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CAPÍTULO 5 Modelamiento matemático

Capitulo_5._Modelamiento_matematico

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Page 1: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

CAPÍTULO 5

Modelamiento matemático

Page 2: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Modelamiento matemático

Cinéticas de producción de biomasa, formación de producto y utilización de sustrato

Page 3: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

¿Cuál es el objetivo?

Maximizar utilidades

Maximizar la eficiencia de la utilización de recursos

Optimizar la formación de producto por las células

Page 4: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

¿Cuál es el objetivo?

Maximizar utilidades

Maximizar la eficiencia de la utilización de recursos

Optimizar la formación de producto por las células

Producir la mayor cantidad de producto en el menor

tiempo con el menor costo

Page 5: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

¿Qué necesitamos?

Describir cuantitativamente los sistemas de cultivo de células

Obtener las cinéticas del proceso

Page 6: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Las cinéticas nos permiten:

Predecir rendimientos Predecir tiempos de reacción Ayudan a determinar el tamaño del

biorreactor (escalamiento)

¿Cómo se obtienen?

Generalmente se obtienen de experimentos efectuados en biorreactores de pequeña escala.

Page 7: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Modelos matemáticos

Un modelo matemático es una descripción matemática de un sistema físico

Un buen modelo matemático se enfoca en aspectos importantes que proporcionen resultados útiles

Los modelos matemáticos son usados ampliamente en cualquier rama de la ciencia e ingeniería

Page 8: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Tarea 1

Investigue cuáles son los tipos de modelos

Ejemplos:

Mecanístico Empírico

Page 9: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Ejemplos de modelos matemáticos

Ecuaciones de cinética química

La ecuación de Michaelis-Menten

Page 10: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Ecuación cinética de primer orden

nPS

SkdtSd

dtSd

ndtPd

SnkdtPd

Reacción

Velocidad de consumo de S Velocidad de formación de P

Combinando ecuaciones

Page 11: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Ecuación de Michaelis-Menten

SK

SVV

m max

Sk

SV

dtSd

m max

dtSd

YdtPd

Velocidad de consumo de S Velocidad de formación de P

Combinando ecuaciones

Sk

SVY

dtPd

m max

Page 12: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Modelos matemáticos:Parámetros, variables y restricciones

Uso de ecuaciones diferenciales con variables que cambian con el tiempo

Uso de parámetros que no cambian con el tiempo y que dependen de las condiciones del sistema

Las variables se expresan como concentraciones Pueden estar restringidos a situaciones de pH o

temperatura constantes Pueden o no considerar efectos de transferencia de

masa

Page 13: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

¿Qué ocurre cuando realizamos una fermentación?

Las células crecen ya sea aumentando en número o en tamaño

Al crecer, toman materiales del ambiente Al crecer, liberan materiales de origen

metabólico

Page 14: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

¿Qué determina la cinética de población celular?

Medio ambiente

Multicomponente Reacciones en solución Equilibrio ácido-base Temperatura y pH variables Cambio en propiedades

reológicas Multifase No-uniformidad espacial

Población celular

Multicomponente Heterogeneidad celular Reacciones múltiples Controles internos adaptabilidad Cambio genético

Nutrientes

Productos

Calor

Interacciónmecánica

Page 15: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Diferentes perspectivas para la cinética de población celular

No estructurado

La población celular se trata como un soluto de

un componente

Descripción celular promedio

multicomponente

Un solo componente, células individuales

heterogéneas

Descripción multicomponente de la

heterogeneidad de célula a célula

Estructurado

Seg

rega

doN

o se

greg

ado

Promediocelular

Promediocelular

Crecimiento balanceado

Crecimiento balanceado

Page 16: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Diferentes perspectivas para la cinética de población celular

No estructurado

La población celular se trata como un soluto de

un componente

Descripción celular promedio

multicomponente

Un solo componente, células individuales

heterogéneas

Descripción multicomponente de la

heterogeneidad de célula a célula

Estructurado

Seg

rega

doN

o s

egre

gad

o

Promediocelular

Promediocelular

Crecimiento balanceado

Crecimiento balanceado

Caso m

ás id

ealiz

ado

Page 17: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Diferentes perspectivas para la cinética de población celular

No estructurado

La población celular se trata como un soluto de

un componente

Descripción celular promedio

multicomponente

Un solo componente, células individuales

heterogéneas

Descripción multicomponente de la

heterogeneidad de célula a célula

Estructurado

Seg

reg

ado

No

segr

egad

o

Promediocelular

Promediocelular

Crecimiento balanceado

Crecimiento balanceado

Caso re

al

Page 18: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Tarea 2

Investigue referente a los modelos estructurados en procesos fermentativos.

