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PROYECTO CGPI: 20050585 DETECCIÓN DE BACTERIAS PATÓGENAS PRESENTES EN PRODUCTOS CÁRNICOS EMPLEANDO MÉTODOS MOLECULARES. DIRECTORA: M. S.P. ELIZABETH FERNÁDEZ RENDÓN RESUMEN En México como en otros países, la salmonelosis constituye una de las principales causas de morbilidad y mortalidad. Salmonella a menudo infecta a los humanos por el consumo de alimentos contaminados de origen animal. En la última década el número de brotes y casos reportados se ha incrementado lo que parece estar relacionado con la creciente industrialización de productos de origen animal. Los métodos de cultivo utilizados como rutina para el aislamiento de Salmonella a partir de alimentos, son laboriosos y consumen demasiado tiempo ya que involucran pasos de pre-enriquecimiento en medios no inhibitorios, enriquecimiento selectivo con el subsecuente aislamiento en medios selectivos con agar y la identificación bioquímica del microorganismo en cuestión. Varias estrategias han sido propuestas como alternativa para reducir los tiempos de análisis, una de ellas la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es una herramienta de la biología molecular altamente específica. El problema se complica ya que es necesario contar con los aislamientos del microorganismo sospechoso, en este caso las salmonelas, para poder emplear este método, lo que incrementa el tiempo de análisis. Aunque esta técnica puede ser extremadamente efectiva sobre suspensiones de ácidos nucleicos puros (bacteria aislada), esta sensibilidad es reducida dramáticamente cuando se aplica directamente a muestras biológicas complejas como son los alimentos, por un sin número de compuestos tales como lípidos, sales y proteínas que afectan la reacción, evitando la polimerización. La propuesta del proyecto que se concluye consistió en utilizar la reacción en cadena de la polimerasa directamente de los alimentos evitando los pasos de pre-

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PROYECTO CGPI: 20050585

DETECCIÓN DE BACTERIAS PATÓGENAS PRESENTES EN PRODUCTOS CÁRNICOS EMPLEANDO MÉTODOS MOLECULARES.

DIRECTORA: M. S.P. ELIZABETH FERNÁDEZ RENDÓN

RESUMEN En México como en otros países , la salmonelosis constituye una de las principales

causas de morbilidad y mortalidad. Salmonella a menudo infecta a los humanos por el

consumo de alimentos contaminados de origen animal. En la última década el número

de brotes y casos reportados se ha incrementado lo que parece estar relacionado con

la creciente industrialización de productos de origen animal.

Los métodos de cultivo utilizados como rutina para el aislamiento de Salmonella a partir

de alimentos, son laboriosos y consumen demasiado tiempo ya que involucran pasos

de pre-enriquecimiento en medios no inhibitorios, enriquecimiento selectivo con el

subsecuente aislamiento en medios selectivos con agar y la identificación bioquímica

del microorganismo en cuestión.

Varias estrategias han sido propuestas como alternativa para reducir los tiempos de

análisis, una de ellas la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es una herramienta

de la biología molecular altamente específica.

El problema se complica ya que es necesario contar con los aislamientos del

microorganismo sospechoso, en este caso las salmonelas, para poder emplear este

método, lo que incrementa el tiempo de análisis.

Aunque esta técnica puede ser extremadamente efectiva sobre suspensiones de ácidos

nucleicos puros (bacteria aislada), esta sensibilidad es reducida dramáticamente

cuando se aplica directamente a muestras biológicas complejas como son los

alimentos, por un sin número de compuestos tales como lípidos, sales y proteínas que

afectan la reacción, evitando la polimerización.

La propuesta del proyecto que se concluye consistió en utilizar la reacción en cadena

de la polimerasa directamente de los alimentos evitando los pasos de pre-

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enriquecimiento, enriquecimiento y aislamiento de las salmonelas de los alimentos y

acortar los tiempos de análisis.

