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PubMed es una interface de búsqueda creada dentro de la base de datos de Medline, permitiendo el acceso a usuarios profesionales de la salud y el público en general.

Las ventajas que brinda es poder obtener información gratuita de Medline, encontrar artículos completos de algunos artículos, al mismo tiempo textos gratuitos en formato electrónico, realizar búsquedas clínicas usando filtros metodológicos.

¿ Qué es PubMed ?

El sistema PubMed ofrece una variedad de modos de búsqueda para acercarse a las necesidades individuales de los usuarios.

Para realizar una búsqueda básica en la base de datos que maneja Pubmed basta con solo ingresar unos pocos términos en el formulario de la página de inicio.

A continuación encontraremos la pantalla principal cuando ingresamos a la página web.

¿CÓMO REALIZAR UNA BÚSQUEDA

BÁSICA?

En la pantalla inicial se encuentran rasgos cuatros áreas muy bien especificadas:

1. Área de ingreso de texto: es el área donde se deben ingresar los términos de

búsqueda.

2. Accesos a otras bases de datos: en el que se encuentran acceso directos a otras

bases del NCBI como Nucleotide, Protein, Genome, Structure, OMIM, Journals, etc.

3. Barra de Funciones de PubMed: está formado por una serie de herramientas que

nos permitirán el refinamiento y la edición de las estrategias de búsqueda. En ella

tenemos: límites, índice/vista previa, historial, portapapeles y Detalles de las

estrategias de búsqueda.

4. Acceso a servicios especiales de PubMed: este área de la pantalla siempre

acompañará al usuario en las diferentes instancias de búsqueda y cambiará las

opciones según el lugar donde se encuentre. En la página de inicio permite acceder a

servicios tales como: Información General sobre PubMed, la Ayuda de PubMed,

Preguntas Frecuentes, Tutoriales interactivos, el Journal Database, el MeSH

Database, el Single Citation Matcher, el Batch Citation Matcher, los Clinical Queries,

los Special Queries, el LinkOut, el My NCBI, entre otros.

Para ingresar alguna palabra de búsqueda solo debemos ingresar el término en el cuadro de texto y luego presionar enter o darle click en Go que se esta al lado del cuadro donde ingresamos la palabra; existen algunas condiciones para poder ingresar los términos en el casillero de texto que debemos tener en cuenta.

Para ingresar varios términos de búsqueda debemos separarlos con un espacio intermedio y luego presionar enter o darle click en Go.

Para realizar una búsqueda por autores debe ser ingresado primero por el apellido, generar un espacio y luego ingresar las iniciales o nombres sin signos de puntuación.

Realizar una búsqueda de títulos de Journals o revistas se puede ingresar de la siguiente manera:

Completos: por ejemplo New England Journal of Medicine

Abreviados según el formato MEDLINE, por ejemplo: N Engl J Med

Números del International Standard Serial Number (ISSN): 0028-4793

Si el nombre de la revista es igual a algún término MeSH, por ejemplo Gene Therapy,

Science o Cell, PubMed buscará el término como MeSH y como texto libre y no como

nombre de publicación. Para evitar lo antedicho habría que agregar el nombre del

campo, por ejemplo Science [TA], con lo cual sí será buscado en dicho campo para evitar

que sea buscado en todos los campos existentes. El número de ISSN no es recomendado

para las citas antiguas.

Luego de ingresar los términos en el cuadro de texto y oprimimos Go se activan los mecanismos internos de búsqueda, encargadas de posibilitar la recuperación de citas.

Mapeo automático de términos

Los términos que ingresamos en el formulario de búsqueda son comparados (en este orden) contra las siguientes tablas de términos : MeSH (Medical Subject Headings), Publicaciones, lista de frases y el índice de autores.

