Diplomado en Sanidad · Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud, 2009 – 2010 2 0. Objetivos En este módulo te familiarizarás con los conceptos, fundamentos y la terminología

Diplomado en Sanidad

Módulo III

Documentación biomédica

Montserrat Salas Valero

Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud, 2009 – 2010

Salas Valero M



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0. Objetivos En este módulo te familiarizarás con los conceptos, fundamentos y la terminología básica de la documentación científica. Aprenderás a identificar tus necesidades de información. Conocerás las principales fuentes de información en ciencias de la salud.

Aprenderás qué es una búsqueda bibliográfica, y cuáles son los instrumentos y herramientas necesarias para construir y formular una correcta estrategia de búsqueda (utilización de descriptores, operadores booleanos) que te permita recuperar información relevante y pertinente. Especialmente nos vamos a centrar en las bases de datos más importante: Pubmed y Embase.

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1. Fuentes de información en Ciencias de la Salud El acceso a la información hoy en día puede constituir una tarea difícil para el investigador, el docente, el estudiante y el profesional sanitario. El crecimiento de la literatura científica, la aparición de nuevas fuentes y recursos de información y el desarrollo de las nuevas tecnologías han contribuido a crear un laberinto informativo de enormes magnitudes. Es en el siglo XX, y más concretamente después de la segunda guerra mundial, cuando comenzó a acelerarse el ritmo de producción de la información. Este crecimiento desmesurado del volumen de información que se genera en todo el ámbito científico y que se conoce como “explosión de la información” ha tenido como

consecuencia la disminución, al menos relativa, de la calidad de los documentos, el envejecimiento y la obsolescencia de los mismos. Para comprender cómo se puede acceder a la información científica y extraer aquella que resulte realmente útil es necesario conocer los fundamentos de una disciplina cuyo objetivo es precisamente clarificar este complejo entramado. Esta disciplina es la Documentación Científica. La documentación nace por la necesidad de llevar a cabo la organización total de las fuentes de información para satisfacer aquella parte del trabajo investigador necesitado de las mismas (1). S. C. Bradford define esta disciplina como “el proceso que permite poner al alcance del investigador toda la literatura sobre la materia que estudia, para que conozca los progresos alcanzados en su especialidad y no malgaste sus facultades creadoras en repetir trabajos ya realizados” (2).

(1) López Yepes J. ¿Qué es Documentación? En: López Yepes, J. (comp.). Fundamentos de Información y Documentación. Madrid: EUDEMA; 1989 (2) Bradford S C. Documentation. Washington: Public Affairs; 1948

El objetivo de las fuentes de información es el de facilitar la localización e identificación de cualquier tipo de documento.

Nota

Fuentes de información: Llamamos fuentes de información a "todos aquellos instrumentos y recursos que sirven para satisfacer las necesidades informativas de cualquier persona, se hayan creado o no con ese fin y sean utilizados directamente o por un profesional de la información como intermediario".

Documento: Todo conocimiento fijado materialmente sobre cualquier soporte y que sirve para transmitir información con carácter perdurable. Podemos clasificarlos en:

• Documentos primarios: son aquellos en los que se encuentra una información "de primera mano" es decir, original tal y como la quiso transmitir el autor (un artículo, una monografía, un dibujo, una película).

• Documentos secundarios: son los que describen y contienen la información de los que hemos llamado documentos primarios. Suelen aparecer organizados como fuentes de documentación y constituyen elementos claves para el buen desarrollo de todo trabajo de investigación.

• Documentos terciarios: la abundancia de fuentes de documentación ha hecho necesaria la aparición de un tercer nivel en el que los documentos secundarios se convierten en objeto de estudio y se recogen en guías de documentos secundarios o bibliografías de bibliografías.

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2. Búsqueda de información: la búsqueda bibliográfica

2.1. Búsqueda de información bibliográfica

Entendemos por búsqueda bibliográfica el conjunto de procedimientos manuales, automáticos e intelectuales encaminados a localizar, seleccionar y recuperar aquellas referencias o documentos que responden a nuestro tema de interés. La búsqueda bibliográfica podemos hacerla de manera manual, en repertorios impresos, monografías, etc., o bien de modo automatizado en bases de datos.