Una parte fundamental fue eliminar todos los componentes inhibitorios de la reacción en

cadena de la polimerasa con la purificación del DNA mediante tratamiento con

proteinasa K y fenol.

Varios ensayos empleando concentraciones conocidas de una cepa tipo fueron

desarrollados sobre muestras de carne de aves que resultó, de acuerdo a la

bibliografía, la que presenta mayor frecuencia de aislamiento de Salmonella en nuestro

país. Los resultados obtenidos con la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa

fueron comparados con los que se obtuvieron con la técnica convencional de cultivo

como estándar de oro.

Se logró detectar la presencia de Salmonella spp empleando la técnica de la reacción

en cadena de la polimerasa directamente de los alimentos cuando se inocularon las

muestras de carne de pollo con concentraciones de aproximadamente 100 bacterias/

ml.

Debido a lo costoso de los reactivos no fue posible emplear esta metodología en un

estudio de campo como son rastros de pollo.

Una ventaja de la técnica es que permite hacer un muestreo externo del producto o

alimento de manera que se pueden tomar las muestras destruir el alimento con un

lavado externo.

Es conveniente señalar que la técnica explorada es una prueba tamiz y que deberá

comprobarse la presencia del patógeno en los alimentos por cultivo ya que es posible

que las bacterias que nos son ya viables puedan dar la prueba positiva.

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Introducción

En los países subdesarrollados las enfermedades gastrointestinales constituyen una de

las principales causas de morbilidad y mortalidad. En México, para 1989, las diferentes

instituciones de salud notificaron, 3,419 casos de brucelosis, 9,790 de shigelosis,

10,939 de tifoidea, 30,899 intoxicaciones alimentarias no especificadas, 72,754 de

salmonelosis y 1,948,542 de otras infecciones intestinales, lo que da un total de

2,076,343 episodios relacionados con transmisión alimentaria.

Salmonella muy a menudo infecta a los humanos a través de alimentos contaminados

de origen animal; el pollo y huevos en particular han sido implicados. El número de

casos reportados de salmonelosis ha incrementado durante la pasada década en varios

países del oeste. El incremento parece estar relacionado a la creciente industrialización

de los alimentos de origen animal.

Los métodos de cultivo usados para la detección de Salmonella en alimentos de origen

animal son laboriosos y consumen demasiado tiempo. Los métodos convencionales de

cultivo usados hoy en día para el análisis de Salmonella involucran pre-enriquecimiento

en agua peptonada, enriquecimiento selectivo en caldo, siembra en medios selectivos,

y la subsecuente identificación por pruebas bioquímicas.

El procedimiento puede consumir por lo menos tres días para obtener colonias

sospechosas que deberán identificarse plenamente. Varias estrategias de análisis

alternativo han sido propuestas, y la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en

particular ha sido propuesta por ser una herramienta de diagnóstico molecular

altamente específica. Aunque esta técnica es extremadamente efectiva sobre

soluciones puras de ácidos nucleicos, esta sensibilidad puede ser reducida

dramáticamente cuando esta es aplicada directamente a muestras biológicas complejas

como son los alimentos. Puesto que los alimentos pueden originarse de ambas fuentes

animal y vegetal, la inhibición puede ser causada por un sin número de compuestos

comúnmente encontrados en los alimentos, tales como lípidos, sales, y proteínas, así

como sustancias presentes en los medios de cultivo empleados durante el

enriquecimiento.. Otros tipos de DNA y células diferentes al del organismo blanco

también han sido mostrados por afectar ambas, la sensibilidad y especificidad de la

PCR.

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Para lograr una alta eficiencia a través del método de la PCR que sustituya el análisis

de rutina de muestras de alimentos, se requieren métodos rápidos y de simple

preparación. Muchos métodos de preparación de muestras, tales como la extracción de

DNA son laboriosos y caros y no proveen la calidad de DNA molde deseado. Por lo

tanto, existe la necesidad de un método de preparación de muestras simple. El uso de

cultivo de enriquecimiento previo al análisis de la PCR tiene varios propósitos,

incluyendo (i) dilución de substancias inhibidoras de la PCR presentes en la muestra,

(ii) multiplicación del microorganismo blanco para proveer concentraciones detectables,

(iii) dilución de células muertas y por último (iv) la posibilidad de aislar el organismo

blanco para estudios complementarios.