1. Tabla de traducción a MeSH

La tabla de traducción MeSH contiene los términos MeSH , Subencabezados, los sinónimos de los MeSH. Si se encuentra un resultado será buscado como término MeSH y como palabra de texto. Por ejemplo, si ingresamos vitamin h en el formulario de búsqueda, PubMed lo traducirá en la siguiente búsqueda: ("Biotin"[MeSH Terms] OR vitamin h[Text Word]). Vitamin h es un sinónimo para el término MeSH Biotin.

Mecanismo de Busqueda de PubMed

2. Tabla de traducción de Publicaciones

La tabla de traducción de publicaciones contiene el nombre completo de la revista, la abreviatura de MEDLINE, y el número ISSN. Por ejemplo, si ingresa el título new england journal of medicine en el formulario, PubMed lo traducirá a: "N Engl J Med"[Journal Name].

3. Lista de frases

Si no se encuentra resultados en las tablas MeSH y de Publicaciones, PubMed consulta la lista de frases generada a punto de partida de todos los componentes de la bases de datos, ej., cold compresses.

4. Índice de Autores

Si no se encuentra la frase en los puntos anteriores y es una palabra seguida de una o dos letras, PubMed chequea el índice de autores. Si no se encuentran resultados, PubMed descompone la frase y repite el proceso anterior hasta encontrar resultados. Si los resultados no son positivos combinara los términos mediante AND y buscará en todos los campos.

Para realizar una búsqueda por frases en PubMed, el buscador lo primero que realiza es una consulta de frases y agrupa los términos en frases lógicas.

Se puede forzar la búsqueda agregándole comillas a la frase que ingresamos, esto hace que se anule el mapeo automático de términos.

Las citas recuperadas de la base MEDLINE son mostradas en la página de resultados de PubMed, además todas las citas pueden ser mostradas en otros formatos disponibles:

Búsqueda de Frases

Summary (default)

Brief

Abstract

Citation

MEDLINE

XML

UI List

LinkOut

ASN. 1

Related Articles

Cited Articles

Cited in Books

CancerChrom Links

Domain Links

3D Domain Links

GEO DataSet Links

Gene Links

Gene (Gene RIF) Links

Genome Links

Project Links

GENSAT Links

GEO Profile Links

HomoloGene Links

Nucleotide Links Protein Links

OMIA Links

OMIM (calculated) Links

OMIM (cited) Links

BioAssay Links

Compound Links

Compound via MeSH

Substance links

Substance via MeSH

PMC Links

Cited in PMC

PopSet Links

Probe Links

Protein Links

SNP Links

Structure Links

UniGene Links

UniSTS Links

Para ver las citas en otros formatos debe seguir los siguientes pasos:

Cita Individual – darle click en el link que contiene el nombre del autor para mostrar el formato de Abstract para la cita.

Todas las citas - seleccione un formato del menú desplegable “Display” y podrá ver todas las citas en el formato seleccionado.

Citas seleccionadas - Clickee en las casillas de verificación, a la izquierda de cada cita que desea ver, y luego seleccione de la opción Display, el formato en el cual desea verlas.

• Summary : Autor, título, Referencia bibliográfica, status de la cita, idioma (si no es inglés), tipo de publicación si review o retracted publication, la leyenda "No abstract available" y los PubMed y MEDLINE Unique Identifiers.

Formatos de Presentación

• Brief : - Autor y primeras 10 letras del título con el PMID.

• Abstract: Referencia bibliográfica, status de la cita, título, indicación si el artículo no está en inglés, autores, Domicilio del autor, Resumen ( si está disponible), tipo de publicación (excepto Journal Article), PubMed y MEDLINE Unique Identifiers. Es el más utilizado y el que generalmente se selecciona para ver las citas recuperadas y luego imprimirlas o guardarlas.

• Citation: Referencia bibliográfica, status de la cita, título, indicación si el artículo no está en inglés, autores, Domicilio del autor, Resumen ( si está disponible), tipo de publicación (excepto Journal Article), PubMed y MEDLINE Unique Identifiers, y Términos MeSH. La siguiente referencia bibliográfica carece de resúmen (Abstract).

