Diego Canalejo Collado

Francisco Corzana López y Gonzalo Jiménez Osés

Facultad de Ciencias, Estudios Agroalimentarios e Informática

Grado en Química

2014-2015

Título

Director/es

Facultad

Titulación

Departamento

TRABAJO FIN DE GRADO

Curso Académico

Análisis conformacional de un glicopéptido en estado libre mediante dinámica molecular

Autor/es

© El autor© Universidad de La Rioja, Servicio de Publicaciones, 2015

publicaciones.unirioja.esE-mail: publicaciones@unirioja.es

Análisis conformacional de un glicopéptido en estado libre mediante dinámica molecular, trabajo fin de grado

de Diego Canalejo Collado, dirigido por Francisco Corzana López y Gonzalo Jiménez Osés (publicado por la Universidad de La Rioja), se difunde bajo una Licencia

Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 3.0 Unported. Permisos que vayan más allá de lo cubierto por esta licencia pueden solicitarse a los

titulares del copyright.

αα

a la conformación de lámina β

–

–

mol=loadpdb “nombre del archivo de la molécula”.pdb

Lógicamente, si sólo se utiliza una “caja” de moléculas de agua, aquellas moléculas próximas a

“ ”

saveAmberParm mol “nombre”.tpp “nombre”.xyz

/home/usuario/amber12/bin/pmemd.cuda –O –i min1.in –o min_vacio1.out –p archivo.tpp –c / / / /archivo.xyz –r archivo.rst

–

–

χ