Ciencimetría para la historia de la taxonomía:

colecciones y tipos de información

Layla Michán 

  

13 y 14 de mayo 2010Auditorio Mario de la Cueva,piso 14, Torre II de Humanidades,Ciudad Universitaria

• Taxonomía• La revolución digital• Estudios métricos de la información

Biodiversidad

Genes

Especies

Ecosistemas

• Unidad evolutiva

• Unidad taxonómica

La sistemática y/o taxonomía

• Es la subdisciplina de la biología encargada de la descripción, la nomenclatura, la clasificación, la teoría y la historia de la clasificación de los seres vivos (Wiley, 1981), incluyendo sus bases, principios, procedimientos y reglas (Simpson, 1961).

• • Constituye el sistema de referencia de la biología, porque

una de sus tareas principales consiste en descubrir, identificar, nombrar y clasificar a los seres vivos, pero aun no se ha cumplido con este objetivo básico e imprescindible, de hecho se encuentra lejos de cumplir su cometido.

• Fue seguramente la primera forma de conocimiento Biológico, la historia de la Biología, hasta el siglo XIX se centró en la historia la historia natural.

• Tenía como uno de sus funciones la de nombrar y clasificar a las especies, para lo cual se organizaban grandes expediciones para describir la flora y la fauna desconocidas, se tomaban muestras, notas, se hacía dibujos y se preservaban especímenes que se catalogaban y se mantenían en las colecciones.

• Esta tarea básica y cotidiana del naturalista no ha cambiado, en esencia es repetida por los taxónomos del siglo XXI aunque varios de sus principios teóricos, metodológicos y técnicos han evolucionado.

• La existencia de grandes colecciones de datos taxonómicos en formato digital que han impuesto nuevos retos y oportunidades para la investigación histórica sobre sistemática biológica, en especial el análisis métrico de la información asociada (meta-datos) a esas colecciones.

• Uno de nuestros intereses es la implementación de bases de datos de información taxonómica para estudiar la historia reciente de la taxonomía en América Latina con énfasis en México.

Objetivos1) Identificar los tipos de colecciones de datos

taxonómicas susceptibles a realizar estudios ciecimétricos,

2) establecer las características y los tipos de la información digital sistematizada en las colecciones de datos existentes;

3) determinar, clasificar y sistematizar las colecciones de datos electrónicas sobre biodiversidad latinoamericana y mexicana útiles para realizar estudios históricos,

4) definir el tipo de problemas históricos que pueden resolverse usando la bibliométría.

Resultados

Las colecciones de datos digitales• Colecciones

– Se refiere a los datos almacenados, a la infraestructura, las organizaciones y las personas necesarias para preservar el acceso a los datos.

– Bases de datos, reservorios o repositorios.

• Datos – De distintos tipos: texto, números, imágenes, vídeo o películas,

audio, software, algoritmos, ecuaciones, animaciones, modelos, simulaciones, etc

– Pueden ser generados por diversos medios, entre ellos la observación, el cálculo o experimento.

• Digitales– Disponibles a través de Internet.– Almacenados en formato digital.

Material y métodoElección de fuentes y recursos

Búsqueda

Extracción

carga

Diseño de la base de datos relacional: tablas, relaciones y formularios

Selección

traducción

Normalización y Depuración

Pruebas

Validación

Migración

Tratamiento cuantitativo: Indicadores ciencimétricos y biliométricos, métodos y modelos matemáticos, y técnicas estadísticas (univariante, bivariante y multivariante)

Registros y campos

Bases de datos

Frecuencia de variables y tablas de contingencia

Regularidades

Interpretación: descripción, comparación, contextualización

Análisis

Explicaciones

Consultas

Relaciones lógicas

Recuperación

Interpretación

Determinación, identificación y parámetrosVisualización

Resultados(preliminares)

