UNIVERSIDADDE PANAMÁ FACULTAD DE …maestriaencienciasbiologicas.weebly.com/.../plandeestudio2015-2016.pdfempresariales vinculadas a las tecnologías de avanzada. 5. Incrementar la

UNIVERSIDAD DE PANAMÁ FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES, EXACTAS

Y TECNOLOGÍA

VICE-RECTORIA DE INVESTIGACIÓN Y POSTGRADO

MAESTRÍA EN CIENCIAS BIOLÓGICAS

Panamá, Agosto de 2014

CONTENIDO 1. Antecedentes .................................................................................................................... 3 2. Título del Programa y Grado ........................................................................................... 4 3. Duración del Programa .................................................................................................... 4 4. Justificación ..................................................................................................................... 4 4.1. Razones generales ............................................................................................................. 4 4.2. Biología Molecular ........................................................................................................... 5 4.3. Biodiversidad y Conservación .......................................................................................... 6 5. Elementos fundamentales del currículum ........................................................................ 6 5.1. Objetivos del Programa .................................................................................................... 6 5.1.1. Objetivos generales: .......................................................................................................... 6 5.1.2. Objetivos específicos: ....................................................................................................... 7 6. Perfil del Egresado ........................................................................................................... 7 7. Estrategias Metodológicas ............................................................................................... 8 8. Plan de estudio ................................................................................................................. 8 8.1. Estructura del Programa de Maestría ................................................................................ 8 PROPEDEUTICO.......................................................................................................... 10 TRONCO COMUN ........................................................................................................ 10 ORIENTACIÓN EN BIOLOGÍA MOLECULAR ......................................................... 11 ORIENTACIÓN EN BIODIVERSIDAD Y CONSERVACIÓN ................................. 12 9. Descripción de Asignaturas ........................................................................................... 13 tronco comun ................................................................................................................. 23 OPCIÓN EN BIOLOGÍA MOLECULAR ...................................................................... 50 OPCIÓN EN BIODIVERSIDAD Y CONSERVACIÓN ................................................ 90 10. Unidad ejecutora .......................................................................................................... 132 11. Modalidad .................................................................................................................... 132 12. Duración ....................................................................................................................... 132 13. Regimen académico ..................................................................................................... 133 13.1. Requisitos de Admisión ................................................................................................ 133 13.2. Requisitos de Selección ................................................................................................ 134 13.3. Requisitos de Permanencia ........................................................................................... 134 13.4. Requisitos de Egreso ..................................................................................................... 134 14. Recursos humanos ....................................................................................................... 134 15. Instalaciones y facilidades ........................................................................................... 135 16. Costos ........................................................................................................................... 136 Orientación en Biología Molecular .............................................................................. 136 Orientación en Biodiversidad y Conservación ............................................................ 137 17. Candidatos a la nueva promoción ................................................................................ 138 18. Evaluación del programa (2011) .................................................................................. 140 19. Anexos ......................................................................................................................... 141 Líneas de investigación ................................................................................................ 141 Lista de docentes .......................................................................................................... 142 Lista de Asesores o Directores de Tesis ...................................................................... 145

3

PROPUESTA DE REAPERTURA DE LA MAESTRIA EN CIENCIAS

BIOLÓGICAS

1. Antecedentes

La Facultad de Ciencias Naturales durante más de 40 años ha formado biólogos con grado de licenciatura quienes se han incorporado con éxito en el quehacer nacional en donde se requería de los profesionales de biología. En los últimos años, los diferentes Departamentos del área de Biología han tenido un aceptable desarrollo académico, lo que permitío proponer la creación del programa de maestría en Ciencias Biológicas. Esto responde a una necesidad nacional de tener profesionales con mayor preparación académica, específicamente con grado de postgrado. También se ha concluido de manera exitosa las actividades académicas de las primeras promociones, cuyos estudiantes en han sustentado o están en fase de presentación de sus trabajos de Tesis.

El programa de Maestría en Ciencias Biológicas se ha abierto a la evaluación por pares externos y a aceptar, dentro de sus planes de mejora, las recomendaciones que se le hagan. En este sentido, ya ha establecido un compromiso con la Agencia Centroamericana de Acreditación de Postgrado (ACAP) en el proceso de evaluación. La Secretaría Ejecutiva de la Agencia Centroamericana de Acreditación de Postgrado ACAP notificó la acreditación del Programa de Maestría en Ciencias Biológicas por un periodo de tres años mediante Oficio/101/2014/ACAP del 15 de julio de 2014. La acreditación supone un Plan de Mejoras. Se han establecido sistemas de incentivos y la asignación de becas para estudiantes nacionales y de los ámbitos regional e internacional y se gestionan fondos en otras instituciones como la SENACYT (Secretaría Nacional de Ciencia y Tecnología) lográndose la consecución de fondos y licencias para estudios e investigación. Sin embargo, se requiere lograr mayor apoyo financiero para los estudiantes que aspiren dedicar más tiempo a los estudios, ser estudiantes de dedicación total a los estudios. Por ello, se decidío participar en la Convocatoria Pública para las universidades acreditadas en la República de Panamá para presentación de propuestas de programas de postgrados de investigación, Convocatoria 2014 PFPN001-2014. EL programa de maestría en Ciencias Biológicas se compromete a realizar los ajustes según recomendaciones de la SENACYT, resultado de la evaluación por revisores externos, y a incorporar oportunamente cambios en los contenidos y estrategias didácticas.

4

Finalmente, la Universidad de Panamá se endosa una homologación del sistema de créditos de postgrado, de manera tal que los programas de maestría cuenten con un mínimo de 50 créditos, lo que obliga a hacer una revisión del Plan de Estudio y la malla curricular.

El programa de esta propuesta, como respuesta a todo lo anteriormente señalado, presenta un enfoque que hace énfasis en el desarrollo máximo de destrezas básicas para todos los biólogos, a través de un tronco central de materias docentes, complementado con cursos e investigaciones que proporcionarán la especialización necesaria para que puedan generar y desarrollar ideas, de manera que se puedan enfrentar los problemas biológicos existentes en nuestra sociedad. Los graduados del programa se insertarán con éxito en programas doctorales y actividades relevantes en investigación.

2. Título del Programa y Grado

Programa de Maestría en Ciencias Biológicas que conlleva el Grado de Maestría con los énfasis que se describirán más adelante.

3. Duración del Programa

El Programa de Maestría está diseñado para que el estudiante complete los requisitos mínimos para optar por el título en un período de dos (2) años. Está estructurado por módulos en cuatrimestres y se completa con la defensa de una tesis de grado la que debe sustentar dentro del período definido por el Reglamento General de Estudios de Postgrado vigente.

4. Justificación

4.1. Razones generales Los avances científicos más connotados de los últimos años y los problemas más apremiantes que enfrenta la humanidad están íntimamente relacionados con la biología. Por ejemplo, la escasez de alimentos que se soluciona en parte con el desarrollo de la biotecnología y la ingeniería genética que permite obtener nuevas variedades; la solución de problemas biomédicos, mediante el proyecto el genoma humano. El conocimiento y protección de la biodiversidad a través de la biología de la conservación. A nivel comunitario, el crecimiento de

5

las ciudades y el desarrollo industrial presionan para encontrar una vía que no detenga el desarrollo de nuestros países y al mismo tiempo conservar los recursos naturales.

Dado estas necesidades se hace necesario la actualización de los profesionales de biología en estos avances tecnológicos que proporcionaran los conocimientos y herramientas necesarias para la solución de los mismos.

Este Programa ayudará a la movilidad académica de nuestros docentes que podrán presentar iniciativas que ofrezcan mayores oportunidades de superación académica, lo que redundará en beneficios para el país. Además, permitirá elevar la productividad y aporte de los docentes calificados en el extranjero con profundos conocimientos, subutilizados actualmente por no existir un mecanismo apropiado de desarrollo. El Programa permitirá, por tanto, mejorar la eficacia de nuestro personal docente.

Los egresados del programa podrán optar por mejores oportunidades académicas y continuar estudios superiores conducentes a un doctorado. También se generan oprtunidades de empleo, tanto en el área estatal como en el sector privado, incluso generando sus propias empresas consultoras o productivas.

4.2. Biología Molecular La Biología Molecular es el estudio de la vida a nivel de átomos y moléculas. Los biólogos comprendieron que un mejor entendimiento de un organismo podría ser obtenido estudiando las células que lo forman. De esta manera descubrieron las estructuras que forman las células, las sustancias que requieren las células, los productos que ellas hacen y otras características celulares.

La Biología Molecular lleva el estudio de la vida, a un siguiente paso, estudia las moléculas que forman los seres vivos, igual que la química puede hacerlo con cualquier otro tipo de molécula. Es decir trata de entender las interacciones entre varios sistemas de la célula, incluyendo interacciones entre los diferentes tipos de DNA, RNA y síntesis de proteínas, así como también como estas interacciones son reguladas.

El desarrollo de la investigación en biología molecular es utilizada además en la medicina preventiva (desarrollo de vacunas), en el tratamiento (producción de drogas), en la agricultura (productos biotecnológicos) entre otros.

Panamá cuenta con áreas calientes de la biodiversidad, el conocimiento de esta es necesaria para desarrollar políticas apropiadas de conservación de las mismas. Las metodologías de la biología molecular, la filogenética han permitido la caracterización y conservación de la biodiversidad. Por ejemplo, los marcadores moleculares pueden ayudar a establecer la extensión de la diversidad dentro de las especies y establecer las prioridades para la conservación.

6

El propósito de este énfasis no es sólo conocer la tecnología, sino más bien preparar a los participantes a adquirir las habilidades para enfrentar problemas y retos científicos. Proveer las herramientas intelectuales para desarrollar un enfoque de biología molecular en problemas de interés local.

4.3. Biodiversidad y Conservación Las regiones tropicales y en particular Mesoamérica, son parte de las zonas biológicas con mayor biodiversidad en el mundo, y por lo tanto un área sumamente importante para los esfuerzos globales de conservación. Con tan solo el 0,5% de la superficie terrestre, alberga el 7% de las especies de plantas y animales a nivel global. Aunado a ello, el Istmo de Panamá representa el sitio donde ha ocurrido el “gran intercambio biótico de América”, al constituirse en el gran puente que permitió el intercambio de especies de los hemisferios Norte y Sur, hace aproximadamente 3millones de años. Sin embargo, la región se ve afectada por diversas actividades humanas como la deforestación, la fragmentación de los bosques y la transformación de uso hacia el desarrollo de obras de infraestructura, actividades mineras, ganaderas, y agrícolas, así como por los efectos de los cada vez más frecuentes eventos climatológicos provocados por los cambios globales.

Todo lo anterior, supone nuevos retos para la conservación de la biodiversidad en la región Mesoamericana, de la cual forma parte el Istmo de Panamá, haciéndose imperioso el incrementar el capital humano para atender las tareas de investigación, docencia y gestión en relación a las estrategias de conservación y manejo de la biodiversidad, a los más altos niveles académicos, científicos y tecnológicos. Esto hará viable, las posibilidades de identificar, plantear y ejecutar políticas, estrategias de manejo y herramientas que mitiguen los impactos humanos y optimicen la conservación de la biodiversidad y la sostenibilidad ambiental del país.

5. Elementos fundamentales del currículum

5.1. Objetivos del Programa

5.1.1. Objetivos generales: 1. Contribuir al desarrollo de la Universidad elevando el nivel docente y académico en el

área de las Ciencias Biológicas.

2. Fortalecer la capacidad nacional de investigación en ciencias biológicas, fomentar la generación de conocimiento biológico y estimular su proyección hacia la sociedad.

3. Formar profesionales con una visión moderna e integral de la biología que les permita asumir una amplia gama de labores, contribuyendo efectivamente, con sus conocimientos, al desarrollo de nuestro país.

7

5.1.2. Objetivos específicos: 1. Formación de recurso humano con capacidad de insertarse exitosamente en programas

doctorales y actividades relevantes en investigación.

2. Aumentar la capacidad de trabajo en equipo para buscar soluciones a problemas complejos que afectan la calidad de vida en el país.

3. Desarrollar la capacidad de los biólogos para integrar las áreas de manejo de recursos bióticos con el desarrollo agropecuario y ecoturismo.

4. Contribuir a la aplicación del conocimiento especializado en las actividades empresariales vinculadas a las tecnologías de avanzada.

5. Incrementar la calidad académica de biólogos y profesionales de otras ciencias afines.

6. Mejorar la calidad del docente de las Ciencias Biológicas en el sector educativo y profesional.

6. Perfil del Egresado

El egresado de este programa de maestría demuestra:

Poseer amplios conocimientos de los principios que fundamentan el análisis biológico aplicado a los problemas ambientales.

Aplicar y adaptar métodos y procedimientos modernos en el campo de las ciencias biológicas.

Realizar investigaciones en el campo de las ciencias biológicas en la caracterización que seleccione además, estará preparado para contribuir en la elaboración de artículos científicos, exponerlos y debatir sus resultados.

Trasladar la experiencia profesional adquirida a otras actividades vinculadas al sector productivo, tanto público como privado.

Impartir docencia en ciencias biológicas básicas y aplicadas en las áreas relacionadas con el programa de maestría a nivel superior.

Realizar análisis crítico de la información científica en el campo de trabajo.

8

Generar empresas consultoras o productivas con las técnicas y conocimientos adquiridos.

Tener preparación y formación para realizar estudios a nivel superior.

Desarrollar un pensamiento crítico y la capacidad creativa para resolver problemas de ciencias biológicas básicas y aplicadas en las áreas relacionadas con el programa de maestría.

Manejar las principales fuentes de información periódica en Ciencias Biológicas y afines, haciendo énfasis en su especialidad.

7. Estrategias Metodológicas

En el desarrollo de la maestría se utilizarán cursos presenciales, semipresenciales, giras o estudios de campo, conferencias, seminarios, clases prácticas y de laboratorios, discusiones y presentaciones de artículos científicos, proyectos y estudios de casos. Se promoverá la movilidad de estudiantes y docentes investigadores del programa.

Se utilizará un sistema modular que consta de asignaturas básicas en un tronco común y dos áreas de orientación. Estas asignaturas podrán ser colegiadas o no.

8. Plan de estudio El régimen académico del plan de estudio es modular y las asignaturas serán impartidas en cuatrimestres que organizará la coordinación académica. Tiene un total de 54 créditos.

8.1. Estructura del Programa de Maestría

El programa de estudio comprende

Curso propedéutico

Asignaturas obligatorias básicas (para todos los énfasis)

Asignaturas obligatorias especializadas para cada énfasis

9

Las áreas de énfasis son:

Biología Molecular

Biodiversidad y Conservación

Esta maestría, de modalidad académica, está orientada a la investigación y por tanto culmina con un trabajo de investigación o tesis que será defendido ante un tribunal.

10

MAESTRÍA EN CIENCIAS BIOLÓGICAS 2014

MODALIDAD ACADÉMICA

PROPEDEUTICO Denominación Abreviatura H.T. H.L. H.P. T.

Fundamentos de Estadística - 32 - 48 Inglés Científico - 16 - 32 Metodología de la Investigación científica - 16 - 32

TRONCO COMUN

Primer Cuatrimestre

Denominación Abreviatura H.T. H.L. H.P. T. Cr. CA Biodiversidad BIO 701 32 - 48 80 3 Bioquímica Avanzada BIO 702 48 - - 48 3 Biología Celular BIO 703 48 - - 48 3 Análisis de datos y diseño experimental en biología

BIO 704 32 - 48 3

Total 12

Segundo Cuatrimestre

Denominación Abreviatura H.T. H.L. H.P. T. Cr. CA Biología Molecular BIO 705 48 - 3 Genética de la conservación BIO 706 48 48 4 Biología Evolutiva BIO 707 32 2 Seminario de Tesis I BIO 708 16 - 1 Total 10

11

ORIENTACIÓN EN BIOLOGÍA MOLECULAR

Tercer Cuatrimestre

Denominación Abreviatura H.T. H.L. H.P. T. Cr. CA

Virología Molecular BIO 710 48 3 Inmunología BIO 711 48 3 Genética microbiana y de eucariotas superiores

BIO 712 48 - - 3

Total 9

Cuarto Cuatrimestre


ADN Recombinante BIO 713 48 - 3 Bioinformática BIO 714 32 48 3 Técnicas en Biología Molecular BIO 715 16 64 - 3 Total 9 Quinto Cuatrimestre


Genética de Poblaciones BIO 716 32 - 48 3 Biotecnología BIO 717 32 2 Marcadores Moleculares BIO 718 32 2 Seminario de Tesis II BIO 719 16 - - 16 1 Total 8 Sexto Cuatrimestre


Actividad Académica Supervisada BIO 709 - - - 1 Tesis BIO 720 16 128 - 144 5 Total 6

12

ORIENTACIÓN EN BIODIVERSIDAD Y CONSERVACIÓN Tercer Cuatrimestre


Biología de la Conservación BIO 721 48 - 48 3 Ecología de Poblaciones BIO 722 48 - 48 96 4 Ecología de Comunidades Naturales BIO 723 48 48 96 4 Total 11

Cuarto Cuatrimestre


Prácticas de Campo en Ecología Tropical

BIO 724 16 32 2

Etología BIO 725 32 32 2 Herramientas para Análisis del Paisaje y Conservación

BIO 726 48 48 96 4

Total 8

Quinto Cuatrimestre


Conservación de Áreas Silvestres Protegidas

BIO 727 32 32 64 3

Conservación y Manejo Sostenible de la Biodiversidad

BIO 728 32 32 64 3

Seminario de Tesis II BIO 729 16 - - 16 1 Total 7 Sexto Cuatrimestre


Actividad Académica Supervisada BIO 709 - - - 1 Tesis BIO 730 16 128 - 144 5 Total 6

13

9. Descripción de Asignaturas

Se propone que esta Maestría tenga un tronco central de cursos que permita la actualización en áreas básicas para la mayoría de las especialidades que pueden ofrecerse en las condiciones docentes y de infraestructura de la Universidad. Los cursos serían los siguientes.

PROPEDÉUTICO

Asignatura: Denominación: FUNDAMENTOS DE ESTADÍSTICA (No otorga créditos para la Maestría). JUSTIFICACIÓN El progreso científico depende no solo del adecuado equipo de campo o laboratorio para obtener los datos, sino del manejo de buenos métodos de colecta, un buen diseño estadístico, así como del dominio de las técnicas para su análisis. Este aspecto es general para todas las ciencias y la biología no es la excepción, por ello es necesario que los estudiantes, tanto de los postgrados como investigadores interesados, dominen los conceptos teóricos de la estadística básica que les permitan profundizar en el dominio de herramientas de análisis más avanzadas, de uso en la actualidad. DESCRIPCIÓN Se enseñan las formas de realizar algunas pruebas estadísticas básicas, destacándose aquellos conceptos básicos para la ejecución y análisis de investigaciones biológicas, desde la planificación. En la medida de lo posible se emplearán ejemplos de experimentos reales, para presentar los casos y la forma de abordar los problemas biológicos. Se hace énfasis en el uso de la estadística descriptiva y el diseño experimental, como ayuda para la interpretación adecuada de los procesos biológicos de interés; de manera que se hará menos énfasis en demostraciones matemáticas que frecuentemente causan confusión a los biólogos; intentando destacar lo positivo y fascinante de los análisis estadísticos al momento de interpretar los resultados de una investigación. Se dedica un tiempo a la elaboración de tablas y gráficos, de manera que el alumno adquiera la destreza de aprender a comunicar los resultados de investigaciones científicas de la manera más sencilla y directa. Por último se abordan medidas de asociación entre variables, los análisis de correlación y regresión, de manera que el alumno cuente con los fundamentos estadísticos básicos para adentrarse en estudios más complejos que exigen el dominio de análisis multivariados, considerados en los cursos más avanzados del programa de estudios.

14

OBJETIVOS 1. Proporcionar un resumen de los principales conceptos, situaciones y opciones involucradas

en análisis estadísticos de datos biológicos, que les permitan incursionar en el uso de técnicas más avanzados.

2. Demostrar dominio de los procedimientos y opciones de análisis estadísticos básicos, que le permitan seleccionar y profundizar en el estudio y utilización de herramientas de análisis más avanzadas.

CONTENIDOS Introducción: el método científico; descripción del problema, modelos, hipótesis, el papel del análisis estadístico. Experimentos y otros ensayos; datos, observaciones y variables; probabilidad; distribución de probabilidades, distribución de variables, distribuciones estadísticas (Z, T’ Student, F2, F). Estimación. tamaño de muestra, diseño de muestreo y análisis de poder:: muestras y poblaciones; determinación del tamaño de muestra para variables continuas y variables discretas; análisis de poder estadístico, determinación del tamaño del efecto para variables continuas y variables categóricas o discretas, cálculo del análisis de poder. Diseño de muestreo: Muestreo simple y estratificado; parámetros y estadístico. Error estándar e intervalos de confianza; interpretación de los intervalos de confianza. Métodos para estimación de parámetros. Pruebas de hipótesis estadísticas clásicas para una y dos poblaciones; pruebas paramétricas; errores de decisión. Diseño experimental: principios generales, replicación, control, aleatoriedad, independencia; tipos de diseño, modelos lineares, factoriales, bloques al azar, anidado, cuadrado latino, mediciones repetitivas Exploración gráfica de los datos: Análisis de gráficas, transformación y estandarización de datos. Correlación y regresión: análisis de correlación; modelos de correlación paramétrica, covarianza y correlación; región de confianza paramétrica y no paramétrica. Análisis de regresión linear simple; análisis de varianza (ANOVA); varianza explicada (coeficiente de determinación); relación entre regresión y correlación; pruebas de poder en correlación y regresión. ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Presentación dialogada con discusiones entre los participantes. RECURSOS DIDÁCTICOS Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc. EVALUACIÓN Tres pruebas teóricas parciales, ejercicios cortos y un examen final.

15

REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS Daniel, Wayne W. 1994. Bioestadística. Editorial LIMUSA, Grupo Noriega Editores. México, D.F. 666 pp. México Jongman, R.H.G., Ter Braak, C.J.F. and O.F.R. van Tongeren (Eds.) 2002. Data Analysis in Community and Landscape Ecology. Cambridge University Press.,UK., reprinted. 299pp. Guisande González, C., Barreiro Felpeto, A. , Maneiro Estraviz, I., Rivero Alarcón, I., Vergara Castaño, A.R., y A. Vaasminte Liste. 2006. Tratamiento de Datos. Ediciones Díaz de Santos, España. 356 pp. Krebs, Charles J. 1998. Ecological Methodology. Addison Wesley Longman Inc., Second Edition; USA, Canada. 620pp. McCune, Bruce and James B. Grace with contribution of Dean L. Urban. 2002. Analysis of Ecological Communities. MjM Software design, Oregon, USA. 300pp. . Murray, Logan. 2010. Biostatistical Design and Analysis using R. A Practical Guide. Wiley-Blacwell, Singapore. 546pp. Paton, Steven R., Isabel C. Castro y Pádraig Whelan. 1994. Introducción a la Bioestadística de Campo. Fundación Charles Darwin para las Islas Galápagos, Ecuador. 143p. Quinn, Gerry P. and Michael J. Keough. 2002. Experimental Design and Data Analysis for Biologist. Cambridge University Press, UK. 537pp. Shaw, Peter. J. 2003. Multivariate Statistics for the Environmental Sciences. Arnold Publishers, London. 233pp.

16

Asignatura Denominación: INGLES CIENTÍFICO Créditos: No otorga créditos JUSTIFICACION

Todo estudiante de postgrado debe dominar un idioma extranjero en adición a la lengua materna. Es de relevancia el idioma inglés en el área científica. Para los estudiantes de un postgrado en Biología es imprescindible el conocimiento de este idioma pues hoy todas las referencias actualizadas sean libros, artículos son en su mayoría en el idioma inglés. Los congresos y conferencias a nivel internacional de alto nivel son en inglés.

DESCRIPCION:

El programa está diseñado para desarrollar destrezas de compresión de lecturas en inglés científico a través de un detallado conocimiento de todos los elementos importantes de una lectura intensiva científica. Loa elementos importantes de una lectura como conocimiento de vocabulario científico, estrategias para la lectura y adquisición de nuevo vocabulario, elementos de cohesión, discernimiento del tópico e idea principal de la lectura serán tratados. El propósito final es que los estudiantes adquieran el nivel intermedio del Centro de Lenguas de la Universidad de Panamá

OBJETIVO GENERAL

Al finalizar el curso Inglés Científico el estudiante habrá ampliado sus repertorios lingüístico y estratégico iniciales a un nivel que le permita enfrentarse como lector a la información contenida en textos de carácter científico y biológico en inglés.

OBJETIVO ESPECIFICOS

x Comprenda las unidades léxicas más frecuentemente encontradas en textos de carácter científico y biológico.

x Reconocer automáticamente el significado de unidades léxicas de la lengua general que se encuentran con alta frecuencia en el discurso científico y biológico en inglés, y

x Reconocer automáticamente el significado del léxico semiespecializado o ‘académico’ de mayor frecuencia en el discurso científico y tecnológico en inglés.

x Aplique la técnica de lectura más apropiada a sus propósitos como lector en una situación dada.

x Desarrolle la metacognición, o reflexión sobre el propio conocimiento, como elemento para la aplicación de estrategias de comprensión de lectura en inglés como lengua extranjera.

x Deduzca las relaciones entre oraciones, y entre partes de un mismo texto, mediante

elementos cohesivos

17

x Distinga entre la idea principal, las ideas secundarias y la organización del texto x Identifique el propósito principal del autor e integre información para llegar a una

conclusión. x Se familiarice con las expresiones de medida y magnitud para cuantificar las diferentes

unidades utilizadas en inglés científico x Aplique la información obtenida a través de los contenidos del curso a situaciones

nuevas

CONTENIDOS

x Listas de vocabulario general y académico de alta frecuencia en inglés. x Técnicas de lectura rápida: skimmingy scanning x Estrategias de comprensión de lectura y metacognición. x Estrategias para determinar el significado de palabras desconocidas:

o Uso de los indicios contextuales, Categorías gramaticales, Prefijos y sufijos, Cognados y falsos amigos, Sinónimos y antónimos, El sintagma nominal en el discurso científico-técnico, y Uso del diccionario

x Elementos cohesivos tales como referentes y conectores discursivos, entre otros. x Tópico, idea principal y detalles con enfásis en Biología x Patrones de organización del texto (introducción, desarrollo, conclusión). x Inferencias y conclusiones. x Mapas conceptuales. x Expresiones numéricas: contrastes entre el español y el inglés. x Sistema Anglosajón vs. Sistema Internacional de Unidades.

ESTRATEGIAS METODOLOGICAS

Las clases serán conducidas en inglés tanto como sea posible. Sin embargo, el estudiante puede expresarse en español tanto en las actividades de clase como en las evaluaciones. Las actividades de aula tienen como fin primordial el desarrollo del procesos cognitivos que faciliten que el estudiante se convierta en un lector crítico e independiente, es decir, se espera que el estudiante pueda, entre otros, comparar, analizar, hacer síntesis, investigar, tomar decisiones, reflexionar, opinar y resolver problemas a partir de su interacción con los textos. Dicho desarrollo cognitivo se apoya en la potencialidad epistémica de la tarea de producción y de su interacción con la lectura. Así, se aprovecha la experiencia de la escritura como herramienta para aprender, asimilar, revisar y transformar los modos de comprensión y organización de los textos propios de inglés científico y técnico. Además, se sirve de la escritura para evaluar lo aprendido por el estudiante.