La diferencia entre las dos radica en la forma en que se realiza el proceso de búsqueda y especialmente en los medios utilizados para la

recuperación de la información. La búsqueda automatizada presenta una serie clara de ventajas sobre la manual como la rapidez, exhaustividad, precisión y actualización. No obstante, ambas pueden o deben, en algunos casos, ser complementarias.

Nota

Antes de realizar una búsqueda automatizada debes pensar si realmente necesitas usar una base de datos o quizá puedas encontrar la información que necesitas en otro tipo de fuentes como: manuales, índices, directorios, enciclopedias, etc.

2.2. Criterios de búsqueda

Antes de iniciar una búsqueda bibliográfica hay que establecer de manera precisa qué es lo que se quiere buscar y cuáles son los conocimientos previos sobre el tema, esto es, formular la pregunta. Así pues debemos:

• Definir claramente los objetivos y la finalidad de la búsqueda bibliográfica. Finalidad que puede ir orientada a:

o Identificar el nivel de conocimientos de la comunidad científica sobre un tema determinado.

o Proporcionar ideas que ayuden a generar nuevas investigaciones.

o Responder a una pregunta clínica.

o Actualizar conocimientos.

• Establecer el nivel, la cobertura y el ámbito de la búsqueda. Es importante establecer los límites de nuestra búsqueda. Estos pueden ser:

o Cronológicos.

o Idiomáticos.

o Temáticos.

o Tipológicos.

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• Seleccionar las fuentes o recursos de información. Uno de los puntos importantes en el proceso de búsqueda es la selección de las fuentes más adecuadas en función de la pregunta expresada.

2.3. Tipos de bases de datos

En esta unidad vamos a centrarnos en bases de datos y en Internet.

¿Qué es una base de datos?

Una base de datos es un conjunto de datos homogéneos, almacenados en un soporte informático, que se estructuran y organizan para facilitar su recuperación. Está formada por registros y éstos a su vez por campos.

Existen distintas clasificaciones de bases de datos.

• Según la naturaleza de la información contenida:

o Bases de datos bibliográficas: Proporcionan referencias bibliográficas de los documentos. Ej. Medline.

o Bases de datos textuales: Contienen la referencia bibliográfica y el texto completo. Ej. Cochrane (revisiones sistemáticas).

o Bases de datos factuales: Contienen información numérica. Ej. Eco- Santé, INEbase, etc.

• Según la cobertura temática:

o Especializadas: tratan sobre un tema o conjunto de conocimientos muy específicos. Ej. Medline, Cochrane Library.

o Multidisciplinares: ofrecen información sobre varios temas o disciplinas.

• Según la cobertura geográfica:

o Internacionales: Ej. Medline.

o Nacionales: Ej. IME, Índice Médico Español.

Nota

En ciencias de la salud existen una enorme variedad de Bases de Datos, desde las de carácter general como Medline hasta las más especializadas como la Cochrane Library. Elegiremos una u otra en función de nuestra necesidad de información.

2.4. La estrategia de búsqueda

La estrategia de búsqueda viene determinada por una serie de pasos sucesivos que deben realizarse para llevar a cabo la consulta o búsqueda bibliográfica.

No existe una única estrategia de búsqueda, ya que toda estrategia se formula, como ya hemos señalado, en función de factores tales como la exhaustividad, la cobertura temporal, la cobertura geográfica, el tipo de documento deseado, etc.

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La estrategia de búsqueda puede dividirse en las siguientes fases:

• Definición de la pregunta. • Análisis de la consulta e identificación de conceptos. • Traducción de la consulta al lenguaje documental. • Formulación de la ecuación de búsqueda. • Rediseño de la estrategia de búsqueda.

2.4.1. Definición de la consulta Definir en una o varias frases cortas el tema sobre el que deseamos obtener información.

Ejemplo

Beneficios del uso de botox en el tratamiento de la hiperhidrosis.

2.4.2. Análisis de la consulta e identificación de conceptos Identificar los conceptos más significativos eliminando aquellos que tengan un contenido vago o impreciso o que representan aspectos secundarios y poco importantes.

Ejemplo

Hiperhidrosis, botox, tratamiento.