Page 19: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Reactores ideales

El reactor por lote ideal

Aplicando un balance de masa

RiconsumeRigeneraRisaleRientrai

R VrVrVcVcdt

dcV ,,,,

0 0 0 0

Page 20: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Reactores ideales

El reactor continuo de tanque agitado ideal

Aplicando un balance de masa

RiconsumeRigeneraisaleientrai

R VrVrFcFcdt

dcV ,,,,

0 0

Page 21: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Tarea 3

Derive la ecuación del balance de masa para un reactor de lote alimentado

Aplique las ecuaciones de balances de masa para un reactor por lotes, continuo y de lote alimentado; considerando dextrosa como sustrato

Page 22: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

¿Qué se necesita entonces?

Se necesita de ecuaciones que permitan calcular las velocidades de generación o consumo.

(?), fr igenera

(?), fr iconsume

Page 23: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Cinéticas de cultivo en lote

Page 24: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Fase exponencial

Page 25: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Velocidad de producción de células

Conforme se incrementa el número de células, la velocidad de biorreacción también se incrementará. Así, si otras condiciones permanecen constantes, la velocidad de incremento de las células (biomasa) depende de la concentración de células presentes en el biorreactor.

xdtdx

Page 26: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Eliminando la proporcionalidad

xdtdx

Donde:

es la velocidad específica de crecimiento

El modelo de crecimiento exponencial

Page 27: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

El modelo de crecimiento exponencial

La velocidad específica de crecimiento () describe qué tan rápido se están reproduciendo las células.

Mientras mayor sea la velocidad específica de crecimiento mayor será la velocidad a la que están creciendo las células

Cuando las células no están creciendo, la velocidad específica de crecimiento es cero.

Durante la fase exponencial, la velocidad específica de crecimiento es prácticamente constante.

Page 28: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Resolviendo el modelo de crecimiento exponencial

xdtdx

Integrando la ecuación anterior entre los límites:

t = t0, x = x0

t = t, x = x

Y considerando constante

00

ttexx

Page 29: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Tarea 4

Evalúe la ecuación del crecimiento exponencial utilizando el Microsoft Excel con los siguientes valores

x0 = 2 g/l t0 = 0 = 0.01 h-1

Genere una gráfica desde 0 h hasta 240 h. ¿Qué sucede si = 0.05 h-1?

Page 30: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Limitaciones del modelo de crecimiento exponencial

Supone que la velocidad específica de crecimiento es constante

Esto es cierto durante el crecimiento exponencial o cuando cesa el crecimiento

Predice que la biomasa nunca deja de crecer

La disponibilidad de nutrientes no es ilimitada y conforme su disponibilidad disminuye, la velocidad de crecimiento celular disminuirá y eventualmente se detendrá.

Page 31: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Relación entre el tiempo de duplicación y la velocidad específica de crecimiento

El tiempo de duplicación es una expresión que describe la velocidad de crecimiento celular.

El tiempo de duplicación representa el tiempo que se requiere para que la población celular aumente al doble.

Durante el crecimiento exponencial, el tiempo de duplicación es prácticamente constante.

Page 32: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Relación entre el tiempo de duplicación y la velocidad específica de crecimiento

11

ttexx

Partiendo del modelo de crecimiento exponencial

Tomando logaritmos

11

ln ttx

x

Si la biomasa se incrementa al doble y se tiene que tD = t2 – t1

2lnDt

Page 33: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

El nutriente que limita el crecimiento

La disponibilidad de nutrientes tiene una influencia principal en la velocidad específica de crecimiento.