18

RECURSOS DIDÁCTICOS Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc. EVALUACIÓN Dos pruebas teóricas, ejercicios parciales y un examen final. BIBLIOGRAFIA Day, R. & others. 2011. Scientific English: A guide for scientist and other professionals. 3th edition. Greenwood publishers. Burnham, N.& Hutson, F. 2007. Scientific English as a Foreign Language. Department of Physics. Worcester Polytechnic Institute100 Institute Road, Worcester, MA 01609-2280 USA. http://users.wpi.edu/~nab/sci_eng/ScientificEnglish.pdf Artículos científicos en temas biológicos

http://users.wpi.edu/~nab/sci_eng/ScientificEnglish.pdf

19

Asignatura: Denominación: METODOLOGÍA DE LA INVESTIGACIÓN Créditos: No otorga créditos

JUSTIFICACIÓN

El entendimiento de los procesos biológicos, la formulación de estrategias de conservación y la evaluación del impacto de las actividades humanas sobre el medio ambiente y en especial, sobre los recursos bióticos, la diversidad de ecosistemas, las especies y sus poblaciones, exige que el profesional de éste campo maneje ciertas herramientas fundamentales, como son el diseño de proyectos de investigación, metodología para la toma de datos en el campo y el análisis estadístico. Lo anterior, ha llevado a identificar la necesidad de fortalecer la capacidad de los profesionales en ciencias biológicas, primordialmente estudiantes de pre y postgrado, para interpretar adecuadamente los fenómenos vinculados a la naturaleza, y brindar el tratamiento correcto a las causas de los problemas. Se requiere de metodologías e instrumentales accesibles a los estudiantes y de fácil aplicabilidad, en los escenarios reales que se presentan. Para encarar los problemas mencionados, es necesario fortalecer la investigación científica en el país, mediante la preparación específica de los futuros profesionales para el análisis y resolución de problemas mediante la realización de investigaciones científicas, por ello el curso de metodología de la investigación constituye una herramienta de apoyo importante en su formación.

DESCRIPCIÓN

El curso consiste de exposiciones magistrales y talleres, sobre los aspectos teóricos y conceptuales básicos de la metodología de la investigación científica en biología. Los estudiantes harán una revisión bibliográfica sobre un tema específico, seleccionado individualmente, elaborarán preguntas de investigación y discutirán criterios sobre la elaboración de hipótesis de investigación, selección de muestras y técnicas de muestreo. También analizarán los criterios y técnicas para la toma de datos; ordenamiento y captura en ordenador; elaboración de gráficas; análisis de datos; redacción de discusión y redacción de conclusiones de una investigación. Al finalizar el curso, los estudiantes presentarán una propuesta de investigación corta sobre un tema de su interés personal o laboral; sustentada de manera oral y escrita. El seminario constará de una sesión semanal de tres horas cada una, en las que se combinará las clases presenciales a manera de conferencias o exposiciones dialogadas y el trabajo en régimen de seminario.

OBJETIVOS

Fortalecer la capacidad de los estudiantes para interpretar adecuadamente los fenómenos vinculados a la naturaleza, las causas de los problemas en su área de conocimiento, mediante el manejo de herramientas fundamentales en el diseño de proyectos de investigación, el dominio

20

de las metodologías para la toma de datos en el campo y su tratamiento correcto mediante análisis estadísticos.

CONTENIDO

I: CONOCIMIENTO CIENTÍFICO, MÉTODO Y PROBLEMAS 1. El método científico, naturaleza, exigencias y condiciones 2. Los problemas científicos. La identificación de problemas de Investigación

científica y el diseño de proyectos. 3. El marco teórico de la investigación y la formulación de problemas científicos. 4. Elementos contenidos en el planteamiento de un problema de investigación 5. Objetivos de una investigación: preguntas de Investigación 6. Justificación de la investigación; criterios para evaluar el valor potencial de una

investigación. Viabilidad y consecuencias de una investigación.

II: LA BUSQUEDA Y ANÁLISIS DE LA INFORMACIÓN CIENTÍFICA 1. La búsqueda de información científica: 2. El análisis de la información científica: 3. Análisis crítico e interpretación de la información científica. 4. La comunicación científica: exigencias en la elaboración del informe de investigación

científica.

III : HIPOTESIS CIENTIFICAS, MUESTREO Y MEDICIÓN DE VARIABLES 1. Las hipótesis científicas:

x Cómo se relacionan las hipótesis, las preguntas y los objetivos de una Investigación. x Las hipótesis científicas. Características. Funciones. Carácter probabilístico de las

hipótesis científicas. Tipos de Hipótesis; 2. El muestreo y medición de variables

x Concepto de variable como característica o atributo. x Las variables y los indicadores en la medición de variables x Definición del número y tamaño de la muestra. x Delimitación y tipo de muestra. x Recolección de datos, medición.

IV. EL DISEÑO DE LA INVESTIGACIÓN, 1. El diseño de la investigación:

21

x Que es un diseño de Investigación. Concepto y función del diseño, objetivos y condiciones.

x Tipos de diseños de investigación: descriptivos y explicativos, experimentales y no experimentales.

x Definición de un Experimento; manipulación de variables dependientes versus independiente.

V. PROTOCOLO DE INVESTIGACIÓN Y REPORTE x Los pasos y las operaciones en la elaboración de un proyecto o protocolo de

investigación. x La búsqueda bibliográfica y el marco teórico de la investigación. x La selección del diseño y las técnicas de recolección, procesamiento y análisis de los

datos de investigación. x El Análisis de datos; elaboración de gráficos y tablas; aplicación de pruebas

estadísticas; manejo de paquetes estadísticos (Software). x Análisis de resultados; interpretación de los resultados de los análisis estadísticos;

cómo se elabora la discusión y las conclusiones, correspondencia con los objetivos específicos.

x Elementos de un protocolo de investigación: portada, titulo, índice, introducción, justificación, antecedentes, objetivos, objetivos específicos, metodología, cronograma de actividades, requerimientos y bibliografía.

x Instructivo para la elaboración de protocolos de investigación: de encuesta descriptiva y encuesta comparativa; de un estudio de revisión de casos; casos y controles; de perspectiva histórica; protocolo de experimento.

ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Presentación dialogada con discusiones entre los participantes. RECURSOS DIDÁCTICOS Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc. EVALUACIÓN Dos pruebas teóricas, ejercicios parciales y un examen final. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS Bernal T. C. 2002. Metodología de la Investigación. Ed Limusa, México.

Cargill, M. y P. O’Connor. 2009. Writing scientific research articles. Strategy and steps. Wiley- Blackwell, Oxford, UK.

22

Feinsinger, P. 2001. Designing Field Studies for Biodiversity Conservation. The Nature Conservancy. Island Press; Washington, Covelo, London.

Hernández Sampieri, R. y Otros. 2007. Metodología de la Investigación. Cuarta Edición. Ed. Mc Graw Hill. México. Libro Digital: http://www.metabase.net/docs/unibe/03624.html Méndez R. I; Namihira G. 2000. El Protocolo de Investigación (Lineamientos para su elaboración y Análisis). Ed. Trillas. México.

Quinn, G.P. & M.J. Keough. 2002. Experimental Design and Data Analysis for biologists. Cambridge University Press.

Sitios WEB:

Búsqueda de Información Científica

x http://www.uprm.edu/library/docs/tutorias/BusquedaInformacionCientifica.pdf x http://www.uprm.edu/library/docs/tutorias/BuscandoInformacionConfiableGoogle.pdf x Bravo Salinas,N.H. 2006. El seminario Investigativo – El seminario como práctica

pedagógica para la formación integral. Dirección URL: http://www.cun.edu.co/docentes/2_taller_pedagogia_CUN_2006A/modelos_de_formacion/3_estrategias_pedagogicas/3_2_Seminario%20Investigativa/32ELSE_1.DOC.

x Flórez Weidinger,L. A. Cómo encontrar información confiable de manera eficaz. http://bioinformate.uniandes.edu.co/cap1.

x Universidad EAFIT 2005. Apuntes de metodología de la investigación - Un resumen de las principales ideas para el desarrollo de proyectos de investigación. Versión 2.5. 14-05-2005.Dirección URL: http://www.controlsystems.net/recursos/i_mas_d/info/apuntes_metodologia_doc.pdf

x El seminario Investigativo Alemán. 2002. Dirección URL: www.iue.edu.co/tmp/des/inv/seminario_investigativo_2002.doc

http://www.metabase.net/docs/unibe/03624.html

http://www.uprm.edu/library/docs/tutorias/BusquedaInformacionCientifica.pdf

http://www.uprm.edu/library/docs/tutorias/BuscandoInformacionConfiableGoogle.pdf

http://bioinformate.uniandes.edu.co/cap1

23

TRONCO COMUN

Asignatura: BIO 701 Denominación: BIODIVERSIDAD Créditos: 3

JUSTIFICACIÓN

La diversidad biológica o biodiversidad comprende la variedad de ecosistemas y seres vivos sobre la tierra y los patrones naturales que la conforman, resultado de miles de millones de años de evolución según procesos naturales y también de la influencia creciente de las actividades del ser humano. La biodiversidad comprende igualmente y las diferencias genéticas dentro de cada especie que permiten la combinación de múltiples formas de vida, y cuyas mutuas interacciones con el resto del entorno fundamentan el sustento de la vida sobre el planeta. A lo largo de la evolución de la vida sobre la tierra han ocurrido procesos constantes de aparición y desaparición de especies, pero en los últimos siglos, y particularmente en las últimas décadas, el impacto del ser humano sobre el medio ha llevado a una tasa de pérdida de especies sin precedentes. La biodiversidad está en crisis principalmente debido a las acciones humanas sobre su entorno, lo que ha conducido a un acelerado proceso de destrucción de la biósfera en general. Ello conduce a la necesidad de incrementar el conocimiento sobre esta materia y fortalecer las capacidades, científicas y tecnológicas que permitan conocer, valorar, y conservar este valioso recurso natural.

DESCRIPCIÓN La asignatura Biodiversidad busca proporcionar a los estudiantes del Programa de Maestría en Ciencias Biológicas los fundamentos sobre las diferentes escalas que comprenden la biodiversidad, lo mismo que herramientas para su medición, su dimensión en una escala espacial, su relación con diferentes disciplinas biológicas y físicas, y la situación a nivel local y regional. Un logro final sería que los estudiantes y egresados diseñen proyectos de investigación relevantes en la búsqueda de soluciones para la problemática de la biodiversidad, tanto a nivel nacional, como regional. OBJETIVOS

x Comprender la importancia de la biodiversidad para el funcionamiento de los ecosistemas y su mantenimiento, así como el valor de su conservación y uso.

x Aplicar herramientas para medir la biodiversidad a distintos niveles y su aplicación para el manejo de sistemas y en el desarrollo y evaluación de proyectos, y como objeto de estudio científico.

24

CONTENIDOS

1. Introducción al estudio de la biodiversidad

x Definiciones y conceptos generales sobre biodiversidad x Importancia de la biodiversidad x Niveles de estudio de la biodiversidad (genes, especies, poblaciones, comunidades,

ecosistemas, paisaje) x Cambios en la biodiversidad a través del tiempo y el espacio x Problemática actual.

2. Origen y dimensiones de la Biodiversidad.

x Origen de la Biodiversidad. o Teorías que explican el origen de la biodiversidad

x Enfoque biogeográfico o Deriva continental y sus consecuencias o Teoría de MacArthur y Wilson; reglas de composición de una comunidad insular;

predicciones; efectos del área, altitud y distancia al continente. x Enfoque ecológico

o Dispersión, colonización, eventos fundadores, radiación adaptativa, aislamiento y evolución

o Extinciones y diversificaciones. o Especies invasoras e invasiones biológicas.

3. Estimación de la biodiversidad global x Grupos de organismos biológicos: bacterias, hongos, protozoos; animales, plantas: grandes

contribuyentes a la biodiversidad global

4. Medición de la biodiversidad

x Diversidad Alfa x Diversidad Beta x Diversidad Gamma x Métodos para la medición de la biodiversidad

o Selección de Grupos Indicadores

5. Inventarios y monitoreo de la biodiversidad

x Importancia de los inventarios de biodiversidad x Consideraciones prácticas para el diseño de muestreo

o Toma de datos en campo o Almacenamiento y manejo de la información o

6. Muestreo de la biodiversidad

25

x Muestreo, censo y seguimiento x Estrategias de censo y muestreo x Curvas especie-área y rarefacción x Curvas de adecuación del esfuerzo de muestreo x Captura con marcaje y recaptura

7. Descripción de la biodiversidad:

x Índices numéricos x Riqueza y rarefacción x Medidas de similitud y de distancia.

8. Conservación de la biodiversidad

x Factores que afectan la biodiversidad: o Extinción de especies, o El fuego y sus consecuencias sobre la diversidad. o Fragmentación del paisaje o Cambio climático o Especies invasoras o Especies transgénicas

x Valoración económica de la biodiversidad y servicios ambientales

9. Convenios internacionales y marco legal sobre diversidad biológica.

x Convención sobre Diversidad Biológica x Relevancia de la biodiversidad en biología de la conservación y en la gestión ambiental.

o Sistema Nacional de Areas Silvestres Protegidas

EVALUACIÓN DE LOS APRENDIZAJES

x Lecturas, resúmenes escritos x Presentaciones, debates y talleres x Monografía, prueba sumativa final.

REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS

Badgett, R.D.; M.B. Usher and D.W. Hopkins (Eds.). 2005. Biological Diversity and Function in Soils. Cambridge University Press, U.K.; 411 p.

Chazdon, R. & T. C. Whitmore. 2002. Foundations of Tropical Forest Biology. The University of Chicago Press, Chicago. 862 p.

26

Feisinger, P. 2001. Designing field Studies for Biodiversity Conservation. The Nature Conservancy, Island Press, Washington, Covelo, London. 212p.

Galindo-Leal, C. et al. 2003. The Atlantic Forest of South America: Biodiversity Status, Threats and Outlook. Island Press, Washington. 488 p.

García, R. 2002. Biología de la Conservación: Conceptos y Prácticas. PNUD, CBM, INBio. Editorial INBio. 166 p.

Groom, M.J., K.M. Meffe & C.R. Carroll. 2006. Principles of Conservation Biology. Third edition. Sinauer Associates, Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 779 p.

Guariguata, M. R. y G. H. Kattan (comp.). 2002. Ecología y Conservación de Bosques Neotropicales. Libro Universitario Regional. Costa Rica. 691 pp.

Hall, B.G. 2007. Phylogenetics Trees Made Easy: A How-To Manual. 3ra. edición. Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts

Hanski, I. & M. E. Gilpin. 1997. Metapopulation Biology: Ecology, Genetics, and Evolution. Academic Press, San Diego, CA. USA. 512 p.

Hubbell, S.P. 2001. The Unified Neutral theory of Biodiversity and Biogeography. Monographs in populations Biology 32. Princeton University Press, New Jersey. 375p.

Leight, E.G.; Dea, A.; and G.J. Vermeij. 2014. Historical Biogeography of the Isthmus of Panama. Biological Reviews 89:148-172.

Losos, E. C. and E.G. leigh, Jr. 2004. Tropical Forest Diversity and Dynamism. Findings from a Large.Scale Plot Network. The University of Chicago Press. USA; 645p. Moreno, C.E. 2001. Métodos para medir la biodiversidad. M & T-Manuales y Tesis SEA, vol. 1. Zaragoza, España. 84 p. Roubik, D.W.; Sakai, S. and A.A.hamid-Karim. 2005. Pollination Ecology and the Rain Forest. Sarawak Studies. Ecological studies 74. Springer, U.S.A. 307p.

Williams, D.M & M.C. Ebach. 2008. Foundations of Systematic and Biogeography. Springer Science + Business Media. New York

World Conservation Monitoring Centre. 1992.Global Biodiversity. Chapman & Hall. 585 pp.

.

Asignatura: BIO 702 Denominación: BIOQUIMICA AVANZADA

27

Créditos: 3 OBJETIVOS GENERALES: Al finalizar el curso, el estudiante debe ser capaz de interpretar el significado bioquímico y fisiológico de las rutas metabólicas más importantes de microorganismos; comprender los mecanismos que regulan las velocidades de rutas metabólicas en condiciones aeróbicas y anaeróbicas; aplicar el conocimiento bioquímico en otras disciplinas biológicas; obtener información científica mediante la revisión de literatura primaria actualizada; preparar presentaciones y comunicarse e interactuar con la comunidad científica. CONTENIDO: Módulo No. 1: Concepto de proteoma Estructura de alpha-aminoácidos proteicos Niveles estructurales proteicos Modificación postraduccional de proteínas Métodos de purificación de proteínas Enzimas Cofactores Clasificación Cinética enzimática Mecanismos de catálisis de enzimas seleccionadas Mecanismos de catálisis Mecanismo de reacción de la Anhidrasa Carbónica Mecanismo de reacción de la Ribonucleasa Pancreática Mecanismo de reacción de la Quimotripsina Enzimas de restricción Módulo No.2: Concepto de transducción Componentes de un sistema de transducción Sistema de transducción de la adenilato ciclasa Sistema de transducción de la fosfolipasa C Respuesta metabólica Mecanismo de acción de las toxinas de Y. cholerae y B. pertussis Complejo piruvato deshidrogenasa Ciclo de Krebs Fosforilación oxidativa Cadena respiratoria Desacopladores Inhibidores Fotosíntesis Módulo No.3:

28

Metabolismo de carbohidratos Absorción de monosacáridos Glucólisis Vía de las pentosas Glucogenogénesis Glucogenolisis Gluconeogénesis Vía de Entner-Doudoroff Ciclo del glioxilato Metabolismo de lípidos Lipogénesis Biosíntesis de fosfolípidos Biosíntesis de triacilgliceroles Lipólisis B-oxidación de ácidos grasos Cetogénesis Cetolisis Biosíntesis del colesterol Sales biliares Metabolismo de proteínas y otros compuestos nitrogenados Absorción de u-aminoácidos Metabolismo de o-aminoácidos Ciclo de la urea Metabolismo de la cadena hidrocarbonada de u-aminoácidos Biosíntesis de u-aminoácidos Folato y cobalamina Metabolismo de compuestos nitrogenados en bacterias Metabolismo de nucleótidos Síntesis de nucleótidos púricos Degradación de nucleótidos púricos Síntesis de nucleótidos pirimidínicos Degradación de nucleótidos pirimidínicos Vías de salvamento Módulo No.4: Investigación y presentación de temas selectos (Actualizados después de cada promoción) Sulfur metabolism in microorganisms Nitrogen metabolism in microorganisms One-carbon metabolism in microorganisms Signal transduction in microorganisms Methanotrophs Photosynthesis in bacteria Fermentations Bioremediation Parasite biochemistry Efflrcient or effective microorganisms Nitrifying and denitrifying bacteria Topoisomerase of pathogenic protozoa Cyanide biodegradation Bacterial celulase

29

BIBLIOGRAFÍA:

1. Campbell MK, Farrel SO. 2014. Biochemistry. 8th. Ed. Cengage Learning, CT, USA 2. Stryer, L.; Berg, J.; Tymoczko, J. Biochemistry.2012, Seventh Edition. W.H. Freeman. 3. Voet, D., Voet J. and Pratt C. Biochemistry. 2011. Fourth Edition. Wiley. 4. Metzler, D. Bioquímica: Las Reacciones Químicas en las Células Vivas; Ediciones

Omega, S.A. Barcelona, España, 1981. 5. Walsh, C. Enzymatic Reaction Mechanisms; W. H. Freeman and Company, New

York,1979.

V. Evaluación: Pruebas Parciales 40% Prueba Semestral35% Presentaciones 25%

Asignatura: BIO 703 Denominación: BIOLOGÍA CELULAR

30

Créditos: 3 JUSTIFICACIÓN La biología celular es una disciplina básica para el biólogo de la época moderna por cuanto que le permite la comprensión de procesos fundamentales como el desarrollo de los seres vivos, cómo el ambiente influye sobre el organismo y a diferenciar el estado de salud de la enfermedad. El estudio de las estructuras celulares y subcelulares, permite conocer el papel de cada organelo en el contexto de la regulación de la expresión genética y el desarrollo de enfermedades así como las bases celulares de la terapia, de la interacción y comunicación celular; del proceso de envejecimiento y del impacto del ambiente sobre los sistemas biológicos. La Biología Celular es la base de muchas disciplinas científicas y ofrece un conjunto de técnicas útiles para dilucidar fenómenos biológicos de la célula como unidad de la vida. DESCRIPCIÓN La Biología Celular estudia la estructura y función de la célula. Comprende el origen y organización de células procariotas y eucariotas y la composición, función e interacción de las organelas que constituyen dichas células así como los mecanismos bioquímicos y fisiológicos que explican la señalización intercelular e intracelular. Se estudian procesos como metabolismo celular, compartimentalización subcelular, flujo de información genética, comunicación celular, ciclo celular. Se describen aplicaciones de la biología celular a la biología de sistemas, a las relaciones evolutivas entre genomas diferentes y entre los mecanismos de señalización que permitirían los conocimientos de sistemas biológicos complejos. OBJETIVOS

x Conocer la organización estructural de las células procariotas y eucariotas. x Integrar la función de cada organela en el funcionamiento de la célula. x Aplicar la biología celular a la biología de sistemas.

CONTENIDO x Células procariotas y eucariotas

o Origen de las células: concepción evolutiva o Estructura general de las células procariotas o Estructura general de las células eucariotas: Organelas.

x Biomembranas: organización, estructura y funciones o Técnicas de estudio o Estructura: lípidos y proteínas o Funciones o Transporte o Señalización o Excitabilidad o Endomembranas

31

o Selección y transporte de componentes celulares. x Señales intercelulares

o Generalidades de las señales extracelulares o Receptores acoplados a proteína G y sus efectores o Receptores de tirosina cinasa y ras o Vìas de MAP cinasa o Segundos mensajeros o Células excitables

Estructura y función Propiedades de los canales iónicos.

x Técnica de patch-clamp Biopotenciales Neurotransmisores, sinapsis y transmisión de impulsos Receptores Transducción

x EnergéticaCelular o Oxidación de la glucosa y de los ácidos grasos o Transporte de electrones y fosforilación oxidativa o Etapas de la fotosíntesis o Análisis molecular de la fotosíntesis o Metabolismo del CO2 durante la fotosíntesis

x CicloCelular o Generalidades del ciclo celular o Estudios bioquímicos o Estudios genéticos o Control del ciclo celular

Mecanismos moleculares que regulan mitosis o Alteraciones del ciclo celular: bases celulares del cáncer

RECURSOS DIDÁCTICOS:

- Multimedia, videos, pizarra, carteles ilustrativos.

EVALUACIÓN: Exámenes parciales, presentación de artículos, resumen de artículos, examen final.

Cada estudiante deberá realizar una presentación sobre 3 artículos que el profesor le proporcionará. Los artículos deberán ser presentados en una exposición de 15 minutos durante los cuales el estudiante podrá hacer uso de cualquier recurso audiovisual que considere necesario.

Se suministrará material adicional y complementario a la bibliografía citada. Una vez entregado este material se espera que el estudiante lea dicho material y esté en capacidad de hacer un resumen del mismo.

32

REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS:

Bruce Alberts, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander D Johnson. 2013. Essential Cell Biology, 4th Edition. Garland Science, NY, USA

Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, David Morgan. Molecular Biology of the Cell 2014. 6th. Ed. Garland Science, NY, USA

Campbell MK, Farrel SO. 2014. Biochemistry. 8th. Ed. Cengage Learning, CT, USA

Cooper, Geoffrey . The Cell: A Molecular Approach. 2013. 6th Ed. Sinauer Associates, Inc. MA, USA.

Karp Gerald. Cell and Molecular Biology: Concepts and Experiments. 2013. 7th Ed. Wiley & Sons. MA, USA. Lodish Harvey , Berk Arnold , Kaiser Chris A. Krieger Monty. Molecular Cell Biology. 2012. 7th. Ed. NY, USA Sperelakis Nicholas. Cell Physiology2012. 4th. Ed.Academic Press, MA, USA. Lim Wendell, Mayer Bruce, Pawson Tony. Cell Signaling. 2014. 1st Ed. Garland Science. NY, USA.

33

Asignatura: BIO 704 Denominación: ANÁLISIS DE DATOS Y DISEÑO EXPERIMENTAL EN BIOLOGÍA Créditos: 3

JUSTIFICACIÓN En las últimas décadas, ha ocurrido un gran desarrollo de paquetes para el análisis estadístico de datos que incrementan la precisión en el análisis y estimación de parámetros biológicos y ecológicos. Los métodos ayudan a estimar el tamaño de la muestra adecuada para describir los fenómenos que se estudian; de manera que se pueda ser más eficiente al realizar los trabajos de investigación biológica, con el mínimo de trabajo y la máxima precisión. Con el avance de la moderna biología molecular y la ecología aplicada a la conservación, cada vez se ha hecho más demandado por la comunidad científica el formar biólogos competentes en el uso de herramientas de análisis que les permitan hacer una adecuada interpretación y divulgación de los datos ante la comunidad científica. DESCRIPCIÓN El curso está diseñado para estudiantes de grado o investigadores en sistemas biológicos; de manera que no se abordan demostraciones de teoremas ni argumentos rigurosos de la teoría estadística que a veces resultan incomprensibles para el biólogo promedio. Sin embargo, el mismo requiere el dominio previo de un curso introductorio a la estadística, que actualice el dominio de conceptos básicos como error estándar, varianza y límites de confianza. Se intenta traducir las recomendaciones estadísticas a un lenguaje biológico, de manera que pueda ser aplicado en el mundo real para investigar y divulgar los resultados de las investigaciones en ciencias biológicas. Se provee al estudiante de la mayoría de los principales conceptos estadísticos y pruebas, empleando ejemplos de datos biológicos de la vida real; evitando el sobreuso de descripciones matemáticas complejas. Se hacen énfasis en los principios del diseño y análisis estadístico de datos biológicos, y al mismo tiempo se extiende en horas de práctica destinadas al uso de los programas (software) de análisis más empleados en la actualidad; considerando que el biólogo generalmente no elabora sus propios programas de análisis de datos, sino que acude a software de análisis estadísticos disponibles en el mercado; algunos de ellos de uso libre disponibles en la web, como PC-ord y R. OBJETIVOS 1. Dominar los principales conceptos, situaciones y opciones involucradas en análisis

estadísticos de datos biológicos, mediante el uso de técnicas actualizadas. 2. Proveer documentación y herramientas de software que habilite a los estudiantes a

desarrollar un nivel adecuado de capacidad para trabajar con datos reales sobre problemas biológicos y ambientales, que permitan divulgar los conocimientos arrojados por las

34

investigaciones biológicas realizadas, con el margen de rigurosidad exigido por la comunidad científica internacional..

CONTENIDOS

x Análisis de regresión múltiple: modelos de regresión linear múltiple; análisis de varianza, diagnóstico de regresión, diagnóstico de gráficas; colinearidad, interacciones en regresión múltiple; regresión polinomial; modelos no lineares.

x Comparando grupos o tratamientos: diseños unifactoriales (de una vía), diagnósticode ANOVA, comparaciones de medias. Análisis de varianza multifactorial, diseños anidados; diseños factoriales. Diseños de bloques al azar y mediciones de repetición simple; diseños de dos factores sin réplica: análisis, interacciones y supuestos; diseños más complejos, software. Diseños parcialmente anidados, análisis, supuestos, comparaciones específicas, pruebas de poder; software.

x Análisis de covarianza (ANCOVA). Modelos lineares generalizados y regresión logística, regresión de Poisson; modelos para datos correlacionados. Análisis de frecuencias; tablas de contingencia; modelos log-lineares.

x Introducción a los análisis multivariados: datos, distribuciones y asociaciones, combinaciones lineares, vectores y valores eigen, derivación de componentes; distancia multivariada y medidas de dissimilitud; comparación de matrices; estandarización de datos; análisis de gráfico y datos. Análisis multivariado de varianza (MANOVA) y análisis de función discriminante. Análisis de componentes principales (PCA), análisis de correspondencia (DCA), análisis de correspondencia canónica (CCA), análisis de redundancia. Escalamiento multidimensional y análisis de cluster, escalamiento clásico-análisis principal coordinado (PCoA); clasificación, análisis de cluster; escalamiento ordinario y cluster para datos biológicos.

x Presentación de resultados: presentación del análisis, exposición de tablas y gráficos, resúmenes de los datos, presentaciones orales.

ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Presentación dialogada con discusiones entre los participantes. Talleres prácticos en laboratorio informático para elaboración de tablas de datos, elaboración e interpretación de gráficos, uso de software, análisis e interpretación de datos. RECURSOS DIDÁCTICOS Proyector de datos (“data show”), computadoras portátiles, software de análisis estadístico; acceso a la web, videos, tablero blanco, pilotos de colores.

35

EVALUACIÓN Tres pruebas teóricas y presentación oral de un trabajo final. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS Jongman, R.H.G., Ter Braak, C.J.F. and O.F.R. van Tongeren (Eds.) 2002. Data Analysis in Community and Landscape Ecology. Cambridge University Press.,UK., reprinted. 299pp. Guisande González, C., Barreiro Felpeto, A. , Maneiro Estraviz, I., Rivero Alarcón, I., Vergara Castaño, A.R., y A. Vaasminte Liste. 2006. Tratamiento de Datos. Ediciones Díaz de Santos, España. 356 pp. Krebs, Charles J. 1998. Ecological Methodology. Addison Wesley Longman Inc., Second edition; USA, Canada.620pp. McCune, Bruce and James B. Grace with contribution of Dean L. Urban. 2002. Analysis of Ecological Communities. MjM Software design, Oregon, USA. 300pp. . Murray, Logan. 2010. Biostatistical Design and Analysis using R. A Practical Guide. Wiley-Blacwell, Singapore. 546pp. Quinn, Gerry P. and Michael J. Keough. 2002. Experimental Design and Data Analysis for Biologist. Cambridge University Press, UK. 537pp. Shaw, Peter. J. 2003. Multivariate Statistics for the Environmental Sciences. Arnold Publishers, London. 233pp.

36

Asignatura: BIO 705 Denominación: BIOLOGIA MOLECULAR Créditos: 3

JUSTIFICACIÓN

Relación con el perfil: Esta asignatura constituye una parte de la formación del estudiante de postgrado debido a que la misma se relaciona con el bloque de conocimientos definidos en el perfil por competencias. El estudiante de la Maestría en Ciencias Biológicas debe tener un adecuado conocimiento de la Biología Molecular ya que el estudio a nivel molecular de los procesos biológicos es hoy hacia donde se dirige la mayor parte de la investigación biológica, y los procesos entendidos a este nivel permiten una comprensión amplia y profunda de los sistemas vivos. El conjunto de conocimientos teóricos prácticos y aplicados que se le proporciona al estudiante actúa como un catalizador fundamental en la comprensión de muchos de los desarrollos teóricos que se abordan en diversas asignaturas de la Maestria. El conocimiento actualizado de las principales técnicas de obtención y análisis del material biológico es, por tanto, capital para todo estudiante de Ciencias Biologicas. sean cuales sean sus intereses de especialización futura. La materia de Fundamentos de Biología Molecular tiene la importante responsabilidad de proporcionar al alumno este necesario conjunto de saberes teóricos , cuya finalidad última pretende capacitarle para la manipulación analítica de muestras biológicas

DESCRIPCIÓN

La Asignatura Biología Molecular consta de seis módulos a desarrollar: DNA: estructura y replicación, Transcripción y procesamiento del ARNm, síntesis de proteínas, regulación de la expresión génica, mutación, reparación y recombinación, técnicas de biología molecular.

. En esta materia se pretende alcanzar un conocimiento general y suficientemente amplio de los fundamentos teóricos y las principales técnicas de la biología molecular. Módulos que incluye; 6 descritos de la siguiente forma:

1. DNA: Estructura y replicación. 2. Transcripción y procesamiento DEL ARNm 3. Síntesis de proteínas 4. Regulación de la expresión génica. 5. Mutación, reparación y recombinación. 6. Técnicas de biología molecular.

37

SÍNTESIS DE METODOLOGÍA Y EVALUACIÓN Se propone utilizar metodologías constructivistas, que promuevan la participación activa de los estudiantes y cuyas evaluaciones formativas y sumativas comprueben la adquisición de competencias. COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS: x Básicas:

o Capacidad de Lectura-escritura. o Recolecta, organiza y analiza información.

x Competencias genéricas:

o Capacidad de abstracción, análisis y síntesis. o Comunicación oral y escrita en lengua nativa. o Capacidad de aplicar los conocimientos en la práctica o Habilidad para trabajar en forma autónoma. o Capacidad de trabajo en equipo

x Competencias específicas:

o Comprende sobre las generalidades de la biología molecular explicando de forma correcta la estructura y función de los ácidos nucleicos. Relaciona el conocimiento y comprende la replicación del ADN y las diferencias entre eucariotas y procariotas.

o Relaciona el conocimiento y comprende la transcripción y procesamiento del ARNm en procariotas y eucariotas.

o Comprende la síntesis de proteínas, identificando los mecanismos y etapas de la transcripción en procariotas y eucariotas.

o Determina la importancia de la regulación de la expresión del gen a través de ejemplos tanto en eucariotas como en procariotas.

o Conoce los conceptos básicos de la mutación, reparación y recombinación del DNA y relaciona estos conocimientos con algunas enfermedades genéticas.

o Alcanza un conocimiento general y de los fundamentos teóricos y las principales técnicas de la biología molecular

38

CONTENIDOS Módulo 1: DNA: Material genético 1.1. Estructura del ADN 1.3. Replicación semiconservativa 1.4 Características generales de la replicación del ADN. Módulo 2: RNA: Transcripción y procesamiento del ARNm 2.1 Ácido Ribonucleico(ARN) 2.2. Transcripción 2.2.1. Características generales. 2.2.2. Etapas de la transcripción 2.2.3. Transcripción en eucariotas 2.2.3.1.Iniciacion 2.2.3.2. Elongación. 2.2.3.3. Procesamiento del pre-mRNA en los eucariotas. 2.3 RNA funcionales 2.3.1 RNA nuclear pequeño(snRNA) 2.3.2. Autoempalme de los intrones y el mundo del RNA 2.3.3. RNA de interferencia pequeño(siRNA) 2.3.4. Spliceosoma 2. 3.6 Ribozimas Módulo 3: Síntesis de proteínas 3.1. Colinealidad de los genes y las proteínas 3.2. El código genético. 3.3. ARN de transferencia(ARNt) 3 .4 . Ribosomas

3. 5. Proceso de traducción Módulo 4: Regulación génica 4.1 Regulación transcripcional en procariotas. 4.1.1. 1nduccion y represión 4.1.2. El operón lac

4.1.3. Generalidades la transcripción en el operón triptófano. 4.2. Regulación de la transcripción en eucariotas.

39

4.2.1. Panorama general 4.2.2. Secuencias reguladoras en los genes codificantes de proteínas. 4.2.3. Activadores y represores de la transcripción 4.2.4. La cromatina y la regulación génica en eucariotas. 4.2.5. La epigenética Módulo 5: Mutación y reparación del ADN 5.1 Mutaciones 5.2 Mecanismo de reparación del DNA Módulo 6: Técnicas utilizadas en biología molecular y sus aplicaciones 6.1 Electroforesis en gel 6.2. Endonucleasas de restricción 6.3. Hibridación del ADN. 6.4 Sondas de ADN 6.5 Aislamiento de ADN 6.6 Clonación del ADN 6.7 Oligonucleótidos sintetizados con métodos químicos 6.8 Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) 6.9 Huellas de paternidad 6.10. Secuenciación 6.11. Análisis del genoma completo 6.12. Análisis genómico comparativo

METODOLOGÍA Y RECURSOS Se desarrollara el temario mediante clases expositivas y participativas tipo magistral; elaboración de mapas conceptuales, investigaciones bibliográficas, discusiones grupales.

EVALUACIÓN Se evaluarán los conocimientos y habilidades teóricas y prácticas, así como la participación y trabajo desarrollado por el alumno en todas las actividades docentes de la asignatura a lo largo del curso. Para esto se utilizarán diferentes modalidades de evaluación: diagnostica, formativa y sumativa.

La evaluación final se distribuirá de la siguiente forma:

• Examen parciales (mínimo 2), 30%-40%

40

• Otras actividades (trabajos en grupos, seminarios, proyectos etc.) y Laboratorio, 20% - 30%

• Examen Final 30%-40%

Se sugiere hacer al final del semestre una evaluación del curso por parte de los estudiantes con la finalidad de mejorar el proceso enseñanza aprendizaje.

BIBLIOGRAFÍA Krebs, J., Goldstein, E & Kilpatrick, S. 2014. Genes XI. Jones & Barlett learning

Griffiths J.F., Weesler R F, Lewontin S., Carroll B. Genética. Editorial McGRAW-Hill/INTERAMERICANA DE ESPAÑA, S.A.U. 2008 Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser C A, Krieger M, Scott M P, Zipursky, S, L, Darnell J. Biología Celular y Molecular. Editorial Médica Panamericana S. A. 2006

Bretscher A, S L, Ploegh H. Molecular Cell Biology. 6* Edition. U.S.A., W.H.Freeman & Co Ltd; 2007.

DM Vasudevan, Sreekumari S, Kannan V.Texto de Bioquímica. Editorial Medical Pubblishers, INC. 2011.

Otras referencias:

Alberts B, Bray D, Hopkin K, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K y Walter P. Introducción a la Biología Celular. 3a Edición. España, Editorial Médica. Panamericana S.A.; 2011.

Alberts B, Jonson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. Molecular Biology of the Cell. 5a edition. Garland, Nueva York, EE.UU. 2008

De Robertis E, Hib J. Fundamentos de Biología Celular y Molecular de De Robertis. 4ta Edición, 2004. Editorial El Ateneo, Argentina

Karp G. Biología Celular y Molecular. Conceptos y Experimentos. 4a edición. México, Editorial Me Graw-Hill, 2006.

Flanagan, N. (2005), Bioresearch Highlights: Significance of SNPs. Gen, 25:1.

Palladino, M.A. (2006). Understanding The Human Genome Project, 2 Ed. Benjamin Cummings.

Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Damell J. Molecular Cell Biology. Fifth Edition. 2003, W. H. Freeman and Company, New York.

41

Paniagua R, Nistal M, Sesma P, Alvarez-Uria M, Fraile B, Anadón R, Saez FJ. Biología Celular. 3a edición. México, Me Graw- Hill .Interamericana; 2007

Wilson J, Hunt T. Molecular Biology of the Cell: The Problems Book. Fifth Edition. Garland Science; 2007

Asignatura: BIO 706 Denominación: GENÉTICA DE LA CONSERVACION CRÉDITOS: 4 JUSTIFICACIÓN El curso Conservación Genética se ofrece a estudiantes de la Maestría en Biología de la Facultad de Ciencias Naturales, Exactas y Tecnología de la Universidad de Panamá. El tema de la Conservación Genética ha venido en desarrollo tras la aparcición de marcadores moleculares que nos permiten discriminar tanto intra como interspecíficamente a las poblaciones naturales y hacer uso de esta información para el monitoreo y recuperación de especies (muchas veces endémicas) en peligro de extinción. El curso analiza y discute los principios de Conservación Genética, tanto teóricos y prácticos (estudio de casos) e incluye algunas bases para la interpretación de los análisis moleculares utilizados comúnmente en la medición de la diversidad genética de poblaciones amenzadas; todo lo cual permitirá al estudiante transmitir su conocimiento con nuevas estrategias. Es la intención de este programa inculcar en el discente un sentido de análisis que le permita ser más responsable en la propuesta de planes de manejo de especies en riesgo. Descripción

El curso Conservación Genética tiene como finalidad el análisis y discusión de los fenómenos que deben ser considerados para medir la diversidad genética de especies en peligro como base para la implementación de planes de manejo de especies amenazadas. El programa ha sido dividido en cuatro módulos: 1) Introducción, 2) ¿Cómo se mide la diversidad genética?, 3) Consecuencias genéticas del pequeño tamaño poblacional y 4) Manejo genético de las especies amenzadas. El primer módulo incluye los conceptos básicos de biodiversidad y la importancia de la conservación genética. En la segunda unidad se abardorán los principales estadísticos utilizados en la medición de la diversidad genética. La tercera fase hace énfasis en la influencia que tiene el tamaño poblacional en la diversidad genética de las poblaciones naturales y el último módulo se enfoca en las opciones de manejo de poblaciones amenzadas desde el punto de vista genético.

42

COMPETENCIAS

x GENERAL: Utilizarán racionalmente los datos genéticos en los procesos de toma de decisiones encaminados a la gestión de la biodiversidad en todos sus niveles de manera que contribuyan a la planificación y ejecución futuros planes de manejo de especies.

x ESPECÍFICOS:

1. Definirán conceptos básicos en Conservación Genética. 2. Analizarán los principales métodos de medición de la diversidad genética en las

especies. 3. Comprenderán los efectos de la reducción del tamaño poblacional en la

conservación de especies. 4. Desarrollarán la habilidad de interpretar los resultados obtenidos a través de

métodos estadísticos modernos para proponer planes de manejo de especies amenazadas.

CONTENIDO

Módulo I - Introducción 1. Niveles de Biodiversidad 2. Marcadores moleculares y genéticos 3. La Diversidad Genética y su importancia 4. Concepto de Conservación Genética

Módulo II - ¿Cómo se mide la diversidad genética?

1. Principales estadísticos 2. Equilibrio de Hardy-Weinberg 3. Genética evolutiva en poblaciones naturales 4. Baja diversidad genética en poblaciones amenazadas

Módulo III - Consecuencias genéticas del pequeño tamaño poblacional

1. Pérdida de la diversidad genética 2. Efectos al azar y deriva genética 3. Depresión por endogamia 4. Fragmentación poblacional 5. Poblaciones genéticamente viables.

Módulo IV - Manejo genético de especies amenazadas (estudio de casos)

1. Resolución de incertidumbres taxonómicas 2. Manejo in situ de especies amenazadas 3. Reproducción controlada y reintroducción 4. Genética molecular forense

43

ESTRATEGIA METODOLÓGICA

Al ser un curso presencial al nivel de maestría, este se centrará en estrategias andragógicas con apoyo de las TIC´s. La implementación de las innovaciones tecnológicas no deja de lado estrategias metodológicas que propician el pensamiento analítico necesario para la construcción y reconstrucción de los contenidos (mapas conceptuales, cuadros comparativos, plenarias, elaboración de glosarios, etc.).

Se facilitará y recomendará material bibliográfico de apoyo (textos seleccionados), lo cual no exime a los participantes del uso de los recursos de documentación y bases de datos a los que se puede tener acceso actualmente. Se introducirá al análisis de resultados genéticos a través de software de

Se enfatizará en las simulaciones y estudio de casos para promover el análisis de resultados en la generación de estrategias para la conservación de especies amenazadas.

RECURSOS DIDÁCTICOS

x Proyector de diapositivas (Datashow)

x Computadoras x Artículos científicos x Videos

x Carteles ilustrativos x Pizarras

EVALUACIÓN

Inicialmente de completará una evaluación diagnóstica y durante la marcha del curso, se realizarán evaluaciones formativas. A nivel cuantitativo – sumativo, se propone el siguiente esquema que se discutirá con los participantes:

CRITERIO PORCENTAJE Asistencia y participación activa 10 % Asignaciones individuales (y/o pruebas parciales) 30 % Actividades grupales en clase (talleres) 20 % Proyecto final colectivo 40 % TOTAL 100 %

44

BIBLIOGRAFÍA

Brown, T. (2008). Genomas. Buenos Aires, Argentina: Médica Panamericana. Cubero, J. I. (2003). Introducción a la mejora genética vegetal. Madrid, España: Grupo Mundi-Prensa. Curtis, H., Barnes, N. S., Schnek, A., & Massarini, A. (2008). Biología. Buenos Aires, Argentina: Editorial Médica Panamericana. Frankham, R., Ballou, J., & Briscoe, D. (2009). Introduction to Conservation Genetics. Cambridge, UK: Cambridge University Press. Hamilton, M. (2011). Population Genetics. West Susset, UK: Blackwell Publishers. Hedrick, P. W. (2011). Genetics of Populatios. Ontario, Canadá: Jones & Bartle Publishers. Pierce, B. A. (2010). Genética: Un enfoque conceptual. Madrid, España: Editorial Médica Panamericana.

45

Asignatura: BIO 707 Denominación: BIOLOGÍA EVOLUTIVA Créditos: 2

JUSTIFICACION

La biología evolutiva -el estudio científico de la evolución de los seres vivos- es un campo científico fundamental, con una sólida tradición científica, consolidado su estudio en la estructura académica de departamentos e institutos universitarios, y programas de estudio. En los últimos años la biología evolutiva ha vivido un nuevo impulso relacionado con la aparición de nuevos métodos y técnicas para la adquisición de datos moleculares, el análisis de la función de genes, el análisis informático de sistemas complejos, así como la existencia de bases extensas de datos biológicos y el refinamiento en el análisis de rasgos complejos. Orientando sus estudios hacia los conceptos, los principios, los métodos, y el uso de los datos rn los diferentes niveles jerárquicos de la organización biológica. Hoy día, las sociedades humanas modernas, en su complejidad, encaran tremendos desafíos relacionados con la salud, la producción de alimentos, la cohesión social y la sostenibilidad ambiental, e incluso los juicios morales con respecto a los cuales fallan las aproximaciones simples, y en los cuales los estudios de la biología evolutiva pueden contribuir a su entendimiento y comprensión.

DESCRIPCION

La evolución es el proceso básico, unificador de toda la Biología. Se revisan los principales conceptos y mecanismos de evolución biológica: deriva genética, adaptación y especiación. Aspectos teóricos y principales métodos utilizados para reconstruir las relaciones de origen de los organismos (filogenia). Se presenta una reseña histórica de los cambios evolutivos que originaron los principales grupos de organismos. Analiza los principales procesos de evolución biológica y su relevancia para originar biodiversidad. Se discuten los procesos que permiten reconstruir el pasado evolutivo de los principales grupos de organismos e inferir sus posibles relaciones de origen

OBJETIVOS

Proporcionar una mejor comprensión de la naturaleza humana, y cómo el bienestar y la armonía de las personas depende de la naturaleza.

Asistir en la solución de problemas específicos, lo que incluye, entre otros casos, la preservación de la biodiversidad, pues ésta es el resultado de la evolución.

.

46

CONTENIDOS:

Introducción

Moléculas y el origen de la vida

Proteínas y el código genético

Metabolismo celular: cambios para derivar energía

Mecanismos de la evolución

Poblaciones, frecuencia genética y equilibrio genético

Cambios en la frecuencia de genes

Estructura e interacción de las poblaciones

De razas a especies

Cultura y control de la evolución humana

Marco orgánico de la evolución

Registro fósil

Macro y microevolución

Adaptaciones y nicho

Sistemática y clasificación

Filogenia molecular

Evolución en plantas y hongos

Evolución de organismos unicelulares a multicelulares

Evolución en invertebrados

Origen de los vertebrados

Colonización de la superficie terrestre a partir del agua

Evolución de los mamíferos

Evolución de los primates y origen del hombre

47

BIBLIOGRAFIA

Bennet, K. D. 1996. Evolution and Ecology : The Pace of Life. Cambridge University Press. 259 páginas.

Doyle, P. 1996. Understanding Fossils: an Introduction to Invertebrate Paleontology. John Wiley & Sons. 426 páginas.

Futuyma, D. J. 1986. Evolutionary Biology. Sinauer Ass. 2a edición.

Holmes, E. C. 2003. Error thresholds and the constrains to RNA virus evolution. Trends in Microbiology 11: 543-546.

Nielsen, C. 2001. Animal Evolution: Interrelationships of the Living Phyla. Oxford University Press. 2a edición, 568 páginas.

Rambaut, A., D. Posasa, K.A. Crandal & E.C. Holmes. 2004. The causes and consequences of HIV evolution. Nature Reviews Genetics 5: 52-61.

48

Asignatura: BIO 708 Denominación: SEMINARIO DE TESIS I Créditos :1

JUSTIFICACION

La necesidad de la presentación de los proyectos de investigación, artículos científicos y la Escritura de los mismos una prioridad para el investigador, por lo que se requiere de un curso donde el estudiante adquiere los conocimientos y destrezas para el desarrollo de estas actividades.

DESCRIPCION

La enseñanza de la materia comprende:

Elaboración y discusión del proyecto de trabajo de grado.

Una revisión de la literatura científica sobre tópicos seleccionados y relacionados con aspectos biológicos. Presentación de un trabajo escrito y discusión oral del mismo, preferiblemente los avances del trabajo de grado

OBJETIVOS

General:

Conocer las principales técnicas de presentación de los proyectos de investigación y redacción de artículos científicos.

Específico

Analizar los componentes estructurales de los artículos científicos.

ESTRATEGIAS METODOLOGICAS

. Conferencias magistrales

. Debates

49

. Evaluación de publicaciones

. Perfiles

. Cuadros comparativos

. Trabajo de taller

. Monografías

. Investigaciones

Instrumentos de Evaluación

Formativa: revisión del contrato de aprendizaje de cada participante (que llena al inicio de la asignatura)

Sumativa

. Evaluación Teoría 50%

. Evaluación Laboratorio 40%

. Apreciación 10%

.Total 100%

Asignatura: BIO 709 Denominación: ACTIVIDAD ACADÉMICA SUPERVISADA Créditos :1

La participación en eventos académicos de la especialidad y otras aprobadas por el Consejo de Investigación, tales como talleres organizados por el programa, complementan la formación investigativa integral. Todos los estudiantes deben publicar (o a lo menos estar aceptado), como resultado de su investigación, al menos un artículo científico en una revista indexada.

50

OPCIÓN EN BIOLOGÍA MOLECULAR

La Biología Molecular es el estudio de la vida a nivel de átomos y moléculas. Los biólogos comprendieron que un mejor entendimiento de un organismo podría ser obtenido estudiando las células que lo forman. De esta manera descubrieron las estructuras que forman las células, las sustancias que requieren las células, los productos que ellas hacen y otras características celulares.

La Biología Molecular lleva el estudio de la vida, a un siguiente paso, estudia las moléculas que forman los seres vivos, igual que la química puede hacerlo con cualquier otro tipo de molécula. Es decir trata de entender las interacciones entre varios sistemas de la célula, incluyendo interacciones entre los diferentes tipos de DNA, RNA y síntesis de proteínas, así como también como estas interacciones son reguladas.

El desarrollo de la investigación en biología molecular es utilizada además en la medicina preventiva (desarrollo de vacunas), en el tratamiento (producción de drogas), en la agricultura (productos biotecnológicos) entre otros.

Panamá cuenta con áreas calientes de la biodiversidad, el conocimiento de esta es necesaria para desarrollar políticas apropiadas de conservación de las mismas. Las metodologías de la biología molecular, la filogenética han permitido la caracterización y conservación de la biodiversidad. Por ejemplo, los marcadores moleculares pueden ayudar a establecer la extención de la diversidad dentro de las especies y establecer las prioridades para la conservación.

El propósito de esta orientación no es sólo conocer la tecnología pero más bien preparar a los participantes a adquirir las habilidades para enfrentar problemas y retos científicos. Proveer las herramientas intelectuales para desarrollar un enfoque de biología molecular en problemas de interés local.

51

Asignatura: BIO 710 Denominación:Virología Créditos: 3

JUSTIFICACIÓN

La Virología es una ciencia de mucha relevancia para los seres humanos. Virus tales como el HIV, hepatitis B, papillomavirus y los virus de la gripe representan una amenaza para la salud humana. Los virus también juegan un papel importante en el desarrollo de diversos tipos de cáncer, igualmente tienen un efecto económico importante al causar enfermedades en plantas y animales domésticos.

Algunos virus han sido utilizados para desarrollar enzimas, pesticidas, agentes antibacteriales, para tipificación de cepas bacterianas, desarrollo de vectores para la producción de proteínas entre otros.

Mucho del conocimiento básico de la Biología Molecular, Biología Celular y cáncer se ha derivado de estudios como virus. El establecimiento del DNA como material genético, el primer factor de transcripción, el primer mejorador de la transcripción eucariota, la primera secuencia de localización nuclear, los intrones, entre otros son los aportes del conocimiento de la virología.

Se requiere entender la estructura, replicación y como causan enfermedades. Esto permitirá desarrollar estrategias de prevención, diagnosis y tratamiento a través de vacunas, anti-virales y técnicas de diagnóstico.

Todos estos aspectos de la Virología forman parte de la formación de un estudiante de postgrado en Ciencias Biológicas con énfasis en Biología Molecular.

DESCRIPCIÓN

En el curso se describe la metodología necesaria para estudiar los virus y la estructura molecular del virus, su genoma, sus proteínas, membranas y cuerpos de oclusión. Se explican los mecanismos de adhesión y entrada al hospedero y transmisión. Se estudian los mecanismo de replicación del genoma viral, ensamblaje y salida de hospedero. Comprende igualmente aspectos de su taxonomía y debido a la gran diversidad que existe entre los virus se destacarán las descripción de las familias virales más relevantes. Finalmente se incluye aspectos de gran importancia científica como mecanismos de evasión de la respuesta inmune, virus y cáncer,

52

terapia antiviral, priones entre otros. Se pretende abarcar con esta asignatura desde los aspectos más básicos de la biología de los virus, hasta los más aplicados y novedosos en terapia génica.

Módulos que incluye; 4 descritos de la siguiente forma: I. Métodos de estudio y estructura viral

II. Transmisión Viral, adhesión, entrada y ensamblaje III. Clasificación y nomenclatura de los virus IV. Temas especiales

SÍNTESIS DE METODOLOGÍA Y EVALUACIÓN Se propone utilizar metodologías constructivistas, que promuevan la participación activa de los estudiantes y cuyas evaluaciones formativas y sumativas comprueben la adquisición de competencias. COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS: x Básicas:

o Capacidad de Lectura-escritura. o Recolecta, organiza y analiza información.

x Competencias genéricas: o Capacidad de abstracción, análisis y síntesis. o Comunicación oral y escrita en lengua nativa. o Capacidad de aplicar los conocimientos en la práctica o Habilidad para trabajar en forma autónoma. o Capacidad de trabajo en equipo

x Competencias específicas: o Comprende la metodología para estudiar los virus o Comprende la estructura molecular de los virus, como infectan y se replican en la

célula hospedera, como se transmite, evoluciona y causa la enfermedad y como la infección en el hospedero es prevenida.

o Discute la taxonomía de los virus. o Conoce las principales familias de virus o Explica las nueva tendencias del uso de virus en terapia génica, drogas antivirales.

Virus “oncolíticos” para tratar cáncer

53

CONTENIDOS

Módulo I: Métodos de estudio y estructura viral x Métodos utilizados en Virología

o Introducción o Cultivo o Aislamiento o Centrifugación o Investigaciones estructurales de células y viriones o Técnicas electroforéticas o Detección de virus y componentes virales o Ensayo de infectividad o Genética

x Estructura viral o Introducción o Genomas virales o Proteínas, capsides o Membranas de viriones o Cuerpos de oclusión o

Módulo II Transmisión Viral, adhesión, entrada y ensamblaje x Transmisión Viral

o Transmisión de: Virus de plantas Virus de vertebrados Virus de invertebrados

x Adhesión, entrada de virus en las células y ensamblaje o Replicación del genoma o Ensamblaje y salida de la célula o Resultados de la infección al hospedero o Virus en animales o Bacteriófagos

Módulo III x Clasificación y nomenclatura de los virus

o Clasificación moderna y de Baltimore

54

o Herpes y otros virus de doble cadena o Parvovirus y otros virus de cadena sencilla o Reovirus, Picornavirus o Rhadovirus, Retrovirus o Ephadnovirus, virus emergentes

Módulo IV x Temas Especiales

o Evasión inmune o Virus y Cancer o Virus y vacunas o Drogas antivirales o Phage terapy o Priones


EVALUACIÓN La evaluación del estudiante se regirá por lo establecido en el estatuto Universitario, Capitulo VIII del Régimen Académico, Sección sexta de la evaluación del aprendizaje, aprobada en Consejo Académico General Universitario No. 22-08 del 29 de octubre del 2008,

Se evaluarán los conocimientos y habilidades teóricas y prácticas, así como la participación y trabajo desarrollado por el alumno en todas las actividades docentes de la asignatura a lo largo del curso. Para esto se utilizarán diferentes modalidades de evaluación: diagnostica, formativa y sumativa.