2.4.3. Traducción de la consulta al lenguaje documental Buscar y seleccionar los términos de búsqueda correspondientes a cada uno de los conceptos identificados. Escoger los descriptores que mejor los representen.

Ejemplo

En PubMed elegiríamos los siguientes descriptores: Hyperhidrosis/therapy, Botulinum Toxin Type A.

2.4.4. Términos de búsqueda: Lenguaje libre o natural A la hora de realizar una búsqueda de información podemos utilizar términos tomados del lenguaje natural. Estos términos se denominan palabras clave.

Palabras clave

Términos libres del lenguaje natural, suficientemente significativos, extraídos generalmente del título o del contenido del documento.

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Se utiliza el lenguaje libre o natural cuando:

• El concepto es nuevo y todavía no forma parte de los vocabularios controlados.

• El concepto es muy preciso.

• Se pretende una búsqueda muy exhaustiva.

• Si utilizamos el lenguaje natural debemos:1

• Buscar por el término seleccionado y todos sus sinónimos.

• Buscar los términos en otros idiomas.

• Buscar por las distintas variantes gramaticales o diferentes grafías de un término: metanálisis, meta-análisis, cinc, zinc.

• Utilizar la forma desarrollada de acrónimos y siglas

Ejemplo

Si utilizamos el lenguaje natural y deseamos buscar el término cáncer deberíamos buscar además de por cáncer, por tumor, tumores, neoplasia, neoplasias, etc.

Nota

Se recomienda utilizar términos del lenguaje natural como complemento del lenguaje controlado, siempre que la base datos posea un tesauro.

Palabras vacías: Las palabras vacías o stopwords son palabras de uso corriente como conjunciones, artículos, preposiciones, etc., que son, generalmente, ignoradas por las bases de datos.

Nota

Debes evitar utilizar palabras vacías en tus búsquedas para evitar silencio documental si buscas por descriptor, y ruido documental si buscas por título, resumen o texto completo.

2.4.5. Términos de búsqueda: Lenguaje controlado Cuando buscamos información en bases de datos debemos, siempre que exista, utilizar el lenguaje controlado. Este lenguaje es el que se utiliza para indexar los documentos en las bases de datos y facilita su posterior recuperación. El Tesauro es el “vocabulario” utilizado en la indización para describir el contenido de los documentos. Los Descriptores son términos controlados tomados de un Tesauro. Cuando los utilizamos eliminamos:

• La sinonimia (palabras diferentes con significado igual o parecido).

• La polisemia (palabras con varios significados).

• Las variantes gramaticales.

• Las ambigüedades.

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Nota

Utiliza descriptores para precisar tus búsquedas.

2.4.5. Formulación de la ecuación de búsqueda: los operadores booleanos Los operadores booleanos son elementos que permiten combinar los términos de búsqueda estableciendo relaciones sintácticas entre ellos. La mayoría de las búsquedas en bases de datos se basan en los principios de la lógica booleana.

Los operadores booleanos son:

• AND (y, &)

• OR (o, +)

• NOT (no, -)

Operador booleano AND (y, &)

Es el operador de intersección, enlaza dos términos en el mismo documento. Recupera los documentos que contienen ambos términos.

Ejemplo

Si queremos recuperar documentos que traten de eczema y asma, el operador que debemos utilizar es AND. “Eczema” AND “Asma”. Sólo recuperaríamos las referencias que contengan los dos términos.

Nota

El operador AND permite crear un conjunto más restrictivo. Sí deseas reducir el número de resultados de una búsqueda debes utilizar este operador.

Operador booleano OR (o, +)

Es el operador de unión y recupera los documentos que contienen cualquiera de los términos.

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Ejemplo

Si queremos recuperar documentos que traten de eczema o de asma, el operador que debemos utilizar es OR. “Eczema” OR “Asma”. Recuperaríamos las referencias que contengan “eczema” o “asma” o los dos términos al mismo tiempo.

Nota

Utiliza el operador OR para ampliar el número de resultados de tu búsqueda. Es útil también para hacer búsquedas por sinónimos o términos en diferentes idiomas.

Operador booleano NOT (no, -)

Este operador se utiliza para la exclusión de un término.

Ejemplo

Si queremos recuperar documentos que traten de eczema pero no de asma, el operador que debemos utilizar es NOT. “Eczema” NOT “Asma”. Recuperaríamos las referencias que contengan “eczema” pero no asma.