• MEDLINE : Cita completa con etiquetas de dos letras que identifican cada campo. Este formato es útil para la utilización de software de manejo bibliográfico como el EndNote.

PudMed brinda varias opciones para observar los resultados además del formato de visualización.

En la figura se puede observar que a parte de la opción de display existen otras tres opciones en la página de resultados.

Otras Formas de Visualizar los Resultados

1. Show: esta opción permite elegir el número de referencias a visualizar por página. Podemos elegir hasta un máximo de 500 referencias por página. Por defecto Pubmed muestra los primeros 20 resultados de cada búsqueda. Es Conveniente indicar un número mayor a la cantidad de citas obtenidas para que los resultados bajen en una sola pantalla. El único inconveniente es que si son muchas, puede haber demoras al descargarlas.

2. Sort by: esta opción permite ordenar los resultados de acuerdo a los siguientes criterios:

Fecha de Publicación Primer Autor Último Autor Revista

3. Send to: permite guardar los resultados de una búsqueda. A su vez dentro de esta opción tenemos:

Text File Printer Clipboard E-mail RSS-Feed Order

A continuación se detallara las opciones que son mas útiles:

o Text: permite visualizar los resultados en forma de texto, sin barras de opciones, ni menú adicionales, es una opción eficiente para poder realizar una impresión, es conveniente determinar el formato de visualización seleccionándolo desde el Display.

o File: esta opción permite que las citas seleccionadas o todas las citas guardarlas en un archivo de texto, es necesario indicar el nombre y el lugar especifico donde se requiere guardar ( solo se puede guardas hasta 10.000 citas).

o Clipboard: Esta opción permite guardar los resultados encontrados en el porta papeles que nos brinda PubMed. Para realizar este procedimiento debemos seleccionar las citas que deseamos almacenar, haciendo un click en el cuadro que se encuentra a la izquierda de cada cita, si se quieren guardar todas no se debe seleccionar ninguna.

Luego presionar Send to Clipboard y las referencias quedarán guardadas en el portapeles. Para recuperarlas, simplemente haga clic en la opción clipboard de la barra de opciones, y aparecerán las citas que fueron seleccionadas y guardadas en el portapapeles.

PubMed en esta opción permite guardar hasta 500 referencias, permaneciendo en el portapapeles durante ocho horas de inactividad del navegador.

o E-mail: las citas seleccionadas o todas pueden ser enviadas a una casilla de correo electrónico, sin importar a forma de visualización en la que se encuentre, ya sea en formato de texto o html. Sólo es necesario ingresar la dirección de correo electrónico del destinatario, también es posible enviar los resultados de una búsqueda.

oOrder: permite encargar una copia en texto completo del artículo. Pero esto es posible sólo a través de una biblioteca, y tiene un costo extra.

En la opción Select Page permite generar el número de páginas que se requiere ver, la cantidad mínima es de 20 registros por página, en la figura podermos observar que los resultados son mostrados en pestañas.

Review (1): en esta solapa se utiliza un filtro, que permite seleccionar a las revisiones en el campo Tipo de Publicación de MedLine.

All (2): en esta solapa se muestran todos los resultados, sin ningún filtro de búsqueda.

SELECCIONAR NUMERO DE CITAS

ICONOS UBICADOS A LA IZQUIERDA DE CADA REFERENCIA

Existen 4 tipos de íconos que se pueden mostrar a la izquierda de cada referencia:

Referencia sin resumen

Referencia con resumen

Texto completo disponible en forma gratuita a través de PubMed Central

Texto completo disponible a través del sitio editor de la Revista.

http://www.slideshare.net/munevarjuan/como-hacer-una-busqueda-correctamente-en-pubmed

http://bib.us.es/salud/aprendizaje_investigacion/common/Guias_pdf/PubMed_basico.pdf

http://pendientedemigracion.ucm.es/info/seas/invest/formac/06.Busqueda_basica_de_Informacion_en_PubMed.pdf

BIBLIOGRAFÍA