• Otras actividades (trabajos en grupos, seminarios, proyectos etc.), 20% - 30%



55

BIBLIOGRAFÍA Alberts B, Jonson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. Molecular Biology of the Cell. 5a edition. Garland, Nueva York, EE.UU. 2008.

Bernard, D., Dulbecco, R. & others. 1989. Microbiology. Lippincott Williams & Wilkins Publishers

Cann, A. 2012. Principles of Molecular Virology. Fith edition. Elsevier Ltd.

Carter, J.B & Saunders, V. 2007. Virology. “Principles and applications”. Jonh Wiley & Sons Publishers.

N.J. Dimmock, A.J. Easton and K.N. Leppard. 2009. Introduction to moderm virology. Jonh Wiley & Sons Publishers.

Shors. T. 2011.Understanding Viruses. 2nd edition. Jones and Bartlett Publishers

56

Asignatura: BIO 711 Denominación: Inmunología Créditos: 3

I. JUSTIFICACIÓN

Los organismos vivos son el hábitat ideal e el que pueden crecer otros organismos. Por lo tanto no es sorprendente que los animales estén sujetos a infecciones por virus, bacterias, protistas, hongos y parásitos animales. Los vertebrados desarrollaron varios mecanismos que les permiten reconocer y destruir estos agentes infecciosos. Como resultado, los vertebrados de muchas células diferentes, algunas de las cuales vigilan el cuerpo mientras son capaces de desarrollar inmunidad contra los patógenos invasores. La inmunidad deriva de las actividades combinadas de muchas células diferentes, algunas de las cuales vigilan el cuerpo mientras que otras se concentran en órganos linfoides, como la medula ósea, timo bazo y ganglios linfáticos. En conjunto, estas células dispersas y órganos discretos forman el sistema inmunitario del cuerpo.

Relación con el perfil: Esta asignatura constituye una parte de la formación del estudiante de postgrado debido a que la misma se relaciona con el bloque de conocimientos definidos en el perfil por competencias. El estudiante de la Maestría en Ciencias Biológicas con énfasis en Biología Molecular debe tener un adecuado conocimiento de la Inmunología ya que a través del diseño de este curso, se pretende transmitir un entendimiento preciso y los fundamentos básicos del sistema inmunológico, haciendo énfasis en las interconexiones existentes entre la inmunidad innata y adquirida y sus repercusiones en la salud y en la enfermedad. Finalmente es mundialmente aceptado que el conocimiento de la inmunología se requiere para la comprensión y manejo de la gran mayoría de patologías conocidas, tanto para el entendimiento de sus medios de producción vivos. El conjunto de conocimientos teóricos y aplicados que se le proporciona al estudiante actúa como un catalizador fundamental en la comprensión de muchos de los desarrollos teóricos que se abordan en diversas asignaturas de la Maestría..

II. DESCRIPCIÓN

La Asignatura Biología consta de seis módulos a desarrollar. En esta materia se pretende alcanzar un conocimiento general y suficientemente amplio de los fundamentos teóricos de inmunología. Módulos que incluye; 6 descritos de la siguiente forma:

1. Introducción y base histológica

57

2. Moléculas y células que interaccionan con el antígeno 3. Las respuestas inmunitarias y sus mecanismos efectores. 4. Inmunidad frente a infecciones. 5. Alteraciones del sistema inmune. 6. Aspectos filogenéticos del sistema inmune.

x Síntesis de metodología y evaluación

Se propone utilizar metodologías constructivistas, que promuevan la participación activa de los estudiantes y cuyas evaluaciones formativas y sumativas comprueben la adquisición de competencias.

III. Competencias que deberán ser adquiridas: x Básicas:

1. Capacidad de Lectura-escritura. 2. Recolecta, organiza y analiza información.

x Competencias genéricas:

1. Capacidad de abstracción, análisis y síntesis.

2. Comunicación oral y escrita en lengua nativa.

3. Capacidad de aplicar los conocimientos en la práctica

4. Habilidad para trabajar en forma autónoma.

5. Capacidad de trabajo en equipo.

x Competencias específicas:

1. Proporcionar una introducción inicial integrado y globalizador para los conceptos en los que se profundizará en el resto del curso

2. Relaciona el conocimiento y comprende Moléculas y células que interaccionan con el antígeno.

3. Introducir al estudiante en la estructura altamente dinámica del sistema inmune, que correlaciona con su función de vigilancia sobre el organismo.

4. Analizar las disfunciones más relevantes del sistema inmune. 5. Conocer las alteraciones del sistema inmune. 6. Introducir a los estudiantes en los aspectos básicos de la filogenética del sistema

inmune.

58

V. Contenidos Módulo 1: Introducción y base histológica 1.1 Introducción a la inmunología

1.1.1. Aproximación histórica a la inmunología. 1.1.2. Visión general del sistema inmune 1.1.3. Inmunidad innata o NATURAL. 1.1.4. Inmunidad adquirida.

1.2.Células del sistema inmune. 1.2.1. Hematopoyesis 1.2.2 Células linfoides. 1.2.3. Fagocitos mononucleares. 1.2.4. Granulocitos 1.2.5. Basófilos

1.3. Organos y Tejidos del sistema inmune. 1.3.1 Órganos linfoides primarios. 1.3.2. Órganos linfoides secundarios. 1.3.3. Recirculación limfocitaria Módulo 2: Moléculas y células que interaccionan con el antígeno 2.1 Antígenos 2.2 Anticuerpos 2.3 Interacciones antígeno-anticuerpo 2.4 Organización y expresión de los genes de inmunoglobulinas y diferenciación de las células. 2.5 Complejo principal de histocompatibilidad(MHC) 2.6 Procesamiento y presentación del antígeno. 2.7 Moléculas de superficie de los linfocitos. 2.8 Maduración, activación y diferenciación de las células.

59

Módulo 3: Las respuestas inmunitarias y sus mecanismos efectores. 3.1 Respuesta inmune humoral. 3.2 Respuesta inmune mediada por células. 3.3 Citoquinas. 3.4 Regulación de la respuesta inmune. 3.5 El sistema del complemento 3.6 Visión de conjunto del sistema inmune. Módulo 4: Inmunidad frente a infecciones. 4.1 Estrategias enfrentadas entre hospedador y parásitos. 4.2 Profilaxis y vacunación. Módulo 5: Alteraciones del sistema inmune. 1.1 Reacciones de hipersensibilidad 1.2 Inmunodeficiencias. 1.3 Autoinmunidad 1.4 Transplante y rechazo 1.5 Inmunidad frente a tumores

Módulo 6: Aspectos filogenéticos del sistema inmune. 6.1 Evolución del sistema inmune VI. Metodología y recursos Se desarrollara el temario mediante clases expositivas y participativas tipo magistral; elaboración de mapas conceptuales, investigaciones bibliográficas, discusiones grupales. VII. EVALUACIÓN Se evaluarán los conocimientos y habilidades teóricas y prácticas, así como la participación y trabajo desarrollado por el alumno en todas las actividades docentes de la asignatura a lo largo del curso. Para esto se utilizarán diferentes modalidades de evaluación: diagnostica, formativa y sumativa.



60

• Otras actividades (trabajos en grupos, seminarios, proyectos etc.) y Laboratorio, 20% - 30%



VIII. Bibliografía ABBA, A.K., Lichtman, A.H., POBER, J,S: Inmunologia celular y molecular(terceraedición); Ed. Interamericana- McGraw Hill(1999) Delves, P., Seamus, M. , Demis, B., Roitt, I: Inmunologia Fundamentos.12° Edicion. Ed. Medica Panamericana. 2014. Fainboin, L., Geffner, J. Introducion a la Inmunologia Humana. Editorial Medica Panamericana. 2011. Otras referencias:

Alberts B, Bray D, Hopkin K, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K y Walter P Introducción a la Biología Celular. 3a Edición. España, Editorial Médica. Panamericana S.A.; 2011.

Alberts B, Jonson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. Molecular Biology of the Cell. 5a edition. Garland, Nueva York, EE.UU. 2008

Karp G. Biología Celular y Molecular. Conceptos y Experimentos. 4a edición. México, Editorial Me Graw-Hill, 2008.



61

Asignatura: BIO 712 Denominación: GENÉTICA MICROBIANA Y EUCARIOTAS SUPERIORES Créditos: 3 JUSTIFICACIÓN La genética microbiana ha jugado un rol único en el desarrollo de los campos de la biología celular molecular e igualmente ha encontrado aplicación tanto en las medicina, agricultura y en las industrias farmacéuticas y alimenticia. Los microbios son ideales para estudios combinados de bioquímica y estudios genéticos y exitosamente han provisto de la información del código genético y de la regulación de la actividad genética. Los estudios genéticos han sido utilizados para estudiar la variación en los microbios patogénicos y también para incrementar la producción de antibióticos a partir de otros microbios. Los estudiantes de biología o de carreras relacionadas encontrarán situaciones donde los conceptos de la genética microbiana se aplican. Por ejemplo epidemias en los hospitales o en la vecindad, producción de productos microbianos recombinantes como la cerveza, hormonas, agentes bioterroristas, secuenciación de un gen novel encontrado en la naturaleza o inclusive la enseñanza de la ciencia a nivel medio o universitario. El estudiante debe no sólo dominar los conceptos básicos de la Genética sino que además debe estar en capacidad de comprender y distinguir las diferencias de los procesos de transmisión, organización y regulación de la expresión de la información en organismos eucariotas modelos como son: C. elegans, S. cerevisiae, A. thaliana, D. melanogaster y H. sapiens. El estudio de los procesos genéticos en estos organismos le permitirá al estudiante aproximarse al estado del arte en la genética de eucariotas. DESCRIPCIÓN En este curso se tratan aspectos fundamentales y características distintivas de los genomas de los microorganismos. Se discuten los mecanismos y particularidades del proceso de replicación en bacterias, bacteriófagos, plásmidos y levaduras. Se estudia la transcripción en procariotas; se revisa la estructura, función, procesamiento y modificación del ARN. Se aborda el proceso de traducción y de manera detallada se estudian los elementos participativos en este proceso. también son discutidos algunos modelos de regulación de la expresión de genes en bacterias. Se explica el mapeo en bacterias y bacteriófagos. Se estudian los conceptos fundamentales de la genética de bacteriófagos y de otros virus. Los estudiantes conocerán como la genética molecular y la tecnología del ADN recombinante pueden ser utilizados para el estudio de microorganismos El curso también describe la estructura y función del genoma eucariótico. Se estudia la organización del genoma, replicación y los mecanismos de la expresión del material genético

62

de eucariotas. Se explican los mecanismos hereditarios de organelos y determinación sexual. Se describen los métodos para el mapeo genético en eucariotas CONTENIDOS:

x Módulo I: Genoma Microbiano o Características del genoma microbiano o Expresión de genes bacterianos o Mutaciones en bacterias o Plásmidos y conjugación o Transformación en bacterias

x Módulo II: o Bacteriófagos o Recombinación no homologa y transposición o Base moleculares de la recombinación o Mecanismos de regulación global o Análisis genéticos en fagos o Análisis genéticos en bacterias

x Módulo III: Genoma de eucariotas o Tamaño y estructura o Marcos abiertos de lectura (ORF) o Elementos repetitivos o Elementos de transposición o “ADN basura” o cromosomas sexuales

x Módulo IV: Control genético del desarrollo y destino de las células o Genética de organelos o Herencia extranuclear

x Módulo V: Mapeo Genético

o Tipos de mapas o Mapeo en Drosophila o Mapeo en levadura o Mapeo en humanos

ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Contará con clases magistrales, discusiones grupales, seminarios, prácticas de laboratorio para lograr el proceso de enseñanza aprendizaje.

63

CRITERIOS DE EVALUACIÓN x Definición – valores de calificación (sumativa)

La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes parámetros:

Exámenes Parciales 40% Seminario de Investigación 10% Semestral 50 %

BIBLIOGRAFÍA Dale J.W. and Park S. F. 2010. Molecular Genetics of Bacteria . Fifth Edition. John Wiley & Sons.

.Cremer, T. and Cremer, M. Chromosome Territories.. Cold Spring Harb Perspect Biol 2010

Forsburg, S. Eukaryotic MCM Proteins: Beyond Replication Initiation.. Microbiology and Molecular Biology reviews, Mar. 2004, p. 109–131

Jackson, R., Hellen, C. and Pestova, T. The mechanism of eukaryotic translation initiation and principles of its regulation. NATURE REVIEWS :Molecular cell Biology. Volume 10, February 2010; 113

Meneely, P. 2009. Advanced Genetic Analysis: Genes, Genomes, and Networks in Eukaryotes. Oxford University Press.

Snyder, L. and Wendy Champness. 2007. Molecular Genetics of Bacteria Third Edition. ASM Press

Kadonaga. J. Transcription in eukaryotes., Cell (2004) 116:247.

Singer, R. and David. RNA Processing and Export. Sami Hocine, Grünwald. Cold Spring Harb Perspect Biol 2010

Vadim O. Chagin, Jeffrey H. Stear and M. Cristina Cardoso. Organization of DNA Replication. Cold Spring Harb Perspect Biol 2010

http://www.amazon.com/Molecular-Genetics-Bacteria-Professor-Jeremy/dp/0470741848/ref=sr_1_2?s=books&ie=UTF8&qid=1304530409&sr=1-2

http://www.amazon.com/Larry-Snyder/e/B001JS31D0/ref=sr_ntt_srch_lnk_1?qid=1304530409&sr=1-1

64

Asignatura: BIO 713 Denominación: ADN RECOMBINANTE Créditos: 3

JUSTIFICACIÓN

Las técnicas de Ingeniería Genética, basadas en la tecnología de ADN Recombinante crearon la habilidad de aislar y manipular genes individuales de genomas complejos para beneficio del hombre. En las ultimas décadas la tecnología del ADN Recombinante a evolucionado a tal punto que se ha convertido en unas de las técnicas básicas disponible y aplicable a cualquier investigación en las Ciencias Biológicas.

DESCRIPCIÓN

En la primera y segunda parte de este curso se discutirán las técnicas y enfoques usados para la inserción de ADN en plàsmidos, fagos u otros vectores de clonación; la transformación de este ADN recombinante en la célula huésped, el rastreo y selección de transformantes. Se explicaran la generación de bibliotecas genéticas y bibliotecas de cDNA y por último se estudiara la síntesis in Vitro de ADN así como también la clonación por sustracción.

En la tercera parte del curso se estudiaran las nuevas técnicas para el análisis de los genes como por ejemplo el estudio de la expresión de los genes (Microarrays), transferencia de genes en celulas de mamíferos y otras técnicas.

COMPETENCIAS

x Competencias genéricas: Capacidad de abstracción, análisis y síntesis; Capacidad de aplicar los conocimientos en la práctica; Capacidad de comunicación oral y escrita, capacidad de investigación, capacidad de aprender y actualizarse permanentemente.

x Competencias específicas :

o Entiende los conceptos fundamentales de las técnicas de la ingeniería genética o Conoce la metodología de las prácticas de DNA recombinante. o Entiende los conceptos fundamentales de las técnicas de la ingeniería genética o Describe la metodología de las prácticas de DNA recombinante o Comprende las metodología para aislar y ligar los ácidos nucleicos o Conoce las distintas enzimas que se utilizan como herramientas en la ingeniería

genética o Conoce los vehículos de clonación utilizados en el DNA recombinante

o Explica los métodos de transformación artificial y natural de los ácidos nucleicos

65

o Comprende la metodología para la construcción de bibliotecas genómicas y cDNA o Conoce los métodos de selección y caracterización de recombinantes o Explica la metodología para la expresión de genes clonados o Buscar y seleccionar rigurosamente bibliografía científica aplicada a la ingeniería

genética o Practicar la honestidad científica en el informe de sus resultados científicos

CONTENIDOS

x Desarrollo de la Tecnología del ADN Recombinante x Métodos para crear moléculas de ADN Recombinante. x Definición x Corte y reunión de moléculas de ADN x Vectores de Clonación x Estrategias de clonación x Duplicación in vitro de DNA

x Selección de Recombinantes y Caracterización

o Selección o Caracterización de recombinantes o Nuevas herramientas para estudiar la función del gen: o Microarrays o Mutagenesis in vitro o RFLP o Expesión de genes eucarióticos en bacteria o Tecnología del ADN recombinante en eucariótas o Pirosecuenciación o Secuenciación de segunda generación

x Utilización del ADN recombinante para el análisis de procesos biológicos x Moléculas de reconocimiento inmunológico. El DNA y lucha contra el SIDA x ADN recombinante y evolución x ADN recombinante en la medicina y la industria x Plantas y animales transgénicos importantes en la agricultura x Genomics: Proyectos de secuenciación de genomas x Terapia Genica

66

METODOLOGÍA Y RECURSOS Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias metodológicas:

x Exposiciones x Prácticas de laboratorio x Trabajos en grupo x Investigaciones bibliográficas

Se utilizan los siguientes recursos:

x Equipo multimedia x Diapositivas x Tablero x Marcadores x Equipo e insumos de laboratorio

CRITERIOS DE EVALUACIÓN

x Técnicas y medios de evaluación.

o Integración y rendimiento en las clases Teórico-Prácticas. o Dos Parciales con evaluación tipo opción múltiple y respuesta ampliada, al final

de la primera y segunda mitad del curso. Incluyen temas estudiados en dichos lapsos.

o Requisitos de regularidad: 80 % de asistencia a las clases teóricas, parciales aprobados.

Los exámenes parciales se califican en una escala de 0 a 100 puntos. La aprobación exige un mínimo de 71 puntos. - Promoción total de la Asignatura: Examen Final: Se realiza al fin del ciclo lectivo. Se toma un examen teórico escrito sobre la totalidad de las Unidades del Programa de la Asignatura

x Definición – valores de calificación (sumativa) La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes parámetros:

x Primer examen parcial………………………..15 x Segundo examen parcial……………………..15 x Laboratorio...……………………………………30 x Examen semestral…………………………… 40

100

67

BIBLIOGRAFIA:

Berg, J., Tymoczko, J. And Stryer, L. 2012. Biochemestry. 7th edition. Mcmillan Education

Brown, T.A. 2010 Gene Cloning & DNA Analysis. 6thedition. Willey & Blackwell Dale J.W & von Schantz, M. 2007. From genes to genome: Concepts and applications of DNA technology. Second edition. John Wiley& Sons Glick, B., Pasternak, J. and Patten, C. 2009. Molecular Biotechnology: Principles and Applications of Recombinant DNA. 4th Edition. Green, M.R. 2012. Molecular cloning a laboratory manual. Fourth edition. Cold Spring Harbor Laboratory pess

Krebs, J., Goldstein, E & Kilpatrick, S. 2014. Genes XI. Jones & Barlett learning

Metzember, S. 2007. Working with DNA. The basics. Garland Science Nicoll, D. 2008. An introduction to genetic engineering. 3th edition. Cambridge University press. NY

68

Asignatura: BIO 714 Denominación: BIOINFORMATICA Créditos: 3 JUSTIFICACIÓN El estudiante de la orientación de Genética y Biología molecular debe adquirir conocimientos acerca de las principales bases de datos y servicios en Internet para el análisis de secuencias de ácidos nucleicos y proteínas. El estudiante principalmente aprenderá a comparar secuencias de ácidos nucleicos y proteínas y entender cómo se da la similitud de estas en las bases de datos con el fin de predecir su función y posible estructura y también cómo estas se utilizan en el análisis filogenético.

DESCRIPCIÓN

La bioinformática es la aplicación de técnicas computacionales para el descubrimiento de conocimientos de datos biológicos. La secuenciación completa del Genoma Humano y tecnologías avanzadas (pirosecuenciación, secuenciación de segunda generación, microarreglos) han proporcionado información biológica sin precedentes.

El foco de la bioinformática es manejar la información que proviene de la industria, de la instituciones académicas para convertirla en información útil. La utilización de esta permitirá resolver problemas en biología, diseño efectivo de drogas para vencer enfermedades humanas.

El curso introducirá a las bases de datos biológicos básicos, principios y métodos para el análisis de secuencias como alineamiento, búsqueda en la base de datos de similaridad, introducción al análisis filogenético

COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS:


x Competencias específicas :

o Tiene un conocimiento general de la bioinformática o Busca información en bases de datos para el análisis de secuencias o Conoce la metodología para el alineamiento de las secuencias o Utiliza programas para el análisis de secuencias o Utiliza las herramientas de la bioinformática para la ingenería genética

69

o Aplica las metodologías teóricas y prácticas para el análisis y la solución de un problema científico

o Entiende y juzga los resultados de una investigación o Muestra interés permanente en la adquisición de conocimientos de nuevas

metodologías de análisis e instrumentación. CONTENIDOS

x Modulo I: Introducción a la Base de Datos o Introducción: Conceptos de bioinformática y Biología Molecular o Pubmed/Medline/Nucleotide en el NCBI para retirar referencias y secuencias de

ácidos nucleicos x Módulo II: Alineamiento y análisis de secuencias

o Alineamientos de dos secuencias o Alineamientos de secuencias múltiples

x Módulo III: Herramientas bioinformáticas para la ingenería genética o Técnicas de edición y ensamblaje de secuencias o Búsqueda de ORF o Detección de sitios de restricción, clonaje e identificación de secuencias de

vectores o Predicción de Estructuras y función de las Proteínas a partir de secuencias de

núcleotidos o Diseño y compra de cebadores

x Módulo IV: Introducción al análisis filiogéntico o Construcción de árboles filogenéticos

ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias metodológicas:

x Exposiciones x Participación en clase, que incluye leer las lecturas, participación individual y en

grupo de los ejercicios asignados durante el semestre. x Entrega de las prácticas de laboratorio durante el semestre


x Equipo multimedia x Computadoras x Internet: Bases de Datos y programas online x Programa DNAMAN

70

CRITERIOS DE EVALUACIÓN Prácticas asignadas 70%

Presentación de Artículos 5%

Examen Final 25%

BIBLIOGRAFÍA

Claverie J.M.& Notredame, C. 2007. Bioinformatics for Dummies. Wiley –Interscience

Mount, D. 2004 Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press.

Zvelebil, M.J. & Baum J. O. 2008. Understanding Bioinformatics. Garland Science

71

Asignatura: BIO 715 Denominación: TÉCNICAS EN BIOLOGÍA MOLECULAR Créditos: 3

JUSTIFICACIÓN

En años recientes, nuestro conocimiento del funcionamiento de sistemas biológicos a nivel celular y molecular ha incrementado como resultado de los avances en técnicas y metodología en este campo. Por ejemplo, el análisis de los ácidos nucleicos e ingeniería genética. Al mismo tiempo estos métodos de análisis mejorados, han permitido a los científicos monitorear e estudiar las muestras más pequeñas de biomoléculas. Como resultado, el entrenamiento requerido para el trabajo práctico en Biología Molecular y Celular es diverso, desde las habilidades para el diseño de las investigaciones prácticas y en el uso apropiado de un gran número de equipo analítico hasta la presentación oral y escrita de los resultados.

DESCRIPCIÓN

El curso proveerá de un perfil de los principios teóricos sobre la metodología de la Biología Molecular y Celular, pero hará énfasis en las aplicaciones prácticas de esta información. Se incluyen las técnicas requeridos para el manejo estéril de cultivos bacterianos y de tejidos vegetales y animales. También provee el conocimiento teórico-práctico de las técnicas más importantes utilizadas hoy día en la Biología Molecular, como por ejemplo la cromatografía, espectrofotometría, electroforesis entre otras. Se presentarán los métodos de análisis mas relevantes de la Biología Molecular.

COMPETENCIAS GENÉRICAS Y ESPECÍFICAS

x Lista y explica las normas de bioseguradad asociadas a las técnicas moleculares estandares, incluyendo cultivos bacterias, electroforesis, purificación de acidos nucleicos, PCR entre otras.

x Conoce la metodologías para cultivos bacteriales y tejidos, asi como las técnicas bio-analítca actual, como la espectrofotometria, centrifugación entre otras

x Explica y practica los principios básicos de las técnicas estériles de cultivo bacterial, transformación, purificación y cuantificación del DNA

x Explica las posibles variaciones del PCR y como sus parametros pueden ser variados para resolver problemas durante el mismo

72

x Planifica un experimento de clonación de DNA que incluye PCR, clonación en un vector adecuado, transformación, aislamiento de plásmidos, seguido del análisis de restricción enzimática con electroforesis de agarosa

x Entiende la naturaleza de una hipótesis en biología molecular y como esta da respuesta a preguntas científicas

x Examina bibliografía relacionada para la formulación de una hipótesis en biología molecular

CONTENIDOS

x Fundamentos sobre las técnicas de Laboratorio: o Principios básicos o Salud y Seguridad o Principios de la química de las soluciones o pH y soluciones tampones

x Manejo de Células y Tejidos o Técnicas estériles y cultivo microbiano o Aislamiento e identificación de microbios o Tejidos y células vegetales o Cultivo de tejidos y medidas de crecimiento o Homeginización y fraccionamiento de las células y tejidos

x Técnicas Analíticas

o Métodos inmunológicos o Isótopos radioactivos, no radioactivos y sus usos o Espectrofotometria básica o Centrifugación o Cromatografía- Métodos de separación, detección y análisis o Principios y práctica de electroforesis o Técnicas avanzadas de electroforesis

x Ensayos de Biomoléculas y estudio del Metabolismo

o Principios fundamentales o Ensayos de aminoácidos y proteínas o Ensayos para lípidos o Purificación de proteínas o Ensayos enzimáticos

x Biología Molecular-LABORATORIOS

73

o Preparación de soluciones o Extracción de DNA genómico o Extracción de plásmidos o Cuantificación de DNA o Restricción Enzimática o PCR o Electroforesis o Ligación o Transformación de DNA-Selección de Recombinantes

x Rotación en Instituciones de Investigación en Biología Molecular METODOLOGÍA Y RECURSOS Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias metodológicas:

x Exposiciones x Prácticas de laboratorio x Trabajos en grupo x Investigaciones bibliográficas





- Integración y rendimiento en las clases Teórico-Prácticas. - Dos Parciales con evaluación tipo opción múltiple y respuesta ampliada, al

final de la primera y segunda mitad del curso. Incluyen temas estudiados en dichos lapsos.

- Requisitos de regularidad: 80 % de asistencia a las clases teóricas, parciales aprobados.

Los exámenes parciales se califican en una escala de 0 a 100 puntos. La aprobación exige un mínimo de 71 puntos. - Promoción total de la Asignatura: Examen Final:

74

Se realiza al fin del ciclo lectivo. Se toma un examen teórico escrito sobre la totalidad de las Unidades del Programa de la Asignatura

x Definición – valores de calificación (sumativa) La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes parámetros:

x Primer examen parcial………………………..15 x Segundo examen parcial……………………...15 x Laboratorio...…………………………………40 x Examen semestral…………………………… 30

100

BIBLIOGRAFIA

Berg, J., Tymoczko, J. And Stryer, L. 2012. Biochemestry. 7th edition. Mcmillan Education

Bruce A., Johnson, A., Lewis, J., Morgan,D. 2014. Molecular Biology of the Cell. 6th. Ed. Garland Science, NY, USA Campbell MK, Farrel SO. 2014. Biochemistry. 8th. Ed. Cengage Learning, CT, USA

Green, M.R. 2012. Molecular cloning a laboratory manual. Fourth edition. Cold Spring Harbor Laboratory pess

Reed, R.; Holmes, D.; Weyers, J. and Jones, A. 1998. Practical skills in Biomolecular Sciences. Prentice Hall, England, U.K.

