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www.bbm1.ucm.es/divul/divul.html www.bbm1.ucm.es/divul/divul.html Una aproximación a la utilidad de la Ciencia Una aproximación a la utilidad de la Ciencia ¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades? ¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades? Francisco Gavilanes Franco Francisco Gavilanes Franco Departamento de Bioquímica y Biología Molecular I Universidad Complutense de Madrid Departamento de Bioquímica y Biología Molecular I Universidad Complutense de Madrid

Sabias Que...(Francisco Gavilanes)

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Una aproximación a la utilidad de la Ciencia

Una aproximación a la utilidad de la Ciencia

¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Francisco Gavilanes FrancoFrancisco Gavilanes Franco

Departamento de Bioquímica y Biología Molecular IUniversidad Complutense de Madrid

Departamento de Bioquímica y Biología Molecular IUniversidad Complutense de Madrid

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

¿QUÉ ES UNA PROTEÍNA?

Formación de un enlace peptídicoNaturaleza plana del enlace peptídico

Biomolécula orgánicaformada por aminoácidos

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Hélice α Lámina β

Page 4: Sabias Que...(Francisco Gavilanes)

¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

NIVELES ESTRUCTURALES

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Hormona del crecimiento

Proteína de membrana (citocromo bc1)

Subunidad grande (50S) del ribosoma bacteriano

DIFERENTES NIVELES DE COMPLEJIDAD

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

DIFERENTES FORMAS DE

REPRESENTAR LA ESTRUCTURA

TRIDIMENSIONAL

Proteasa Kex2a) Modelo de cableb) Modelo de cintac) Modelo de varillas y esferasd) Modelo de esferas e) Modelo de superficies

electrostáticas

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

FUNCIONES DE LAS PROTEÍNAS

UNIÓN DE LIGANDOS CATÁLISIS

INTERRUPTORES ESTRUCTURALES

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

¿CÓMO EMPEZÓ ESTA HISTORIA?

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Premio Nobel de Química en 1954

LINUS C. PAULING (1901-1994)

Premio Nobel de la Paz en 1963

Page 10: Sabias Que...(Francisco Gavilanes)

¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

John C. Kendrew (1917-1997)MIOGLOBINA

Max F. Perutz (1914-2002)HEMOGLOBINA

Premio Nobel de Química en 1962

“Could the search for ultimate truth really haverevealed so hideous and visceral-looking an

object?”(Perutz, 1964)

“The arrangement seems to be almostlacking in the kind of regularities which

one instinctively anticipates”Kendrew y col., 1958

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Modelo de la mioglobina

Page 12: Sabias Que...(Francisco Gavilanes)

¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

¿CÓMO SE DETERMINA LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL EN

LA ACTUALIDAD?

Page 13: Sabias Que...(Francisco Gavilanes)

¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

MÉTODOSDE

DETERMINACIÓNESTRUCTURAL

DIFRACCIÓNDE RAYOS X

RESONANCIAMAGNÉTICA

NUCLEARMICROSCOPÍAELECTRÓNICA

Page 14: Sabias Que...(Francisco Gavilanes)

¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Microscopía electrónica

Difracción de rayos X

RMN

Microscopía óptica

Rangos de aplicación de las técnicas de determinación estructural

Page 15: Sabias Que...(Francisco Gavilanes)

¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Obtencióncristales

Fundamento

Patrón de difracción

DIFRACCIÓN DE RAYOS X

Mapa de densidadelectrónica

Page 16: Sabias Que...(Francisco Gavilanes)

¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

RESONANCIA MAGNÉTICA NUCLEAR

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Capa de carbón

ProteínaHaz de electrones

Imagen final

Los electrones que inciden sobre la sal del átomo pesado sufren una mayor dispersión y generan un fondo oscuro, mientras que los que atraviesan la proteína generan un imagen brillante.

MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA (Tinción negativa)

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Soporte de carbón

Proteína

Haz de electrones

Imagen final

Los electrones que inciden sobre la proteína sufren más dispersión y generan un imagen oscura

La proteína se congela en nitrógeno líquido

MICORSCOPÍA ELECTRÓNICA (Criomicroscopía)

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

200 Å

Molécula de proteína (prefoldina)

Tinción negativa

Molécula de proteína (GroEl-Es)

Criomicroscopía

MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA

Alineamiento de imágenes

Promediado de imágenes

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

VARIACIÓN DEL NÚMERO DE PROTEÍNAS RESUELTAS

MICROSCOPÍA RMN DIFRACCIÓN DE RAYOS X

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

¿HASTA QUE PUNTO ES IMPORTANTE CONOCER LA ESTRUCTURA

TRIDIMENSIONAL?

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

¿Hasta que punto es importante conocer la estructura tridimensional?

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

CONOCIENDO LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL PODEMOS

CONOCER COMO FUNCIONAN LAS PROTEÍNAS

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

ESTRUCTURA

DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA

FUNCIÓN

SECUENCIA DE AMINOÁCIDOS

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Conocemos la función a través de la estructura

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

¿Es importante que una proteína mantenga la estructura tridimensional?

Hemoglobina normal

Hemoglobina en la anemia calciforme

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Fibras de Hemoglobina

Eritrocito normal

Eritrocito de anemia falciforme

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

ESTRUCTURA

DISEÑO DE FÁRMACOS

FUNCIÓN

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Búsquedade

nuevosfármacos

Cribado de compuestos

naturaleso de síntesis

Síntesis de un análogo deun efectorendógeno

Diseño racionalbasado

en la estructura

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

CRIBADO DE ALTO RENDIMIENTO

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

Celebrex

SÍNTESIS DE UN ANÁLOGO DE UN EFECTOR ENDÓGENO

Artritis reumatoide

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

DISEÑO RACIONAL BASADOEN LA ESTRUCTURA

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

DISEÑO RACIONAL

Michael Rossmann (1986)

Proteína VP1 del rinovirus humano

Fármaco WIN 51711 unido a VP1

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

TRANSCRIPTASTRANSCRIPTASA INVERSAA INVERSA

RECEPTOR CD4RECEPTOR CD4

RECEPTOR RECEPTOR DE DE QUIMIOCINASQUIMIOCINAS

BICAPA LIPBICAPA LIPÍÍDICADICA

GP120GP120

GP41GP41RNARNA

CCÁÁPSIDA PSIDA (P24)(P24)

INTEGRASINTEGRASAA

NUCLEOCNUCLEOCÁÁPSIDA PSIDA (P7)(P7)

SUPERFICIE SUPERFICIE DE LINFOCITO DE LINFOCITO TT

VIRUS DEL SIDA

La proteasa hidroliza la poliproteínaen sus componentes, permitiendo, así, la función de cada una de las

partes

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

INHIBIDORES DE LA PROTEASA DEL HIV

Ritonavir

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

DISEÑO RACIONAL. Otros ejemplos:

SIDA Inhibidor de proteasas

nelfinavir

Úlceragástrica

Antagonistade receptor de H2

cimetidina

Glaucoma Inhibidor de anhidrasa carbónica dorzolamida

Enfisema Inhibidor deelastasa ONO-5046

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¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?¿Sabías que conociendo la estructura tridimensional de las proteínas se pueden curar enfermedades?

DISEÑO RACIONAL. Otros ejemplos:

Antiviral Inhibidor deneuraminidasa

zanamivir

AntipsicóticoReceptor de serotonina amisulpride

Antidepresivo Reutilizaciónde serotonina venlafaxine

Leucemia mieloide crónica

Inhibidor detirosina quinasa imatinib