Replicón y Replicación

Replicación del DNA

Conflicto entre la direccion de lareplicación y la trancripción.

Casi todas las unidades activas detranscripción están orientadas deforma que se expresan en la mismadirección que la horquilla dereplicación que pasa sobre ellas.

Cadena codificante

Cadena templado3’ 5’

5’ 3’

Transcripción

Replicación

Tamaño de los replicones eucarióticos:≈ 40 kb en moscas o levadura - ≈ 100 kb en animales superiores

Tasa de replicación:2,000 pb/min (en bacterias es de 50,000 pb/min)

En una célula somática típica, la fase S dura > 6h

Cada foco contiene >300 horquillas de replicación

ARS = AutonomousReplicating Sequence(levadura)

ORC = Origin RecognitionComplexComplejo de 6 proteínas de400 kDa.

Al contar el número de sitios a los que se uneORC, se puede estimar que hay unos 400orígenes de replicación en el genoma delevadura.

Esto significa que la longitud promedio de unreplicón es de ~35,000 bp.

Un origen puede ser una secuenciade DNA que sirve para iniciar lasíntesis de DNA utilizando comomolde UNA de las cadenas. Laapertura del duplex no conducenecesariamente al comienzo de lareplicación de la otra cadena.

El problema de los replicones lineales:

El problema de los replicones lineales; otras soluciones:

� Convertir el replicón lineal en una molécula circular o multimérica (T4 y Lambda)

� Crear un horquilla en el extremo, de forma que no haya un extremo libre (mitocondrias deParamecium)

� Tener un extremo variable y un mecanismo para añadir o eliminar unidades (cromosomaseucarióticos)

Los genomas de cadena sencilla se generan para laconjugación bacteriana

La maquinaria de replicación

Los puntos GATC del origen continúan hemimetilados unos 13 min después de la replicación

El promotor del gene dnaA también muestra retraso antes de empezar a metilarse

SeqA se une al DNA hemimetilado con más fuerza que al DNA completamente metilado. Las mutantesseqA inician la replicación del DNA demasiado pronto, acumulando así un número excesivo de orígenes

Tasa de errores en baterias:10-8-10-10

Helicasa (DnaB)

Pol III α

Primasa (DnaG)

Pol III β

Pol III γδ

Pol III τ

RNA primer

dsDNA

ssDNA

Telómeros

Todas las secuencias teloméricas tienen la fórmula Cn(A/T)m, n>1 y m=1 a 4

En células animales, el tamaño promedio del asa es de 5-10 kb