Rajan, K. 2011. Analytical techniques in biochemistry and molecular biology. Springer

75

Asignatura: BIO 716 Denominación: GENÉTICA DE POBLACIONES Créditos: 3

JUSTIFICACIÓN

Para comprender los procesos que mantienen la variabilidad fenotípica hay que conocer la estructura genética de las poblaciones (variabilidad genética) y los factores que condicionan esta variación. La variabilidad genética esta dada por el grado de heterocigocidad que posea la población. Existen diversas técnicas para detectar la variabilidad genética y métodos matemáticos-estadísticos para cuantificarla dentro de poblaciones y entre poblaciones. Estos conocimientos permiten entender la importante relación entre variabilidad genética y el manejo racional de las poblaciones biológicas, la determinación de la erosión genética y la conservación de estos recursos naturales.

DESCRIPCIÓN

Principios básicos de la genética de poblaciones. Polimorfismo genético en poblaciones naturales. Principales técnicas para detectar el polimorfismo proteico y de ADN. Propiedades principales de los marcadores . Medidas de la variabilidad genética. Reconstrucción de historias evolutivas a partir de datos de ADN.

x Módulos que incluye. Módulo I: La variación en las poblaciones Módulo II: Equilibrio Genético Módulo III: Variación Genética Módulo IV: Las fuerzas que mantienen y cambian la variación genética de las poblaciones

COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS:


76

x Competencias específicas : o Conocer y comprender los conceptos básicos de la Genética de

Poblaciones, los tipos de poblaciones que se estudian y los procesos genéticos que mantienen la variación fenotípica de las poblaciones.

o Aplicar , analizar e interpretar los modelos y métodos matemáticos de análisis de las poblaciones. o Conocer y aplicar algunos aspectos moleculares de la variación

Genética. .

CONTENIDOS

Modulo I: La variación en las poblaciones

Caracteres afectados por la variación Medida de la variación. o Variación discontinua o Variación continua

x Origen de la variación o Variación ambiental o Variación genética

x Polimorfismos genéticos o Caracterización del polimorfismo o Causas que mantienen a los polimorfismos o Tipos de polimorfismos

Módulo II: Equilibrio Genético

x Poblaciones y acervo de genes x Frecuencias genotípicas y génicas x Equilibrio genético, Principio de Hardy-Weinberg x Propiedades principales del equilibrio genético x Utilización del principio de Hardy- Weinberg x Distintos casos de la codominancia autosómica

bialélica x Ruptura del equilibrio

77

Módulo III: Variación Genética.

x Importancia de la variación genética x Medida de la variación genética

o Porcentaje de loci polimórficos o Grado de heterocigocidad de la población

x Marcadores moleculares x Genoma eucarionte x Mutación, frecuencia y papel evolutivo

Módulo IV: Fuerzas que mantienen o cambian la variación genética de las poblaciones

x Recombinación y flujo genético o Recombinación o Flujo genético o Proporción de genes introducidos o Tasa de migración

x Sistema de cruzamientos

o Tipos de cruzamientos o Consanguinidad. Medida y efecto o Apareamiento asociativo o Hibridación o Apareamiento disociativo

x Selección Natural

o Concepto moderno y características o Agentes selectivos o Eficacia biológica o valor adaptativo o Niveles de acción de la selección natural o Tipos de acción de la selección o Selección natural estabilizante o Selección natural diversificadora o Selección natural direccional

78

x Deriva Genética o Concepto y efectos de la Deriva Genética

x Tamaño efectivo de la población o Efecto del fundador o Efecto cuello de botella

METODOLOGÍA Y RECURSOS Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias metodológicas:

x Exposiciones x Lecturas dirigidas x Trabajos en grupo x Investigaciones bibliográfica





x Integración y rendimiento en las clases Teórico-Prácticas. x Dos Parciales con evaluación tipo opción múltiple y respuesta ampliada, al final

de la primera y segunda mitad del curso. Incluyen temas estudiados en dichos lapsos.

x Requisitos de regularidad: 80 % de asistencia a las clases teóricas, parciales aprobados.

Los exámenes parciales: se califican en una escala de 0 a 100 puntos. La aprobación exige un mínimo de 71 puntos. Examen Final: Se realiza al fin del ciclo lectivo. Se toma un examen teórico escrito sobre la totalidad de las Unidades del Programa de la Asignatura

x Definición – valores de calificación (sumativa)

79

La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes parámetros:

x Primer examen parcial…………………….....15 x Segundo examen parcial……………………..15 x Laboratorio...……………………………… ...30 x Examen semestral…………………………... 40_

100%

BIBLIOGRAFIA

x Cubero, J. I. (2003). Introducción a la mejora genética vegetal. Madrid, España: Grupo Mundi-Prensa.

x Curtis, H., Barnes, N. S., Schnek, A., & Massarini, A. (2008). Biología. Buenos Aires, Argentina: Editorial Médica Panamericana.

x Frankham, R., Ballou, J., & Briscoe, D. (2009). Introduction to Conservation Genetics. Cambridge, UK: Cambridge University Press.

x Hamilton, M. (2011). Population Genetics. West Susset, UK: Blackwell Publishers. x Hedrick, P. W. (2011). Genetics of Populatios. Ontario, Canadá: Jones & Bartle

Publishers. x Pierce, B. A. (2010). Genética: Un enfoque conceptual. Madrid, España: Editorial

Médica Panamericana.

80

Asignatura: BIO 717 Denominación: BIOTECNOLOGÍA Créditos: 2 JUSTIFICACIÓN Esta asignatura se relaciona con el bloque de conocimientos, definidos en el perfil por competencias de un estudiante graduado de la Maestría en Ciencias Biológicas de la Universidad de Panamá. DESCRIPCIÓN La Biotecnología representa una de las principales áreas de desarrollo científico y tecnológico en el mundo. Esta disciplina en las últimas décadas ha re-emergido y ha acaparado la atención de los científicos y gobiernos como posible alternativa para encontrar soluciones a los tres problemas básicos que enfrenta el hombre: Alimentación-Salud-Ambiente, uniendo lo tradicional y lo más novedoso desde el punto de vista científico y técnico.

El curso “Introducción a la Biotecnología”, se presenta como una alternativa del currículo universitario a nivel de postgrado, permitiendo a los estudiantes la adquisición de conocimientos básicos en Biotecnología. En este curso se proyectara el alcance de esta nueva rama del saber; la aplicación e integración de principios de las ciencias e ingeniería; identificación de los campos de acción y los resultados más promisorios; además del conocimiento de nuevas tecnologías que conllevan a la obtención de productos con máxima eficiencia, economía y seguridad factible.

x Módulos que incluye, 5 descritos de la siguiente forma: o Módulo I: Introducción a la Biotecnología. o Módulo II: Disciplinas de apoyo a la Biotecnología. o Módulo III: Aplicaciones de la Biotecnología o Módulo IV: Perspectiva de la Biotecnología o Modulo V: Bioética y Biotecnología.

x Síntesis de metodología y evaluación

Se propone utilizar metodologías constructivistas, que promuevan la participación activa de los estudiantes y cuyas evaluaciones formativas y sumativas comprueben la adquisición de competencias.

81

COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS: Competencias genéricas: Capacidad de razonamiento crítico y autocrítico, capacidad de análisis y de síntesis, creatividad, iniciativa y espíritu emprendedor, compromiso social y medioambiental, fluidez y propiedad en la comunicación científica oral y escrita. Competencias específicas:

x Formación teórica en el uso de las herramientas básicas y el material biológico importantes en Biotecnología. x Formación práctica en técnicas microbiológicas y de biología molecular básicas aplicadas a la Biotecnología. x Capacidad para aplicar la teoría a la práctica de cualquier actividad biotecnológica. x Competencia técnica y científica en la resolución de problemas relacionados con la Biotecnología. x Compresión de los problemas sociales y éticos de la Biotecnología. x Resolución mediante Biotecnología de los problemas medioambientales. x Demostrar conocimiento de la literatura científica y técnica en Biotecnología CONTENIDOS

Módulo 1: Introducción a la Biotecnología: x Definición x Origen x Evolución x Desarrollo

Módulo 2: Disciplinas de apoyo a la Biotecnología x Informática x Ingeniería Química x Física x Genética x Bioquímica x Microbiología x Estadística x Inmunología x Biología Molecular y celular x Matemáticas x Fisiología Humana, animal y vegetal.

82

Módulo 3: Aplicaciones de la Biotecnología x Ingeniería genética través de la biología molecular y bioinformatica. x Medio ambientales y acuáticas

- Acuicultura - Biorremediacion - Modificaciones transgénicas

x - Desarrollo de fármacos - Bioinformatica - Exploración de alta capacidad de procesamiento - Cultivo celular y pruebas humanos

x - Biotecnología agrícola - Cultivos transgénicos - Localización genética de semillas. - Animales transgénicos

x Deteccion - Forense - Huellas digitales de DNA - Deteccion de enfermedades geneticas - Identificacion de species

x Farmaceuticas/Cuidados de salud - Biofarmacologia - Tecnologia de la fermentacion

Módulo 4: Perspectiva de la Biotecnología x Nuevas herramientas para diagnostico de enfermedades. x Capital humano x El negocio de la biotecnología x Organización de una empresa de Biotecnología x Trabajos e Biotecnología x Tendencias en alza en la industria biotecnológica

Módulo 5: x Regulación sobre la aprobación/supervisión

- Food and Drug Administration(FDA) - Environmental protection Agency(EPA) - U.S Department of Agriculture(USDA) - Introduccion a las patentes

83

- Productos biotecnologicos en el marco legal. Módulo 6: Biotecnología y Bioética.

x Definición de bioética - Toma de decisiones

x Biotecnología y naturaleza - Células y productos - Organismos genéticamente modificados - Creaciones de embriones para la investigación - Clonación - Derechos de los pacientes y material biológico. - Legislación en desarrollo

x Economía, papel de la ciencia y comunicación



x Técnicas y medios de evaluación. La evaluación realizara mediante 2 exámenes parciales escritos, un trabajo

Final y el examen semestral. x Definición – Los valores de calificación serán sumativos:

Parciales: 15% cada uno Trabajo Final: 30% Examen Semestral: 40%

BIBLIOGRAFÍA Aggarwal, S. (2007). What´s Fueling the Biotech Engine? Nature Biotech.,25.

Beyond Borders: The Global Biotechnology Report 2006. Ernst and Young. 2006. www.ey.com/bryond borders.


Lizeswiski, K. (2006). Metabolomics Plays Crucial Discovery Role. Gen,26.1.


84

Ry to IPO: The Business of Biotecnology. Cambridge, MA: Perseus.obbins-Roth, C. (2001). From Acadenm Thieman, W.J., Palladino, M.A. (2010). Introducción a la Biotecnología. 2° Edición. Editorial Pearson

85

Asignatura: BIO 718 Denominación: MARCADORES MOLECULARES Créditos: 2 créditos JUSTIFICACIÓN

A partir de la última década del siglo XX, las técnicas de marcadores moleculares han dado un vuelco al conocimiento genético de las diferentes especies y han posibilitado localizar genes y marcadores para hacer más eficiente su selección; es por eso que los marcadores constituyen una herramienta actual y una alternativa a la transgenesis para obtener nuevas variedades por métodos tradicionales.

DESCRIPCIÓN

Este curso describe la naturaleza de los diferentes marcadores moleculares y además proporciona, y explica una serie de protocolos experimentales con aplicación en diversos campos de la biología y áreas relacionadas. Se discute en adición literatura científica en la cual se han utilizado marcadores moleculares en la solución de problemas específicos.

x La asignatura incluye los siguientes módulos: Módulo I: Enzimas como marcadores moleculares Módulo II: Hibridización molecular de marcadores Módulo III: Marcadores moleculares en bacterias Módulo IV: Marcadores moleculares en eucariotas

COMPETENCIAS QUE DEBERÁN SER ADQUIRIDAS: (vinculadas al perfil del egresado).

x Competencias genéricas: o Emplea abstracción, análisis y síntesis o Aplica conocimientos a la práctica o Utiliza comunicación oral y escrita o Capacidad de aplicar los conocimientos en la solución de problemas o Aplica el trabajo en equipo o Demuestra uso de las tecnologías de la información y de la

comunicación o Utiliza la investigación o Demuestra interés de actualización continua

86

x Competencias específicas: o Explica las diferencias entre los distintos tipos de marcadores moleculares o Reconoce las ventajas y desventajas de cada uno o Es capaz de decidir qué tipo demarcador molecular se puede utilizar en una

situación concreta

CONTENIDOS x Módulo I: Enzimas como marcadores moleculares

Aloenzimas e isoenzmas Ventajas y desventajas Sistemas aloenzimáticos Aplicaciones y ejemplos

x Módulo II: Hibridización molecular de marcadores Sondas para un solo locus Sondas para locus múltiples Ventajas y desventajas Aplicaciones y ejemplos

x Módulo III: Marcadores moleculares en bacterias Rep-PCR ERIC-PCR Genes como marcadores Sistema de tipaje mediante multilocus (MLST) ITS

x Módulo IV: Marcadores moleculares en eucariotas SNPs Microsatelites PCR-RFLP AFLP Genes y secuencias de organelos

METODOLOGÍA Y RECURSOS Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias

metodológicas: o Clases magistrales o Discusión de artículos o Investigaciones bibliográficas


87

o Equipo multimedia o Tablero o Marcadores o Artículos asignados o Investigaciones asignadas

CRITERIOS DE EVALUACIÓN Para el desarrollo de los temas se seguirán las siguientes estrategias Definición – valores de calificación (sumativa) La nota final del estudiante será determinada porcentualmente de acuerdo a los siguientes parámetros:

x Primer examen parcial…………………..……..15 x Segundo examen parcial………………..……...15 x Participación en la discusión de

artículos...………………………………………15 x Proyecto……………………….………………..15 x Examen semestral………………………..…… 40_

100

BIBLIOGRAFIA

Avise, J. 2004. Molecular markers, natural history and evolution. Second Edition. Sinauer Associates inc, publishers, Massachusets, USA

Krebs, J., Goldstein, E & Kilpatrick, S. 2014. Genes XI. Jones & Barlett learning

Lodish H, Berk a, Zipurisky LS, Matsudaira P, Baltimore D, Darnell. J Molecular cell biology(4ed) W. H. Freeman and Company New York

Cetano-Anolles. 1998. DNA Markers: Protocols, Applicatins and Overviews.

Cornide- Hernandez. 2002. Marcadores Moleculares: Nuevos Horizontes en la Genetica y la Selección de las Plantas. Editorial Felix Varela.

88

Asignatura: BIO 719 Denominación: SEMINARIO DE TESIS II Créditos: 1 JUSTIFICACION

El curso de seminario constituye un complemento indispensable en la formación investigadora. Con ellos el alumno aplica los conocimientos de técnicas y metodologías de investigación a su propia investigación. DESCRIPCION

En este curso el estudiante debe presentar los avances de la tesis de grado en forma oral y escrita, utilizando las metodologías apropiadas para la escritura de todo proyecto de investigación. OBJETIVOS x Clarificar aspectos básicos relacionados con elaboración de una tesis, el proceso de

redacción y la defensa de la tesis. x Orientar a los estudiantes en el proceso de titulación para obtener el grado de Maestría. CONTENIDO DEL CURSO: x Revisión de la literatura científica sobre tópicos seleccionados y relacionados con aspectos

biológicos. x Elaboración y discusión de los avances en el proyecto de trabajo de grado. x Presentación de un trabajo escrito y discusión oral del mismo, preferentemente de los

avances del trabajo de grado. METODOLOGÍA: Al ser un curso presencial al nivel de maestría, este se centrará en estrategias andragógicas con apoyo de las TIC s. Se propone la exposición y evaluación de las tesis como una revisión crítica de gran cantidad de información que debe ser explicada de forma documentada y fundamentada. Se promueve un debate de los informes escritos y verbales a fin de pulir lo mayormente posible el Informe de Tesis. BIBLIOGRAFÍA La bibliografía básica estará en función del tema de la tesis.

89

Asignatura: BIO 720 / BIO 730 Denominación: Tesis Créditos: 5

JUSTIFICACION

La Tesis consiste en un trabajo de investigación original sobre un problema relacionado con un campo científico, tecnológico, humanístico o artístico dado, dentro de las líneas de investigación de un Programa de Maestría; y constituye un requisito obligatorio para la obtención del grado de Magíster en Programas de Maestría con la modalidad académica. La Tesis es un aporte al conocimiento.

DESCRIPCION

En esta asignatura el alumno debe realizar individualmente un trabajo escrito original sobre un tema de su elección relacionado con los estudios cursados en el programa de Maestría. La Tesis de Maestría es el resultado de un trabajo de investigación. Debe realizarse un estudio profundo, con rigor y crítico de la literatura. Es fundamental la correcta elección de las fuentes bibliográficas utilizadas a fin de que la visión que se tenga del tema de estudio se corresponda con la existente en la literatura universal. Los datos experimentales deben cumplir los estándares exigidos para cualquier investigación en cuanto a estructura, recogida, análisis, etc. OBJETIVOS x Dar a los estudiantes la oportunidad de realizar una investigación en un área de

conocimiento de las ciencias biológicas, según estándares científicos y académicos normalmente aceptados.

x Permitir que el estudiante ponga en práctica el conocimiento, competencias y sensibilidades que le permitan mostrar y comprender las características de las problemáticas que se abordan en las ciencias biológicas.

BIBLIOGRAFÍA La bibliografía básica estará en función del tema de la tesis.

90

OPCIÓN EN BIODIVERSIDAD Y CONSERVACIÓN

Las regiones tropicales y en particular Mesoamérica, son parte de las zonas biológicas con mayor biodiversidad en el mundo, y por lo tanto un área sumamente importante para los esfuerzos globales de conservación. Con tan solo el 0,5% de la superficie terrestre, alberga el 7% de las especies de plantas y animales a nivel global. Aunado a ello, el Istmo de Panamá representa el sitio donde ha ocurrido el “gran intercambio biótico de América”, al constituirse en el gran puente que permitió el intercambio de especies de los hemisferios Norte y Sur, hace aproximadamente 3millones de años. Sin embargo, la región se ve afectada por diversas actividades humanas como la deforestación, la fragmentación de los bosques y la transformación de uso hacia el desarrollo de obras de infraestructura, actividades mineras, ganaderas, y agrícolas, así como por los efectos de los cada vez más frecuentes eventos climatológicos provocados por los cambios globales. Todo ello supone nuevos retos para la conservación de la biodiversidad en la región Mesoamericana, de la cual forma parte el Istmo de Panamá, haciéndose imperioso el incrementar el capital humano para atender las tareas de investigación, docencia y gestión en relación a las estrategias de conservación y manejo de la biodiversidad, a los más altos niveles académicos, científicos y tecnológicos. Esto hará viable, las posibilidades de identificar, plantear y ejecutar políticas, estrategias de manejo y herramientas que mitiguen los impactos humanos y optimicen la conservación de la biodiversidad y la sostenibilidad ambiental del país.

91

Asignatura: BIO 721 Denominación: BIOLOGÍA DE LA CONSERVACIÓN Creditos: 3

JUSTIFICACION

Las amenazas actuales a la diversidad biológica no tienen precedente, nunca tantas especies han estado tan amenazadas en un periodo de tiempo tan corto. Esta tendencia tiene entre sus principales actores al incremento de la población humana, a su demanda de recursos para satisfacer sus necesidades, a la implementación de tecnologías meramente extractivas, así como también la inequidad social y económica. Las amenazas que se ciernen sobre las especies se añaden una a la otra, no actúan de manera independiente, esto es, existe un sinergismo de amenazas. Finalmente, mucha gente se está dando cuenta que las amenazas sobre el ambiente se traducen en amenazas sobre la humanidad, dado que dependemos exclusivamente de los recursos aportados por nuestro entorno para nuestra sobrevivencia. Ante este escenario, surge la Biología de la Conservación como una ciencia multidisciplinaria para dar respuesta a la crisis ambiental actual, aanalizando los principios y consideraciones biológicas que deben tomarse en consideración y que contribuyen como herramientas para la solución a la problemática de la conservación y manejo de la biodiversidad.

DESCRIPCIÓN

El curso Biología de la Conservación tiene como propósitos, el análisis y discusión de los principios biológicos de la Conservación los cuales deben sustentar los lineamientos estratégicos de manejo y conservación.y aborda mecanismos , incluyendo la estructura y sus aplicaciones. El programa ha sido dividido en seis secciones: La introducción describe el concepto, características y los principios orientadores de su estudio. La segunda parte se refiere a los niveles de abordaje del problema de conservación de la biodiversidad, ecosistemas, comunidades, poblaciones, especies y genes. La tercera sección estudiará las amenazas a la diversidad de especies, el aislamiento de las poblaciones, y las posibles repercusiones: especiación, endemismo, causas y consecuencias; situación del endemismo en Panamá, la extinción de especies y el tamaño mínimo viable de una población; especies exóticas y especies oportunistas. La cuarta sección se refiere a la fragmentación de los ecosistemas, sus consecuencias; la teoría de aislamiento geográfico; la composición biológica de los fragmentos; la heterogeneidad; consecuencias biológicas de la fragmentación, exclusión inicial, barreras y aislamiento. La quinta y última sección contempla aquellos aspectos biológicos que están

92

relacionados y deben tomarse en consideración para el manejo de los ecosistemas, como son la definición de áreas de conservación, zonas de vecindad y corredores biológicos.

OBJETIVOS

1.analizar el impacto humano sobre las especies, comunidades y ecosistemas

2.Desarrollar mecanismos prácticos para prevenir la extinción de especies y, en la medida de lo posible, reintegrarlas en ecosistemas funcionales.

CONTENIDO

Módulo I - Introducción

Concepto e importancia de la Biología de la Conservación

Características, principios orientadores de la disciplina

Una disciplina integradora ante un problema de actualidad: La pérdida de la diversidad biológica

Módulo 2. Conservación de poblaciones y especies

Tipos y niveles de biodiversidad.

Ecosistemas, especies y genes

Módulo 3. Amenazas a la conservación

El aislamiento de las poblaciones

Posibles repercusiones

Especiación

El endemismo, causas y consecuencias

Situación del endemismo en Panamá

Extinción de especies

Tamaño mínimo viable de una población

Especies exóticas y las especies oportunistas

93

Estado actual

Importancia de su registro y control.

Módulo 4. La fragmentación de los ecosistemas

Consecuencias

Los fragmentos y la teoría de aislamiento geográfico

La composición biológica de los fragmentos

Fragmentación y heterogeneidad

El proceso de fragmentación

Consecuencias biológicas de la fragmentación

Exclusión inicial

Barreras y aislamiento

Efecto de apiñamiento

Extinciones regionales y locales

Cambios en la composición de especies

Módulo 5. El manejo de los ecosistemas

Principios orientadores

Las áreas de conservación:

Sus objetivos, tamaño y forma: una decisión compleja

Representatividad ecológica de las AP

Zona de vecindad

Corredores biológicos

Consideraciones biológicas para la planificación y diseño de

corredores biológicos

Corredores biológicos en áreas privadas

94

Monitoreo de corredores biológicos

Impactos y limitaciones

Corredores biológicos en Panamá

ACTIVIDADES DE EVALUACIÓN

- Talleres en clases (presentación y discusión de temas en la clase) 10 %

- Dos pruebas sumativas parciales 30%

- Trabajo final escrito 30%

- Examen final 30 %


Andrade de Franco, J. L. 2013. The concept of biodiversity and the history of conservation biology: from wilderness preservation to biodiversity conservation. JHistória (São Paulo) 12/2013; 32(2):21-48. Chazdon, R. & T. C. Whitmore. 2002. Foundamentations of Tropical Forest Biology. The University of Chicago Press, Chicago. 862 p.

Dyke, F.V. (2008). Conservation biology. Foundations, concepts, applications. Springer, segunda edición. Frank, D. 2013. Biodiversity, conservation biology, and rational choice.Studies in History and Philosophy of Science Part C Studies in History and Philosophy of Biological and Biomedical Sciences.

Groom, M.J., K.M. Meffe & C.R. Carroll. 2006. Principles of Conservation Biology. Third edition. Sinauer Associates, Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 779 pp.

Krebs, C.J. (2009). Ecology. Benjamin Cummings, San Francisco, sexta edición. Meffe, K.M. & C.R. Carroll. 1994. Principles of Conservation Biology. Sinauer Associates,

https://www.researchgate.net/publication/262762429_The_concept_of_biodiversity_and_the_history_of_conservation_biology_from_wilderness_preservation_to_biodiversity_conservation?ev=srch_pub&_sg=SR272kS4vkc8G%2BervJqojrUqXlIO7hH44U3jwQ6TqfYFrsvTI%2Bpl5DhzmxGl6J8A_7l2aX5fI7A4ZCJW5lbmizFoYEtM1J6mPl7JWiA0HaAA0Ahs82Znm2QFLem3FZErd_cK2JomNs5YcoLcjf76z3ROBaHAOQgIbUmC0kuxzh6k%2FTlAsEgXa0ek6PgzVPR8EY

https://www.researchgate.net/publication/262762429_The_concept_of_biodiversity_and_the_history_of_conservation_biology_from_wilderness_preservation_to_biodiversity_conservation?ev=srch_pub&_sg=SR272kS4vkc8G%2BervJqojrUqXlIO7hH44U3jwQ6TqfYFrsvTI%2Bpl5DhzmxGl6J8A_7l2aX5fI7A4ZCJW5lbmizFoYEtM1J6mPl7JWiA0HaAA0Ahs82Znm2QFLem3FZErd_cK2JomNs5YcoLcjf76z3ROBaHAOQgIbUmC0kuxzh6k%2FTlAsEgXa0ek6PgzVPR8EY

https://www.researchgate.net/researcher/2049078430_Jose_Luiz_de_Andrade_Franco

https://www.researchgate.net/publication/258443350_Biodiversity_conservation_biology_and_rational_choice?ev=srch_pub&_sg=qbH3mx58Oumv2TAO8WVFdU7kk77nFx9bDSTGiUPmOgDe%2B3GCpVUTQEPaeGHD%2FP2d_ZfPN7hdFPflD3%2FxWCy43tdklCEuTu%2Bj%2Fq0GNA4mFxzRzyeCkma90vgb4vmwMNhRH_%2FrJFSAmTUGx10jGKIldaFHVQqPnCQzrihhka0HqiU6awrkrgQMiHe6Fa6MGOHNLy

95

Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 600 pp. Hanski, I. & M. E. Gilpin. 1997. Metapopulation Biology: ecology, genetics, and evolution. Academic Press, San Diego, CA. USA. 512 pp. Proulx, R., Massicotte, P. and M. Pépino. 2013. Googling Trends in Conservation Biology. Conservation Biology 08.

Pullin, A.S. (2002). Conservation Biology. Cambridge University Press.

Simberloff, D. (1988). The contribution of population and community biology to conservation science. Ann. Rev. Ecol. Syst. 19, 473-511.

Soulé, M.E. (Ed.). 1986. Conservation Biology: the science of scarcity and diversity. Sinauer Associates, Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 584 pp.

Soulé, M.E. & B. A. Wilcox (Ed.). 1980. Conservation Biology: an evolutionary – ecological perspective. Sinauer Associates, Inc. Sunderlads, Massachusetts, USA. 584 pp.