El propósito del trabajo fue determinar la presencia de Salmonella por métodos

moleculares para evaluar su sensibilidad como técnicas alternativas en el diagnóstico

de productos cárnicos.

La hipótesis fue es posible detectar la presencia de Salmonella spp. a partir de carne

de aves sin el empleo una etapa de enriquecimiento de la muestra.

Uno de los principales problemas abordados fue eliminar los medios de enriquecimiento

en la detección de la Salmonella a partir de los alimentos, ya que aunque la

concentración de bacterias patógenas en el alimento pueden ser suficientes para ser

detectadas, se requieren concentraciones suficientes del microorganismo en los

alimentos ya que éste se comporta como una matriz que retiene a los microorganismos,

lo que dificulta su extracción. El enriquecimiento en el caso del análisis de alos

alimentos se muestra como una alternativa ya que incrementa el número de

microorganismos, lo que facilita su detección por la técnica de la reacción en cadena de

la polimerasa, sin embargo consume tiempo valioso en el diagnóstico. Una forma de

resolver este problema fue lavar externamente la carne de pollo de tal forma que se

pudiera retirar cualquier contaminación principalmente externa y concentrar las

bacterias por medio de centrifugación, separar el paquete celular en donde se esperaba

la presencia del microorganismo. Esto además de evitar que en el alimento fueran

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atrapadas algunas bacterias, facilita el proceso de análisis ya que el producto puede ser

muestreado sin causarle ningún deterioro.

Otro problema abordado fue la eliminación de aquellos agentes inhibitorios que se

encontraban en el alimento y que interfieren con la reacción en cadena de la polimerasa

(PCR) como son las proteínas, grasas, etc Para ello se le dio un tratamiento con

proteinasa K y fenol para eliminar estas interferencias en los concentrados de bacterias

obtenidas a partir del lavado.

El último problema abordado fue hacer que la sensibilidad de la técnica fuera adecuada

para poder utilizarla en muestras con concentración de bacterias diferente.

En el trabajo se inocularon muestras de pollo con concentraciones conocidas de una

cepa tipo de Salmonella spp. se pusieron en bolsas de polietileno y se adicionó agua

peptonada para recuperar la contaminación externa, empleando frotación del producto.

El líquido recuperado fue analizado por medo de la técnica de la reacción en cadena de

la polimerasa previo al tratamiento con proteinasa K y fenol para obtener el DNA de la

muestra.

La técnica de la reacción en cadena de la polimerasa detecta la presencia de un gen

que codifica una invasina presente en las bacterias del género Salmonella.

Al mismo tiempo que se realizó este ensayo, por el método tradicional de cultivo fue

analizado el alimento que se inoculó para determinar que no estuviera contaminado con

este microorganismo desde antes y esto incrementara la posibilidad de encontrar

positivo el alimento. Asimismo al momento de inocular las muestras se realizó un

recuento de las salmonelas para saber la concentración a la cual se encontraban por

medio de la técnica de vaciado en placa con agar cuenta estándar.

La presente investigación contribuye con métodos de análisis que disminuyen los

tiempos de diagnóstico en la industria alimentaria. En la actualidad se pueden emplear

este tipo de métodos pero se requiere del aislamiento de las bacterias para realizarlo, la

principal contribución es realizar la detección de la bacteria directamente del alimento

sin perder tiempo en su aislamiento. Se puede emplear como una prueba tamiz que

permite liberar los productos asegurando que no se encuentran contaminados con este

patógeno y si la prueba es positiva debe ser confirmada la presencia del

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microorganismo por el método convencional de cultivo pero en un número reducido de

muestras.

