GENÓMICA: ¿UNA NUEVA ERA EN LA MEJORA Y

CONSERVACIÓN GANADERA?

J.V. DelgadoUniversidad de Córdoba

Presidente de la Red CONBIAND.

GESTIÓN GENÉTICA DE LAS POBLACIONES ANIMALES

MEJORA GENÉTICA

CONSERVACIÓN GENÉTICA

SELECCIÓN:

Objetivos y criterios

Población cerrada

Cruzamientos

Diversidad genética

de especies y razas

EVOLUCIÓN DE LOS MÉTODOS SELECTIVOS

SELECCIÓN INTUITIVA

SELECCIÓN CUANTITATIVA

SELECCIÓN ASISTIDA POR MARCADORES Y GENÓMICA

NUEVA TENDENCIA MUNDIAL

?

AGRONEGOCIO AUTOABASTECIMIENTO

GLOBALIZACIÓN

CONSECUENCIAS DE LA GLOBALIZACIÓN EN LA CIENCIA

Cada vez hay menos ciencia pública y más ciencia privada.Cada vez lo fines de la ciencia son más comerciales y menos altruistas.Cada vez un único idioma es más dueño de la ciencia, el inglés.

CONSECUENCIAS DE LA GLOBALIZACIÓN EN LA CIENCIA

Cada vez la divulgación de la ciencia está más controlada por unas pocas editoriales.Cada vez los investigadores son más evaluados por sus acciones de interés global y menos por su capacidad de solucionar problemas concretos.

CONSECUENCIAS DE LA GLOBALIZACIÓN EN LA CIENCIA

Cada vez hay menos libertad de expresión científica.Cada vez se destinan más presupuestos nacionales de investigación al pago de costes privados de patentes.Cada vez hay menos presupuestos nacionales para proyectos de interés local y se busca la financiación con fondos público de consorcios científicos internacionales con fuerte participación privada.

CONSECUENCIAS DE LA GLOBALIZACIÓN EN LA CIENCIA

En suma, cada vez la ciencia está menos al servicio de todos y más al interés de unos pocos, y especialmente en la cría animal.

NUEVAS HERRAMIENTAS “ÓMICAS”

ENERGÍA ATÓMICA

“ÓMICAS”

- +

GENÓMICA, PROTEÓMICA, TRANSCRIPTÓMICA

La Genómica estudia el genoma o patrimonio genético de los seres.La Proteómica estudia el proteoma que no es más que el acerbo proteico de los seres. La Transcriptómica se encarga del estudio del transcriptoma, que es el mensaje entre el gen y su expresión proteica, portado por el ARN mensajero

DESARROLLO DE LA GENÓMICADescubrimiento de la doble hélice (Watson y Crack, 1953) como estructura arquitectónica del ADNReacción en cadena de la polimerasa (Mullis y cols. 1986), mecanismo de obtener copias suficientes de fragmentos de ADN para ser analizadasSecuenciación, mecanismo para conocer de forma ordenada en los cromosomas, la estructura, la naturaleza y la localización de los genes Proyectos “genomas” conocimiento de los mapas genéticos de las especies

BASES DE LA GENÓMICA

Genética Molecular para definir la estructura de los genesEstadística para relacionar estas estructuras con sus expresionesBioinformática, para disponer de la capacidad de cálculo para analizar tan complejas bases de datos.

APORTACIONES DE LA GENÓMICA A LA CRÍA ANIMAL

Ahora podemos leer directamente en el genoma, y no basarnos en nuestra intuición, o en aproximaciones estadísticas avanzadas (BLUP) para hacer selección. La relación causa-efecto entre los genes y su expresión esta perfectamente determinada, al menos en caracteres simples.La Selección Genómica se abre paso en caracteres cuantitativos complejos.

ALGO SOBRE LA PROTEÓMICA

Se ha considerado como sinónimo de la Genómica, y en otros casos como parte de ella. Hoy se sabe que la relación gen-proteína varía con el tiempo y con los efectos ambientales, surgiendo la Epigenética, para explicarloLa Epigenética estudia las modificaciones en la expresión de genes, que son heredables. Con la regulación epigenética se puede observar como es la adaptación al medio ambiente dada por la plasticidad del genoma.

ALGO SOBRE LA TRANSCRIPTÓMICA

También se consideró parte de la genómicaLa transcriptómica permite cuantificar el nivel de expresión de los genes, empleando técnicas para analizar miles de moléculas de ARNm al mismo tiempo.

ALGUNAS CONCLUSIONES PARCIALES

Estas ciencias estudian todo el proceso de la vida, desde la información genética (genómica), hasta su expresión en proteínas (proteómica), pasando por la transmisión del mensaje por parte del ARNm (transcriptómica). Aparecen conceptos que resucitan el Lamarquismo, admitiendo la posibilidad de que “la función haga al órgano”, con la regulación epigenética del proceso. Estamos ante un nuevo mundo, o al menos ante una nueva era, que pone en nuestra manos unos métodos y una tecnología sin precedentes. Pero ¿como está afectando esto a la cría animal?