Verboom, B. & van Apeldoorn, R. (1990). Effects of habitat fragmentation on the red squirrel, Sciurus vulgaris L.Landscape Ecology, 4, 171-176.

https://www.researchgate.net/researcher/70489136_Raphael_Proulx

https://www.researchgate.net/researcher/59089464_Philippe_Massicotte

https://www.researchgate.net/researcher/57884433_Marc_Pepino

https://www.researchgate.net/publication/256608458_Googling_Trends_in_Conservation_Biology?ev=srch_pub&_sg=CHQ5oQq82lO3EGg7rnX43IwpymXjTr2wYrDaJGYYEkl5ShQMYAvv4OIJT1kyA5G%2B_5YNoCA93Gld8r%2FYr1sEPDlU1Q4cV15opHiqtEUsFud9OqMpNF4gaLluwq5ZF6mII_XCs2TSPAFIC2VqVinZT5YVZHlCGcHhnw2YuhRM49sXP9AAaYjcrRgHgEWMen%2FNr0

96

Asignatura: BIO 722 Denominación: ECOLOGÍA DE POBLACIONES Créditos: 4 JUSTIFICACIÓN

A menudo las primeras preguntas que se hace un biólogo que trabaja con diferentes tipos de organismos, es cuántos hay en un área determinada. A los biólogos, conservacionistas y planificadores no sólo le interesa los individuos por separado, es imprescindible tener a mano más información sobre su organismo de interés, por ejemplo conocer la cantidad de individuos, como se distribuyen por grupos de edad, la proporción por sexo, su distribución en un área determinada. También es imprescindible para lograr éxito en su gestión conocer las características del entorno de la población, como son los recursos espaciales (alimento, refugios, agua, territorio, sitios de reproducción, etc.), lo mismo que las condiciones (temperatura, precipitaciones, humedad) y, por supuesto, las interacciones con miembros de su misma especie y con otras especies. Además, el biólogo necesita saber cómo afectan a las poblaciones naturales esas variables en diferentes ciclos temporales, ya sean diurnos/nocturnos, estacionales o multianuales. Una herramienta útil para estimar estas características de la población o de las comunidades es la Ecología de Poblaciones. Conocer en profundidad las dinámicas que inciden sobre una población natural, ahondando en sus causas, es una herramienta muy valiosa para preservar la biodiversidad. Se trata de un estudio complejo, desde luego, pero que tiene una extraordinaria utilidad para entender la tasa de mortalidad, de natalidad o los flujos migratorios de las especies y de las poblaciones que impactan directamente en el ecosistema. DESCRIPCIÓN El curso Ecología de Poblaciones brinda al estudiante una visión general de esta rama de la Ecología, la cual tiene como objetivo básico el estudio de los cambios numéricos de las poblaciones naturales e identificar sus causas y consecuencias. De este modo, el interés en el estudio de estos cambios numéricos reside en describirlos, explicarlos, predecirlos y analizar sus consecuencias ecológicas y evolutivas. Para ello, como ciencia que es, la ecología de poblaciones trabaja con cálculos matemáticos, curvas de crecimiento, fórmulas matemáticas que emanan directamente de la disciplina demográfica. Los datos deber ser recogidos en el campo para la realización de censos, así como de los diferentes muestreos necesarios para cubrir todos los componentes de esta rama de la ecología.

97

OBJETIVO

x Analizar los procesos ecológicos que determinan la distribución y abundancia de las poblaciones naturales.

CONTENIDOS

1.Conceptos básicos en ecología de poblaciones

x Definición de ecología de poblaciones: ámbito de estudio x Relación de la ecología de poblaciones con la genética, fisiología, conducta animal y

evolución

2.Parámetros de la población

x La población como unidad de estudio x Estimación de los parámetros de la población x Densidad x Natalidad x Mortalidad x Inmigración y Emigración x Limitaciones del análisis de poblaciones x Composición de las poblaciones

3.Técnicas demográficas (Tablas de vida)

x Cuadros estadísticos de esperanza de vida x Capacidad innata de incremento en el número de individuos x Distribución de edades x Distribución por categorías diamétrica x Evolución de los rasgos demográficos

4.Crecimiento de las poblaciones

x Teoría matemática x Generaciones discretas x Generaciones de traslape x Pruebas de laboratorio para la Teoría Logística

98

x Datos de campo acerca del crecimiento de las poblaciones: o Modelos estocásticos del crecimiento de las poblaciones o Modelos de distribución

x Dinámica de las Poblaciones.

5.Interacciones de las especies (Competencia y depredación)

x Competencia por recursos x Modelo matemático x Poblaciones naturales x Evolución de la capacidad competitiva x Generaciones discretas x Generaciones continuas x Evolución de los Sistemas Depredador-Presa x Mecanismos de defensa de las plantas

6.Territorio y ámbito de acción,

x Movimientos y migraciones x Distribución espacial x

7.Ecología molecular x Estudio en plantas y animales x Hibridación x ADN mitocondrial x El estudio de comunidades bacterianas x Métodos y aplicaciones en plantas y animales x Endogamia, fecundación cruzada y sistemas reproductivos en plantas con flores x Formas de medir la endogamia x Estimaciones de fecundación cruzada en poblaciones naturales de plantas con flores. x Clonación y sus efectos en la Biología de poblaciones. x Definiciones x Tipos de clonación en plantas x Ventajas y desventajas x La especie como unidad evolutiva x Uso de marcadores moleculares para su reconocimiento y delimitación

99

EVALUACIÓN

Prácticas de campo e informes 15% Trabajo escrito en base a un mínimo de 15 referencias 10% Presentación oral de trabajo en un seminario 10% Dos exámenes parciales 30% Examen final 35% _________________________________________________________ 100%


Akçakaya, H.R. 2005. RAMAS Gis: Linking spatial data with population viability analysis (version 5). Applied Biomathematics, Setauket, New York.

Alstad, D. 2001. Populus 5.1: simulations of population biology. Software. Univ. of Minnesota. http://www.cbs.umn.edu/populus.

Andermeer, J.H., Goldberg, D.E. 2003. Population Ecology: First Principles. Princeton Universtiy Press pp. 280.

Begon, M., Mortimer, M. & D. J. Thompson. 1996. Population Ecology: a unified study of animals and plants. 3a. edición. Blackwell Science, Cambridge.

Davis, D.E. & R.L. Winstead. 1987. Estimación de tamaños de poblaciones de vida silvestre. Pp. 233-258, En Manual de Técnicas de Gestión de Vida Silvestre. Cuarta edición en español. Wildlife Society. Maryland, USA.

Downing, R.L. 1987. Estadísticas vitales de poblaciones animales. Pp. 259-281, En Manual de Técnicas de Gestión de Vida Silvestre.Cuarta edición en español. Wildlife Society. Maryland, USA.

Hastings, A. 1997. Population biology. Concepts and Models. Springer-Verlag, New York.

Hanski, I. and Gaggiotti, O.E. 2004. Ecology, genetics and evolution of metapopulations. (eds). Elsevier Academic Press.

Hodgson, D.J., Townley, S. 2004. Linking management changes to population dynamic responses: the transfer function of a projection matrix perturbation. Journal of Applied Ecology 41: 115-1161.

Krebs, C.J. 2009. Ecology. Benjamin Cummings, San Francisco, sexta edición.

100

Moreno, C.E. 2001. Métodos para medir la biodiversidad. M & T-Manuales y Tesis SEA, vol. 1. Zaragoza, España. 84 pp.

Asignatura: BIO 723 Denominación: ECOLOGÍA DE COMUNIDADES NATURALES Créditos: 4

JUSTIFICACION

Panamá es una de las regiones con mayor diversidad biológica en Mesoamérica, abrigando una alta diversidad de plantas, animales silvestres y otros organismos por Km de superficie; de allí que aparezca entre los llamados “puntos calientes” de diversidad. El conocimiento de su diversidad biológica, así como de los factores ambientales y procesos que permiten la convergencia, desarrollo y funcionamiento de los ensambles de especies en comunidades bióticas que caracterizan los ecosistemas, son parte del análisis de este curso. La comprensión de estos procesos son herramientas importantes para ayudar a comprender las bases ecológicas de la diversidad biológica a nivel local y regional y ayudar a proponer prioridades de investigación, monitoreo y manejo.

DESCRIPCION

La ecología de comunidades es el estudio de las poblaciones de distintos organismos que habitan sincrónicamente un lugar, y su estudio permite hacer aproximaciones a interrogantes que se plantean en la teoría ecológica como: la comprensión de patrones y procesos que ocurren en las comunidades, así como la utilización de diferentes recursos por las poblaciones cuáles son las condiciones que permiten establecer la existencia de competencia, así como las condiciones para que los depredadores afecten la biodiversidad; la sucesión de especies y el estado de equilibrio. El uso de escalas espaciales y temporales en las que ocurren los fenómenos comunitarios, así como el empleo de herramientas estadísticas utilizadas en la ecología de comunidades Este curso, ofrece la oportunidad de aprender el manejo de herramientas potentes y versátiles, con particular énfasis en el análisis de datos multivariado, brindando al futuro investigador las capacidades básicas para analizar aspectos ecológicos de la dinámica de poblaciones,

101

comunidades y ecosistemas de organismos acuáticos continentales. Por último se analizan las principales amenazas, así como los criterios para la conservación de comunidades naturales.

OBJETIVOS

Fortalecer la capacidad de analizar aspectos ecológicos de la dinámica de comunidades y de las poblaciones que forman parte de las mismas, tanto en ecosistemas terrestres como acuáticos continentales.

CONTENIDOS

1. Naturaleza y características de las comunidades: Concepto de comunidades biológicas. Patrones y procesos causales. Estructura, organización, dinámica. Ensambles. Escalas.

2. Estructura de las comunidades y su relación con el medio físico: Componentes. Atributos y parámetros, Asociaciones. Patrones de distribución espacial. Medidas de la asociación y su significado, análisis de gradientes. Ordenamiento indirecto de gradiente: análisis de componentes principales y análisis de correspondencias. Ordenamiento directo, análisis de correspondencias canónicas. Clasificación de comunidades. Método fitosociológico de Braun-Blanquet. Método de los grupos florísticos de Ellenberg. Clasificaciones numéricas.

3. Diversidad: Hipótesis. Patrones espaciales de diversidad: hipótesis de causalidad; ejemplos. Indicadores. Gradientes. Distribución especie-abundancia: modelos biológicos y descriptivos. Riqueza específica: métodos de estimación. Índices de diversidad. Efectos de la diversidad en el funcionamiento de ecosistemas: principales hipótesis; experimentación. Diversidad taxonómica y funcional.

4. Interacciones bióticas: Nicho ecológico. Teoria de nicho y competencia. Competencia interespecífica. Depredación, herbivoría y defensas de las plantas contra los herbívoros El enfoque funcional. Especies claves e interacciones fuertes y débiles. Rol de los mutualismos en la organización de comunidades y funcionamiento de ecosistemas. Polinización y dispersión de semillas, agentes e influencia en los atributos de comunidades. Banco de semillas: formación, diferencias según ecosistemas. Redes de mutualismos.

5. Cambios en la comunidad:

102

Teoría de disturbios. Modelo del equilibrio. Consecuencias ecológicas de los disturbios. Disturbios naturales y disturbios antrópicos. Sucesión, especies sucesionales pioneras, tempranas y tardías; patrones de regeneración de diferentes grupos ecológicos. Invasiones biológicas, causas, características de las especies invasoras y de las comunidades invadidas. Efectos sobre las comunidades naturales en ambientes acuáticos y terrestres. Estabilidad, relación estabilidad-diversidad. Modelos de simulación; microclima, cambios en el espacio y en el tiempo; características ecológicas.

6. Organización y producción de las comunidades: Niveles y trama trófica. Flujo de energía. Producción primaria y secundaria. Estabilidad. Especies dominantes.

7. Metacomunidades y biogeografía de islas: Contexto histórico. Relación especie-área. Número de especies y tasa de reemplazo. Teoría del Equilibrio. Composición de especies. Teoría de ensambles de especies. Distribución anidada: definición, hipótesis de causalidad, relación con funciones de incidencia, índice de anidamiento. Aplicación al diseño de reservas naturales. Teoría de Metacomunidades: Conceptos y estructura; modelos de formación de ensambles.

8. Conservación de comunidades: Principales amenazas, fragmentación del hábitat y especies invasoras. Criterios para la conservación de comunidades. Especies clave, especies paraguas. Diversidad genética en comunidades. Estrategias de conservación: ambientes degradados y matrices antrópicas, áreas núcleo y corredores. Relación de la biogeografía de islas con el diseño de reservas naturales. ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Presentación dialogada con discusiones entre los participantes. RECURSOS DIDÁCTICOS Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc.

103

EVALUACIÓN 1) Aprobar dos exámenes parciales teórico-prácticos. 60%. 2). Aprobar los informes de los trabajos prácticos. Cada informe deberá entregarse en tiempo y forma y ser sustentado oralmente. 10% 3) Asistir al 80% de los trabajos prácticos. Se tomará asistencia al comienzo del trabajo práctico. 5% 4) Presentación de examen final.25%.


Braun-Blanquet J .1979. Fitosociología. Bases para el estudio de las comunidades vegetales. Blume ediciones. Condit, R., Pitman, N., Leigh, Jr. E.H., Chave, J., Terborgh, J., Foster, R.B., Núñez, P., Aguilar, S., Valencia, R., Villa, G., Muller-Landau, H.C., Losos & E., Hubbell, S.P. 2002. Beta-diversity in tropical forest trees. Science, 295, 666-669.

Clarke, B. & Gorlay, R. 2006. PRIMER-E (Data Analysis Software System), Version 6. Plymouth, UK.

Duivenvoorden, J.F., Svenning, J.-C. & Wright, S.J. 2002. Beta Diversity in Tropical Forests. Science, 295, 636-637.

Gentry, A. H. 2001. Patrones de Diversidad y Composición Florística en los Bosques de las Montañas Neotropicales. En M. Kappelle, y A.D. Brown (Eds.), Bosques Nublados del Neotrópico (pp. 85-124). Costa Rica: INBIO.

Guariguata, M. R. y Ostertag, R. 2002. Sucesión primaria. En: M. R. Guariguata y G.H. Kattan (Eds.), Ecología y Conservación de Bosques Neotropicales (pp.591-623). Libro Universitario Regional. San José: Editorial Tecnológica de Costa Rica.

Hennig, C. & Hausdorf, B. 2010. PRABCLUS, Functions for Clustering of Presence-Absence, Abundance and Multilocus Genetic Data. R package version 2.2-2. http://CRAN.Rproject.org/package=prabclus

Jaksic F. 2001. Ecología de comunidades. Ediciones Universidad Católica de Chile.

104

Jongman, R.H.G., Ter Braak, C.J.F. And O.F.R. Van Tongeren (Eds.) 2002. Data Analysis in Community and Landscape Ecology. Cambridge University Press.,UK., reprinted. 299pp. Kjær Sydenham, M. A., Stein, R. M., Totland, O. and K. Eldegard. 2014. Does Multi-Level Environmental Filtering Determine the Functional and Phylogenetic Composition of Wild Bee Species Assemblages?.Ecography 07/2014.

Lantschner, M. V., y Rusch, V. 2007. Impacto de Diferentes Disturbios Antrópicos Sobre las Comunidades de Aves de Bosques y Matorrales de Nothofagus antartica en el N.O. Patagónico. Asociación Argentina de Ecología. Ecología Austral, 17, 99-112.

Laurance, Jr., W. F. and O. Bierregaard (Eds.), 1997. Tropical Forest Remnants: Ecology, Management and Conservation of Fragmented Communities (pp 71-83). Chicago, London: The University of Chicago Press.

Mccune, Bruce And James B. Grace with contribution of Dean L. Urban. 2002. Analysis of Ecological Communities. MjM Software design, Oregon, USA. 300pp. Meave, J.A., Flores-Rodríguez, C., Pérez-García, E.A, y M.A. Romero-Romero. 2011. Edaphic and seasonal heterogeneity of seed banks in agricultural fields of a tropical dry forest region in southern Mexico. Botanical Sciences. 90(3):313-329.

Morrisey, E., and R. B. Franklin. 2014. Resource Effects on Denitrification are Mediated by Community Composition in Tidal Freshwater Wetlands Soils. Environmental Microbiology 07/2014.

Norris, S. 2003. Neutral theory a new unified model for ecology. BioScience. 53 (2): 124-129.

Oksanen, J., Blanchet, F.G., Kindt, R., Legendre, P., Minchin, P.R., O'hara, R.B., Simpson, G.L., Solymos, P., Stevens, M.H.H. & Wagner, H. 2012. Vegan, Community Ecology Package. R package version 2.0-3. http://CRAN.R-project.org/package=vegan

Pérez-Ramos, I.M. 2007. Factores que condicionan la regeneración natural de especies leñosas en un bosque mediterráneo del sur de la Península Ibérica. Ecosistemas 16 (2) 131-136. Ruokolainen, K. & Tuomisto, H. 2002. Beta-Diversity in Tropical Forests. Science, 297, 1439a.

https://www.researchgate.net/researcher/12290368_Orjan_Totland

https://www.researchgate.net/publication/264125007_Does_multi-level_environmental_filtering_determine_the_functional_and_phylogenetic_composition_of_wild_bee_species_assemblages?ev=pubfeed_top&trpid=53d83436d685ccb8168b4600_2



https://www.researchgate.net/publication/263738609_Edaphic_and_seasonal_heterogeneity_of_seed_banks_in_agricultural_fields_of_a_tropical_dry_forest_region_in_southern_Mexico?ev=pubfeed_overview&trpid=53d832f3d685cc1e7e8b464f_1



https://www.researchgate.net/publication/264162260_Resource_effects_on_denitrification_are_mediated_by_community_composition_in_tidal_freshwater_wetlands_soils?ev=pubfeed_top&trpid=53d83436d685ccb8168b4600_4

https://www.researchgate.net/publication/264162260_Resource_effects_on_denitrification_are_mediated_by_community_composition_in_tidal_freshwater_wetlands_soils?ev=pubfeed_top&trpid=53d83436d685ccb8168b4600_4

105

Terradas, J. 2001. Ecología de la Vegetación: De la Ecofisiología de las Plantas a la Dinámica de Comunidades y Paisajes. Barcelona; Ediciones Omega. 703p. Tuomisto H. y Ruokolainen K. 1998. Uso de Especies Indicadoras para Determinar Características del Bosque y de la Tierra. En: Kalliola, R. y Flores Paitán, S. (eds.), Annales Universitatis Turkuensis Ser. A 11, 481-491.

Asignatura : BIO 724 Denominación: PRÁCTICAS DE CAMPO EN ECOLOGÍA TROPICAL Créditos: 2

JUSTIFICACION

El curso representa una oportunidad para los estudiantes de participar de un ambiente de discusión y análisis de la teoría y la práctica en ecología tropical. Además, constituye el escenario para sintetizar el marco teóricos detrás de los distintos procesos ecológicos que influyen en el mantenimiento de la diversidad biológica tropical, y su interpretación a través de la observación de las relaciones e interrelaciones entre los distintos organismos que forman parte de la diversidad tropical. Poniendo en práctica y fortaleciendo su capacidad de observación e interpretación de la naturaleza.

DESCRIPCIÓN

Comprende la revisión de conceptos básicos y de actualidad en ecología tropical, lectura de artículos y discusión en foros y debates en clases. Visita y estadía en lugares escogidos por su diversidad de clima, flora y fauna. En cada sitio, habrá caminatas de reconocimiento y proyectos de grupo dirigidos por profesores. Estos proyectos evaluarán en el campo conceptos ecológicos y facilitarán el planteamiento de preguntas con el fin de entrenar a los estudiantes para llevar a cabo proyectos de investigación individual, en los últimos días de cada visita. En las noches habrá conferencias, sesiones de trabajo, discusiones, y preparación de informes. En todos los proyectos, se dará énfasis a la concepción teórica del problema, al análisis cuantitativo de los datos y a su interpretación ecológica y contarán con el apoyo de los profesores, computadoras y bibliografía-

106

OBJETIVOS

x Interpretar los conceptos teóricos, y aplicarlos en el diseño, toma de datos, interpretación de resultados y sustentación de proyectos de investigación, en ecología tropical.

x Reconocer las diferencias en comunidades y ecosistemas tropicales a través de la práctica de campo.

CONTENIDOS

1. Hipótesis que explican la diversidad en los trópicos x Teoría de los refugios hipótesis de la estabilidad; competencia, depredación, la

heterogeneidad del hábitat, teoría de nicho ecológico; la dinámica de claros.

2. Técnicas de muestreo y recolección de datos en campo x Diseño y preparación de un diseño de investigación corta ; revisión de las metodologías

de muestreo y análisis sobre un grupo de interés.

3. Interacciones ecológicas x Reconocimiento e interpretación de las Interacciones observadas en los distintos casos de

estudio; planta animal: frugivoría, dispersión de frutos y semillas; ecología de polinizadores (invertebrados y vertebrados); co-evolución de plantas y animales; diversidad biológica y funciones en suelos.

4. Estudios de caso

x Ecología del Bosque Nuboso (Cordillera de Talamanca; Cerro Jefe; El Gaital, Valle de Antón): Características del paisaje y la diversidad;; el viento;; bosque “enano”, disponibilidad de luz, altura del dosel, epífitas, epífilas y hemiepífita. Ventajas de las diferentes estrategias en relación a la competencia de luz. Formas de crecimiento de plantas y tipos de comunidad; porte de los árboles, densidad del sotobosque. Análisis de disturbios: la tala, los incendios, la agricultura, las pendientes y la erosión, otros impactos humanos; principales especies en peligro de extinción. Flora, principales familias: Asteraceae, Fabaceae, Poaceae, Apiaceae Ericaceae, Verbenaceae, Scrophulariaceae. Fauna: el problema del declive de los anfibios.

x Ecología del Bosque Lluvioso (Parque Nacional Darién, Soberanía, Portobello,

Chagres y San Lorenzo)

107

Ciclo de nutrientes, la fertilidad del suelo, las micorrizas. Formación del suelo: la textura del suelo: la cal, arcilla, arena, la estructura y textura del suelo; lixiviación de nutrientes. Estructura de los bosques: la composición, la cobertura, el perfil, la temperatura; estratos en un bosque tropical, árboles emergentes, tamaño y forma de la copa de los árboles, la competencia por luz y su influencia en la estructura del bosque: bejucos, lianas, epífitas, hemi-epífitas del sotobosque. Caídas de árboles, su origen y sus consecuencias: dosel interrumpido. Efecto de borde, papel de las especies pioneras. Floración: atracción de polinizadores; la co-evolución en relación con la floración no sincrónica. Fructificación, dehiscencia, ganchos, explosivos. La dispersión y depredación de semillas. Flora: especies de plantas de la selva. Fauna: las especies de animales de la selva. Disturbios y conservación: situaciones relevantes que afectan a los bosques tropicales, incluyendo la minería de oro, la explotación forestal, el desarrollo, la invasión humana, la caza.

x Ecología del Bosque Seco (P.N. Sarigua y P. N. Cerro Hoya; Punta Garachiné,

Darién) Características físicas: la alta radiación solar, la humedad baja. Los bosques secos de baja altitud. Los procesos ecológicos: la competencia y especialización de las especies en la zona. Productividad, la estacionalidad, ciclo de nutrientes, la fertilidad del suelo. Flora representativa. La perturbación y conservación: las granjas de camarón, el desarrollo de las costas, el pastoreo y el fuego, la deforestación y desertificación.

x Ecología de Bosques Costeros y Humedales (Oreyzales, manglares y cativales) Manglares, cativales y oreyzales ; árboles halófitos, zonas de transición, fluctuación de la marea. Alta productividad, la exportación de detritos de alta importancia, raíces poco profundas, suelos anaeróbicos y altos en CO2. Especies "vivíparas". Raíces aéreas: trampas de sedimentos para construir más tierra. Neumatóforos, tolerancia a concentraciones de sal; suelos arenosos, capacidad de colonización de costas expuestas.

ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Lectura y discusión de artículos, presentaciones orales, elaboración de resúmenes escritos sobre estudios de caso.

108

RECURSOS DIDÁCTICOS Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), , computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, transporte terrestre y acuático. EVALUACIÓN

x Dos exámenes parciales teóricos (25%) x Llecturas y discusión de artículos (10%) x Asistencia y participación en giras de estudio de caso, reporte y sustentación de informes

(40%) x Preparación, entrega y sustentación de monografía final (25%).

REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS Brenes, A. y V. F. Saborío. 1999. Elementos de Climatología, su aplicación didáctica a Costa Rica. Editorial Universidad Estatal a Distancia, San José, Costa Rica.

Bardgett, R. D., Usher, M.B y D.W. Hopkins. 2005. Biological Diversity and Functions in Soils. Cambridge University Press.UK.

Chazdon, R., L. y T. Whitmore C. (Eds.). 2002. Fundamentos de Biología Tropical. The University of Chicago Press.

Guariguata, M. y G. Kattan. (Eds.). 2002. Ecología y Conservación de Bosques Neotropicales. Libo Universitario Regional, San José, Costa Rica.

Gurevitch, J., Schneider, S.M. y G.A. Fox. The Ecology of Plants. 2006. Sinauer Associates, Inc.Publishers; Second Edition. Massachusetts, U.S.A.

Losos, E.C. and E. G. Leigh Jr. 2004. Tropical Forest Diversity and Dynamism. Finding from a large –Scale Plot Network.The University of Chicago Press, Chicago and London.

Monge-Nájera, J., Gómez-Figueroa, P. y M. Rivas-Rossi. 2001. Biodiversidad Tropical. Iera edición. Editorial Universidad Estatal a Distancia. San José, Costa Rica.

Roubik, D.W., Sakai,S. and A.A. Hamid Karim. 2005. Pollination Ecology and the Rain Forest. Sarawak studies. Ecological Studies 174. Springer Science+ Business Media.USA.

109

Smithsonian Tropical Research Institute (STRI), 1982. Evolución en los Trópicos. Traducciones: Pedro Galindo, Diomedes Quintero, Noris Sallazar, Ruth Sierra. Editorial Universitaria, Universidad de Panamá, Panamá.

Terborgh, J. 1992. Diversidad y el Bosque Tropical. Scientific American Library, Nueva York.

Asignatura : BIO 725 DENOMINACIÓN : ETOLOGÍA Créditos: 2

JUSTIFICACIÓN:

La Etología permite entender al animal como un todo, comprende no solo el estudio de la conducta animal, sino la misma, en condiciones naturales. Esta aproximación permite entonces aportar, en sentido práctico, al uso sostenible de los recursos animales para diversos fines. En el campo de la salud, por ejemplo, mediante la búsqueda de nuevas toxinas, drogas y medicamentos; ya que estos poseen técnicas terapéuticas innatas. Por razones similares, permite el uso racional de su carne y derivados para la nutrición humana. Así como el mejoramiento de técnicas de conservación en zoológicos y reservas naturales, con vistas a su conservación. Por último, la evolución humana está asociada a las técnicas de caza y recolección, condiciones que crearon una dependencia natural del hombre y las especies que le rodean; afinidad que ha sido denominada por los etólogos como biofilia.

DESCRIPCIÓN

Se estudian las principales metodologías utilizadas para entender las causas del comportamiento animal. Se continúa con el estudio de los mecanismos biológicos causales de la conducta (genético, neuronal, humoral y sensorial), el desarrollo de la conducta, el aprendizaje y la conducta o etología cognitiva. En tercer término se describen los principales patrones y la función de la conducta trófica y la defensa antipredatoria. Como cuarto interés se incluye una descripción de los patrones reproductivos, el cortejo, sistemas de apareamiento y cuidados parentales. Por último, se repasan los principales desarrollos asociados al entendimiento de la conducta social en los animales.

110

OBJETIVOS

1- Explicar las principales técnicas de estudio de la conducta animal. 2- Describir los más importantes patrones de conducta y sus causas internas y externas. 3- Explicar los principales mecanismos causales de la conducta animal.

CONTENIDOS

1.Introducción a la etología y sus métodos. Etología, psicología animal y conducta animal. Desarrollo y conceptos actuales de Etología. Materiales y métodos etológicos en el laboratorio y el campo. (Método descriptivo y Método cuantitativo) Clasificación de los diversos tipos de conductas (Causal, funcional e histórico).

2.Estímulos, emisores y receptores. 2.1 Clasificación moderna de los receptores. 2.2 Estimulo adecuado y estímulo señal.