MATERIALES Y MÉTODOS

Figura 1- DIAGRAMA GENERAL DE TRABAJO

Cepa tipo de Salmonella

Estandarizar el inóculo deSalmonella para los ensayos de

la PCR

Estandarizar la técnica de PCR para la detección de Salmonella

directa del alimento

Detección de Salmonella en muestras de carne de

aves por PCR

Detección de Salmonella en muestras de carne de

aves por cultivo

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Figura 2- Estandarización del inóculo de Salmonella.

Inocular un tubo con caldo Mueller-Hinton

Incubar por 4 h a 37° C hasta alcanzar la concentración del tubo 0.5 del nefelómetro de McFarland (1.5 x 108 bacterias/ml)

Realizar diluciones decimales hasta 107

Sembrar cada dilución en placas con agar cuenta estándar

Cepa de Salmonella

Realizar el recuento de colonias de Salmonella spp en cada

dilución.

Seleccionar las diluciones con 10, 100 y 1000 bacterias/ml

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Figura 3- Estandarización de la PCR para la detección de Salmonella spp a partir de muestras de pollo inoculadas.

Carne de pollo

Pasar a bolsa estéril + 300 ml de agua peptonada 0.1 %

Homogeneizar en stomacher 230 rpm/ 1 min.

Centrifugar el agua de lavado a 5000 rpm/ 15 min.

Resuspender sedimento en agua peptonada 0.1%

Preenriquecimiento en 10 ml de agua peptonada 1%

Inocular con 1 ml de una suspensión con concentraciones

conocidas de Salmonella

Incubar a 37ºC 5 h en agitación

Enriquecimiento selectivo

0.5 ml en 10 ml de caldo selenito

0.5 ml en 10 ml de caldo tetrationato

Incubar a 42º C por 24 h.

Siembra en medios selectivos Mc. Conkey, XLD, sulfito de bismuto

Identificación bioquímica presuntiva

Identificación serológica

1 ml 1 ml 1 ml

Centrifugar 5000 rpm/15 min.

Resuspender en 1 ml de agua peptonada 0.1%

Extracción y purificación de DNA

Inocular con 1 ml de una

suspensión con concentraciones

conocidas de Salmonella

Tomar 1 ml

Extracción y purificación

de DNA

PCR

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Cepas.- Para este trabajo se utilizará la cepa de Salmonella enteritidis ATCC 203

de la colección del Laboratorio de Bacteriología Médica del IPN-ENCB.

Material biológico.- Se colectaran muestras de pierna y muslo de pollo en

diferentes locales de una Central de Abastos en los cuales se expende el pollo a

granel para consumo humano.

Estandarización del inóculo de Salmonella.- A partir de un cultivo puro de 24 h

de S. enteritidis en caldo Mueller-Hinton, se toma una asada y se inocula otro

tubo con caldo Mueller-Hinton, se incuba a 37° C por 4 h hasta alcanzar la

concentración del tubo 0.5 del nefelómetro de Mc Farland (1.5 x 10 8 bacterias/ml),

a partir de este último se realizan diluciones decimales hasta 107 , se siembra 0.1

ml de cada dilución en placas con agar cuenta estándar, se incuban a 37° C por

48 h. Posteriormente se realiza el conteo de colonias de Salmonella spp en cada

dilución, se selecciona la dilución con 10, 100 y 1000 bacterias/ml.

Tratamiento de la muestra para la estandarización de la PCR.- Dos piezas de

pollo (pierna y muslo) serán homogeneizadas en 300 ml de agua peptonada 0.1%

en una bolsa plástica estéril. Cada bolsa es sacudida a fondo en un stomacher a

230 rpm/1 minutos, posteriormente se centrífuga el agua de lavado a 5000 rpm

por 15 minutos, finalmente se resuspende el sedimento en agua peptonada 0.1%.