• 134 de colecciones con información sobre biodiversidad de AL. – Bibliográficas

• Las académicas multidisciplinarias y biológicas• Las 6 más grandes

– Curatoriales y nomenclaturales• Exógenas y endógenas• El flujo de información

– Mundiales, regionales

Clasificación de las CDDB• Tipos de datos

– Texto, números e imágenes– Video , películas y audio– Software, algoritmos y ecuaciones, – Animaciones modelos, simulaciones,

etc

• Tipo de información– Bibliográfica– Curatorial– Nomenclatural– Biológica (morfológica bioquímica,

molecular)– Geográfica– Ecológica– Institucional

• Cobertura temática– Gupos y/o taxones

• Nivel de organización– Genes – Especies– Ecosistemas

• Cobertura geográfica– Mundial– Regional – Local– Institucional– Personal

• Cobertura temporal

• Origen de la información– Éndogena (A.L)– Exógena

• Iniciativa– Académica– Gubernamental– Privada

• Acceso– Libre– Restringido

• Tamaño– Cantidad de registros– Memoria virtual (Teras o Gigas)

Nombre Editor-Productor C. Tipológica C. temporal C. temática

1. AGRICOLA National Agriculture Library

Libros, artículos y monografías, simposios, conferencias, reportes

1970 Agricultura: ciencia animal, acuacultura, biotecnología, botánica, conservación, citología, forestal, horticultura, ecología humana, hidrología, hidroponia, microbiología, pesticidas, fisiología, plantas, animales ciencia de las plantas, contaminación, calidad del agua.

2. AGRIS International Food and Agriculture Organization (FAO)

Libros y monografías, conferencias, simposios, reuniones, artículos publicados, patentes

1975 Producción animal, ciencias acuáticas, forestal, fuentes naturales, contaminación, producción de plantas, protección de plantas, transgénicos

3. Algology mycology and protozoology abstracts Cambridge Scientific Artículos de revistas (T) 1982

Algología: reproducción, crecimiento, ciclos de vida, bioquímica, genética, infección e inmunidad en el hombre, otros animales y plantas.

4. Aqualine Cambridge Scientific Libros y monografías, conferencias, simposios, reuniones, artículos publicados

1960 Calidad del agua, legislación sobre el agua, análisis y los desechos del agua y su uso, afluentes industriales.

5. Bacteriology abstracs Cambridge Scientific Abstracts

Artículos de revistas (T) 1982 Bacteriología, bioquímica, genética, inmunología, vacunas y enfermedades del hombre y los animales, en sus aspectos básicos y clínicos

6. BIOBASE Elsevier Conferencias, simposios, reuniones, artículos de revista

1994 Microbiología aplicada y biotecnología, investigación sobre el cáncer, biología celular, ciencias ambientales y ecológicas, endocrinología y metabolismo, genética y biología molecular, inmunología, neurociencias, ciencias de las plantas, bioquímica de proteínas, toxicología

7. BioBusiness Thomson Reuters Registro bibliográficos y artículos públicos en diferentes medios

1995 Producción animal, biotecnología, medio ambiente forestal toxicología, tratamiento de residuos.

8. BioCommerce data`s BioCommerce Data Ltd.

Directorios y registros bibliográficos 1981 Bioquímica, control biológico, conversión de biomasa, biopesticidas, celular hibridización, genómica, horticultura, inmunología, microbiología, biología molecular, recombinación de RNA, transgénicos, tratamiento de residuos

9. BioEngineering Abstracts Cambridge Scientific Libros y monografías, conferencias, simposios, reuniones, artículos publicados, patentes

1991 Aplicaciones marinas, aplicaciones medioambientales, bioinformática, acuacultura y pescaderías.

10. Biological Abstracts Thomson Reuters (T) 1926 Botánica, microbiología y farmacología

11. Biological Digest Cambridge Scientific Abstracts

Compilacíon de Abstracts y Indices de literatura nacional e internacional

1989 Ciencias biológicas

12. BioOne Cambridge Scientific Abstracts

Colección de resúmenes e índices de literatura de texto completo (T)

1915 Ciencias biológicas y de la salud

13. BIOSIS Previews Thomson Reuters Libros y monografías, conferencias, simposios, reuniones, artículos publicados, Patentes (T)