3.Conceptos centrales de etología 3.1 Patrones Modales de Acción (PMA). 3.2 Encadenamientos de PMA. 3.3 Estímulo señal y Mecanismos desencadenadores Innatos (MDI). 3.4 Desencadenadores sociales. 3.5 Orientación animal (Taxias y tactismos) 3.6 Conceptos modernos sobre la orientación. 4.Evolución de la conducta. 4- Conducta Social. 4.1- Cooperación y comunicación. 4.2- Competencia, Agresión y Conciliación. 4.3- Las especies sociales. 5.Reproducción. 5.1- Procesos reproductores básicos. 5.2- Atracción y Cortejo. 5.3- Sistemas de apareamiento y competencia postcopulatoria. 5.4- Cuidados parentales. 5.5- Fisiología del Comportamiento

111

6.El Sistema Nervioso, el Sistema Endocrino y la Conducta. 6.1 Neuroetología. 6.2 Hormonas y conducta. 7.Desarrollo comportamental. 7.1 Desarrollo comportamental en anfibios. 7.2 Desarrollo comportamental en aves. 7.3 Desarrollo comportamental en mamíferos. 8.Aprendizaje y cognición. 8.1 Evolución del aprendizaje. 8.2 Tipos de aprendizaje 9.Etología cognitiva. 9.1- La etología cognitiva como ciencia. 9. 2- Formación de conceptos. 9. 3- Capacidad de aprender el lenguaje. 9. 4- Capacidad cuantitativa. 9. 5- Memoria y percepción. 9. 6- Procesos cognitivos complejos. 10- Conducta trófica y antipredatoria. ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS

1- Discusión de artículos científicos relevantes de cada tema. 2- Exposición de algunos aspectos relevantes de la conducta animal (Conferencias

Magistrales). 3- Exposición por especialistas en algunos de los temas a discutir. 4- Visitas de campo para familiarizarnos con los estudios etológicos de campo (Barro

Colorado, Cerro Campana, Parque Zoológico de Summit y otros). 5- Realización de proyectos cortos de investigación por los estudiantes.

112


AXELROD, R. y HAMILTON W.D. 1984. Evolution of cooperation in biological systems. En: Evolution of Cooperation. Ed. R. Axelrod. Cap. 5: 88 – 105. Basic Books.

BEKOFF, M. 1995. Cognitive ethology and the explanation of nonhuman animal behavior. En: Comparative Approach to Cognitive Science. Eds: J-A. Meyer y H.L. Roitblat. Pp. 119 – 150. Cambridge: MIT Press.

GRIFFIN, D.R. 2001. Animal Minds: Beyond Cognition to Counciusness. 1ª Edición. Chicago: Chicago University Press. 355. pp.

HALLIDAY, T. 1998. The Senses and Communication. 1ª Edición. Berlin: Springer-Verlag. 236 pp.

HAUSER, M.D. 2000. Wild Minds. What Animals Really Think. 1ª Edición. Nueva York: Henry Holt & Co. 315 pp.

HINDE, R.A. 1970. Animal Behaviour. 2ª Edición. Tokio: McGraw-Hill-Kagausha. 876 pp.

LORENZ. K. 1986. Fundamentos de la Etología. 1ª Edición castellana. Buenos Aires: Editorial Paidós. 349 pp.

MAIER, R. 2001. Comportamiento Animal: Un enfoque Evolutivo y Ecológico. 1ª Edición. Madrid: McGraw-Hill. 581 pp.

SEBEOK, T.A. 1977. How Animal Communicate. 1ª Edición. Bloomington, Indiana: Indiana University Press. 1128, pp.

WILSON E.O. 2002. Sociobiology: The New Synthesis. Edición 25 Aniversario. Cambridge: The Belknap Press of Harvard University Press. 697, pp.

113

Asignatura: BIO 726 Denominación: HERRAMIENTAS DE ANÁLISIS DEL PAISAJE Créditos : 4

JUSTIFICACIÓN

La investigación en fragmentación de hábitats es desde hace años uno de los campos más desarrollados dentro de la biología de la conservación , ya que este proceso está afectando a la biodiversidad a nivel mundial. La fragmentación ha sido descrita tradicionalmente como la división progresiva de un hábitat a priori relativamente continuo en un conjunto de fragmentos aislados y de menor tamaño, que quedan embebidos en una matriz de hábitat degradado, cualitativamente muy diferente al original. Por su parte, la conectividad ecológica, también llamada conectividad del paisaje, ha sido definida como la facilidad que presenta el territorio para el movimiento de las especies (individuos y genes) y otros flujos ecológicos entre las diferentes zonas de hábitat. La conectividad se considera clave para fomentar la persistencia y variabilidad genética de las poblaciones de flora y fauna, contribuyendo a mitigar los efectos negativos de la fragmentación de los hábitats y a permitir la adaptación de las especies frente a los desplazamientos en sus áreas óptimas de distribución debidos a los cambios del clima, de los usos del suelo y otros factores. Esto se ha llevado a la práctica mediante el fomento, diseño e implementación de áreas silvestres protegidas y corredores biológicos. La complejidad que suponen los cambios en el paisaje debidos a la fragmentación requiere llevar un análisis integral que permita integrar los conocimientos en los procesos de planificación, investigación y monitoreo para la conservación y el manejo sostenible de la biodiversidad. Adicionalmente exige la comprensión de la tecnología informática para gestionar y analizar información espacial, que permita establecer los diagnósticos, elaborar planes de manejo, el monitoreo y la evaluación de la efectividad de las áreas para la conservación de las especies y ecosistemas representativos.

DESCRIPCIÓN

Se abordan los conceptos fundamentales y las aplicaciones de metodologías, índices y herramientas informáticas de reciente desarrollo y uso libre, relacionadas con el análisis del paisaje con fines de realizar estudios sobre fragmentación de hábitat, el cual constituye una de las más serias amenazas a la biodiversidad y su conservación en la actualidad. Se abordarán los fundamentos y el manejo de herramientas de interés para el análisis de la conectividad y sus posibilidades de aplicación. Se estudian ejemplos prácticos, como el papel de los corredores biológicos. Se analizarán los componentes, aplicaciones y ventajas del uso de Sistemas de Información Geográfica para el anál

114

isis de datos espacialmente referenciados. Se combinará la discusión de los conceptos básicos y fundamentos teóricos, con la práctica de metodologías cuantitativas y herramientas de actualidad; como acceso a la web, uso de software, computador, mapas, GPS y otros equipos. También se proporcionan datos de ejemplos de situaciones y casos reales de interés, que permiten la práctica del uso de los paquetes de análisis, su utilización y posibilidades de aplicación en diversos estudios y procesos tendientes a la conservación y manejo de la biodiversidad. Cada participante contará con un ordenador individual para su uso durante el curso. El programa proporcionará las respectivas licencias con fines de enseñanza y también se hará uso de licencias libres en la web ampliamente utilizadas.

OBJETIVOS

x Adquirir conocimientos básicos para el estudio del paisaje como entidad global viva y dinámica.

x Familiarizarse con las herramientas y técnicas más utilizadas en el análisis y diseño del Paisaje.

x Apoyar la toma de decisiones en materia de identificación de prioridades de investigación, monitoreo, planificación y gestión de la conservación, mediante la identificación de zonas críticas para el mantenimiento o fomento de la conectividad ecológica, y la evaluación de los impactos de los cambios en el paisaje.

CONTENIDOS

1. Ecología del Paisaje. a. Definiciones de Paisaje y sus componentes

- Matriz, - Parche, - Corredores

o Dónde y cómo surge la disciplina y sus relaciones con otras disciplinas (Geografía . Fitosociología, Análisis Regional, etc.)

b. Escalas de análisis en Ecología del Paisaje.

2. Fragmentación de hábitats: patrones y procesos de cambio paisajístico y biológico a. Causas de los Patrones de Paisajes:

- Factores abióticos, - interacciones bióticas, - Cambios en el uso del suelo.

115

c. Consecuencias de la fragmentación - Fragmentación y Efecto de Borde - Conectividad y Corredores Biológicos.

3. Modelos conceptuales de paisaje

a. Modelo de islas b. Modelo de parche-matriz-corredor c. Modelo de paisaje abigarrado d. Modelo de paisaje continuo.

4. Heterogeneidad del Paisaje

a. Definición b. Caracterización.

5. Cuantificación de los Patrones de Paisaje

a. Fragmentación, b. Conectividad, índices de disponibilidad de hábitat c. Dinámica de parches.

6.. Análisis de datos espacialmente referenciados mediante Sistemas de Información Geográfica (SIG).

a. Aplicaciones, planificación ambiental, dinámica del paisaje, evaluación de impactos; prevención de desastres; agrícola; forestal; catastro.

b. Fuentes de datos geográficos: fuentes primarias y secundarias; bases de datos espaciales. Cartografía, principios, definición de mapas, ubicación y sistemas de

coordenadas, cálculo de escalas. Teledetección GPS (Sistema Global de Posicionamiento).

7. Aplicaciones

a. La Ecología del Paisaje en el diseño de políticas de conservación. (Estudio de caso: identificación de las zonas críticas para el mantenimiento de la conectividad del hábitat ).

b. La Ecología del Paisaje en el proceso de ordenamiento territorial. Microcuencas- sistemas agrícolas y otros elementos de la matriz.

c. Aplicación del modelo al análisis de la fragmentación de bosques en Panamá.

116

ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Discusiones de lecturas, e investigaciones cortas. Taller sobre uso de SIG. Taller de análisis del paisaje de un caso de estudio específico. RECURSOS DIDÁCTICOS Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc. EVALUACIÓN Dos pruebas teóricas y dos talleres o seminarios, de los cuales se obtendrá la ponderación de la calificación final. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS

Aliaga, G. y J. Peña Llopis. 2006. Sistemas de Información Geográfica aplicados a la Gestión del Territorio. Rev. geogr. Norte Gd., Santiago , n. 36, dic. 2006. Disponible en Formato Documento Electrónico(ABNT): <http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-34022006000200007&lng=es&nrm=iso>. accedido en 29 jul. 2014. http://dx.doi.org/10.4067/S0718-34022006000200007. Arroyo-Rodríguez V, Pineda E., Escobar F., y J. Benítez-Malvido. 2009. Value of Small Patches in the Conservation of Plant-Species Diversity in Highly Fragmented Rainforest. Conserv Biol 23: 729–739. Barredo Cano, J.I. 2006. SIstemas de Información Geográfica y Evaluación Multicriterio en la Ordenación del Territorio. Madrid, España. Edición RA-MA 270p. 2da edición. Fahrig, L. 2003. Effects of Habitat Fragmentation on Biodiversity. Annu Rev Ecol Evol Syst 34: 487–515. García, D. 2011. Efectos biológicos de la fragmentación de hábitats: nuevas aproximaciones para resolver un viejo problema. Ecosistemas 20 (2): 1-10.

117

Garmendia A, Arroyo-Rodríguez V, Estrada A, Naranjo E, and K.E. Stoner. 2013. Landscape and Patch Attributes Impacting Medium- and Large-Sized Terrestrial Mammals in a Fragmented Rain Forest. J Trop Ecol 29: 331–344.

Hernández-Ruedas, M.A.; V. Arroyo-Rodríguez, J. A. Meave, M. Martínez-Ramos, G. Ibarra-Manríquez, E. Martínez, G. Jamangape, F. P. L. Melo, y B. A. Santos. 2014. Conserving Tropical Tree Diversity and Forest Structure:The Value of Small Rainforest Patches in Moderately-Managed Landscapes. Centro de Investigaciones en Ecosi PLOS ONE Volume 9, issue:6 e98931. www.plosone.org. Jongman, R.H.G., Ter Braak, C.J.F. And O.F.R. Van Tongeren (Eds.) 2002. Data Analysis in Community and Landscape Ecology. Cambridge University Press.,UK., reprinted. 299pp. Kattan, G.H. (2002). Fragmentación: patrones y mecanismos de extinción de especies. En M. R. Guariguata y G. H. Kattan (Eds.), Ecología y conservación de bosques neotropicales (pp.561-590). Libro Universitario Regional. San José: Editorial Tecnológica de Costa Rica.

Laurance, W.F., Sayer, J., and K.G. Cassman. 2014. Agricultural Expansion and its Impacts on Tropical Nature. Trends Ecol Evol 29: 107–116. Laurance. W.F., Delamónica, P., Laurance, S.G., Vasconcelos, H.L. and T.E. Lovejoy. 2000. Rainforest Fragmentation Kills Big Trees. Nature 404: 836. Lindenmayer, D., Hobbs, R.J., Montague-Drake, R., Alexandra, J., Bennett, A. et al. 2008. A Checklist for Ecological Management of Landscapes for Conservation. Ecol Lett 11: 78–91. Melo, F.P.L., Arroyo-Rodríguez, V., Fahrig, L., Martínez-Ramos, M., and M. Tabarelli. 2013. On The Hope for Biodiversity-Friendly Tropical Landscapes. Trends Ecol Evol 28: 461–468. Moreno- Jiménez, A. 2006. Sistemas y Análisis de la Información Geográfica: Manual de Autoaprendizaje con ARCGIS. México, Ediciones AlfaOmega; 911p. Pardini, R., Bueno, A.A., Gardner, T.A., Prado, P.I., and J.P. Metzger. 2010. Beyond the Fragmentation Threshold Hypothesis: Regime Shifts in Biodiversity Across Fragmented Landscapes. PLoS ONE 5: e13666. Regos, A., Tapia, L., Vidal, M. y J. Domínguez. 2012. Teledetección y Sigs Como Fuentes de Información Ambiental en el Modelado de Distribución de Especies: El Caso Práctico del

118

Conejo Europeo. XV Congreso Nacional de Tecnologías de la Información Geográfica, Madrid, AGE-CSIC, 19-21 de Septiembre de 2012. Roarke, D. y J.M. Marzluff. 2004. Importance of Reserve Size and Landscape Context to Urban Bird Conservation. Conservation Biology, 18 (3), 733-745.

Sanderson, J., K. Alger, G. A . B. da Fonseca, C. Galindo-Leal, V. H. Inchausty and K. Morrison. 2003. Biodiversity Conservation Corridors: Planning, Implementing and Monitoring Sustainable Landscapes. Conservation International, Washington DC, USA. 41pp. Terradas, J. 2001. Ecología de la Vegetación: De la Ecofisiología de las Plantas a la Dinámica de Comunidades y Paisajes. Barcelona; Ediciones Omega. 703p. Vila Subirós, J., Varga Linde, D., Llausàs Pascual A. y A. Ribas Palom. 2006. Conceptos y Métodos Fundamentales en Ecología del Paisaje (Landscape Ecology). Una Interpretación Desde la Geografía. Doc. Anàl. Geogr. 48, 2006 151-166. Zev, N., Lieberman, A., Sarmiento, A. S., Ghersa, F.O., León C.M. y J. Rolando. 2001. Ecología de Paisajes: Teoría y Aplicación. Buenos aires, Editorial de la Facultad de Agronomía; 571 p.

Sitios WEB:

www.geogra.alcala.es (Master SIG)

www.giscampus.es (Master UNIGIS)

www.esri.com (Programa Arc/info)

www.clarklabs.org (Programa Idrisi)

www.opengis.com (Interoperabilidad)

www.dices.net (Portal SIG)

www.ncgia.ucsb.edu (Manual SIG, inglés)

http://www.geogra.alcala.es/

http://www.giscampus.es/

http://www.esri.com/

http://www.clarklabs.org/

http://www.opengis.com/

http://www.dices.net/

http://www.ncgia.ucsb.edu/

119

Asignatura: BIO 727 Denominación: CONSERVACION Y MANEJO SOSTENIBLE DE LA BIODIVERSIDAD Créditos: 3 JUSTIFICACIÓN

La acelerada deforestación de la selva húmeda tropical, la contaminación de aguas y suelos y la desaparición y/o amenaza de las especies de flora y fauna silvestres, son algunos de los problemas causados por dichas actividades. Para encarar estos problemas se requiere contar con profesionales con una sólida formación en el entendimiento de los procesos evolutivos y ecológicos que la explican, los problemas relacionados con la pérdida de la biodiversidad la formulación de estrategias de conservación y la evaluación del impacto de las actividades humanas sobre el medio ambiente y en especial, sobre la biodiversidad. Ello requieren del conocimiento de ciertas herramientas fundamentales que proporcionan una combinación de teoría ecológica y metodología aplicada para evaluar las amenazas a la biodiversidad, así como la comunicación de resultados que apoyen la toma de decisiones de manejo.

DESCRIPCIÓN

Se analiza la diversidad biológica en la región mesoamericana y en particular en Panamá; la situación actual, estado de conservación, las amenazas; usos y valores; las políticas, estrategias de conservación; marco legal e institucional; el sistema de áreas silvestres protegidas; gobernanza y financiamiento. Para ello, se ofrece al alumno una aproximación a las bases conceptuales y procedimientos, así como un análisis y discusión de las iniciativas nacionales e internacionales y su situación normativa. El temario aporta los contenidos básicos y suficientes para que el alumno progrese hacia los cursos más avanzados que le facultarán para incorporarse hacia la investigación aplicada y la gestión.

El alumno adquirirá conocimientos relacionados con el concepto de biodiversidad, como los niveles en los que se organiza, métodos de evaluación, amenazas y factores que contribuyen a su pérdida, así como el desarrollo del concepto de extinción. En este sentido, se proporcionará información sobre el estado de las especies vegetales y animales actualmente amenazadas o en peligro de extinción; así como los hábitats y sitios críticos para la conservación. Se analizarán ejemplos concretos de especies, valorando el estado actual de sus poblaciones, sus hábitats y las principales amenazas a las que están sometidos. Así como algunas de las medidas propuestas para su conservación. Se analizarán las políticas que promueven distintas estrategias de conservación y gestión de la biodiversidad, tales como los principales acuerdos y convenios internacionales al respecto (la Convención de Diversidad Biológica, la Conferencia de Río). El alumno conocerá también las comisiones a nivel de Mesoamérica y Panamá sobre la

120

conservación de los hábitats naturales y de la fauna y flora silvestre y su aplicación en la normativa legal e institucional.

OBJETIVOS

Adquirir conocimientos básicos sobre la gestión de recursos de flora y fauna, terrestre y acuática, así como de los ecosistemas naturales.

Manejar las herramientas conceptuales, instrumentales y normativas para la evaluación del estado de conservación del patrimonio biológico, la planificación y el desarrollo de proyectos dirigidos a la investigación, la conservación y el manejo de elementos de la biodiversidad y sus hábitats.

CONTENIDOS

1.Situación actual de la biodiversidad

x Diagnósticos e inventarios nacionales x Usos y valores de la biodiversidad, x Especies endémicas, raras, comerciales, exóticas, cultivadas, invasoras. x Estado de conservación de especies y ecosistemas

Listas rojas de especies, metodologías para la incorporación de especies a las listas.

Ecoregiones, ecosistemas y hábitats críticos para la conservación

2.Valores de la biodiversidad

x Recursos de la biodiversidad. x Beneficios sociales x Servicios ecosistémicos x Otros valores de la biodiversidad

3.Pérdida de la biodiversidad

x Impacto de actividades humanas, amenazas; Cambio de uso de la tierra,

121

Fragmentación de hábitats; Destrucción de hábitats

x Vulnerabilidad a los cambios climáticos Sistemas biológicos terrestres Sistemas marinos y de aguas continentales Sistemas de gestión y sistemas humanos Impactos regionales: América Latina.

4.Alternativas a la pérdida de la biodiversidad

x Estrategias y políticas de conservación x Conservación in situ:

Restauración de hábitats El Sistema de Areas Silvestres Protegidas Corredores Biológicos

x Conservación ex situ: x Bancos de Germoplasma x Técnicas de cultivo in vitro, crioconservación x Jardines Botánicos y Arboretos x Reservas Cinegéticas; tipos de caza, modelos de gestión cinegética x Zoocriaderos, Zoológicos; Acuarios. x Vacíos de información.

5.Marco legal e institucional

x Normativa legal en conservación y biodiversidad x Planes de manejo, ordenación y monitoreo

De bosques Pesca de especies continentales y marinas, períodos de veda De especies de interés cinegético De especies amenazadas y en peligro

6.Gobernanza y manejo participativo

x Concepto de gobernanza x Principales actores x Fortalecimiento de las capacidades locales x Manejo participativo.

122

7-Financiamiento internacional y local

x Mecanismos de Desarrollo Limpio, x Protocolo de Kyoto, x Programa REDD x Bonos verdes x Bonos de carbono.

8.Cambios Climáticos Globales

x Mitigación Áreas silvestres protegidas Bosques Humedales continentales Ecosistemas costero-marinos Suelos

x Adaptación Áreas silvestres protegidas Desastres naturales Disponibilidad de agua Pesquerías marinas y de agua dulce Recursos genéticos Biodiversidad y resiliencia de los ecosistemas.

x Oportunidades e implicaciones para la gestión y la gobernanza en las áreas protegidas Recomendaciones de políticas.

ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Presentación dialogada con discusiones entre los participantes; estudios de caso; visitas; entrevistas a actores claves; giras de estudio. RECURSOS DIDÁCTICOS Retroproyectores, proyector de diapositivas, proyector de datos (“data show”), ilustración con material del laboratorio, computadoras, videos, pizarra, tiza multicolor, cámara digital, etc.

123

EVALUACIÓN Dos pruebas teóricas (60%) Un trabajo monográfico final, sustentado oralmente (40%).


Arribas, P.; Abellán,P.; Velasco,J.; Bilton, D.T.; Lobo, J.M.; Millán, A.; y D. Sánchez-Fernández. 2012. La vulnerabilidad de las especies frente al cambio climático, un reto urgente para la conservación de la biodiversidad. Ecosistemas: 21 (3) 79-84. Burgiel, Stanley W. Muir, Adrianna A.2010. Invasive species, climate change and ecosystem-based adaptation : addressing multiple drivers of global change. IUCN/ Global Invasive Species Programme (GISP), ZA, Washington, D.C. Bennett, G. 2004. Integrating biodiversity conservation and sustainable use : lessons learned from ecological networks.IUCN Commission on Ecosystem Management CIPAV (Fundación Centro de Investigación en Sistemas Sostenibles de producción Agropecuaria). 2003. Restauración de suelos y vegetación nativa: ideas para una ganadería andina sostenible. Apotema , Medellín, 96 p. Comisión Centroamericana de Ambiente y Desarrollo, CCAD. 2003. Estrategia regional para la conservación y uso sostenible de la biodiversidad en Mesoamérica. Corredor Biológico Mesoamericano. Guatemala. Dudley, N., Stolton, S., Belokurov, A., Krueger, L., Lopoukhine, N., MacKinnon, K., Sandwith, T. and N. Sekhran. (Editores). 2009. Soluciones Naturales: Las Áreas Protegidas Ayudan a las Personas a Enfrentar el Cambio Climático. IUCN-WPA, TNC, PNUD, WCS, El Banco Mundial, y WWF, Gland , Suiza, Washington, D.C. y Nueva York, EE.UU. FAO. 2005a. Contribución de los bosques a los objetivos de desarrollo del milenio (17 Período de sesiones). Roma, Italia: Comité de Montes, FAO. Forero, A., y Finegan, B. 2002. Efectos de borde en la vegetación de remanentes de bosque muy húmedo tropical, en el norte de Costa Rica y sus implicaciones para el manejo y la conservación. Revista Forestal Centroamericana, (edición especial) 38, 39-43. Fundación Centro para la Investigación en Sistemas Sostenibles de Producción Agropecuaria, CIPAV. 2003. Restauración de suelos y vegetación nativa: ideas para una ganadería sostenible.

124

Cali, Colombia: CIPAV, GEF, Banco Mundial, CATIE, Nitlapán, American Bird Conservancy, CRQ, CVC. Galindo-Leal, C., Jacobsen, T. R., Langhammer, y P. F., Olivieri, S. 2003. State of hotspots: the dynamics of biodiversity loss. En C. Galindo-Leal e I. Gusmao- Camara (Eds.), The Atlantic forest of South America. Biodiversity status, threats, and outlook, (pp.12-23). Center for Applied Biodiversity Science at Conservation International. Washington-Covelo- London: Island Press.

García- Montiel, D.C. 2002. El legado de la actividad humana en los bosques neotropicales contemporáneos. En M.R. Guariguata y G.H. Kattan (Eds.), Ecología y conservación de bosques neotropicales (pp. 98-116). Libro universitario regional. San José: Editorial Tecnológica de Costa Rica.

García, Randall. 2002. Biología de la Conservación: Conceptos y Prácticas. Instituto Nacional de Biodiversidad, INBIO; Heredia, Costa Rica. 168p.. González- Espinosa, M.; Reyes-Benayas, J. M. y N. Ramírez-Marcial (Eds.).2008. Restauración de Bosques en América Latina. Mundi-Prensa, Fundación Internacional para la Conservación de Ecosistemas(FIRE). México, 252 p. Hannah, I., G. F. Midgley, T. Lovejoy, W. J. Bond, M. Bush, J. C. Lovett, D. Scott and F. I. Woodward. 2002.Conservation of biodiversity in a changing climate.Conservation Biology 16(1): 264-268.

Harvey, C.A. y J. C. Sáenz (Eds.) 2008. Evaluación y Conservación de Biodiversidad en Paisajes Fragmentados de Mesoamérica. Instituto Nacional de Biodiversidad, INBIO; Heredia, Costa Rica.624 p. Hill, D., Fasham, M., Tucker, G., Shewry, M. and P. Shaw. /Editors). 2005. Handbook of Biodiversity Methods. Survey, Evaluation and Monitoring, Cambridge Univ. Press, 573 p. Kaimowitz, D. 2002. Las causas subyacentes de la deforestación en el trópico. En M.R. Guariguata, y G.H. Kattan (Eds.), Ecología y Conservación de Bosques Neotropicales (pp.597). Libro universitario regional. San José: Editorial Tecnológica de Costa Rica.

Kingsford, R. and Biggs, H. C. 2012. Strategic adaptive management guidelines for effective conservation of freshwater ecosystems in and around protected areas of the world. IUCN World

125

Commission on Protected Areas (WCPA)/ IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA), Freshwater and Protected Areas Task Force/Australian Wetlands and Rivers Centre (AWRC), AU/ University of New South Wales, AU/ South African National Parks (SANParks), ZA/ Australia, Murray-Darling Basin Authority (MDBA).

Louman, B. Et al. 2001. Silvicultura de Bosques Latifoliados Húmedos con Énfasis en América Central. CATIE, Costa Rica. 265 p.

Madrigal Cordero, Patricia y V. Solís Rivera. 2000. Diagnóstico sobre el ordenamiento jurídico e institucional de la biodiversidad en Panamá. IUCN, Oficina Regional para Mesoamérica.

Nichols, O.G., y Nichols, F.M. 2003. Long- term trends in faunal recolonization after bauxite mining in the Jarah forest of South-Western Australia, Restor. Ecology, 11, 261-272.

Organización Internacional para las Maderas Tropicales, OIMT. 2002. Directrices de la OIMT para la restauración, ordenamiento y rehabilitación de bosques tropicales secundarios y degradados.Yokohama:OIMT. Pagiola S., Agostini, P., Gobbi, J., de Haan, C., Ibrahim, M., Murgueitio, E., et al. 2004. Pago por servicios de conservación de la biodiversidad en paisajes agropecuarios. (Informe No. 96-40). Environmental Economics Series, The World Bank. Pedroni, L. y R. Camino. 2001. Un Marco lógico para la formulación de manejo forestal sostenible. CATIE, Costa Rica. 38 p. Peres C.A., y Laurance W. F. 2006. Synergistic effects of simultaneous environmental changes. En W. F. Laurance y C. A. Pérez (Eds.), Emerging Threats to Tropical Forests (pp.81-86). Chicago, London: The University of Chicago Press. Sabogal, C., de Jong, W., Pokorny, B. y B. Louman (editores). 2008. Manejo Forestal Comunitario en América Latina. Experiencias, Lecciones Aprendidas y Retos para el Futuro. CIFOR, CATIE; Belem, Brasil. 294 p. Schroth, G.; da Fonseca, G.A.B.; Harvey, C.A.; Gascon, C.; Vasconcelos, H.L., and A.M.N.Izac. 2004. Agroforestry and Biodiversity Conservation in Tropical Landscapes.Island Press, Washington, Covelo; London. 523p.

