Presentación de PowerPointsgpwe.izt.uam.mx/files/users/uami/lebo/BBM_Enzimas_y_Cinetica/2... · Ejemplo Nomenclatura de enzimas 4. Liasas 4.1 Liasas Carbono-Carbono. (Rompimiento

Enzimas

Dra. Leticia Bucio Ortiz. Depto. Ciencias de la Salud. DCBS. UAM-Izt. México.

Descarboxilación de His

Deshidrogenación Et-OH

Descarboxilasa

Deshidrogenasa alcohólica

EnzimaSubstrato

rec A

Proteína de

choque térmico

Rec A

HSP70

gen

Caract.

Comité de la Unión Internacional de Bioq. y Biol. Mol. (IUBMB)

http://www.enzyme-database.org/ http://us.expasy.org/enzyme/http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/


Lis, Arg

Pepsina Renina

Tripsina Lisozima

Urea

Ac. Fumárico

Arginina

Ureasa Aldolasa

Fumarasa Enolasa

Arginasa Amilasa

EC 1.1.1.2

Accepted

name:

alcohol dehydrogenase (NADP+)

Reaction: an alcohol + NADP+

= an aldehyde + NADPH + H+

Other na

me(s):

aldehyde reductase (NADPH2); NADP-alcohol dehydrogenase; NADP+-

aldehyde reductase; NADP+-dependent aldehyde reductase; NADPH-

aldehyde reductase; NADPH-dependent aldehyde reductase; nonspecific

succinic semialdehyde reductase; ALR 1; low-Km aldehyde reductase;

high-Km aldehyde reductase; alcohol dehydrogenase (NADP+)

Systematic name: alcohol:NADP+

oxidoreductase

Comments: A zinc protein. Some members of this group oxidize only primary

alcohols; others act also on secondary alcohols. May be identical

with EC 1.1.1.19 (L-glucuronate reductase), EC 1.1.1.33

[mevaldate reductase (NADPH)] and EC 1.1.1.55 [lactaldehyde

reductase (NADPH)]. A-specific with respect to NADPH.

Links to other

databases:

BRENDA, ERGO, EXPASY, IUBMB, KEGG, PDB, CAS registry

number: 9028-12-0


enzyme commission

http://www.enzyme-database.org/query.php?name=1.1.1.19&search=search_some&es=on



http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php3?ecno=1.1.1.2

http://www.ergo-light.com/ERGO/CGI/fr.cgi?org=&user=&fr=1.1.1.2

http://www.expasy.ch/cgi-bin/nicezyme.pl?1.1.1.2

http://www.chem.qmw.ac.uk/iubmb/enzyme/EC1/1/1/2.html

http://www.genome.ad.jp/dbget-bin/www_bget?ec:1.1.1.2

http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi-bin/enzymes/GetPage.pl?ec_number=1.1.1.2

1. Oxidorreductasas

2. Transferasas

3. Hidrolasas

4. Liasas

5. Isomerasas

6. Ligasas

Clases de Enzimas:


EC 1.1 Acting on the CH-OH group of donors

EC 1.1.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor

EC 1.1.1.1 alcohol dehydrogenase

EC 1.1.1.2 alcohol dehydrogenase (NADP+)

EC 1.1.1.3 homoserine dehydrogenase

EC 1.1.1.4 (R,R)-butanediol dehydrogenase

EC 1.1.1.5 acetoin dehydrogenase

EC 1.1.1.6 glycerol dehydrogenase

EC 1.1.2 With a cytochrome as acceptor

EC 1.1.2.1 now EC 1.1.99.5

EC 1.1.2.2 mannitol dehydrogenase (cytochrome)

EC 1.1.3 With oxygen as acceptor

EC 1.1.3.1 deleted, included in EC 1.1.3.15

EC 1.1.3.2 now EC 1.13.12.4

EC 1.1.3.3 malate oxidase

EC 1.1.3.4 glucose oxidase

EC 1.1.4 With a disulfide as acceptorEC 1.1.4.1 vitamin-K-epoxide reductase (warfarin-sensitive)

EC 1.1.5 With a quinone or similar compound as acceptor

EC 1.1.5.1 Deleted, see EC 1.1.99.18 cellobiose dehydrogenase (acceptor)

EC 1.1.99 With other acceptors

EC 1.1.99.1 choline dehydrogenase

EC 1.1.99.2 2-hydroxyglutarate dehydrogenase

El 2o no.

OH 1

Aldehído 2

CH-CH 3

Amino 4


2o y 3er. No. subclase y sub-subclase específ.