Contaminación de la muestra con enriquecimiento para estandarización de

la PCR.- Se inocula con 1 ml de una suspensión de S. enteritidis con

concentraciones de 10, 100 y 1000 bacterias/ml en la suspensión obtenida en el

paso 7.6, la mezcla se coloca en 10 ml de agua peptonada 1 % y se incuba 5 h a

37° C, luego de la incubación, el cultivo se centrífuga a 5000 rpm por 15 minutos,

el sedimento se resuspende en 1 ml de agua peptonada, a partir del cual se lleva

a cabo la extracción y purificación del DNA para posteriormente procesarlo para

PCR.

Contaminación de la muestra sin preenriquecimiento para estandarización

de PCR.- Se toma 1 ml de la suspensión del sedimento obtenida en el paso 7.6 y

se le adiciona 1 ml de una suspensión de S. enteritidis para obtener una

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concentración de 10, 100 y 1000 bacterias/ml, se mezcla y se toma 1 ml para

extracción y purificación de DNA para posteriormente procesar para PCR.

Método para el aislamiento de Salmonella spp por la técnica oficial de

cultivo (NOM-114-SSA1-1994). Inocular 1 ml de una suspensión de bacterias

obtenidas por lavado externo con stomacher de dos piezas de pollo (pierna y

muslo) a dos tubos de medio de enriquecimiento selectivo conteniendo 10 ml de

caldo selenito y 10 ml de caldo tetrationato, adicionar a éste último 0.2 ml de una

solución de yodo-yoduro. Incubar a 42º C por 24 h.

Después del tiempo de incubación mezclar el tubo con caldo selenito cistina y

sembrar una asada por estría cruzada en agar xilosa lisina desoxicolato (XLD),

agar verde brillante (VB), y una tercera caja con cualquiera de los medios

selectivos adicionales (agar entérico de Hecktoen o agar sulfito de Bismuto).

Efectuar el mismo procedimiento para el caldo tetrationato e incubar las placas 24

± 2 h a 35º C.

Identificación bioquímica. Seleccionar al menos 2 colonias típicas de cada medio

selectivo. Inocular dos tubos, uno con agar triple azúcar hierro (TSI) y otro con

agar hierro lisina (LIA), por estría en la superficie y por punción en el fondo.

Incubar por 24 ± 2 h a 35º C.

Tipificación serológica. Se colocan 2 gotas de solución salina estéril 0.85% en un

portaobjetos y se suspende una porción del cultivo desarrollado en TSI,

posteriormente se agrega una gota de antisuero polivalente somático “O”, se

mezcla con movimientos rotatorios aproximadamente durante 1 minuto. La

presencia de aglutinación (grumos) en el portaobjetos se considera como positiva.

Cuando la aglutinación es positiva con el antisuero polivalente, se procede a

realizar la tipificación con antisueros para los grupos A, B, D, E y para el antígeno

Vi.

Extracción de DNA.- Extracción del DNA de las muestras contaminadas natural y

artificialmente. Se toma 1 ml de alícuota de la muestra en agua peptonada se

centrifuga a 10,000 x g en un tubo de microcentrifuga por 5 min a 4º C. El

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sobrenadante es cuidadosamente desechado, y el paquete celular se resuspende

en 300 µl de buffe r TE (Tris-HCl 10 mM, EDTA [pH 8.9] 0.1 mM). El tubo de

microcentrifuga es incubado por 10 min a 100º C en baño de agua e

inmediatamente enfriado en hielo. Después se centrifuga a 14,000 X g a 4º C por

5 min, el sobrenadante conteniendo el DNA es cuidadosamente transferido a un

nuevo tubo de microcentrifuga.

7.11 Purificación de DNA mediante tratamiento con proteinasa K y fenol.- Se

transfiere el lisado a uno o más tubos de centrífuga, se adiciona proteinasa K (20

mg/ml) hasta una concentración final de 100 µg/ml, mezclar cuidadosamente, se

incuba en un baño de agua por 3 h a 50° C. Remover la mezcla de vez en vez.