Nota

El operador NOT excluye el conjunto B y los elementos de A que comparten la condición B. Debes utilizar este operador para restringir la búsqueda.

Para combinar los operadores booleanos debemos utilizar paréntesis.

Ejemplo

Si queremos recuperar documentos que traten de la frecuencia de asma en pacientes con eczema o dermatitis combinaríamos los términos de la siguiente manera:

“Asma” AND (“Eczema” OR “Dermatitis”)

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2.5. Rediseño o reformulación de la estrategia de búsqueda

En algunas ocasiones los resultados de la búsqueda no son los esperados ya sea por exceso (recuperamos demasiadas referencias) ya sea por defecto (recuperamos muy pocas o ninguna).

Cuando esto sucede debemos volver a replantear la búsqueda.

Si obtenemos muchos resultados debemos:

• Añadir términos más específicos

• Combinar los nuevos términos con el operador AND.

• Eliminar truncados.

• Utilizar descriptores.

• Buscar en campos específicos utilizando etiquetas de campo.

• Utilizar operadores de proximidad para enlazar conceptos.

• Limitar la búsqueda por tipo de publicación, año, idioma, etc.

Si obtenemos pocos resultados debemos:

• Emplear términos genéricos.

• Añadir sinónimos combinándolos con el operador OR.

• Utilizar truncados.

• Utilizar términos en lenguaje natural.

• Ampliar la búsqueda a todos los campos.

• Eliminar los operadores de proximidad.

• Ampliar la búsqueda a varios años, a cualquier idioma, a cualquier tipo de publicación.

Nota

Analiza las referencias obtenidas, revisa los términos de búsqueda que has utilizado, revisa su ortografía. Si encuentras términos usados con un sentido diferente al que a ti te interesa, elimínalos. Si después de analizar y revisar las referencias no encuentras lo que buscas puede ser una indicación de que no estás buscando en la base de datos adecuada.

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3. Descriptores en Ciencias de la Salud

3.1. Los tesauros

Definición: Un tesauro es un vocabulario controlado y estructurado, formado por términos que guardan entre sí relaciones semánticas y genéricas. Estas relaciones pueden ser de equivalencia, jerárquicas y asociativas. Se trata de un instrumento de control terminológico que permite convertir el lenguaje natural de los documentos en un lenguaje controlado, ya que representa, de manera unívoca, el contenido de éstos, con el fin de servir tanto para la indización, como para la recuperación de los documentos.

Las bases de datos utilizan generalmente un Tesauro para indizar los documentos que las integran y facilitar su posterior recuperación. Así MEDLINE utiliza el MeSH y Embase-Excerpta Médica utiliza EMTREE. Es necesario por lo tanto conocer el vocabulario utilizado para poder realizar búsquedas precisas.

3.2. MeSH – Medical Subject Headings

MeSH(2) acrónimo de Medical Subject Headings, es el vocabulario controlado elaborado por la National Library of Medicine y utilizado para la indización,

catalogación y recuperación de información biomédica de la base de datos Medline.

Los términos del MeSH se organizan en forma de categorías jerárquicas o estructuras en árbol, lo que permite ampliar o acotar los términos en las búsquedas bibliográficas.

Desde 2008 el MeSH incluye los descriptores que aparecen en MEDLINE / PubMed, los del catálogo de la NLM y los de otras bases de datos de la National Library of Medicine.

(2) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=mesh

El MeSH incluye cuatro tipos de términos:

• Encabezamientos principales o Headings: aproximadamente contiene unos 24.000 encabezamientos principales que representan conceptos extraídos de la literatura científica biomédica.

Ejemplo

• Brain

• Brain Neoplasms

• Brain Injuries

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• Subencabezamientos o Subheadings, también llamados calificadores, sirven para describir aspectos particulares de un descriptor o encabezamiento.

Ejemplo

• Abnormalities

• Adverse effects

• Anatomy and histology

• Diagnosis

• Supplementary Concept Records: 172.000 términos adicionales recogidos en un tesauro químico independiente que se actualiza semanalmente.

