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Bancos de datos de la Biblioteca Nacional de Medicina
Efraín Flores Rivera, [email protected] de marzo de 2007
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Objetivos
Conocer el alcance y el contenido de tres bases de datos de la Biblioteca Nacional de Medicina: PubMed, TOXNET y MedlinePlus.
Distinguir el tipo de información que se puede obtener en cada una de estas bases de datos.
Realizar búsquedas sencillas en cada una de las bases de datos estudiadas.
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¿Qué es PubMed?
Un sistema de búsqueda en la Internet desarrollado en la Biblioteca Nacional de Medicina de los EE.UU. (NLM, por sus siglas en inglés)
Provee acceso gratuito a MEDLINE®, uno de los bancos de datos bibliográficos más importantes desarrollados por la NLM.
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El acceso incluye
MEDLINE- Considerada la base de datos más importante de la NLM. Abarca los campos de medicina, enfermería, microbiología, odontología, veterinaria, ciencias ambientales y otras áreas de las ciencias de la salud.
OLDMEDLINE- Aproximadamente dos millones de citas de revistas biomédicas de 1950-1966.
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El acceso incluye, cont.
Citas en proceso- Información básica y resúmenes de citas antes de que sean indizadas e incluídas en MEDLINE.
Citas de artículos no incluídos en MEDLINE (ciencias, química, etc.).
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Contenido de PubMed
Más de 16 millones de referencias y resúmenes de artículos publicados desde el 1950 en adelante.
Incluye el enlace al texto completo de algunos artículos.
Los documentos provienen de más de 5,000 revistas de ciencias de la salud.
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Además…
Su alcance es internacional (más de 80 países).
La mayoría de las revistas incluídas son inglés (90%).
Aunque incluye revistas en español y muchos otros idiomas, el resumen siempre aparece en inglés.
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¿Qué incluye un registro de PubMed?
Título de la revista Nombres de los autores Resumen publicado en el artículo Encabezamientos de materia (MeSH) Información sobre la fuente de la revista Afiliación del primer autor Idioma del artículo Tipo de publicación (ejs. Review, Clinical Trial,
etc.)
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Para conectarse a PubMed
A través de la página de la National Library of Medicine:
http://www.nlm.nih.gov/
Recomendamos conectarse a través de la página de la Biblioteca del RCM:
http://rcm-library.rcm.upr.edu
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Búsqueda por palabras claves
Escriba el término o frase en el área de búsqueda, y pulse el botón Go o la tecla Enter.
Si el concepto se compone de más de una palabra, PubMed los combina automáticamente utilizando el operador “AND”.ej. prostate cancer prostatectomy
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Para modificar su búsqueda
Si desea buscar una frase, escríbala entre comillas (ej. “localized prostate cancer”).
Puede utilizar los operadores o conectores booleanos: AND- Se recuperan citas que contengan todos
términos. OR- Recupera citas que incluyan por lo menos uno de
los términos de la búsqueda. NOT- Se excluye el término que aparece a la derecha.
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Búsqueda usando el vocabulario controlado
MeSH (Medical Subject Headings)Contiene el vocabulario controlado de la base
de datos. Incluye definiciones y referencias cruzadas.Se utiliza para hacer búsquedas por temas o
materias.
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Para buscar usando el vocabulario controlado
1. Pulse MeSH Database en la barra de la izquierda.
2. Escriba el término que desee buscar y pulse Go.
3. Seleccione el MeSH que desee usar.4. Pulse el menú de Sent to y envíe el MeSH al
Search Box.5. Repita el procedimiento anterior con los otros
términos de su búsqueda.
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Truncar
El truncamiento o truncado nos brinda la opción de recuperar todos los términos que tienen la misma raíz.
Por ejemplo: child* (child, children, childhood, etc.)
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Puede limitar las búsquedas por:
Autor Revista Texto completo
gratuito Fecha de publicación Humanos o animales Género
Idiomas Subconjuntos de
revistas Tipo de artículo Edades de los
participantes Otras
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Para leer los resúmenesde los artículos
Pulse en Summary y seleccione Abstract en el menú para leer todos los resúmenes.
Pulse para leer el resumen de un artículo específico.
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Otras funciones de PubMed
Enlaces al texto completo Búsquedas por título de
revista Imprimir referencias
seleccionadas Enviar referencias al
correo electrónico Completar citas Otras
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Artículos con texto completo gratuito
Icono que indica texto completo gratis
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Logotipos Al seleccionar en Display los formatos de Abstract o
Citation, pueden aparecer diferentes logotipos:
Enlace al texto completo de revistas disponibles
en los bancos de datos del RCM*
Revista disponible en formato impreso (papel) en
la biblioteca del RCM*
Otros logotipos que digan “Free full text”
Acceso gratuito al texto completo gratuito
Acceso gratuito al texto completo
Logotipos que no digan “Free full text”
Proveen enlace a la página web de la editorial que publica la revista; hay que pagar para obtener el artículo.
*Aparece sólo cuando se conecta a PubMed a través de la página de la biblioteca del RCM.
