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MODELADO MOLECULAR YCALCULO DE PROPIEDADES –

HERRAMIENTASCOMPUTACIONALES 

Resumen: En esta charla se resentaranherram!entas "#s!cas ara el $!"u%& ' m&$ela$&$e m&l(culas) Tam"!(n se resentara la *&rma

en +ue se calculan r&!e$a$es electr,n!cas '

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Por Modelado Molecular entendemos:

La generación, manipulación y/o representación deestructuras moleculares realistas y de suspropiedades fisicoquímicas.

Una aplicación simplista y poco rigurosa de laQuímica Computacional

n muc!os casos se suele usar como sinónimo deQuímica Computacional si "ien a"arca menos que

esta.

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# uso de la mec$nica cu$ntica, la mec$nicaestadística y de otros aspectos de la físicamolecular, química%física y fisicoquímica paradeterminar propiedades moleculares

Modelado Molecular

&spectos de la in'estigación en química que sonfacilitados o !ec!os posi"les por las computadoras

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H.O

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M&l(cula !m&rtanteara la -!$a es lacl&r&/la0 resente en laslantas ' 1rac!as a la

cual se r&$uce el*en,men& $e la

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ADN

ATP

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()*#+&

 un "r&nc&$!lata$&rren(r1!c&

 sures!,n $e

sensac!,n $ensanc!&

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-M*#& M-LCUL&*

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**&M#+&0C-MPU&C#-+&L0

+&1&)-* % 2*-30* 

PLU%#+ 4&U5#L#&* 1#0U&L#6&*M-LCUL&07

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5#0+ P*-*&M&0 4soft8are7 *&U#-0

9 C-M*C#&L0 QU P*M#+ )#2U&*4M-)L&*7 M-LCUL&0 9 C&LCUL&*P*-P#)&)0 ) L&0 M#0M&0

9P*CM&1-&)*-&2)#

CM2#--((#C

M-L&U00#&+1#3

-*C&-*-0

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HYPERCHEM

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CHEMBIOOFFICE

,

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La creac!,n $elh&m"re

M!1uel 3n1el

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Se $!s&ne $e un cluster $e 4 n&$&sc&n*&rma$& &r el s!1u!ente e+u!am!ent&:Se!s c&muta$&ras $e $&"le r&cesa$&r5e&n 6788 +ua$ c&re $e cuatr& n9cle&s ' susresect!-&s $!sc&s0 c&n mem&r!as +ue -an $e

a ;4 are $e cluster!?ac!,n es ROC@S 4).) En este Cluster se encuentra !nstala$& ela+uete ORCA en su -ers!,n 7)8)7 '

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P*)C#* P*-P#)&)0 M-LCUL&*0

-M*#& 9 P&*&M*-0M-LCUL&*0

)#0&+C#&0 ) +L&C

&+UL-0 ) +L&C+*;&0 ) +L&C

&M&

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HOMO am&n!ac&

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La parte superior del $tomo de o=ígeno aparece decolor ro>o indicando la presencia de dos pares solitariosde electrones.l o=ígeno tam"i?n es m$s electronegati'o que elcar"ono. Las $reas en las que los $tomos de !idrógeno@so"resalen@ aparecen de color aAul ya que !ay poca

densidad de electrones.

MP

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 Relación cuantitativaestructura-actividad (en inglés,

Quantitative structure-activityrelationship, QSAR, o bien,quantitative structure-propertyrelationship, QSPR)

Actividad !(propiedades "sicoqu#$icas y%o propiedadesestructurales)

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PROPIEDADES ESPECTROSCOPICAS

ESPECTROS ELECTRONICOSESPECTROS VIBRACIONALES IR Y RAMANESPECTROS RMNPREDICCIÓN DE PROPIEDADES

FARMACOLOGICASMECANISMOS DE REACCIÓN

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  Calidad de los c$lculos teóricos utiliAados

  l criterio para seleccionarlos  0u aplica"ilidad y el modelo químico utiliAado  #nterpretación correcta de los resultados.

Computadoras noresuel'en

los pro"lemasl operador lo !ace

▼ Aumento en la caac!"a" "e c#lculo $ %o!e"a"e& '%#(!ca& "ela& comuta"o%a&

▼ P%o'%ama& m#& )am!'a*le&+ $ econ,m!co&

stas !erramientas est$n al alcance de la mayoría de losla"oratorios, sin em"argo de"emos tener cuidado de ponerlas en

manos e=pertas

Modelos ine=actos !ipótesis erróneas malos resultados

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&est's seguroque con unanari grandepodr's volar

B

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I=RACIONES *+./ARS

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ASI

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TERMO-.IMICA

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COMPLEJO Cu Flavonoide

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COMPLEJO Cu- Flavonoide

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El -u/m!co comutac!onal 0ue'acon o%*!tale& molecula%e&

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con o%*!tale& molecula%e&m!ent%a& $o t%a*a0o "u%o en el

la*o%ato%!o

1Po% 2u3 el -u/m!coe4e%!mental cu!"a &u&e&t%uctu%a& como a unte&o%o5

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B CU+- #MP- -M&* LL&* & &QULL&@#**& P*-M#)&@ D

"Estén preparados paraenfrentar el futuro,

 porque el futuro viene ygeneralmente llegamucho antes de que

nosotros estemos listos para abandonar el

presente" 0 2 .si$adia

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M.CHAS GRACIAS