Posteriormente se mantiene la solución a temperatura ambiente y se adiciona un

volumen igual de fenol equilibrado con Tris-Cl 0.1 M (pH 8.0). Se mezclan

cuidadosamente las dos fases volteando lentamente el tubo durante 10 minutos,

posteriormente se separan las dos fases por centrifugación a 5000 g por 15 min,

en seguida se transfiere la fase acuosa a un tubo de centrífuga nuevo. Se repite la

extracción con fenol 2 veces más.

Técnica de PCR para la detección de Salmonella spp. La PCR es realizada en

un termociclador Gen Amp PCR System 9700 (Applied Biosystems). Para esta

técnica se utilizaran los iniciadores para el gen invA propuesto por Rahn y cols.,

1992, el cual está localizado sobre la isla de patogenicidad 1 de Salmonella spp y

codifica una proteína del sistema de secreción tipo III (Collazo y Galán, 1997).

Cuadro II. Iniciadores utilizados para la PCR.

Gen Iniciadores Secuencia Tamaño del amplificado

(pb)

Temperatura de alineamiento (° C)

inv A 139 141

GTGAAATTATCGCCACGTTCGGGCAA TCATCGCACCGTCAAAGGAACC 284 64

Esta técnica se realizará empleando un volumen de 25 µl de la mezcla para PCR

conteniendo 0.4 µM de cada iniciador, 200 µM de cada dNTP (Roche

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Diagnostics), 1X PCR buffer (20mM Tris-HCl [pH 8.4], 50 mM KCl), 1.5 mM MgCl2,

0.75 U Taq polimerasa (Invitrogen), y 5 µl de muestra de DNA. Las condiciones de

incubación son 95°C por 1 min. Seguido de 35 ciclos de 95°C por 30s, 64º C por

30 s, y 72 °C por 30 s. Se emplea una extensión final de 72°C por 4 min.

Una alícuota de 10 µl de un producto de PCR se coloca sobre un gel de agarosa

1.8% conteniendo 0.5 µg de bromuro de etidio/ml y se corre a 6 V/cm por 90min.

Equipo para electroforesis y peso estándar.

RESULTADOS

Meta 1

Recopilar información bibliográfica que sustentara la presente investigación.

RESULTADOS

Con base en aproximadamente 70 citas bibliográficas se justificó el presente

trabajo, se fundamentó la metodología utilizada y los resultados obtenidos.

Meta 2

Detección de cepas tipo de Salmonella spp. con la técnica de la reacción en

cadena de la polimerasa (PCR) utilizando diferentes inicadores recomendados

para su demostración.

RESULTADOS

Para el cumplimiento de esta meta se revisó la bibliografía existente y se escogió

con base a otros estudios realizados con este microorganismo, aquella secuencia

de iniciadores que permitiera detectar diferentes especies de Salmonella que

coincidiera con los tipos serológicos que se describen en nuestro país. Fue

necesario realizar un Blast (programa que permite realizar la homología de las

secuencias de gen escogido con las de las especies de Salmonella y otros

microorganismos que pudieran contener este gen para eliminar aquelllas

secuencias que tuvieran problemas. En un trabajo previo realizado por Rahn y

cols., 1992 se probó la secuencia de iniciadores escogida y se estudiaron las

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posibilidades de obtener resultados positivos con varias cepas diferentes a

Salmonella.

La secuencia utilizada se muestra a continuación:

Gen Iniciadores Secuencia Tamaño del amplificado

(pb)

Temperatura de alineamiento (° C)

inv A 139 141

GTGAAATTATCGCCACGTTCGGGCAA TCATCGCACCGTCAAAGGAACC 284 64

Los iniciadores detectan el gen invA propuesto por Rahn y cols., 1992, están

localizados sobre la isla de patogenicidad 1 de Salmonella spp y codifica una

proteína del sistema de secreción tipo III (Collazo y Galán, 1997).

RESULTADOS

Los resultados incluyeron la estandarización de la técnica para detectar la cepa

tipo de Salmonella inoculada en muestras de pollo.

En la figura 4 se observa la extracción del DNA de algunas cepas utilizadas para

lograr la estandarización de la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa

(PCR).