Ejemplo

• Ibuprofene arginine [Substance Name]

• Rofecoxib [Substance Name]

• Solufenum [Substance Name]

• Tipos de publicación, Publication Types: describe el tipo de publicación indexada.

Ejemplo

• Clinical Trial

• Letter

• Randomized Controlled Trial

• Review

El MeSH presenta una estructura jerárquica. Los encabezamientos están organizados en forma de árbol (MeSH trees). Dispone de 16 categorías o ramas.

a. Anatomy

b. Organisms

c. Diseases

d. Chemical and Drugs

e. Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment

f. Psychiatry and Psychology

g. Biological Sciences

h. Physical Sciences

i. Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena

j. Technology and Food and Beverages

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k. Humanities

l. Information Science

m. Persons

n. Health Care

o. Publication Characteristics

p. Geographic Locations

Cada categoría está compuesta a su vez por subcategorías. Cada encabezamiento ocupa una posición determinada dentro de la jerarquía.

La estructura jerárquica del MeSH permite la búsqueda en Medline / PubMed de términos generales que incluyen, a su vez, y por defecto, términos más específicos. Esta característica se conoce como “Explode” o “Exploding”

MeSH Browser nos va a permitir navegar por la estructura arbórea o arborescente del MeSH, localizar un descriptor determinado, buscar un calificador, ver las relaciones de unos términos con otros y la posición que estos descriptores ocupan dentro del árbol o jerarquía. El MeSH es un tesauro construido a partir de grupos o categorías de términos que se enlazan entre sí, hacia arriba o hacia abajo, mediante hiperenlaces, mostrando la relación existente entre ellos. Permite localizar información con varios niveles de especificidad. Como vimos en la unidad didáctica anterior la calidad de un sistema de recuperación de información está determinada por la asignación efectiva de los términos de su vocabulario controlado, de forma que permita localizar fácilmente los términos buscados.

MeSH Database, disponible en la barra lateral de PubMed:

• Permite localizar y seleccionar términos MeSH (Headings, Subheadings, Supplementary Concept Records, and Publication Types) para efectuar búsquedas en PubMed.

• Proporciona la definición del término y el año de inclusión en la base de datos.

• Permite ver la posición de los términos dentro de la jerarquía.

• Permite combinar encabezamientos y subencabezamientos para construir búsquedas en PubMed.

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Figura 1. Página al detalle de un término en el Mesh

Nota

Para buscar en Medline / PubMed o en cualquiera de las bases de datos Entrez debes utilizar el MeSH Database y seleccionar los descriptores que más se ajusten a los conceptos que buscas. Si deseas ampliar información utiliza el MeSH Browser.

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3.3. DeCS – Descriptores en Ciencias de la Salud

El DeCS - Descriptores en Ciencias de la Salud es un vocabulario estructurado y trilingüe (español, inglés y portugués) creado por BIREME, Sistema Latinoamericano y del Caribe de Información en Ciencias de la Salud, para la indización de artículos de revistas científicas, libros, informes técnicos y para facilitar su posterior recuperación en las bases de datos LILACS, MEDLINE e IBECS.

Ha sido desarrollado a partir del MeSH – Medical Subject Headings de la NLM de los Estados Unidos con el objetivo de permitir el uso de una terminología común para la búsqueda en los tres idiomas.

Estructura del DeCS (http://decs.bvs.br/E/homepagee.htm): El DeCS se estructura en 20 categorías jerárquicas Además de los términos médicos originales del MeSH, el DeCS incorpora términos de áreas específicas tales como la Salud Pública, Homeopatía, Ciencia y Salud y Vigilancia Sanitaria.

Los conceptos que componen el DeCS están organizados en una estructura jerárquica permitiendo la búsqueda en términos más amplios o más específicos dentro de una misma estructura jerárquica. (fig. 1)

Nota

Utiliza el DeCS como traductor de términos biomédicos al inglés.

El DeCS es un vocabulario dinámico que cuenta en el momento actual con 29.429 descriptores, siendo de estos 24.767 del MeSH y 4.723 exclusivamente del DeCS. Registra un proceso constante de crecimiento y actualización.