1926 Biología aeroespacial, agricultura, bacteriología, bioquímica, bioingeniería, biofísica, biotecnología, botánica, biología celular, biología ambiental, genética inmunología, microbiología, parasitología, patología, biología sistemática, toxicología, ciencia veterinaria, virología

Bibliográficas

1960 1966 1967 1969 1970 1973 1974 1975 1976 1978 1980 1981 1982 1983 1984 1985 1987 1989 1990 1991 1994 1996 1997 1998 1999 2002 2004 2005

No. bases X año 1 2 5 7 9 10 11 14 15 16 17 19 23 25 26 27 28 29 30 31 32 35 36 38 39 41 42 43

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

50

Base

s de

dato

s

Año de origen de las bases de datos

Figura

SCI4000

Pubmed9,000, 18 millones*

Latindex2,400, 14,500 *

Urlich´s260,000

Hela3,000,

Zoological Record4500, 1,805,444 *

TaXMeXX60, 9000*

Index Kewensis

Biosis5000, 13 millones

BASE DE DATOS

1926 Biosis

1970 Agrícola

1969 Biosis toxicology

1981 Biocommerce data´s

1991 BioEngineering Abstracts

1995 1998 BioBussiness

1975 AGRIS Internacional

1960 Aqualine

1982 Life Sciences Abstracts

1994 Biobase

1975 2008 Enviroline

1967 Environmental Sciences

1984 General Science Abstracts

1981 Oceanic Abstracts

1900 Science Citation Index

1981 Pollution Abstracts

1990 2008 SciSearch

1967 Water Resources Abstracts

1981 Wilson Biological & Agricultural Index

1864 Zoological Record

1975 Scielo

1978 Periódica

2002 REDALyC

1869 Scopus

1915 BioOne

1910 CAB

1900 Science Citation Index

2002 Directory of Open Access Journals

1800 Chemical Abtracts

1967 BIREME

1982 Algology mycology and protozoology abstracts

1982 Bacteriology abstracs

1926 Biological Abstracts

1989 Biological Digest

1940 Environment complete

1982 Industrial and Applied Microbiology Abstracts

1935 Wildlife & ecology studies worldwide

1950 PubMed

1910 Smithsonian Istitution

2007 Google Scholar (acádemico)

1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010

Scopus 160

ZR

10 736

Periódica411

46

129

125

11

22

109

Biosis 1 387

CAB 2 857

68

67

130

78

SCI 460

149

186

218

204

Taxonomía América Latina

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

Biosis SCI CAB Periódica ZR

%

Inglés

Español

Portugués

Francés

Taxonomía América Latina

1

10

100

1000

10000

100000

1864

1870

1876

1882

1888

1894

1900

1906

1912

1918

1924

1930

1936

1942

1948

1954

1960

1966

1972

1978

1984

1990

1996

2002lo

g D

ocu

men

tos

SCI Periodica

SCI Biosis

CAB Scopus

ZR

Periódica

CAB

ZRBiosis

Scopus

SCI

2

39

25

41

33

Internacionales

Regional285

142

118 108

195

17

Corriente principal

Multidisciplinarias

Thomson Reuters

Taxonomía América Latina

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Biol E

volut

Zooloogía

Ecol y cienc am

b

Cienc biolog

Anat y m

orf

Botànica

Paleontología

Biol m

ar y acuát

Biodiv y conserv

Genética y herencia

Parasitología

Biol reprod

Fisiología

Enfer infecc

Forestal

Agricultura

Boquím

y biol mol

%Biosis

ZR

CAB

SCI

Periódica

Taxonomía América Latina

DOCUMENTALBIOLÓGICA

Investigación sobre biodiversidad

Memorias

Artículos Catálogos ChecklistLibros

Páginas electrónicas

índices y abstracts

Revisiones

Libros de texto Enciclopedias Manuales

Bases de datos bibliográficas

Organismos y sus partes

Diarios y Etiquetas

Colecciones

Catálogos

Bibliotecas y hemerotecas

INSTITUCIONAL

Science Citation Index®

Zoological Record BIOSIS PreviewsBiological Abstracts

Genetic databasesGenetic databases

The Tree of Life

Bases de datos biológicas

Bases de datosinstitucionales

CDDB exógenas a A.L

EndógenasExógenas

Por su origen geográfico

• La mayor cantidad de información sobre biodiversidad sobre América Latina se encuentra en Instituciones de EUA y Europa (Inglaterra, Alemania y España)

• Royal Botanic Gardens 7-8 milones de especímenes de plantas.