Figura 4. Electroforesis en gel de agarosa 0.8% de DNA bacteriano. Carril 2 (DNA de S. tiphymurium), carril 3 (DNA de una cepa de Salmonella aislada de carne de pollo), carril 4 (DNA de Salmonella infantis).

1 2 3 4

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Una vez comprobado que se había logrado extraer el DNA de las cepas en

estudio, se procedió a realizar los primeros ensayos de amplificación de DNA

mediante la técnica de PCR.

El siguiente ensayo de PCR que se hizo fue para probar 3 temperaturas de

alineamiento, una a 64º C y las otras dos, 6º C arriba y abajo de la indicada, es

decir 70 y 58º C. Para este ensayo se usó DNA de Salmonella typhimurium.

Como puede observarse en la figura 5, las tres temperaturas de alineamiento

probadas (70, 64 y 58º C), se obtuvo buena amplificación, por lo que se decidió

elegir la temperatura intermedia entre estas que es la de 64º C.

Figura 5. Electroforesis en gel de agarosa al 1.6% de los amplificados de DNA de S. typhimurium a diferentes temperaturas de alineamiento. Carril 1 (amplificado del DNA de S. typhimurium a una temperatura de alineamiento de 70º C), carril 2 (amplificado del DNA de S. typhimurium a una temperatura de alineamiento de 64º C), carril 3 (amplificado del DNA de S. typhimurium a una temperatura de alineamiento de 58º C), carril 4 (marcador de peso molecular). Carril 5-8 (Otras muestras). Una vez obtenidos los productos de amplificación (mezcla de reacción y

condiciones de amplificación como habían sido establecidas anteriormente), se

cargaron en los pozos de un gel de agarosa 1.6%, 10µl del amplificado más 2.5 µl

1 2 3 4 5 6 7 8

350 800

2652 pb

50

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de azul de bromofenol y 2 µl del marcador de peso molecular más3 µl de agua

destilada estéril y 3 µl de azul de bromofenol.

Después de tener establecidas las condiciones de reacción para la PCR, lo

siguiente fue amplificar el DNA de cepas de Salmonella.

En la figura 6 se muestran los resultados obtenidos con la secuencia de

iniciadores escogida capaz de detectar varias especies de Salmonella, las bandas

de tres cepas de Salmonella que fueron amplificadas en el gel de agarosa

muestran los productos de amplificación esperados de 284 pb.

Figura 6. Electroforesis en gel de agarosa al 1.6% de los amplificados de DNA de Salmonella typhimurium (carril 1), Salmonella. infantis ( carril 2), Salmonella enteritidis (carril3), marcador de peso molecular (carril 4).

50

350

800

2652

1 2 3 4 5 6 7 8

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Meta 3 Recuperación del patógeno por la técnica de cultivo Inoculación de la cepa tipo de

Salmonella spp en concentraciones de 10, 100 y 1000 cel/g en carne de ave y su

recuperación por la técnica de cultivo .

RESULTADOS

En las figuras 7, 8 y 9 se muestran los resultados obtenidos con las muestra

contaminadas con Salmonella . La figura 7 muestra los productos de amplificación

cuando se utilizaron 1000 bacterias/mL de alimento, la figura 8 muestra los

resultados obtenidos cuando se inocularon 100 bacterias/mL del alimento y en la

figura 9 se muestran los resultados obtenidos cuando se inocularon solamente 10

bacterias/mL de alimento.

Figura 7. Electroforesis en agar de agaros a que muestra los resultados de la inoculación de muestras de pollo con 1000 bacterias/ml de S. typhimurium. Carril 1: Muestra 1. Carril 2: Muestra 2. Carril 3: Muestra 3.Carril 4: Muestra 4. Carril 5: Control negativo.Carril 6: Control positivo. Carril 7: Marcador de peso molecular.