REPERCUSIONES DE LAS “OMICAS” EN LA MEJORA

¿Qué están haciendo ya las “ómicas” por nosotros?: Nos han permitido el acceso directo a las enfermedades

genéticas. La lectura del gen anómalo en el genoma nos permite su identificación directa y su selección negativa.

En enfermedades genéticas de naturaleza poligénica, los procedimientos se complican y tenemos que apoyarnos en la bioinformática para identificar los genotipos indeseables.

La Farmacogenómica estudia la variabilidad de respuesta ante el medicamento entre unos pacientes y otros e intenta definir el tratamiento que mejor se ajuste a cada individuo en función de su estructura genética.

Nutrigenómica

REPERCUSIONES DE LAS “OMICAS” EN LA MEJORA

¿Qué van a hacer las “ómicas” por nosotros: Selección Asistida por Marcadores:

Identificación de genes de acción mayor sobre un determinado carecer productivo y selección en su favor: Caseínas de la leche; Terneza y el marmoreo de la carne, Calpaina, Calpastatina y Leptina

Selección Genómica:Introducen la información de decenas de miles de genes con efectos conocidos (chip), con todas sus variantes, generalmente basadas en mutaciones de un único nucleótido (SNP). La estadística y la bioinformática relacionan los fenotipos con la información genómica leída en el chip, aumentando la precisión de las estimaciones de los valores genéticos.

VENTAJAS ATRIBUIDAS A LA SELECCIÓN GENÓMICA

Aumento de la fiabilidadDisminución del intervalo generacionalIncremento del progreso genéticoHasta ahora funciona en el Frisón Americano, pero sus resultados no han sido repetibles en otras razas y en otras condiciones.

REPERCUSIONES DE LAS “OMICAS” EN LA CONSERVACIÓNNueva dimensión de la conservación, mantenimiento en genotecas de fragmentos de ADN concretos de gran interés para la conservación.No es necesario conservar ADN común o sin función.Se podrá conservar sólo animales o germoplasma portadores de genes concretos muy amenazados.

REPERCUSIONES DE LAS “OMICAS” EN LA CONSERVACIÓN

Otra aplicación, será la selección genómica de los animales a conservar basada en su grado de biodiversidad.Sustituye a otros marcadores, como los microsatélites, como herramienta de la conservación: caracterización y relaciones filogenéticos entre poblaciones, trazabilidad e identificación individual, control genealógico, adscripción de individuos a poblaciones, etc.

ANÁLISIS CRÍTICO: MEJORADesde que ILUMINA y otros desarrollaron la evaluación genómica de los Frisones americanos, han inundado los medios de comunicación con grandes presiones propagandísticas sobre lo que parece ser la panacea de la mejora y la conservación.Los investigadores, los técnicos y hasta los gobiernos lo creen. En casi todos los países desarrollados están en marcha, o en proyecto estudios masivos de selección genómica en sus razas más desarrolladas, especialmente bovinas.

ANÁLISIS CRÍTICO: MEJORAA mi esto me parece una locura: Los resultados de ILUMINA aun no se han demostrado

repetibles en otras condiciones. En la mayoría de los países las deficiencias de los

programas de selección que repercuten en la precisión de los VG están en factores como el control de rendimientos, la identificación, el control genealógico, la gestión de la información y la participación ganadera.

ILUMINA es una empresa privada, es peligroso poner toda nuestra soberanía en mejora y conservación en manos privadas. Debemos desarrollar nuestros propios programas aun yendo más despacio.

El esnobismo de la ciencia llega a tal punto que estos temas arrastran muchos de los escasos recursos de I+D+i, afectando a otros proyectos más tangibles.

ANÁLISIS CRÍTICO: CONSERVACIÓNEl saldo de las aportaciones genómicas a la conservación es y será sin duda negativo: La mayor precisión de los valores genéticos incrementarán la

respuesta genética a la selección, amentanda la pérdida de diversidad genética intraracial.

La utilización de Chips genómicos, desviará presupuestos de la conservación hacia la mejora como consecuencia del marketing.

Estos métodos competirán con otros ya implantadas como los microsatélites, generando una pérdida de la continuidad de las bases de datos ya existentes, las homologaciones entre laboratorios, etc, por la sustitución metodológica.

Utilizar los Chips genómicos para estudios de biodiversidad, es como usar misiles para derribar pajarillos, hoy por hoy no es cierto que resulten más baratos, ni más eficaces.

En el control genealógico, no aporta nada nuevo, sólo una mayor simpleza, pero nos genera una dependencia del Chip.

ANÁLISIS CRÍTICO: CONSERVACIÓN

Creo sinceramente que con la implantación del Chip en la conservación quien único se beneficia es ILUMINA y demás empresas, por tanto recomiendo no sucumbir a los “cantos de sirena” propagandísticos a la hora de elegir la metodología molecular de apoyo a la conservación.

CUIDADO CON EL USO DE LAS HERRAMIENTAS GENÓMICAS

MUCHAS

GRACIAS