El 3er no. Con

NAD o NADP 1

Citocromo 2

Oxígeno 3

Disulfito 4

Quinona 5

EC 1.2 Acting on the aldehyde or oxo group of donors


EC 1.2.1.1 deleted, replaced by EC 1.1.1.284 and EC 4.4.1.22

EC 1.2.1.2 formate dehydrogenase


EC 1.2.2.1 formate dehydrogenase (cytochrome)

EC 1.2.2.2 pyruvate dehydrogenase (cytochrome)


EC 1.2.3.1 aldehyde oxidase

EC 1.3 Acting on the CH-CH group of donors


EC 1.3.1.1 dihydrouracil dehydrogenase (NAD+)


EC 1.3.2.1 now EC 1.3.99.2

EC 1.3.2.2 now EC 1.3.99.3


EC 1.3.3.1 dihydroorotate oxidase

EC 1.3.3.2 now EC 1.14.21.6


El 4o no. representa el no. de lista de

la enzima dentro de la sub-subclase.

Nombre formal: ATP, glucosa fosfotransferasa

2.7.1.1

2. Nombre de la clase: Transferasa

7. Subclase; Fosfotransferasa

1. Sub subclase: fosfotransferasas con un grupo OH como

aceptor

1. Para la D-Glucosa como aceptor del grupo fosfato.

Hexoquinasa


Ejemplo Nomenclatura de enzimas

4. Liasas

4.1 Liasas Carbono-Carbono. (Rompimiento del enlace C-C).

4.1.1 Carboxi-liasas (Rompimiento del enlace C-COO-)

4.1.1.22 Carboxilasa de la histidina (Rompimiento del enlace C-COO- de la histidina)

4.1.2 Aldehído-liasas

4.2 Liasas Carbono-Oxigeno (rompimiento del enlace C-O)

4.3 Liasas carbono-Nitrógeno (rompimiento del enlace C-N)

4.4 Liasas carbono-azufre (rompimiento de los enlaces C-S).

4.5 Liasas Carbono- halógeno

4.6 Liasas fósforo-oxígeno

1. Oxidorreductasas

2. Transferasas

3. Hidrolasas

4. Liasas

5. Isomerasas

6. Ligasas

Clases de Enzimas:


Enzimas:

No. Clase Tipo de reacción

que catalizan

Ejemplo

1 Oxidorreductasas De óxido reducción

(transferencia de e-)

Deshidrogenasas

Peroxidasa

Oxidasas

Oxigenasas

Reductasas

Reducción: ganancia de electrones (hidrógeno o pérdida deoxígeno)

Oxidación: pérdida de electrones (hidrógeno o ganancia deoxígeno).

La Oxidación y la Reducción son reacciones acopladas (REDOX)


Si una molécula se reduce, tiene que haber otra que se oxide y VS.

1. Oxido-reductasas

( Reacciones de oxido-reducción).

Succinato Deshidrogenasa

Citocromo c oxidasa.


EC 1.3.5.1

EC 1.9.3.1

Enzimas:

No. Clase Tipo de reacción que

catalizan

Ejemplo

1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de

e-)

Deshidrogenasas

Peroxidasa Oxidasas

Oxigenasas

Reductasas

2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas

Transaminasas


EC 2.7.1.1 EC 2.7.1.40

2. Transferasas (Transferencia de grupos funcionales)

•grupo aldehído

•grupo acilo

•grupo glucosilo

•grupo fosfato (kinasas)


EC 2.6.1.2


catalizan

Ejemplo

1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de e-)

Deshidrogenasas

Peroxidasa Oxidasas

Oxigenasas

Reductasas


Transaminasas

3 Hidrolasas

Hidrólisis, con transferencia

de grupos funcionales del

agua

Pirofosfatasa

Tripsina

Enzimas:


Transforman polímeros en monómeros.

Actuan sobre:

3. Hidrolasas (Reacciones de hidrólisis)

•enlace éster

•enlace glucosídico

•enlace peptídico

•enlace C-NDra. Leticia Bucio Ortiz. Depto. Ciencias de la Salud. DCBS. UAM-Izt. México.

H2N-CH-CO-NH-CH-CO-NH-CH-COOH

R1 R2 R3

H2N-CH-COOH + NH-CH-CO-NH-CH-COOH

R1 R2 R3

H2O

OH

H

Tripsina EC 3.4.21.4


catalizan

Ejemplo

1 Oxidorreducta-

sas

De óxido reducción (transferencia de e-)

Deshidrogenasas

Peroxidasa Oxidasas

Oxigenasas

Reductasas


Transaminasas

3 Hidrolasas Hidrólisis, con transferencia de grupos

funcionales del agua

Pirofosfatasa

Tripsina

4 Liasas Rompimiento de C-C, C-O, C-N y otros

enlaces por medios distintos a la hidrólisis

y la oxidación, incluyen reacciones en las

que se elimina agua para dejar enlaces

dobles o en las que se agrega agua a

dichos enlaces dobles

(Sintasas)

Aldolasa

Descarboxilasa

pirúvica

Enzimas:


4. Liasas: Rompimiento de C-C, C-O, C-N

•Entre C y C

•Entre C y O

•Entre C y N


Oxidorreductasa

EC 4.1.1.1

EC 4.1.2.13


catalizan

Ejemplo

1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de e-)

Deshidrogenasas

Peroxidasa Oxidasas

Oxigenasas

Reductasas


Transaminasas

3 Hidrolasas Hidrólisis, con transferencia de grupos

funcionales del agua

Pirofosfatasa

Tripsina

Aldolasa

4 Liasas Rompimiento de C-C, C-O, C-N y otros

enlaces por medios distintos a la

hidrólisis y la oxidación, incluyen

reacciones en las que se elimina agua

para dejar enlaces dobles o en las que se

agrega agua a dichos enlaces dobles

(Sintasas)

Descarboxilasa

pirúvica

5 Isomerasas

Transferencia de grupos en

el interior de las moléculas

para dar formas isómeras.Cis Trans, L D, Aldehido Cetona.