2652 pb

800 pb

350 pb

1 2 3 4 5 6 7

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Figura 8. Electroforesis en gel de agarosa que muestra los resultados de la inoculación de muestras de pollo con 100 bacterias/ml de S. typhimurium. Carril 1: Muestra 1. Carril 2: Muestra 2. Carril 3: Muestra 3. Carril 4: Control negativo. Carril 5 Control positivo. Carril 6: Marcador de peso molecular

2652 pb

800 pb

350 pb

1 2 3 4 5 6

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Figura 9. . Electroforesis en gel de agarosa que muestra los resultados de la inoculación de muestras de pollo con 10 bacterias/ml de S. typhimurium. Carril 1: Muestra 1.Carril 2: Muestra 2 Carril 3: Muestra 3. Carril 4:Control positivo Carril 5: Marcador de peso molecular Los resultados obtenidos nos indicaron que cuando se inocularon 10 bacterias de

Salmonella en las muestras, los resultados obtenidos no fueron reproducibles en

todas las muestras inoculadas como se observa en la figura 9 en donde

solamente en una de las tres muestras inoculadas se logró detectar a la bacteria

por lo que se deduce que la sensibilidad de la técnica es de 100 bacterias/mL.

Meta 4

Detección de Salmonella por PCR directa del alimento con enriquecimiento.

Inoculación de la cepa de Salmonella en diferentes concentraciones en carne de

ave y su detección con enriquecimiento de la muestra.

RESULTADOS

Debido a que los resultados obtenidos en los experimentos anteriores fueron sin

la utilización de los medios de enriquecimiento, no se ensayaron con el

enriquecimiento ya que se alargarían los tiempos de análisis de las muestras.

1 2 3 4 5

2652 pb

800 pb

350 pb

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Meta 5

Detección de Salmonella por PCR directa del alimento sin enriquecimiento.

Inoculación de la cepa de Salmonella en diferentes concentraciones en carne de

ave y su detección sin enriquecimiento

RESULTADOS

Con los resultados obtenidos en la meta 3 se concluyó que si era posible detectar

la presencia de Salmonella en las muestras sin enriquecimiento, con lo que se

concluye que el método es suficientemente sensible como para detectar a la

bacteria blanco con el manejo propuesto en el proyecto.

Será necesario realizar estudios de campo en donde se analicen muestras

contaminadas en forma natural para observar el funcionamiento de la técnica.

En el presente trabajo no se continuó con estos ensayos ya que lo costoso de los

reactivos empleados solamente nos permitía llegar a cumplir estas metas y en un

estudio recurrente se elevaría el costo del proyecto que difícilmente podría ser

apoyado con un presupuesto superior al proyecto inicial.

IMPACTO

El presente trabajo se fundamentó en la necesidad que se tiene en la industria

alimentaria de contar con métodos más rápidos para liberar lotes de productos

que no tengan riesgos de producir enfermedad al ser consumidos.

La salmonelosis es una enfermedad endémica que provoca serios problemas de

salud en la población. Con los tratados de libre comercio es exigencia de otros

países que los productos de exportación estén libres de patógenos como

Salmonella el presente proyecto tendría un impacto en el sector productivo a nivel

de rastros en donde es común encontrar esta contaminación con Salmonella que

al ser aislada con los métodos de cultivo se prolonga el tiempo de liberación de

lotes del producto avícola.

La implementación de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) permitiría, a

nivel de rastro, liberar aquellas canales que se encontraran libres del patógeno,

dada la especificidad de la prueba y sobre todo en muestras que solamente

fueran sometidas a lavado, sin destrucción del producto, aquellas que resultaran

positivas necesariamente deberán ser sometidas a pruebas de cultivo de

bacterias para comprobar la presencia de Salmonella dado que con las células

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muertas se pueden encontrar productos de amplificación. De tal forma que la

utilización de la PCR se propone como una prueba tamiz que permite descartar

las canales de pollo que estén libres del patógeno.

El principal beneficio es en el sector salud al proporcionar al consumidor

productos inocuos que no le provoquen enfermedades.

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