Si un nutriente se encuentra disponible en concentraciones que limitan el crecimiento de las células, entonces se dice que este nutriente limita el crecimiento

Page 34: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

El nutriente que limita el crecimiento

Algunas fermentaciones se diseñan para que la fuente de carbono sea la limitante

En otras, la fuente de nitrógeno es limitante En la mayoría de las fermentaciones aerobias a gran

escala, la disponibilidad de oxígeno será limitante En algunas fermentaciones se controla

intencionalmente la disponibilidad de un nutriente para disminuir o detener la velocidad de crecimiento

Page 35: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

La cinética de crecimiento tipo Monod

El crecimiento de biomasa depende de la disponibilidad de nutriente

Page 36: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

La cinética de crecimiento tipo Monod

En 1942, Monod propone la siguiente ecuación que describe el efecto del nutriente limitante en la velocidad específica de crecimiento

xdtdx

sK

s

s

max

sK

sx

dt

dx

s

max

Page 37: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Parámetros del modelo de Monod

La velocidad específica de crecimiento máxima es la máxima velocidad que se alcanza cuando el nutriente que limita el crecimiento no está limitado.

sK

sx

dt

dx

s

max

Page 38: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Parámetros del modelo de Monod

La constante de Monod es la concentración del nutriente limitante en la que la velocidad específica de crecimiento es la mitad de la máxima velocidad que puede ser alcanzada.

sK

sx

dt

dx

s

max

Page 39: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Tarea 5

Investigue cuáles son las diferencias o similitudes entre las siguientes ecuaciones:

Ecuación de Monod Ecuación de Michaelis-Menten (estándar) Ecuación de Langmuir (isoterma de adsorción)

Page 40: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Otras formas de cinéticas de crecimiento

Tessier

sKse 1max

1max 1 sK s

Moser

Contois

sBx

s

max

Levenspiel

sK

s

s

s

s

n

max

max

1

pi KssK

s2

max

Andrews

Page 41: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Modelos de crecimiento no estructurados

En este tipo de modelos se considera que la velocidad de aumento en la masa celular es una función solamente de la masa celular.

xfdt

dx

Page 42: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Modelos de crecimiento no estructurados

xdt

dx

Malthus

Logístico

xkxdt

dx 1

Gompertz de dos parámetros

tkxedt

dx

Gompertz detres parámetros

axkxedt

dx t

Page 43: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Coeficientes de rendimiento

Un rendimiento (o coeficiente de rendimiento) se define como la cantidad de producto que se produce a partir de una entrada dada.

Por ejemplo, si se producen 0.6 g de ácido cítrico a partir de 1 g de glucosa, entonces el rendimiento es de 0.6 g/g.

Los rendimientos varían durante la fermentación y por esta razón se utilizan coeficientes de rendimiento promedio.

Page 44: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

La importancia de los coeficientes de rendimiento

Los coeficientes de rendimiento son una medida de la eficiencia de una conversión particular.

Coeficientes de rendimiento optimizados significan mayor producción con bajo consumo de materia prima.

Se utilizan para comparar alternativas de fermentación

Se utilizan junto a datos cinéticos para modelar la fermentación.

Un mayor rendimiento no implica una mayor productividad.

Page 45: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Tipos de coeficientes de rendimiento

Coeficiente de rendimiento de biomasa

Los coeficientes de rendimiento mayormente utilizados son:

10

01

ss

xxY sx

01

10

xx

ssY xs

1

01

ss

ppY

osp

Coeficiente de rendimiento de sustrato

Coeficiente de rendimiento de producto

Page 46: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Tarea 6

Investigue sobre coeficientes estequiométricos de rendimiento en procesos de fermentación y su diferencia con los coeficientes de rendimiento vistos anteriormente

Page 47: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Cinética de consumo de sustrato

El consumo de sustrato se clasifica en:

Asociado al crecimiento Paralelo

Page 48: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Consumo de sustrato asociado al crecimiento

En este tipo de cinética se considera que la velocidad de consumo de sustrato es proporcional a la velocidad de crecimiento de biomasa.

dt

dx

Ydt

ds

sx

1

Page 49: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Consumo de sustrato paralelo

Este tipo de cinética considera un consumo paralelo de sustrato para crecimiento y para otros requerimientos energéticos o de mantenimiento

mxdt

dx

Ydt

ds

sx

1

Consumo de sustratopara crecimiento

Consumo de sustratopara mantenimiento

Page 50: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Cinéticas de crecimiento y consumo de sustrato

Modelos no acoplados al consumo de sustrato

xkxdt

dx 1

mxdt

dx

Ydt

ds

sx

1

xkxdt

dx 1

mxxkxYdt

ds

sx

11

Page 51: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Cinéticas de crecimiento y consumo de sustrato