Southerland, W. 2000. The Conservation Handbook Research, Management and Policy. Blackwell Sciences. Oxford. 278 p.

126

Asignatura: BIO 728 Denominación: CONSERVACIÓN DE ÁREAS SILVESTRES PROTEGIDAS Créditos: 3 JUSTIFICACION Durante mucho tiempo se pensó que protegiendo una superficie determinada de espacio natural, como las áreas silvestre, se aseguraría la supervivencia de las especies que allí habitan. Sin embargo, en la actualidad el manejo de las áreas naturales protegidas enfrenta serios problemas debido a su fragmentación, poniendo en peligro la supervivencia su biodiversidad. Entonces resulta evidente que es necesario conocer mejor la estructura y funcionamiento de los ecosistemas protegidos, para lograr un manejo adecuado. Ello requiere un conocimiento de los principios ecológicos, así como la comprensión de los procesos que operan en el área y la aceptación del concepto de que el manejo de áreas protegidas es otra forma especializada de uso de la tierra. Dado que los espacios naturales son caracterizados principalmente por su biodiversidad, es importante y necesaria la participación de biólogos en la búsqueda de soluciones a los problemas planteados. Sin embargo, también es importante que aquellos que participen en el esfuerzo para mejorar el manejo de las áreas silvestres comprendan los conceptos básicos que las rigen. Es por esto que deben conocer las técnicas para la planificación y manejo de lo espacios naturales protegidos; así como, los aspectos legales, sociales y económicos involucrados. DESCRIPCION Se proporcionan los conceptos teóricos y las herramientas metodológicas básicas, que permiten comprender y desarrollar los procesos de planificación necesarios para el buen funcionamiento de un área protegida. En el curso se incorporan conceptos ecológicos aplicados al manejo de áreas protegidas, metodologías para la elaboración de planes de manejo, programas de monitoreo, métodos de manejo participativo, normativa de uso, zonificación, oportunidades de usos y determinación de la capacidad de carga turística de las áreas silvestres protegidas. Se examinan los detalles de la planificación y gestión de las áreas silvestres protegidas, una de las herramientas en la gestión del medioambiente. Se presentarán y discutirán las características y especificaciones de las distintas figuras de protección de espacios naturales, según la normativa internacional (parques y reserva naturales; monumentos naturales,etc.) y se analizarán ejemplos de espacios naturales protegidos en Panamá.

127

OBJETIVOS Proporcionar a los estudiantes los principales conceptos, principios, métodos y técnicas de manejo de áreas protegidas, que le permitan participar exitosamente en el manejo de áreas silvestres. Ofrecer a conocer a los biólogos un nuevo escenario para la aplicación de sus conocimientos profesionales, con el propósito de lograr un uso adecuado de las áreas silvestres. Fomentar el enfoque interdisciplinario y el trabajo en equipo para identificar y resolver los problemas que afectan a las áreas silvestres protegidas. CONTENIDOS Módulo 1. Antecedentes en el manejo de áreas silvestres.

x Antecedentes históricos generales del manejo de áreas silvestres. x Antecedentes históricos del manejo de áreas silvestres en Panamá. x Conceptos, definiciones y tendencias relativas al manejo de áreas silvestres.

Módulo 2. Situación de las áreas silvestres en Panamá. x Sistema Nacional de áreas protegidas. x Marco legal e institucional para el manejo de áreas silvestres protegidas. x Conflictos en el manejo de áreas silvestres protegidas.

Módulo 3. La planificación y manejo de áreas silvestres x Conceptos ecológicos aplicados al manejo de áreas protegidas. x Elaboración de Planes de manejo. x Monitoreo de la biodiversidad en áreas protegidas. x Manejo participativo. x Instrumentos de normativa y zonificación. x Capacidad de carga turística de las áreas silvestres protegidas.

Módulo 4. Beneficios sociales, económicos y ambientales de las áreas silvestres. x Las áreas silvestres protegidas y su influencia sobre las comunidades locales. x Las actividades humanas en las zonas de amortiguamiento y en el interior de las áreas

protegidas. x Servicios y beneficios ambientales que ofrecen las áreas protegidas. x Los usos turísticos y recreativos asociados a las áreas silvestres protegidas.

Módulo 5. Evaluación de Planes de manejo y sistemas de áreas protegidas. x Metodología de evaluación. x Efectividad del manejo e Indicadores. x Estudio de caso.

128

ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS Las clases son presénciales, donde el docente presentará los temas centrales para la discusión. Los estudiantes desarrollarán los temas expuestos mediante discusiones en grupo y lecturas asignadas. Además, los estudiantes tendrán la responsabilidad de preparar informes, producto de consultas sobre temas asignados. Como complemento se realizarán estudios de caso, sobre planes de manejo de bosques naturales. El curso estará basado en una revisión amplia de los conceptos teóricos, principios, métodos y técnicas de manejo de áreas silvestres protegidas, así como el estudio de casos exitosos y logros del Sistema Nacional de Áreas Protegidas (SINAP) de Panamá. EVALUACIÓN Participación en análisis de lecturas debates y foros de discusión (35%), sustentación oral de trabajos de investigación (35%) y presentación de monografía como trabajo final del curso (35%). REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS Balmford, A., A. Bruner, P. Cooper, R. Costanza, S. Farber, R. E. Green, M. Jenkins, P. Jefferiss, V. Jessamy, J. Madden, K. Munro, N. Myers, S. Naeem, J. Paavola, M. Rayment, S. Rosendo, J. Roughgarden, K. Trumper,R. K. Turner. 2002. Economic reasons for conserving wild nature. Science Vol. 297: 950-953. Balmford, A. and T. Whitten. 2003. Who Should Pay for Tropical Conservation, and How Could the Costs be met? Oryx 37 (2): 238-250. Barber, C. V., Miller, K. and M. Boness. 2004. Securing protected areas in the face of global change : issues and strategies. IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA). Borrini, G.; Dudley, N.; Jaeger, T.; Lassen, B.; Pathak, N.; Phillips, A.; Sandwith, T. 2013. Governance of protected areas : from understanding to action. Biodiversity and Protected Area Management (BIOPAMA) Programme/ Convention on Biological Diversity (CBD), Secretariat/ Germany, Federal Ministry for Economic Cooperation and Development/ ICCA Consortium/ IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA).

129

Cairns, S.; Dudley, N.; Hall, C.; Keeneleyside, K. and S.Stolton. 2012. Ecological restoration for protected areas : principles, guidelines and best practices. IUCN; Canada, Parks Canada; Convention on Biological Diversity (CBD), Secretariat; IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA); Protected Planet; Society for Ecological Restoration International, USA. Borrini, G. ; Kothari, A. and G. Oviedo. 2004. Indigenous and local communities and protected areas : towards equity and enhanced conservation. Cardiff University, Department of City and Regional Planning, UK/ IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA). Day, J.; Dudley, N.; Hockings, M.; Holmes, G.; Laffoley, D. D'A. Stolton, S.; and S. Wells. 2012. Guidelines for applying the IUCN protected area management categories to marine protected areas. Convention on Biological Diversity (CBD), Secretariat/ IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA)/ Protected Planet/ UNEP-WCMC. Dudley, Nigel Stolton, Sue. 2007. Defining protected areas : an international conference in Almeria, Spain, May 2007. IUCN, IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA). Dudley, N. and A. Phillips. 2006. Forests and protected areas : guidance on the use of the IUCN protected area management categories. IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA)/ Cardiff University, UK. Eagles, P. F. J.; McCool, S. F. and C. D. Haynes.. 2002. Sustainable tourism in protected areas : guidelines for planning and management. IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA)/ UNEP/ World Tourism Organization.

García Mora, M. R. 2003. Conectividad ambiental : las áreas protegidas en la cuenca mediterránea. España, Junta de Andalucía, Red de Espacios Naturales Protegidos de Andalucía/ IUCN Centre for Mediterranean Cooperation, España.

Hamú, D.; Auchincloss, E.; and W. Goldstein. 2004. Communicating protected areas. IUCN Commission on Education and Communication (CEC).

Hockings, M.; Stolton, S.; Leverington, F.; Dudley, N. and J. Courrau. 2006.Evaluating effectiveness : a framework for assessing management effectiveness of protected areas. IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA)/James Cook University, AU/Rainforest CRC, AU.

130

IUCN. 2003.The Central American system of protected areas : more than three decades of conceptualization and management challenges. Conservation International/ Nature Conservancy, USA/ PROARCA/ IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA)/ Corredor Biológico Mesoamericano.

Miller, K. 1980. Planificación de Parques Nacionales para el Ecodesarrollo en Latinoamérica. Ed. Fund. para la Ecología y la Protección del Ambiente FEPMA. España.

Morales, R. y Cifuentes, M. 1989. Sistema Regional de Áreas Silvestres Protegidas en América Central. Plan de acción 1989-2000. Centro Agronómico Tropical de Investigaciones y Enseñanza. Turrialba, Costa Rica.

OMT – PNUMA. 1995. Directrices para la Ordenación de los Parques Nacionales y Zonas Protegidas para el Turismo. Serie Informes Técnicos N° 13. OMT/ PNUMA.

Smith, G.; Jakubowska, J.; and I. May. 2000. A global overview of protected areas on the World Heritage list of particular importance for biodiversity. UNEP-WCMC, IUCN.

Scherl, L. M.;Wilson, A. W.; Blockhus, R.; Franks, J.M.; Mcneely, Jeffrey , P. ; Mcshane, A.; and A. Thomas. 2004. Can protected areas contribute to poverty reduction ? Opportunities and limitations,IUCN, GEF, WWF, CARE International and World Bank.

Thomas, Lee and J. Middleton. 2003. Guidelines for management planning of protected areas. IUCN World Commission on Protected Areas (WCPA)/University of Cardiff, Department of City and Regional Planning, UK.

Vreugdenhil, D.; Terborgh, J.; Cleef, A. M.; Sinitsyn, M.; Boere, G. C. ; Archaga, V.L. and Prins, H.H.T. 2003.Comprehensive protected areas system composition and monitoring. World Institute for Conservation and Environment, USA.

131

Asignatura: BIO 729 Denominación: SEMINARIO DE TESIS II Créditos: 1 JUSTIFICACION

La necesidad de la presentación de los proyectos de investigación, artículos científicos y la Escritura de los mismos una prioridad para el investigador, por lo que se requiere de un curso donde el estudiante adquiere los conocimientos y destrezas para el desarrollo de estas actividades.

DESCRIPCION

En este curso el estudiante debe presentar los avances de la tesis de grado en forma oral y escrita, utilizando las metodologías apropiadas para la escritura de todo proyecto de investigación.

OBJETIVOS GENERALES: Conocer las principales técnicas de presentación de los proyectos de investigación y redacción de artículos científicos.

OBJETIVOS ESPECÍFICOS: x Revisión de los avances en la formulación del Anteproyecto de Tesis. x Aprobación e inscripción del Anteproyecto de Tesis.

CONTENIDO DEL CURSO: x Elaboración y discusión del proyecto de trabajo de grado. x Revisión de la literatura científica sobre tópicos seleccionados y relacionados con aspectos

biológicos. x Presentación de un trabajo escrito y discusión oral del mismo, preferentemente de los

avances del trabajo de grado. METODOLOGÍA: Al ser un curso presencial al nivel de maestría, este se centrará en estrategias andragógicas con apoyo de las TIC s. No obstante, la implementación de las innovaciones tecnológicas no deja de lado estrategias metodológicas que propician el pensamiento analítico. Se propone la exposición y evaluación de los distintos temas escogidos por los estudiantes y el debate inherente a estos a

132

cada uno de los temas, así como las correcciones en forma de los escritos a fin de pulir lo mayormente posible sus Anteproyectos de Tesis. EVALUACIÓN Inicialmente de completará una evaluación diagnóstica y durante la marcha del curso, se realizarán evaluaciones formativas. A nivel cuantitativo – sumativo, se propone el siguiente esquema que se discutirá con los participantes: CRITERIO PORCENTAJE Asistencia y participación activa 10 % Asignaciones individuales 30 % Actividades grupales en clase (talleres) 20 % Proyecto final 40 % TOTAL 100 % La calificación de este curso está sujeta a la debida inscripción de sus anteproyectos de tesis en la Vicerrectoría de Investigación y Postgrado.

1. Unidad responsable

Vicerrectoría de Investigación y Postgrado

10. Unidad ejecutora Facultad de Ciencias Naturales, Exactas y Tecnología

11. Modalidad El programa propuesto es una Maestría Académica que deberá ser completado con Tesis de grado. La Coordinación del Programa tomará las providencias para orientar académicamente al estudiante mediante tutorías.

12. Duración 2 años

133

13. Regimen académico

13.1. Requisitos de Admisión Poseer título universitario de Licenciatura en Biología o Ciencias afines.

Demostrar solvencia económica o apoyo de entidad pública o privada que garantice el financiamiento de los costos en la Maestría.

Someterse a entrevistas con el Comité de Admisión.

Presentar los siguientes documentos personales:

a. Formulario de admisión completo.

b. Tres copias autenticadas del título académico.

c. Tres copias autenticadas del certificado oficial de calificaciones, que incluya la escala de calificaciones y el sistema de créditos universitarios, incluyendo su traducción al español, si fuese necesario.

d. Copia de la cédula de identidad personal o un documento equivalente.

e. Tres fotografías tamaño carnet (con el nombre al reverso).

f. Curriculum vitae (datos personales, antecedentes académicos, experiencia docente y profesional, investigaciones realizadas, publicaciones, asesorías, distinciones académicas, etc.)

g. Certificado médico de buena salud física y mental.

h. Dos cartas de recomendación de profesionales del área.

i. Constancia del financiamiento, durante del periodo de estudios, de los gastos personales y de colegiatura.

g) Comprobar un nivel intermedio en inglés como mínimo, determinado por el Centro de Lenguas de la Universidad.

134

13.2. Requisitos de Selección La selección de los aspirantes será efectuada en primera instancia por el Comité de Admisión del Programa y posteriormente los resultados serán sometidos a la Comisión Académica del Programa, quien tomará la decisión final. La selección se efectuará tomando en consideración el cumplimiento de los requisitos de admisión.

La apertura de cada opción estará condicionada a un mínimo de cinco (5) estudiantes. Se espera que el número de estudiantes admitidos en el programa sea de 10 a 16 estudiantes.

13.3. Requisitos de Permanencia Lo establecido en el Reglamento General de Estudios de Postgrado.

13.4. Requisitos de Egreso a) Haber aprobado las asignaturas del Plan de Estudio.

b) Mantener, durante sus estudios un índice no menor de 2.0.

c) Comprobar su dominio del uso de la computadora

d) Elaborar y sustentar oralmente ante un Comité Académico designado por la Comisión Académica, una tesis de grado desarrollada en una de las áreas de Investigación de Ciencias Biológicas.

e) Haber cumplido con todos los requisitos administrativos y académicos del Programa.

f) Demostrar un dominio del idioma inglés no inferior a 500 en el TOEFL ( Test of English as a Foreign Language).

14. Recursos humanos En la Universidad de Panamá laboran profesionales de la Biología con el grado de Doctor y con grado de Maestría.

El personal docente del programa de maestría será nombrado de conformidad con lo establecido en el Estatuto y el Reglamento General de Estudios de Postgrado de la Universidad de Panamá. Para tal fin, serán elegibles los profesores que laboran en los departamentos académicos de la Universidad de Panamá, centros e institutos de investigación, en la industria, y en las

135

universidades o instituciones nacionales o extranjeras que mantengan acuerdos o convenios de cooperación con la Universidad de Panamá. Se están cursando invitaciones a profesores del extranjero, por medio de los convenios y demás acuerdos que tiene la Universidad de Panamá y la Secretaría Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación. A los profesores invitados se les ofrecerá hospedaje y un estipendio diario para alimentación y gastos personales menores. Cuando la selección del docente recaiga en un extranjero, se nombrará también, a título de homólogo, a un profesor que ejerza la docencia en la Universidad de Panamá.

15. Instalaciones y facilidades

Para desarrollar esta maestría se cuenta con la siguiente infraestructura y recursos:

Laboratorios de Departamentos de la escuela de Biología – FCNET

Laboratorios científicos - Edificio Laboratorios Científicos – Gemelos VIP

Museos de la Facultad de Ciencias Naturales, Exactas y Tecnología

Instituto Especializado de Análisis

Biblioteca Simón Bolívar

Instituto Conmemorativo Gorgas

Instituto de Medicina Forense

Complejo Metropolitano de la Caja del Seguro Social Harmodio Arias Madrid

Colecciones bibliográficas de profesores e investigadores

Recursos de apoyo de SENACYT (Computadores, INTERNET 2, Talleres, Documentación, etc.)

Laboratorios de STRI apoyado en el convenio con la universidad de Panamá.

Apoyo de Profesores de Universidades extranjeras con las que se mantiene convenios marcos.

136

16. Costos Rubro Costo

Pre-inscripción B/. 50.00

Matrículas (c/u) B/. 30.00

Créditos (c/u) B/. 60.00

Laboratorios (c/u) B/. 50.00

Inscripción de Tesis B/. 300.00

Además de los costos arriba mencionados, el estudiante deberá pagar los costos establecidos en concepto de:

Carnet B/. 1.00 (anual)

Cafetería B/. 2.00 (semestral)

Bienestar estudiantil B/. 1.00 (semestral)

Seguro Colectivo estudiantil B/. 1.50 (semestral)

Biblioteca B/. 1.00 (semestral)

Deporte B/. 1.00 (semestral)

Diploma B/. 80.00

Créditos Oficiales B/. 3.00

Paz y Salvo Finanzas B/. 2.00

Orientación en Biología Molecular RUBROS CANTIDAD COSTOS

Propedéutico 1 x 225.00 225.00 Pre-inscripción 1 x 50.00 50.00 Matrículas 6 x 30.00 180.00 Créditos 54 x 60.00 3240.00 Laboratorio 2 x 50.00 100.00 Carné anual 2 x 1.00 2.00 Servicios Universitarios

Cafetería 4 x 2.00 8.00

137

Bienestar estudiantil 4 x 1.00 4.00 Seguro Colectivo estudiantil 4 x 1.50 6.00

Biblioteca 4 x 1.00 4.00 Deporte 4 x 1.00 4.00

Derecho a Tesis 1 x 300.00 300.00 Diploma 1 x 80.00 80.00 Créditos oficiales 1 x 3.00 3.00 Paz y Salvo Finanzas 1 x 2.00 2.00 TOTAL: B/. 3,543.00 B/. 4208.00

Orientación en Biodiversidad y Conservación RUBROS CANTIDAD COSTOS

Propedéutico 1 x 225.00 225.00 Pre-inscripción 1 x 50.00 50.00 Matrículas 6 x 30.00 180.00 Créditos 54 x 60.00 3240.00 Laboratorio 1 x 50.00 50.00 Carné anual 2 x 1.00 2.00 Servicios Universitarios

Cafetería 4 x 2.00 8.00 Bienestar estudiantil 4 x 1.00 4.00

Seguro Colectivo estudiantil 4 x 1.50 6.00 Biblioteca 4 x 1.00 4.00

Deporte 4 x 1.00 4.00 Derecho a Tesis 1 x 300.00 300.00 Diploma 1 x 80.00 80.00 Créditos oficiales 1 x 3.00 3.00 Paz y Salvo Finanzas 1 x 2.00 2.00 TOTAL: B/. 3,543.00 B/. 4158.00

138

17. Candidatos a la nueva promoción 1 Som monn Iglesias [email protected] 2 Digna Caicedo Perea [email protected] 3 Eric Pérez [email protected] 4 Yexenia Cárdenas y. [email protected], 5 Adriana Spence Brown [email protected] 6 Leonel Rivera [email protected] 7 Yazmín Oliveros [email protected] 8 Fátima Frías [email protected] 9 Marie Mela [email protected]

10 Diógenes Anderson [email protected] 11 Noemí Ortega [email protected] 12 Daisy Serrano [email protected] 13 Daisy Ayarza [email protected] 14 Karina Beitia [email protected] 15 Carlos Bracho [email protected] 16 María Magallón [email protected] 17 Aurelio Johnson [email protected] 18 Erasmo Rodríguez [email protected] 19 Eblis Díaz [email protected] 20 Luis Camarena [email protected] 21 Mahody diaz [email protected] 22 Roxana Pimentel [email protected] 23 Julia Moreno [email protected] 24 Rudolph Hansen [email protected] 25 Reyla Barrera [email protected] 26 Genaro Winford [email protected] 27 Yasury Ruíz [email protected] 28 Orlando Ortiz [email protected] 29 Kahoris Lasso [email protected] 30 Aziel Chavarría [email protected] 31 Stephanie Bósquez [email protected] 32 Librada Atencio [email protected] 33 Ibeth Polo [email protected] 34 Isis contreras [email protected] 35 Úrsula Vargas [email protected] 36 Mireya Rodríguez [email protected] 37 Celeste Rubio [email protected] 38 Marcos Hugmes [email protected] 39 Lany Valdez [email protected] 40 Rosa Gálvez [email protected] 41 Estefani Martínez [email protected]

mailto:[email protected],

mailto:[email protected]



































139

42 Christel Ramos [email protected] 43 Argelis romero [email protected] 44 Amarilis Malter [email protected] 45 Yasury Ruíz [email protected] 46 Julia Moreno [email protected] 47 Leyda Rodríguez [email protected] 48 Yoselyn Álvarez [email protected] 49 Roselvy barrios [email protected] 50 Ana Raquel Lenny [email protected] 51 Lissette Jurado [email protected] 52 Marcelo Mack [email protected] 53 Azael Gonzales [email protected] 54 Indira Pinzón [email protected] 55 Milex Molinar [email protected] 56 Geniva de Nightingale [email protected] 57 Joel Sánchez [email protected] 58 Yaraví Suarez yaraví[email protected] 59 Patricia Pérez [email protected] 60 Carlos Martínez [email protected] 61 Gabriela Pobeda [email protected] 62 Celideth Zuñon [email protected] 63 Vladimir Loaiza [email protected] 64 Máximo Jiménez [email protected] 65 Javier Mancilla [email protected] 66 Marggie Rodríguez [email protected] 67 Martha Gómez [email protected] 68 Osiris Murcia [email protected] 69 Marcos Hughes [email protected] 70 Beatriz Sosa [email protected] 71 Lizbeth Chacón [email protected] 72 Mayra Contreras [email protected] 73 Melvys Vega [email protected] 74 Lorena L. Adames T. [email protected]





















140

18. Evaluación del programa (2011) La Agencia Centroamericana de Acreditación de Postgrado ACAP revisó exhaustivamente el Informe de Evaluación Externa de la Maestría en Ciencias Biológicas de la Universidad de Panamá y de su Comité Técnico de Evaluación de forma positiva. La Secretaría Ejecutiva de la Agencia Centroamericana de Acreditación de Postgrado ACAP notificó en consecuencia la acreditación del Programa de Maestría en Ciencias Biológicas por un periodo de tres años mediante Oficio/101/2014/ACAP del 15 de julio de 2014. La acreditación supone un Plan de Mejoras.

141

19. Anexos

Líneas de investigación Las líneas que se desarrollan, de acuerdo al nuevo plan de estudio, son Biología Molecular y Biodiversidad y Conservación. Durante el proceso de acreditación universitaria se recomendó acotar los diferentes programas de investigación de cada una de las áreas o unidades académicas. De esta manera, la línea de Biología Molecular tiene como sub-líneas:

1. Polimorfismos genéticos a nivel molecular y celular 2. Biotecnología

Para el énfasis de Biodiversidad y Conservación las sub-líneas de investigación para desarrollar las investigaciones son:

1. Diversidad, conservación y utilización de la Flora Panameña 2. Ecofisiología Vegetal 3. Sistemática y Diversidad de Vertebrados e Invertebrados 4. Ecología y Biología de la Conservación de Vertebrados e Invertebrados

142

Lista de docentes Se presenta a continuación una lista de docentes que en su mayoría pertenecen a la planta de la Facultad de Ciencias Naturales y Exactas y que se consideran para impartir los cursos. Igualmente se añaden los docentes del extranjero. La lista no está cerrada.

Propedéutico Profesores Fundamentos de Estadística Inglés Científico Centro de Lenguas-Universidad de Panamá

Metodología de la Investigación científica

Dr. Enrique Medianero

Tronco Común Biodiversidad Mgtr. Jacobo Araúz

Dra. Cristina Garibaldi

Bioquímica Avanzada Dr. Tomás Diez

Biología Celular Dr. José Young Análisis de datos y diseño experimental en biología

Dr. Enrique Medianero Dr. Daniel Emmen

Biología Molecular Mgtr. Olga Chen Dr. Carlos Ramos Dra. Magaly de Chial

Genética de la conservación Dr. Edgardo Díaz Dra. Gretel Geada (invitada-Cuba)

Biología Evolutiva Dr. Carlos Vergara Dr. Oscar Puebla (STRI)

Seminario I Dra. Yolanda Águila Dra. Edna González Mgtr. James Coronado

Biología Molecular Virología Molecular Dra. Alex Martínez

Dra. Sara Ahumada

Inmunología Dra. Lisbeth Salazar (Costa Rica) Mgtr. Brenda de Mayorga

Genética microbiana y de eucariotas superiores

Mgtr. Brenda de Mayorga Dr. Carlos Ramos Dr. Luis Mejía Dr. Fernando Carlos Gómez Merino (invitado-

143

México)

ADN Recombinante Dr. Amador Goodridge Dr. Carlos Ramos Dra. Magaly de Chial

Bioinformática Dr. Luis Mejía Dra. Diego M. Riaño-Pachón (Invitado-Brazil)

Técnicas en Biología Molecular Dr. Carlos Ramos Dra. Magaly de Chial Dr. Juan Pascale Gorgas, STRI, Instituto de Medicina Forense, INDICASAT

Genética de Poblaciones Dra. Edna González Dr. Oscar Puebla (STRI)

Biotecnología Dr. Luis Maroto (invitado de Cuba) Mgtr. Brenda de Mayorga Mgtr. Olga Chen

Marcadores Moleculares Dr. Carlos Ramos Dr. Ronnie Gavilán

Biodiversidad y Conservación

Biología de la Conservación Dr. Daniel Emmén Mgtr. Jorge Mendieta Mgtr. Jacobo Araúz

Ecología de Poblaciones Dr. Daniel Emmén Dr. Omar López

Ecología de Comunidades Naturales Dr. Omar López Dr. Luis Cayuela (Invitado España) Dra. Cristina Garibaldi

Prácticas de Campo en Ecología Tropical

Dr. Omar López Dr. Daniel Emmen Dra. Cristina Garibaldi

Conservación de Áreas Silvestres protegidas Conservación y Manejo Sostenible de la Biodiversidad

Mgtr. Jacobo Araúz Dr. Eric Flores Mgtr. Jorge Mendieta Dr. Rogelio Sotolongo (invitado Cuba), Mgtr. Jacobo Araúz Dra.Cristina Garibaldi

144

Herramientas para Análisis del Paisaje y Conservación

Dr. Luis Cayuela (invitado España) Dr. Raúl Martínez Dra. Cristina Garibaldi

Etología Dr. César Villarreal

145

Lista de Asesores o Directores de Tesis Se presenta a continuación una lista de docentes que se proponen como Asesores o Directores de Tesis, y que pertenecen a la planta de la Facultad de Ciencias Naturales y Exactas. La lista no está cerrada, se considera la posibilidad de asesores externos con co-asesores de nuestra planta docente.

Nombre del Profesor Grado Académico Carlos Ramos Ph.D Magaly de Chial Ph.D. Edna González Ph.D. Luis Mejía Ph.D. José Young Ph.D. Yolanda Aguila Ph.D. Jacobo Araúz MSc Cristina Garibaldi Ph.D Daniel Emmen Ph.D. Dora Quirós Ph.D.

Documents

UNIVERSIDADDE PANAMÁ FACULTAD DE …maestriaencienciasbiologicas.weebly.com/.../plandeestudio2015-2016.pdfempresariales vinculadas a las tecnologías de avanzada. 5. Incrementar la