• Alfabético

• Permutado

• Jerárquico

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Ejemplo de un registro DeCS (fig. 4)

Figura 4- registro DeCS

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4. Medline / Pubmed

4.1. Un poco de historia

Medline es posiblemente una de las bases de datos de bibliografía médica más importante y más utilizada en el mundo. Producida por la National Library of Medicine (NLM) es la versión automatizada de tres índices impresos: Index Medicus, Index to Dental Literature e International Nursing Index.

4.2. Definición, características y contenido de PubMed

PubMed (http://www.pubmed.gov.) es un sistema de búsqueda desarrollado y mantenido por el National Center for Biotechnology Information (NCBI) de la National Library of Medicine (NLM). PubMed está disponible de manera gratuita a través de NCBI Entrez retrievalsystem.

PubMed ofrece:

• Diversas modalidades de búsqueda.

• Acceso a los descriptores MeSH.

• Posibilidad de almacenar, crear alertas bibliográficas, etc. a través de la aplicación My NCBI.

• Enlaces al texto completo de artículos.

• Acceso a otros sistemas de búsqueda de la NLM como: ClinicalTrials.gov, MedlinePlus, NIH Clinical Alerts and Advisories, PubMed Central.

Figura 5 - Pantalla principal de acceso a PubMed

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Figura 6 - Caja de búsqueda básica o rápida. Al lado búsqueda avanzada

Figura 7 - Explicación Menú Central: Ayuda, Herramientas y Recursos

4.3. Buscando en PubMed: Búsqueda básica

Antes de iniciar una búsqueda en PubMed conviene repasar algunos conceptos ya vistos anteriormente. Véase Lenguajes de interrogación, operadores boléanos.

• Lenguajes de interrogación: PubMed permite la utilización de palabras clave, descriptores MeSH y la combinación de ambos.

• Sintaxis: los operadores booleanos que el sistema utiliza para combinar términos son AND, OR, NOT.

Nota

Estos operadores han de ir siempre en mayúsculas. El sistema los interpreta de izquierda a derecha. Si queremos romper esta secuencia es necesario utilizar paréntesis.

Ejemplo

PubMed dispone de una herramienta que sugiere alternativas ortográficas al término introducido en la caja de búsqueda. Los términos sugeridos aparecen en un menú que se abre mientras se escribe en la caja de búsqueda, si pulsamos sobre cualquiera de ellos nos recupera las citas que contienen ese término.

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Figura 8 - Sugerencias de Términos

4.3.1. Búsqueda básica por palabras claves (lenguaje natural) Para iniciar la búsqueda en PubMed debemos introducir el término o términos deseados en el cuadro o caja de búsqueda y pulsar Go o la tecla Enter.

Para borrar los términos del cuadro de búsqueda pulsa .

El sistema recuperará los registros en los que encuentre correspondencia con los términos buscados. Esto se denomina mapeo automático de términos. PubMed enlaza automáticamente un término o frase no MeSH al término MeSH que mejor lo describe.

Ejemplo

Cancer es un sinónimo o “Entry Term” del término MeSH Neoplasms

1. PubMed rastrea automáticamente el término “cancer” y selecciona el término MeSH más apropiado, en este caso “Neoplasms” y efectúa la búsqueda por él.

2. PubMed busca el término MeSH “neoplasms” en todos los campos “All Fields”. 3. PubMed busca el término “cancer” en todos los campos “All Fields”.

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4.3.2. Búsqueda compuesta de varios términos Si introducimos varios términos o frase en la caja de búsqueda, PubMed buscará esos términos y la combinación de cada uno de ellos en todos los campos

Ejemplo

4.3.3. Traducción de la búsqueda "muscular atrophy"[MeSH Terms] OR ("muscular"[All Fields] AND "atrophy"[All Fields]) OR "muscular atrophy"[All Fields] OR ("muscle"[All Fields] AND "atrophy"[All Fields]) OR "muscle atrophy"[All Fields]

En el caso de que PubMed no encuentre resultados, descompone la frase y repite el mapeo automático hasta encontrar resultados. Los términos que no encuentran correspondencia serán buscados en todos los campos [All Fields] y cada término será combinado con el operador AND.

4.3.4. Búsqueda por autor/es Para buscar por autor podemos introducir el apellido seguido de la inicial o iniciales del nombre. No se utilizan signos de puntuación.

Nota

Para recuperar artículos del autor Colon debemos calificar el término con la etiqueta de campo correspondiente [au].

