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Estructura secundaria
• Las estructuras secundarias son uniones de cadenas polipeptidicas que se pueden plegar en estructuras regulares.
• En 1951 Linus Pauling y Robert Corey propusieron las siguientes estructuras periódicas:
• Hélice alfa• Hoja beta• Giro beta• Bucle omega
• Estas estructuras están debidas a una forma regular de los puentes hidrogeno entre los grupos NH2 y COOH de los aminoácidos próximos.
Hélices alfa
• Es una estructura en forma de cilindro, se estabiliza por puentes de hidrogeno entre los grupos NH2 y COOH de la cadena principal, salvo los aminoácidos cercanos al final de una hélice alfa.
• El sentido de giro de una hélice puede ser dextrógiro(en sentido a las agujas del reloj) o levógiro (en sentido contrario).
• Las hélices dextrógiras son las mas favorables energéticamente porque hay menos choques estéricos entre las cadenas y el esqueleto.
• El contenido de hélices alfa en proteínas oscila entre el 25 y 100%.
Hojas beta
• Esta formada por 2 o mas cadenas polipeptidicas, llamadas hebras beta, son extendidas unidas por puentes de hidrogeno.
• La cadenas laterales de aminoácidos contiguos apuntan en direcciones opuestas.
• Las cadenas adyacentes pueden ser anti paralela o paralela.• En el ordenamiento paralelo, el esquema de puentes de
hidrogeno es ligeramente mas complicado por la posición de los grupos NH2 y COOH.
• En diagramas esquemáticos, las hebras beta se representan por flechas apuntando hacia el COOH terminal.
Giros beta y bucles omega
• La mayor parte de las proteínas tienen formas que requieren cambios en la dirección de sus cadenas polipeptidicas.
• Este cambio se debe al elemento estructural llamado giro inverso o giro beta.
• Estructuras mas elaboradas son responsables para las inversiones de la cadena que son los bucles omega.
• Los bucles no tienen estructuras periódicas regulares, son a menudo rígidas y bien definidas.
• Giro beta Bucle omega