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Limitar la búsqueda a una revista específica
1. Pulse en Limits.2. Pulse en Add Journal, y escriba el título de la
revista en la que le interesa buscar.3. Pulse el botón Go.4. El sistema recupera todas las referencias de
artículos publicados en la revista especificada.5. Para buscar un tema dentro de la revista
seleccionada, escriba las palabras clave en el área de búsqueda.
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2. Pulse Add Journal
3. Escriba el título de la revista que desea buscar
1. Pulse Limits
4. Escriba el tema que desea buscar en la revista.
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Imprimir lista de referencias
1. Seleccione las referencias que desee imprimir.2. Elija la opción Printer en el menú de la
derecha (Send to).3. Cuando aparezca la ventana de impresión,
pulse Print this page.4. De esta forma se asegurará de imprimir sólo
las referencias que seleccionó, y no la lista completa.
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Enviar al correo electrónico
1. Seleccione los artículos que desee enviar.2. Elija la opción de e-mail en el menú de la
derecha (Send to).3. Cuando aparezca la pantalla de envío, escriba
su dirección de correo electrónico.4. Si desea, puede añadir algún comentario.5. Pulse sobre el botón de Mail.
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Número de referencias que se envirán al correo electrónico
Si desea enviar las referencias con los resúmenes, seleccione Abstract en el menú.
Escriba aquí la dirección de correo electrónico
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Para encontrar referencias específicas o con información incompleta
1. Pulse Single Citation Matcher en la barra de la izquierda.
2. Llene los espacios con la información que tenga disponible.
3. Pulse el botón Go para hacer la búsqueda.
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Llene los campos con la información que tenga disponible.
Pulse Go para hacer la búsqueda
Para empezar, pulse Single Citation Matcher.
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Recomendaciones
Conéctese a PubMed a través de la página web del RCM.
Complete los tutoriales. Practique frecuentemente. Revise las opciones de ayuda.
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Ejercicios
1. Busque estudios relacionados con el asma en niños puertorriqueños.
2. Identifique resúmenes de ensayos clínicos (clinical trials) publicados a partir del 2005, acerca del cáncer del seno.
3. Mencione dos artículos acerca de la violencia publicados en el Puerto Rico Health Sciences Journal.
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¿Qué es TOXNET?
Conjunto de bancos de datos sobre toxicología, salud ambiental, sustancias químicas peligrosas, emisiones de productos tóxicos, nomenclatura química, salud ocupacional y productos para el consumidor.
Desarrollado por la División de Servicios Especializados de la Biblioteca Nacional de Medicina de los EE.UU.
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¿Dónde se encuentra?
TOXNET está disponible de forma gratuita en el Internet.
http://toxnet.nlm.nih.gov
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Cuatro Tipos de Bancos de Datos
1. Archivos de datos toxicológicos (un registro por sustancia química)
2. Archivos de literatura toxicológica (referencias bibliográficas)
3. Emisiones de tóxicos al ambiente4. Otras bases de datos
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Hazardous Substances Data Bank (HSDB) Producido por la NLM Cerca de 5,000 registros de
sustancias químicas Toxicología de químicos
potencialmente peligrosos Información sobre
exposición humana, higiene industrial, procedimientos para manejo de emergencias, efectos sobre el ambiente y regulaciones
Datos de libros, documentos gubernamentales, informes técnicos y fuentes escogidas de literatura primaria
Información arbitrada por un Panel de Revisión Científica
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Chemical Carcinogenesis Research Information System (CCRIS)
Producido por el National Cancer Institute (NCI)
Datos e información sobre carcinogenia, mutaciones, desarrollo e inhibición de tumores
Casi 9,000 registros de sustancias químicas
Datos provenientes de estudios citados en revistas científicas, fuentes actualizadas y otras fuentes epecializadas
Evaluada por científicos, incluye referencias bibliográficas
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Genetic Toxicology (GENE-TOX)
Datos de la EPA Nota: No se actualiza
desde enero de 2000 Estudios sobre
mutagenecidad 3,214 registros de
sustancias químicas Literatura seleccionada
fue evaluada por científicos expertos
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Integrated Risk Information System (IRIS) Contiene posiciones de
consenso científico de la EPA sobre los efectos en la salud y en el desarrollo del cáncer a partir de la exposición oral o la inhalación de sustancias químicas específicas en el ambiente
Casi 550 registros de sustancias químicas
Revisada por grupos de científicos de la EPA
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International Toxicity Estimates for Risk Assessment (ITER)
Datos del “Toxicology Excellence for Risk Assessment (TERA)”, una organización sin fines de lucro
Compara información internacional sobre la evaluación de riesgos obtenida de diferentes organizaciones (EE.UU y otros países)
Cerca de 650 registros de sustancias químicas
Incluye sinopsis, enlaces a los documentos de las organizaciones
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LactMed
Desarrollada por la NLM Base de datos de
medicamentos y otros químicos a los cuales las madres lactantes pueden estar expuestas y sus posibles efectos en los bebés.