Figura 10 - Resultado de búsqueda por autor

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4.3.5. Búsqueda por frase En PubMed podemos buscar frases. Para ello debemos introducir el término entre comillas

Nota

Al utilizar las comillas se anula el mapeo automático de términos y se deshabilita la explosión automática de términos o “Explode”. Es decir PubMed recupera las citas que incluyen el término “Colonic Neoplasms” pero no los términos más específicos de la jerarquía como “Adenomatous Polyposis Coli”

4.3.6. Búsqueda por términos MeSH Para construir una estrategia de búsqueda utilizando los descriptores MeSH, lo primero que debemos hacer es seleccionar la base de datos MeSH.

Ejemplo

Vamos a buscar artículos que traten del uso del botox en el tratamiento de la hiperhidrosis: Sigue los pasos que vienen a continuación.

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1. Buscamos el término hyperhidrosis.

Figura 11 - Pantalla de resultado en el MeSH

2. Pulsamos sobre el término para ver la información disponible.

Figura 12 - Detalle término Hyperhidrosis en el Mesh: definición, subencabezamientos y arbol

Nota

Podríamos ya lanzar la búsqueda de este término MeSH en PubMed pulsando sobre la opción links y seleccionando PubMed.

3. Seleccionamos el subencabezamiento therapy y lo enviamos a la caja de búsqueda mediante la opción “Search Box with AND” en el menú desplegable “Send to”.

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Figura 13 - Método de búsqueda en el Mesh

Ya tenemos en la caja de búsqueda el descriptor MeSH seleccionado con el subencabezamiento correspondiente.

4. Vamos a completar la búsqueda para localizar aquellos artículos que traten específicamente del tratamiento de la hiperhidrosis mediante la aplicación de botox.

5. Volvemos al formulario de búsqueda e introducimos el término botox y pulsamos el botón Go.

6. El término aceptado es Botulinum Toxin Type A. Seleccionamos el término y lo enviamos a la caja de búsqueda mediante la opción “Search box with AND” del menú desplegable “Send to”.

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Figura 14 - Lanzar la búsqueda una vez seleccionado el término

7. Con los dos términos en la caja de búsqueda ya sólo queda efectuar la búsqueda en PubMed.

Nota

Cuando realizamos una búsqueda por un término MeSH, PubMed automáticamente buscará ese encabezamiento y todos los encabezamientos más específicos situados por debajo de éste en la jerarquía. Esto se conoce como “exploding a term” o explosión automática de términos.

Ejemplo

Figura 15 - Visión del arbol del Mesh

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4.3.7. Advanced Search Existe la opción de realizar búsquedas avanzadas.

4.3.8. Funciones adicionales: historial

Se detalla en orden todo el historial de búsquedas de una sesión. Guarda hasta 100 búsquedas y sólo se borra después de 8 horas de inactividad. Muestra la hora en que se hicieron las búsquedas y el número de resultados obtenidos.

Es útil porque nos permiten:

• Ver las estrategias de búsqueda realizadas.

• Reejecutar una búsqueda anterior sin necesidad de teclear de nuevo.

• Combinar las búsquedas entre sí.

Las búsquedas aparecen precedidas de un número de orden y del símbolo #. Si pasamos el ratón sobre el enlace que aparece al inicio de cada línea (#search) y presionamos el botón izquierdo del ratón se abre una ventana de “opciones” que permite:

• Utilizar los operadores booleanos para combinar las búsquedas.

• Borrar la búsqueda.

• Volver a ejecutarla.

• Ver los “Details” de la búsqueda.

• Guardar la búsqueda en My NCBI.

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4.3.9. Funciones adicionales: límites Las búsquedas en PubMed se pueden limitar entrando en “Búsqueda Avanzada”. Esta opción nos permitirá obtener resultados más precisos ya que podemos limitar la búsqueda por autor, revista, fechas.

Limitar la búsqueda por autor

Para localizar artículos de un determinado autor/es se introduce el apellido en la caja de búsqueda. El sistema ofrece la posibilidad de autocompletar el apellido o iniciales del autor. Si deseamos añadir más autores, seleccionamos en la siguientes caja de búsqueda Autor e introducimos el segundo, y antes de realizar la búsqueda deberíamos de seleccionar el operador con el que se van a combinar AND o bien OR.