Mutasas

Epimerasas

Racemasas

Enzimas:


5. Isomerasas (Reacciones de isomerización)


EC 5.3.1.1

EC 5.4.2.1

No. Clase Tipo de reacción que catalizan

Ejemplo

1 Oxidorreducta-sas

De óxido reducción (transferencia de e-)

Deshidrogenasas

Peroxidasa Oxidasas

Oxigenasas

Reductasas


Transaminasas

3 Hidrolasas Hidrólisis, con transferencia de grupos funcionales del agua

Pirofosfatasa

Tripsina

Aldolasa, P Alc

4 Liasas Rompimiento de C-C, C-O, C-N y otros enlaces

por medios distintos a la hidrólisis y la oxida-

ción, incluyen reacciones en las que se elimi-

na agua para dejar enlaces dobles o en las

que se agrega agua a dichos enlaces dobles

(Sintasas)

Descarboxilasa pirúvica

Anhidrasa carbónica,

Deshidratasas

5 Isomerasas Transferencia de grupos en el interior de

las moléculas para dar formas isómeras.

Cis Trans, L D, Aldehido Cetona.

Mutasas (P-Gluco mutasa)

Epimerasas

Racemasas

6 Ligasas Formación de enlaces C-C, C-S,

C-O y C-N. Mediante reacciones

de condensación, acopladas a

la ruptura del ATP

Sintetasas

Piruvato carboxilasa

DNA-ligasa

Enzimas:


6. Ligasas (Formación de enlaces, hidrolisis de ATP)


ATP

ADP PEC 6.4.1.1

EC 6.3.1.2

•Entre C y O

•Entre C y S

•Entre C y N

•Entre C y C Dra. Leticia Bucio Ortiz. Depto. Ciencias de la Salud. DCBS. UAM-Izt. México.

Succinil CoA-sintetasa

EC.6.2.1.4 Formadora de GDP

Succinato + CoA + GTP Succinil-CoA + fosfato + GDP

EC.6.2.1.5 Formadora de ADP

Succinato + CoA + ATP Succinil-CoA + fosfato + ADP

6. Ligasas (Formación de enlaces, con aporte de ATP)

E + S SE E + P


1. Actuación global de la reacción catalizada.

2. Utilizar un procedimiento analítico para la determinación de S que

desaparece o los productos de la reacción que aparecen.

3. Si la enzima requiere cofactores (iónes metálicos o coenzimas).

4. La dependencia de la actividad enzimática con la [S] o sea KM del S.

5. El pH óptimo.

6. Un intervalo de temperatura en la que la enzima es estable y

muestra actividad elevada.

¿Cómo detectar una enzima?


Es la cantidad que transforma 1.0 mM (10-6 M) de S /min

a 25oC, en las condiciones de medida óptima.

1.0 Unidad de Actividad Enzimática

25º C 30º C 37º C 25º C 30º C 37º C

LDH 80 - 240 106-317 151 - 454

FA

(fosf. alcal)

Mujeres

40-190 49-232 64 - 306

Hombres

50 -190 61 - 232 80 - 306

GOT (ASAT) 5 -15 7- 21 10 - 31 5 -17 78 - 24 10 - 35

GPT (ALAT) 5 -19 7 - 31 9 - 43 5 - 23 7 - 26 9 - 36

Enzimas. Valores normales en U/L.

Referencia. Ensayos de Diagnostico MERCK


Es el no. de U de enzima / mg de proteína.

Es una medida de la pureza de la enzima.

La Actividad Específica

4000-8000 U 2000-5000 U

Catalasa de

Aspergillius niger

4000-8000 U/mg de prot.

100 mg $ 209.80 USD.

Catalasa de

Hígado de bisonte

2000-5000 U/mg de prot.

1 g $ 768.50 USD.


Es el no. de moléculas de S transformadas / unidad de tiempo,

por una molécula de enzima

(o por un sólo sitio catalítico, cuando la E, es el limitante).

El Número de Recambio de una Enzima

Anhidrasa carbónica

b-Amilasa

b-Galactosidasa

Fosfoglucomutasa

36 000 000

1 000 000

12 000

1 240

Enzima. Moles de S, transf./ min.

a 20-38 oC.


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