Más de 400 registros Arbitrada y con todas las
referencias bibliográficas
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TOXLINE (TOXicology Literature onLINE) Información bibliográfica sobre los
efectos farmacológicos, bioquímicos, fisiológicos, ambientales y toxicológicos de sustancias químicas y otros agentes sobre los sistemas vivientes
Información de revistas de toxicología, informes técnicos, proyectos de investigación y colecciones de archivos
Casi 3.5 millones de referencias Enlaces a referencias de PubMed
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DART/ETIC (Developmental and Reproductive Toxicology/Environmental Teratology Information Center)
Información bibliográfica sobre teratología y otros aspectos de la toxicología del desarrollo y la reproducción
Más de 100,000 referencias Enlaces a referencias de
PubMed y a otras fuentes como resúmenes de conferencias científicas, informes técnicos y revistas que no están incluídas en PubMed
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Toxics Release Inventory (TRI)
Contiene información sobre las emisiones al ambiente de químicos tóxicos epecíficos y su disposición
Datos suministrados a la EPA por las instalaciones industriales en los EE.UU.
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Toxics Release Inventory (TRI)
Describe las emisiones anuales de químicos tóxicos al ambiente (1987 – 2004)
Incluye nombres y direcciones de las instalaciones, cantidades de las sustancias químicas liberadas al aire, agua, tierra o transferidas a los centros de disposición
Casi 1,562,569 de registros Se puede ver la localización física de las
instalaciones usando TOXMAP
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TOXMAP Desarrollado por la NLM Ofrece mapas de los
EE.UU. de las emisiones de químicos al aire, agua y tierra, según las reportan las instalaciones industriales de los EE.UU.
Se busca por nombre de la sustancia química, nombre de la instalación industrial o su localización
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Haz-MAP
Desarrollada por NLM Base de datos de salud
ocupacional sobre los efectos en la salud de la exposición a sustancias químicas y biológicas en el trabajo
Se busca por agente químico, enfermedad o empleo
Aprox. 1,000 químicos y 180 efermedades ocupacionales
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Household Products Database
Desarrollada por la NLM Información sobre los efectos
potenciales a la salud de químicos o sustancias contenidos en más de 6,000 productos de uso doméstico
Se puede buscar por la categoría del producto, como “Pesticidas”, listas alfabéticas, nombres de marcas, etc.
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ChemIDplus
Archivo de estructuras y nombres usado para identificar sustancias químicas
Contiene más 380,000 registros químicos, de los cuales más de 263,000 incluyen las estructuras químicas
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La búsqueda en TOXNET
Cada base de datos de TOXNET se puede consultar de forma independiente o combinándolas todas, usando “Search All Databases” (el número de registros puede variar un poco cuando se consultan las bases de datos por separado)
Las bases de datos usan motores de búsqueda muy similares.
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Búsqueda en TODAS las bases de datos
Buscar por nombres químicos, otros térmicos (incluyendo múltiples términos) y números (incluyendo números de CAS)
La lista de resultados presenta un resumen de los registros que aparecieron en cada una de las bases de datos.
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Al pulsar el número le lleva a la base de datos.
Ejemplo de una búsqueda en TODAS las bases de datos
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Ej. HSDB (Hazardous Substances Data Bank)
Pulse el nombre del químico para acceder al registro completo.
Aparecen primero los registros más relevantes al tema que se especificó.
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Todos los archivos de datos de TOXNET siguen formato de presentación similar.
Ejemplo de un registro completo
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Búsqueda en bases de datos individuales
Puede buscar usando:Operadores booleanos AND, OR, NOT para
combinar palabrasTrucando de términos con el asterisco (*) al
final de las palabrasFrases específicas escribiéndolas entre
comillas.
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Pulse para seleccionar la base de datos que desea consultar.
Escriba las palabras de su búsqueda.
Pulse para limitar la búsqueda por fecha, autor, idioma, campos específicos en el registro, etc. Los límites varían según la base de datos que utilice.
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Puede limitar su búsqueda a determinados campos del registro.
Ej. Límites en Hazardous Substances Data Bank (HSDB)
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Ejercicios
¿Cuáles son los efectos en el feto del uso de cocaína?
Identifique las emisiones de benceno en Puerto Rico para el año 2005. ¿Qué compañía tuvo la mayor cantidad de emisiones?
¿Cuáles son los efectos adversos para la salud asociados al insecticida Real Kill Ant & Roach Killer?
Encuentre la estructura química de la furosemida (Furosemide).
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¿Qué el MedlinePlus?
Es un sitio en Internet para el público en general, creado por la Biblioteca Nacional de Medicina de los EE.UU.
Puede encontrar información sobre salud de fuentes fidedignas, en inglés y español.
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Contenido
Temas de Salud Información sobre medicamentos Enciclopedia Médica Tutoriales Interactivos Noticias
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¿Cómo buscar?
No es necesario escribir acentos ni la tilde de la ñ.
Se permiten los siguientes operadores booleanos: AND, OR, NOT.
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¿Cómo conectarse?
Está disponible en forma gratuita en Internet.
http://medlineplus.gov