Poblaciones estructuradas, flujo génico & sistemas de reproducción
Ecología Molecular – TP 6
Estudio de caso N°1:
Estimación del número de padres en el erizo incubante Abatus agassizii
Claudia Maturana
GERUD 2.0
1
2: Abrir archivo: Frec_adultos.txt
1
Abrir archivo: Madre2.txt
Antes de apretar aquí, los datos deben estar correctamente alineados.1
1
2
Ordenar por likelihood
Estudio de caso N°2:
Relaciones de parentesco en poblaciones de Guanaco
Muestreo invasivo
Para este estudio:
- 1 población- 40 individuos, 20 machos + 20 hembras- 17 microsatélites
Open guanaco.txt
1
1
¿CONCLUSIONES?
Estudio de caso N°3:
Polinización de Voluptuosa labilis y su efecto sobre la estructura genética
Vive en parches aislados, de 300 a 3500 m de altura
400 m
3000 m
Polinización
La próxima vez, simularé los datos
20 km20 km
20 km
1
23
4 400 m
3000 m
4 muestras de 50 individuos
10 loci, microsatélites
Abrir archivo: Voluptuosa.gtx
Paso 1: Fis en cada población
Análisis en detalle
Locus por locus¿Conclusiones?
¿Cómo interpretar un Fis estadísticamente significativo?
• Sistema de reproducción• Efecto Wahlund• Selección• Alelos nulos
s
sFis
2
is
is
F
Fs
1
2
S: tasa de autofertilización
Población Fis s
1
2
3
4
s
sFis
2
is
is
F
Fs
1
2
S: tasa de autofertilización
Población Fis s
1 0,544 0,70
2 0,598 0,75
3 0,177 0,3
4 0,173 0,29
Primer resultado del estudio
El cambio en el agente polinizador está asociado a una diferencia en la tasa de auto fertilización.
¿Interpretación?
Terreno!!!
Paso 2: AFC 3D
Paso 3: Fst global y permutaciones
Paso 4: Fst por pares y permutaciones
Paso 5: Modelo de diferenciación
Resultados
R2 = 0,2453
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
19 21 23 25 27 29
Km
Fst
Conclusiones e interpretación
Mariposa = dispersion = flujo genico
outcrossing
3 años más tarde…
?
Estudio de caso N°4:
El caracol curador
4 muestras de 400 individuos
10 loci, izoenzymas
2
3 Isla
1
20 km
Abrir archivo: caracol.gtx
Paso 1: Fis en cada población
Análisis en detalle locus por locus
¿Conclusiones?
¿Ideas?
2
3 Isla
1
2
3 Isla
1a1b
Abrir archivo: caracol2.gtx
Paso 1: Fis en cada población
Paso 2: AFC 3D sobre poblaciones
Otra especie
Abrir archivo: caracolcont.gtx
Paso 2: AFC 3D sobre poblaciones
Paso 3: Fst global y permutaciones
Paso 4: Fst por pares y permutaciones
Paso 5: Modelo de diferenciación
Resultados
R2 = 0,1756
0,06
0,08
0,1
0,12
0,14
0,16
0,18
0 10 20 30 40
km
Fst
/1-F
st
R2 = 0,7082
R2 = 0,583
0,06
0,08
0,1
0,12
0,14
0,16
0,18
0 10 20 30 40
km
Fst
/1-F
st1a otros
Conclusiones e interpretación