir la transcripción

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

Cada gen tiene una combinación particular de intensificadores y silenciadores.

Genes distintos pueden compartir secuencias idénticas de intensificadores y

silenciadores, pero no existen dos genes que posean la misma combinación de estas secuencias reguladoras.

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Los represores de eucariontes trabajan de distintas maneras

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

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El represor Mig1 esta involucrado en el control

de los genes GAL de la levadura S. cerevisiae

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Reclutamiento de la maquinaria de transcripción en eucariontes

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

Remodeladores• de la cromatinaModificadores de •

nucleosomasFactores de •

transcripción basalesProteínas que •

estimulan el inicio y la elongación

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Proteínas que promueven el inicio o elongación de la transcripción

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

TFIIH

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Regulación por hormonas

Los seres vivos coordinan

la regulación de la

expresión genética a

través de sistemas de

señalización complejos.

Las hormonas son

mensajeros químicos que

median las señales

intercelulares.

Tipos de hormonas

Componentes

Hormonas peptídicas

Cadenas cortas de amino

ácidos.

Hormas proteicas

Cadenas largasde amino

ácidos.

Hormonas esteroideas

Derivadas del colesterol.

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Receptores a • estrógenos,

progesterona, testosterona

Receptores a glucocorticoides •

(cortisona, hidrocortisona,

dexametasona)

Receptores a • acido retinoico, y

Vitamina D

Regulación por hormonas

esteroideasLas hormonas esteroides son moléculas pequeñas derivados de

colesterol solubles en lípidos. Debido a su naturaleza lipídica, tienen

poco o ningún problema para pasar a través de las membranas

celulares.

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Regulación de la expresión génica por

hormonas esteroideas La hormona interactúa con un receptor dentro de su célula blanco. En

este ejemplo, el receptor se encuentra en el citoplasma (receptor

nuclear tipo I), otros receptores de hormonas esteroides se encuentran

en el núcleo (receptor nuclear tipo II).

Principles of Genetics 6th Edition, D. Peter Snustad Michael J. Simmons 2012

1. Las hormonas esteroideas entran a la célula blanco y se unen con un receptor, el complejo del receptor de esteroides/hormona se mueve hacia el núcleo.

2. El complejo hormona/receptor de esteroides se une al elemento de respuesta a hormona en el DNA.

3. La unión del complejo estimula la transcripción.

4. El mRNA transcrito es procesado y transportado al citoplasma.

5. El mRNA es traducido a proteínas.

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Receptor a Glucocorticoides (GR)

Receptor a Glucocorticoides (GR)

El ligando que estimula

(cortisol) es liposoluble

y entra a la célula.

El GR se encuentra en

complejo inactivo con

Hsp y es liberado por el

ligando.

Entra a núcleo donde

se dimeriza y actúa

sobre sus elementos de

respuesta estimulando

la transcripción de

genes específicos.

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Las hormonas peptídicas y las hormonas proteicas son péptidos o

proteínas que tienen un efecto sobre el sistema endocrino de los animales.

Las hormonas peptídicas son solubles en agua y actúan en la superficie de

las células diana a través de segundos mensajeros, para transmitir el

mensaje a través de las membranas plasmáticas de las células blanco

para regular la expresión de genes en el núcleo.

Regulación por hormonas

peptídicas

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Regulación de la expresión génica por

hormonas peptídicas

Principles of Genetics 6th Edition, D. Peter Snustad Michael J. Simmons 2012

1. La hormona (una señal extracelular) se unen a un receptor en la membrana de la célula blanco.

2. El complejo hormona/receptor activa una proteína citoplasmática.

3. La proteína citoplasmática activada desencadena una cascada de cambios que transmiten la señal en el núcleo.

4. La señal induce que un factor de transcripción se una al DNA.

5. El factor de transcripción unido al DNA estimula la transcripción de genes particulares.

6. El mRNA transcrito es procesado y transportado al citoplasma.

7. El mRNA es traducido a proteínas.

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Regulación de la expresión génica por

hormonas peptídicas

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El RNA no es sólo funcional como un mensajero entre el DNA y las proteínas, también participa en la regulación de la expresión génica.

Regulación de la expresión por RNAs

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Presencia de RNA de doble cadena •

(por virus, RNA anti- sentido, etc.)

Se generan siRNAs de • 21 nt por

corte con DICER

Se forma RISC cargado con siRNA •

y varias proteínas incluyendo

ARGONAUTA

RISC dirige el siRNA a su mRNA •

blanco con el cual forma

complementariedad PERFECTA y

promueve el corte y degradación

de este mRNA

Regulación por siRNAs

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

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Los miRNAs se transcriben por •

la RNA polimerasa II como

transcritos primarios y son

procesados por DROSHA en el

núcleo

Luego son exportados al •

citoplasma y son cortados por

DICER a tamaño de 21 nt

Los miRNAs son tomados por •

RISC con ARGONAUTA y son

dirigidos a sus mRNA blanco

con los cuales muestran

complementariedad

IMPERFECTA generalmente en sus regiones 3’UTR

RISC cargado con miRNAs •

dirige la inhibición traduccional

de los mRNAs blanco

Regulación por miRNAs

Watson et al., (2014) Molecular Biology of the Gene, 7th edition.

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Control transcripcional

Factores de • transcripción

Grado de • condensación de la

cromatina

Grado de • metilación del ADN

Control post-transcripcional

Splicing alternativo

Capping

Poliadenilación

Control transporte del mRNAMecanismos que determinan si el

mRNA maduro sale o no a citosol

Control traduccional

Mecanismos que determinan si el

mRNA presente en el citosol es o no

traducido

Control de la degradación del mRNAMecanismos que determinan la

supervivencia del mRNA en el citosol

Control de la actividad proteica

Mecanismos que determinan la

activación o desactivación de una

proteína, así como el tiempo de

supervivencia de la misma

Resumen