Modelos acoplados al consumo de sustrato

sK

sx

dt

dx

s

max

mxdt

dx

Ydt

ds

sx

1

mxsK

sx

Ydt

ds

ssx

max1

sK

sx

dt

dx

s

max

Page 52: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Tarea 7

Integración analítica y numérica (parámetros conocidos)

Integre analíticamente la siguiente ecuación y genere una tabla en Excel donde la evalúe desde t = 0 hasta t = 150 h, en incrementos de 1.5 h. Utilice para esto k = 0.075 y β = 0.14. ¿Qué unidades deben tener k y β? Integre considerando que en t = 0, x = 1.638 g/l.

xkxdt

dx 1

Integre numéricamente la ecuación anterior utilizando el método de Runge-Kutta y compare las dos soluciones.

Page 53: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Cinética de formación de producto

La formación de producto se clasifica en:

Asociada al crecimiento No asociada al crecimiento Combinada

Page 54: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Formación de producto asociada al crecimiento

Asociada al crecimiento significa que la velocidad de formación de producto es proporcional a la velocidad de formación de biomasa. Cuando el crecimiento cesa, la formación de producto también cesa.

dt

dxY

dt

dpxp

Page 55: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Formación de producto no asociada al crecimiento

No asociada al crecimiento significa que la velocidad de formación de producto no es proporcional a la velocidad de formación de biomasa. En algunos casos, la formación de producto continuará después de que haya cesado el crecimiento.

xdt

dp

Page 56: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

La cinética de Leudecking-Piret

En 1959, Leudecking y Piret consideraron que la formación de producto era combinada y toma en cuenta la parte asociada al crecimiento y la parte no asociada al crecimiento

xdt

dxY

dt

dpxp

Page 57: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Cinéticas de crecimiento, consumo de sustrato y formación de producto

Modelos no acoplados al consumo de sustrato

xkxdt

dx 1

mxdt

dx

Ydt

ds

sx

1

xkxdt

dx 1

mxxkxYdt

ds

sx

11

xdt

dxY

dt

dpxp xxkxY

dt

dpxp 1

Page 58: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Cinéticas de crecimiento y consumo de sustrato

Modelos acoplados al consumo de sustrato

sK

sx

dt

dx

s

max

mxdt

dx

Ydt

ds

sx

1

mxsK

sx

Ydt

ds

ssx

max1

sK

sx

dt

dx

s

max

xdt

dxY

dt

dpxp x

sK

sxY

dt

dp

sxp

max

Page 59: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Algunos comentarios

El modelado matemático de procesos fermentativos es un aspecto de la biotecnología muy estudiado.

Los modelos nos permiten entender de mejor manera los procesos complejos ya que permiten analizar estos procesos sistemáticamente y permiten identificar parámetros y variables importantes.

Page 60: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

¿Cómo resolvemos estas ecuaciones?

Analíticamente (si es posible)

Numéricamente (Runge-Kutta)

Independientemente de la técnica utilizada, se tienen problemas de valor inicial ya que se tienen derivadas con respecto al tiempo

0

0

0

0

ppssxx

t

Software comercial

Programación

Page 61: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

¿Qué valor le damos a los parámetros?

Algunos valores se reportan en la literatura pero dependen de las condiciones de fermentación como el pH, la temperatura o las fuentes de carbono y nitrógeno

Entonces ¿qué podemos hacer?

Necesitamos realizar un ajuste de datos experimentales mediante una optimización (regresión)

Page 62: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Optimización de parámetros

Se obtienen datos experimentales Se escoge el modelo que se probará para

determinar su capacidad de ajustar tales datos

Se realiza la optimización de parámetros Se obtienen valores optimizados de los

parámetros

Page 63: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

¿Cuáles son las opciones?

Si las ecuaciones del modelo son explícitas, se puede utilizar software comercial como el Excel o el Statistica para realizar la optimización de parámetros.

Si las ecuaciones del modelo son implícitas (ecuaciones diferenciales), se tiene que utilizar software especializado.

Page 64: Capitulo_5._Modelamiento_matematico

Tarea 8

Ajuste de datos experimentales con Excel

Los siguientes datos experimentales se obtuvieron durante la producción de un metabolito secundario en un reactor airlift. Ajuste estos datos al modelo logístico utilizando el Solver del Excel.

t, h x, g/l

0 1.638

16 3.465

24 4.773

40 6.058

48 6.596

72 6.44

96 6.681

120 7.207

142 7.48

166 7.658

xkxdt

dx 1