Limitar la búsqueda por revista

Para limitar la búsqueda por revista introduce el título de la revista en la caja de búsqueda. El sistema permite autocompletar el título exacto.

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Limitar por fechas

Se puede limitar la búsqueda por fechas. El sistema ofrece dos posibilidades: limitar la búsqueda por la fecha en que el artículo ha sido publicado o por la fecha en que la cita ha sido incorporada a PubMed. En ambos casos, desplegando el menú, se puede elegir un periodo determinado o rango de fechas. Se utiliza el formato es YYYY/MM/DD (año, mes y día). Ej.: 2000/06/03.

Además ofrece una serie de opciones para limitar por idioma, disponibilidad del texto completo, tipo de publicación, género, grupos de edades, etc…

Figura 16 - Caja de búsqueda básica o rápida. Al lado búsqueda avanzada

Limitar a texto completo o resumen

Podemos seleccionar la opción u opciones que más interese.

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Limitar a humano / animal o limitar por sexo:

Es una opción útil para seleccionar el grupo o el sexo al que se desea aplicar el estudio. Si la opción no se activa, el sistema no aplicará el límite para este criterio.

Limitar por tipo de publicación

Permite limitar la búsqueda por tipo de documento: revisión, editorial, carta, artículo, etc. El menú desplegable muestra las opciones disponibles.

Limitar por Idioma

Subsets

Este menú permite limitar la búsqueda deacuerdo con alguno de los subconjuntos o subcategorías contenidos en PubMed.

Para utilizarlo hay que pulsar el menú desplegable y ver las opciones disponibles.

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Limitar por edad

Nos permite limitar por grupos bien delimitados por ejemplo: Infant, newborn o un grupo de edad más amplio: All child (0-18 años).

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A. Material de apoyo • Curso Online gratuito "Biblioteca Virtual en Salud"

http://bvs.isciii.es/E/bases.php

• PubMed Overview: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/overview.html

• PubMed Online Training http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.htm

• PubMed Basics http://nnlm.gov/training/resources/pmtri.pdf

• Searching PubMed with MeSH http://nnlm.gov/training/resources/meshtri.pdf

• My NCBI http://nnlm.gov/training/resources/myncbitri.pdf

• Full Text and PubMed http://nnlm.gov/training/resources/fulltexttri.pdf

• PubMed Training Manual Disponible en: Training Manuals and Resources http://www.nlm.nih.gov/pubs/web_based.html

• PubMedHelp http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=helppubmed.chapter.pubmedhelp

• Tutorial MeSH terms & using the history tab. [Vídeo] http://es.youtube.com/watch?v=NSyF6GD0Xrg&feature=related

• Tutorial PubMed RSS Feed [Vídeo] http://es.youtube.com/watch?v=t4FKO85irvw

• Tutorial PubMed RSS Feed (1) [Vídeo] http://es.youtube.com/watch?v=r6bPvtmio2Y

• Tutorial PubMed Feeds into WordPress [Vídeo] http://es.youtube.com/watch?v=G0Q_A8DTjug&feature=related

• Tutorial PubMed Interact http://pmi.nlm.nih.gov/interact/tutorial.html

• GoPubMed [Vídeo] http://www.gopubmed.org/GoMeshPubMed/gomeshpubmed/Help/Video/gopubmed_es.html

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B. Lecturas recomendadas • Bojo Canales C. et al. Internet Visible e Invisible: Búsqueda y selección de recursos de

información en Ciencias de la Salud. [En línea]. 2004 [Consultado el 11 de mayo de 2008] Disponible en http://bvs.isciii.es/mono/pdf/BNCS_01.pdf

• Campos Asensio C. Tutorial My NCBI para bibliotecas. [on line]. [Consultado el 3 de marzo de 2008]. Disponible en http://eprints.rclis.org/archive/00008621/01/Tutorial_My_NCBIpara_Bibliotecas.pdf

• Doms S, Schroeder M. GoPubMed: exploring PubMed with the Gene Ontology.

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Diplomado en Sanidad · Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud, 2009 – 2010 2 0. Objetivos En este módulo te familiarizarás con los conceptos, fundamentos y la terminología