• Natural History Museum London 28 milliones de insectos y arañas

INFORMACIÓN DOCUMENTAL DIGITALINFORMACIÓN BIOLÓGICA DIGITAL

Investigación: Nomenclatura Descripción Clasificación Relaciones

Congresos Sociedades

Colegios invisibles

Preprints

Memorias

Artículos

Páginas electrónicas

índices y abstracts

Revisiones

Libros de texto Enciclopedias Manuales

Gris

Primaria

Secundaria

Terciaria

Información

Bases de datos

Organismos sus partes y la información sobre ellos

Diarios y Etiquetas

ColeccionesCatálogos

Hemeroteca

Biológicas Documentales

Institucionales

Recursos electrónicos

Migración

Análisis

Recuperación

Indicadores

Taxonomía y sistemática

CienciometríaBibliometría

InterpretaciónHistoria y sociología de las ciencias

Ciencias y tecnologías de la información

Bibliotecología

INFORMACIÓN INSTITUCIONAL DIGITAL

Biótica© incluye catálogos de:

• Nombres de algunos grupos biológicos hasta género o especie•

Nombres de autores de los taxones•

Colecciones e instituciones•

Estados y municipios para México (INEGI 2005)•

Regiones hidrológicas, marinas,  terrestres prioritarias de México, así como las ecorregiones marinas de América del norte.

•Catálogos que podrán asociarse al ejemplar y son personalizables por el usuario como: formas de nutrición, formas de vida, hábitos, etc.

•Catálogo de parámetros poblacionales que es personalizable por el usuario

•Tipos nomenclaturales

Colecciones Biológica Mexicanas

México

Curatoriales y nomenclaturales

• CONABIO

• UNAM

Bibliografía

• IBUNAM• Periódica• Scielo

Iniciativas aisladas dentro una misma institución.

No hay flujo de información entre ellas

Publicaciones

Colecciones

Universidades

Publicaciones

Sociedades

Institutos de

Investigación

Investigadores

Autores• Investigadores• Aficionados

Manejadores

Usuarios•Investigadores•Profesores•Alumnos•Publico en general

Actores sociales involucrados

Entidades • Académicas• Privadas• Gubernamentale

s

Conclusiones• Hay diversas iniciativas institucionales y locales, ninguna regional.• Las colecciones de datos digitales son una herramienta característica de

la Sociedad del Conocimiento, a través de su estudio se puede entender mejor dicho fenómeno.

• Los usuarios tienen acceso a gran cantidad de datos de fuentes diversas de manera simultánea.

• Existen muchas aplicaciones electrónicas que permiten almacenar, procesa, analizar y visualizar la información pero no están incorporadas a los datos sobre biodiversidad como es el caso de las ciencias biológicas experimentales.

• Información heterogénea y dispersa en diferentes colecciones.• Repercute en el intercambio de los datos y • Facilita la colaboración entre usuarios de diferentes disciplinas,

instituciones y ubicaciones geográficas.• Este constituye un caso de estudio interesante dentro de la Biología por

sus singularidades y su importancia estratégica para A.L.

• Las colecciones de datos digitales sobre biodiversidad de América Latina son un ejemplo representativo de la sociedad del conocimiento científico en la región:– Carencia de iniciativas regionales– Poca colaboración– Falta de infraestructura y recursos

• -NUEVAS OPORTUNIDADES!

Perspectivas

• Analizar mayor cantidad de colecciones, en especial las pequeñas, locales y las institucionales.

• Hacer análisis de casos del flujo de información.

• Evaluar el impacto que ha tenido la aparición de estas colecciones en la práctica taxonómica del siglo XXI.

Llorente y Castro, 2002